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A Graph Search-Empowered Integrative Database of Arabidopsis Signaling Transduction, Metabolism and Gene Regulation Networks   
Location:  Home > Details for node AT2G16960
Type: Protein GRN ID: np19210 Name:
Annotation: ARM repeat superfamily protein [TCDB:1.F.1.1] [TCDB:2.C.1.2] [TCDB:3.A.16.1] [TCDB:3.A.7.12] [TCDB:9.A.42.1] [TCDB:9.A.5.1]
Gene Locus: AT2G16960
Gene Expression (Affy ATH1 probeset): 266524_at    
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 as format     
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 Protein modification
 Protein-protein interaction
        also include predicted relationship
 Compound-protein interaction
 TF-target gene regulation
 Small RNA-target regulation
        also include predicted relationship
 Carrier and transported molecule
 Catalytic chemical reaction
 Co-expressed gene pair
        with mutual information value >

  Ignore nodes having > relationships
 
Relationship type:  protein modification     catalytic chemical reaction     protein-protein interaction    
compound-protein interaction     TF-target gene regulation     small RNA-target regulation    
co-expressed gene pair     carrier and transported molecule     family/complex and member
Relationship evidence:  Solid line: validated          Dashed line: predicted
Relationship direction: Arrow: positive          T shape: negative          None arrow: unknown or n/a
Hormone association: Thicker line: hormone related relationship         : hormone related Node
Node type:  Transcription factor or transcriptional regulator       Compound       Kinase
 Small regulatory RNA (miRNA & ta-siRNA)       Other nodes
No. Path
2 AT2G16960  --  transport  --  Polypeptide
3 AT2G16960  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  ALDH22A1
4 AT2G16960  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  LHCA2
5 AT2G16960  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT3G59440
6 AT2G16960  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT3G59320
7 AT2G16960  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  CP33; PDE322
8 AT2G16960  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  CPK13
9 AT2G16960  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  ATG4; CHLG; G4; PDE325
10 AT2G16960  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT3G51730
11 AT2G16960  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  FERONIA
12 AT2G16960  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  BAM2
13 AT2G16960  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT3G49560
14 AT2G16960  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT3G44160
15 AT2G16960  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT3G43630
16 AT2G16960  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT3G36659
17 AT2G16960  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT3G22845
18 AT2G16960  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT3G19300
19 AT2G16960  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AtHrd1A; Hrd1A
20 AT2G16960  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT3G13070
21 AT2G16960  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  SRF4
22 AT2G16960  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT3G11325
23 AT2G16960  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT3G09700
24 AT2G16960  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  LAC7
25 AT2G16960  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  ATERDJ3A; TMS1
26 AT2G16960  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT3G08610
27 AT2G16960  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  ATCSLC06; ATCSLC6; CSLC06; CSLC6
28 AT2G16960  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  SEC
29 AT2G16960  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  ATDCL2; DCL2
30 AT2G16960  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  ATPDI11; ATPDIL2-1; MEE30; PDI11; UNE5
31 AT2G16960  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  CER8; LACS1
32 AT2G16960  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT2G46493
33 AT2G16960  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  TIF3I1; TRIP-1
34 AT2G16960  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  SEC61 BETA
35 AT2G16960  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT2G44920
36 AT2G16960  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT2G44581
37 AT2G16960  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT2G44578
38 AT2G16960  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  ATOEP37; OEP37
39 AT2G16960  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AtPP5; PAPP5; PP5; PP5.2
40 AT2G16960  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  ATOEP16-3; OEP16-3
41 AT2G16960  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  TPR15
42 AT2G16960  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT2G41000
43 AT2G16960  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  ATSZF2; CZF1; SZF2; ZFAR1
44 AT2G16960  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  LHCB4.3
45 AT2G16960  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT2G39630
46 AT2G16960  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT2G38195
47 AT2G16960  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT2G38185
48 AT2G16960  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AKR4C8
49 AT2G16960  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  ATTIM17-2; TIM17; TIM17-2
50 AT2G16960  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT2G37050
51 AT2G16960  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT2G35330
52 AT2G16960  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT2G34560
53 AT2G16960  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  LCR75; LCR79
54 AT2G16960  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  LCR76
55 AT2G16960  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT2G30940
56 AT2G16960  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AtVSR2; BP80-1;2; VSR1;2; VSR2
57 AT2G16960  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  ATCYP5; CYP19-4; CYP5
58 AT2G16960  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT2G25570
59 AT2G16960  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT2G25220
60 AT2G16960  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  UBP19
61 AT2G16960  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT2G24420
62 AT2G16960  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  ALDH11A3
63 AT2G16960  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT2G23450
64 AT2G16960  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  ATRER1C1
65 AT2G16960  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT2G23140
66 AT2G16960  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  UBA1A
67 AT2G16960  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  UFD1
68 AT2G16960  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  ATSYTA; NTMC2T1.1; NTMC2TYPE1.1; SYT1; SYTA
69 AT2G16960  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT2G19880
70 AT2G16960  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT2G18240
71 AT2G16960  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT2G17500
72 AT2G16960  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  ATTRN1; TRN1
73 AT2G16960  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT2G16940
74 AT2G16960  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT2G16460
75 AT2G16960  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  ATVSR3; BP80-2;2; VSR2;2; VSR3; VSR3
76 AT2G16960  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  BP80-2;1; MTV4; VSR2;1; VSR4
77 AT2G16960  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  ALDH6B2
78 AT2G16960  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  ELF8; VIP6
79 AT2G16960  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT2G05810
80 AT2G16960  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  ATG8D
81 AT2G16960  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  LACS8
82 AT2G16960  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  ATUPS3; UPS3
83 AT2G16960  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT2G03140
84 AT2G16960  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT2G02370
85 AT2G16960  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  LCR73
86 AT2G16960  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  ATMAP65-6; MAP65-6
87 AT2G16960  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AHK4
   Funding by the National Science Foundation    Funding by the Oklahoma Center for the Advancement of Science & Technology    Additional funding by the Samuel Roberts Noble Foundation


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