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A Graph Search-Empowered Integrative Database of Arabidopsis Signaling Transduction, Metabolism and Gene Regulation Networks   
Location:  Home > Details for node AT2G16940
Type: Protein GRN ID: np23838 Name:
Annotation: Splicing factor, CC1-like [TCDB:1.F.1.1] [TCDB:3.A.1.208] [TCDB:3.A.16.1] [TCDB:9.A.5.1]
Gene Locus: AT2G16940
Gene Expression (Affy ATH1 probeset): 266534_at    
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 as format     
Data Filter
 Protein modification
 Protein-protein interaction
        also include predicted relationship
 Compound-protein interaction
 TF-target gene regulation
 Small RNA-target regulation
        also include predicted relationship
 Carrier and transported molecule
 Catalytic chemical reaction
 Co-expressed gene pair
        with mutual information value >

  Ignore nodes having > relationships
 
Relationship type:  protein modification     catalytic chemical reaction     protein-protein interaction    
compound-protein interaction     TF-target gene regulation     small RNA-target regulation    
co-expressed gene pair     carrier and transported molecule     family/complex and member
Relationship evidence:  Solid line: validated          Dashed line: predicted
Relationship direction: Arrow: positive          T shape: negative          None arrow: unknown or n/a
Hormone association: Thicker line: hormone related relationship         : hormone related Node
Node type:  Transcription factor or transcriptional regulator       Compound       Kinase
 Small regulatory RNA (miRNA & ta-siRNA)       Other nodes
No. Path
2 AT2G16940  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.857488) with  --  AT2G45700
3 AT2G16940  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.834326) with  --  AT2G25970
4 AT2G16940  --  transport  --  Protein-cysteine
5 AT2G16940  --  transport  --  Bile salt
6 AT2G16940  --  transport  --  Polypeptide
7 AT2G16940  --  transport  --  HCO3-
8 AT2G16940  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.857488) with  --  AT2G45700  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.88708) with  --  AT1G22660
9 AT2G16940  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.857488) with  --  AT2G45700  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.827888) with  --  MOS3; NUP96; PRE; SAR3
10 AT2G16940  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.857488) with  --  AT2G45700  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.801774) with  --  AT1G66660
11 AT2G16940  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.857488) with  --  AT2G45700  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.808981) with  --  AT4G11790
12 AT2G16940  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.857488) with  --  AT2G45700  --  has similar expression pattern (mutual information value=1.08844) with  --  AT4G32910
13 AT2G16940  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.857488) with  --  AT2G45700  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.855822) with  --  CIP111
14 AT2G16940  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.834326) with  --  AT2G25970  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.870181) with  --  AT5G51300
15 AT2G16940  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.834326) with  --  AT2G25970  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.808972) with  --  DIM1A
16 AT2G16940  --  transport  --  Protein-cysteine  --  has product (in catalytic reaction)  --  S-Farnesyl protein
17 AT2G16940  --  transport  --  Protein-cysteine  --  is transported by  --  AT2G43550
18 AT2G16940  --  transport  --  Protein-cysteine  --  is transported by  --  OWL1
19 AT2G16940  --  transport  --  Protein-cysteine  --  is transported by  --  AT2G35540
20 AT2G16940  --  transport  --  Protein-cysteine  --  is transported by  --  ATL9
21 AT2G16940  --  transport  --  Protein-cysteine  --  is transported by  --  AT2G34990
22 AT2G16940  --  transport  --  Protein-cysteine  --  is transported by  --  ATCB5-B; B5 #4; CB5-B
23 AT2G16940  --  transport  --  Protein-cysteine  --  is transported by  --  TPP
24 AT2G16940  --  transport  --  Protein-cysteine  --  is transported by  --  PS2
25 AT2G16940  --  transport  --  Protein-cysteine  --  is transported by  --  AT2G29220
26 AT2G16940  --  transport  --  Protein-cysteine  --  is transported by  --  AT2G28970
27 AT2G16940  --  transport  --  Protein-cysteine  --  is transported by  --  AT2G28960
28 AT2G16940  --  transport  --  Protein-cysteine  --  is transported by  --  AT2G27940
29 AT2G16940  --  transport  --  Protein-cysteine  --  is transported by  --  PDF1.2b
30 AT2G16940  --  transport  --  Protein-cysteine  --  is transported by  --  PDF1.3
31 AT2G16940  --  transport  --  Protein-cysteine  --  is transported by  --  AT2G23450
32 AT2G16940  --  transport  --  Protein-cysteine  --  is transported by  --  AT2G20840
33 AT2G16940  --  transport  --  Protein-cysteine  --  is transported by  --  AT2G20360
34 AT2G16940  --  transport  --  Protein-cysteine  --  is transported by  --  ATTRN1; TRN1
35 AT2G16940  --  transport  --  Protein-cysteine  --  is transported by  --  ATPRB1; PRB1
36 AT2G16940  --  transport  --  Protein-cysteine  --  is transported by  --  AT2G03140
37 AT2G16940  --  transport  --  Protein-cysteine  --  is transported by  --  ATMAP65-6; MAP65-6
38 AT2G16940  --  transport  --  Protein-cysteine  --  is transported by  --  AHK4
39 AT2G16940  --  transport  --  Protein-cysteine  --  is transported by  --  AT2G01820
40 AT2G16940  --  transport  --  Protein-cysteine  --  is transported by  --  MEE65
41 AT2G16940  --  transport  --  Protein-cysteine  --  is transported by  --  MDAR6
42 AT2G16940  --  transport  --  Protein-cysteine  --  is transported by  --  ATCSLA03; ATCSLA3; CSLA03; CSLA03; CSLA3
43 AT2G16940  --  transport  --  Protein-cysteine  --  is transported by  --  AT1G14820
44 AT2G16940  --  transport  --  Bile salt  --  is transported by  --  FIP2
45 AT2G16940  --  transport  --  Bile salt  --  is transported by  --  AT5G54860
46 AT2G16940  --  transport  --  Bile salt  --  is transported by  --  ATGPT1; GPT1
47 AT2G16940  --  transport  --  Bile salt  --  is transported by  --  AT5G54720
48 AT2G16940  --  transport  --  Bile salt  --  is transported by  --  AT5G54710
49 AT2G16940  --  transport  --  Bile salt  --  is transported by  --  ATNDT1; NDT1
50 AT2G16940  --  transport  --  Bile salt  --  is transported by  --  AtBOR1; BOR1
51 AT2G16940  --  transport  --  Bile salt  --  is transported by  --  RLK
52 AT2G16940  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  ALDH22A1
53 AT2G16940  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  LHCA2
54 AT2G16940  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT3G59440
55 AT2G16940  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT3G59320
56 AT2G16940  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  CP33; PDE322
57 AT2G16940  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  CPK13
58 AT2G16940  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  ATG4; CHLG; G4; PDE325
59 AT2G16940  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT3G51730
60 AT2G16940  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  FERONIA
61 AT2G16940  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  BAM2
62 AT2G16940  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT3G49560
63 AT2G16940  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT3G44160
64 AT2G16940  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT3G43630
65 AT2G16940  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT3G36659
66 AT2G16940  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT3G22845
67 AT2G16940  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT3G19300
68 AT2G16940  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AtHrd1A; Hrd1A
69 AT2G16940  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT3G13070
70 AT2G16940  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  SRF4
71 AT2G16940  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT3G11325
72 AT2G16940  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT3G09700
73 AT2G16940  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  LAC7
74 AT2G16940  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  ATERDJ3A; TMS1
75 AT2G16940  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT3G08610
76 AT2G16940  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  ATCSLC06; ATCSLC6; CSLC06; CSLC6
77 AT2G16940  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  SEC
78 AT2G16940  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  ATDCL2; DCL2
79 AT2G16940  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  ATPDI11; ATPDIL2-1; MEE30; PDI11; UNE5
80 AT2G16940  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  CER8; LACS1
81 AT2G16940  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT2G46493
82 AT2G16940  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  TIF3I1; TRIP-1
83 AT2G16940  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  SEC61 BETA
84 AT2G16940  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT2G44920
85 AT2G16940  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT2G44581
86 AT2G16940  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT2G44578
87 AT2G16940  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  ATOEP37; OEP37
88 AT2G16940  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AtPP5; PAPP5; PP5; PP5.2
89 AT2G16940  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  ATOEP16-3; OEP16-3
90 AT2G16940  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  TPR15
91 AT2G16940  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT2G41000
92 AT2G16940  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  ATSZF2; CZF1; SZF2; ZFAR1
93 AT2G16940  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  LHCB4.3
94 AT2G16940  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT2G39630
95 AT2G16940  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT2G38195
96 AT2G16940  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT2G38185
97 AT2G16940  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AKR4C8
98 AT2G16940  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  ATTIM17-2; TIM17; TIM17-2
99 AT2G16940  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT2G37050
100 AT2G16940  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT2G35330
101 AT2G16940  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT2G34560
102 AT2G16940  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  LCR75; LCR79
103 AT2G16940  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  LCR76
104 AT2G16940  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT2G30940
105 AT2G16940  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AtVSR2; BP80-1;2; VSR1;2; VSR2
106 AT2G16940  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  ATCYP5; CYP19-4; CYP5
107 AT2G16940  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT2G25570
108 AT2G16940  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT2G25220
109 AT2G16940  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  UBP19
110 AT2G16940  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT2G24420
111 AT2G16940  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  ALDH11A3
112 AT2G16940  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  ATRER1C1
113 AT2G16940  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT2G23140
114 AT2G16940  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  UBA1A
115 AT2G16940  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  UFD1
116 AT2G16940  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  ATSYTA; NTMC2T1.1; NTMC2TYPE1.1; SYT1; SYTA
117 AT2G16940  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT2G19880
118 AT2G16940  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT2G18240
119 AT2G16940  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT2G17500
120 AT2G16940  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT2G16960
121 AT2G16940  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT2G16460
122 AT2G16940  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  ATVSR3; BP80-2;2; VSR2;2; VSR3; VSR3
123 AT2G16940  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  BP80-2;1; MTV4; VSR2;1; VSR4
124 AT2G16940  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  ALDH6B2
125 AT2G16940  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  ELF8; VIP6
126 AT2G16940  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT2G05810
127 AT2G16940  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  ATG8D
128 AT2G16940  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  LACS8
129 AT2G16940  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  ATUPS3; UPS3
130 AT2G16940  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT2G02370
131 AT2G16940  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  LCR73
132 AT2G16940  --  transport  --  HCO3-  --  has product (in catalytic reaction)  --  3-Methylglutaconyl-CoA
133 AT2G16940  --  transport  --  HCO3-  --  has product (in catalytic reaction)  --  Malonyl-CoA
134 AT2G16940  --  transport  --  HCO3-  --  has product (in catalytic reaction)  --  Carbamoyl phosphate
135 AT2G16940  --  transport  --  HCO3-  --  has product (in catalytic reaction)  --  Carbamate
136 AT2G16940  --  transport  --  HCO3-  --  is product (in catalytic reaction) of  --  ATPPC3; PPC3
137 AT2G16940  --  transport  --  HCO3-  --  is product (in catalytic reaction) of  --  ATPPC2; PPC2
138 AT2G16940  --  transport  --  HCO3-  --  is product (in catalytic reaction) of  --  ATPPC4; PPC4
139 AT2G16940  --  transport  --  HCO3-  --  is product (in catalytic reaction) of  --  ATPEPC1; ATPPC1; PEPC1; PPC1
140 AT2G16940  --  transport  --  HCO3-  --  is product (in catalytic reaction) of  --  2-Methyl-3-oxopropanoate
141 AT2G16940  --  transport  --  HCO3-  --  is transported by  --  AT2G03810
142 AT2G16940  --  transport  --  HCO3-  --  is transported by  --  AT1G65240
143 AT2G16940  --  transport  --  HCO3-  --  is transported by  --  AT1G57620
144 AT2G16940  --  transport  --  HCO3-  --  is transported by  --  AT1G56720
145 AT2G16940  --  transport  --  HCO3-  --  is transported by  --  AT1G54150
146 AT2G16940  --  transport  --  HCO3-  --  is transported by  --  AT1G51900
147 AT2G16940  --  transport  --  HCO3-  --  is transported by  --  RHS6
148 AT2G16940  --  transport  --  HCO3-  --  is transported by  --  AT1G51790
149 AT2G16940  --  transport  --  HCO3-  --  is transported by  --  ATSERK2; SERK2
150 AT2G16940  --  transport  --  HCO3-  --  is transported by  --  AT1G26690
151 AT2G16940  --  transport  --  HCO3-  --  is transported by  --  ATPUB44; PUB44; SAUL1
152 AT2G16940  --  transport  --  HCO3-  --  is transported by  --  BIP3
153 AT2G16940  --  transport  --  HCO3-  --  is transported by  --  iam hyd
154 AT2G16940  --  transport  --  HCO3-  --  is transported by  --  PEX6
   Funding by the National Science Foundation    Funding by the Oklahoma Center for the Advancement of Science & Technology    Additional funding by the Samuel Roberts Noble Foundation

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