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A Graph Search-Empowered Integrative Database of Arabidopsis Signaling Transduction, Metabolism and Gene Regulation Networks   
Location:  Home > Details for node AT3G59440
Type: Protein GRN ID: np24440 Name:
Annotation: Calcium-binding EF-hand family protein [TCDB:3.A.16.1] [TCDB:9.A.5.1]
Gene Locus: AT3G59440
Gene Expression (Affy ATH1 probeset): 251488_at    
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 Protein modification
 Protein-protein interaction
        also include predicted relationship
 Compound-protein interaction
 TF-target gene regulation
 Small RNA-target regulation
        also include predicted relationship
 Carrier and transported molecule
 Catalytic chemical reaction
 Co-expressed gene pair
        with mutual information value >

  Ignore nodes having > relationships
 
Relationship type:  protein modification     catalytic chemical reaction     protein-protein interaction    
compound-protein interaction     TF-target gene regulation     small RNA-target regulation    
co-expressed gene pair     carrier and transported molecule     family/complex and member
Relationship evidence:  Solid line: validated          Dashed line: predicted
Relationship direction: Arrow: positive          T shape: negative          None arrow: unknown or n/a
Hormone association: Thicker line: hormone related relationship         : hormone related Node
Node type:  Transcription factor or transcriptional regulator       Compound       Kinase
 Small regulatory RNA (miRNA & ta-siRNA)       Other nodes
No. Path
2 AT3G59440  --  transport  --  Polypeptide
3 AT3G59440  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  ALDH22A1
4 AT3G59440  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  LHCA2
5 AT3G59440  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT3G59320
6 AT3G59440  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  CP33; PDE322
7 AT3G59440  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  CPK13
8 AT3G59440  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  ATG4; CHLG; G4; PDE325
9 AT3G59440  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT3G51730
10 AT3G59440  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  FERONIA
11 AT3G59440  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  BAM2
12 AT3G59440  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT3G49560
13 AT3G59440  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT3G44160
14 AT3G59440  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT3G43630
15 AT3G59440  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT3G36659
16 AT3G59440  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT3G22845
17 AT3G59440  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT3G19300
18 AT3G59440  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AtHrd1A; Hrd1A
19 AT3G59440  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT3G13070
20 AT3G59440  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  SRF4
21 AT3G59440  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT3G11325
22 AT3G59440  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT3G09700
23 AT3G59440  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  LAC7
24 AT3G59440  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  ATERDJ3A; TMS1
25 AT3G59440  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT3G08610
26 AT3G59440  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  ATCSLC06; ATCSLC6; CSLC06; CSLC6
27 AT3G59440  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  SEC
28 AT3G59440  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  ATDCL2; DCL2
29 AT3G59440  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  ATPDI11; ATPDIL2-1; MEE30; PDI11; UNE5
30 AT3G59440  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  CER8; LACS1
31 AT3G59440  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT2G46493
32 AT3G59440  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  TIF3I1; TRIP-1
33 AT3G59440  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  SEC61 BETA
34 AT3G59440  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT2G44920
35 AT3G59440  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT2G44581
36 AT3G59440  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT2G44578
37 AT3G59440  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  ATOEP37; OEP37
38 AT3G59440  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AtPP5; PAPP5; PP5; PP5.2
39 AT3G59440  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  ATOEP16-3; OEP16-3
40 AT3G59440  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  TPR15
41 AT3G59440  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT2G41000
42 AT3G59440  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  ATSZF2; CZF1; SZF2; ZFAR1
43 AT3G59440  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  LHCB4.3
44 AT3G59440  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT2G39630
45 AT3G59440  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT2G38195
46 AT3G59440  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT2G38185
47 AT3G59440  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AKR4C8
48 AT3G59440  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  ATTIM17-2; TIM17; TIM17-2
49 AT3G59440  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT2G37050
50 AT3G59440  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT2G35330
51 AT3G59440  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT2G34560
52 AT3G59440  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  LCR75; LCR79
53 AT3G59440  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  LCR76
54 AT3G59440  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT2G30940
55 AT3G59440  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AtVSR2; BP80-1;2; VSR1;2; VSR2
56 AT3G59440  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  ATCYP5; CYP19-4; CYP5
57 AT3G59440  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT2G25570
58 AT3G59440  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT2G25220
59 AT3G59440  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  UBP19
60 AT3G59440  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT2G24420
61 AT3G59440  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  ALDH11A3
62 AT3G59440  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT2G23450
63 AT3G59440  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  ATRER1C1
64 AT3G59440  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT2G23140
65 AT3G59440  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  UBA1A
66 AT3G59440  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  UFD1
67 AT3G59440  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  ATSYTA; NTMC2T1.1; NTMC2TYPE1.1; SYT1; SYTA
68 AT3G59440  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT2G19880
69 AT3G59440  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT2G18240
70 AT3G59440  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT2G17500
71 AT3G59440  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT2G16960
72 AT3G59440  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  ATTRN1; TRN1
73 AT3G59440  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT2G16940
74 AT3G59440  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT2G16460
75 AT3G59440  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  ATVSR3; BP80-2;2; VSR2;2; VSR3; VSR3
76 AT3G59440  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  BP80-2;1; MTV4; VSR2;1; VSR4
77 AT3G59440  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  ALDH6B2
78 AT3G59440  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  ELF8; VIP6
79 AT3G59440  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT2G05810
80 AT3G59440  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  ATG8D
81 AT3G59440  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  LACS8
82 AT3G59440  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  ATUPS3; UPS3
83 AT3G59440  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT2G03140
84 AT3G59440  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT2G02370
85 AT3G59440  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  LCR73
86 AT3G59440  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  ATMAP65-6; MAP65-6
87 AT3G59440  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AHK4
   Funding by the National Science Foundation    Funding by the Oklahoma Center for the Advancement of Science & Technology    Additional funding by the Samuel Roberts Noble Foundation

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