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Welcome to HRGRN
A Graph Search-Empowered Integrative Database of Arabidopsis Signaling Transduction, Metabolism and Gene Regulation Networks   
Location:  Home > Details for node PS2
Type: Protein GRN ID: np22105 Name: PS2
Annotation: PS2 | Presenilin-2 [TCDB:3.A.1.208]
Gene Locus: AT2G29900
Gene Expression (Affy ATH1 probeset): 263484_at    
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 as format     
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 Protein modification
 Protein-protein interaction
        also include predicted relationship
 Compound-protein interaction
 TF-target gene regulation
 Small RNA-target regulation
        also include predicted relationship
 Carrier and transported molecule
 Catalytic chemical reaction
 Co-expressed gene pair
        with mutual information value >

  Ignore nodes having > relationships
 
Relationship type:  protein modification     catalytic chemical reaction     protein-protein interaction    
compound-protein interaction     TF-target gene regulation     small RNA-target regulation    
co-expressed gene pair     carrier and transported molecule     family/complex and member
Relationship evidence:  Solid line: validated          Dashed line: predicted
Relationship direction: Arrow: positive          T shape: negative          None arrow: unknown or n/a
Hormone association: Thicker line: hormone related relationship         : hormone related Node
Node type:  Transcription factor or transcriptional regulator       Compound       Kinase
 Small regulatory RNA (miRNA & ta-siRNA)       Other nodes
No. Path
2 PS2  --  interacts with  --  AT5G09310
3 PS2  --  interacts with  --  AT2G31440
4 PS2  --  transport  --  Protein-cysteine
5 PS2  --  transport  --  Bile salt
6 PS2  --  transport  --  HCO3-
7 PS2  --  interacts with  --  AT5G09310  --  interacts with  --  PS1
8 PS2  --  interacts with  --  AT5G09310  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.805153) with  --  AT5G27210
9 PS2  --  transport  --  Protein-cysteine  --  has product (in catalytic reaction)  --  S-Farnesyl protein
10 PS2  --  transport  --  Protein-cysteine  --  is transported by  --  AT2G43550
11 PS2  --  transport  --  Protein-cysteine  --  is transported by  --  OWL1
12 PS2  --  transport  --  Protein-cysteine  --  is transported by  --  AT2G35540
13 PS2  --  transport  --  Protein-cysteine  --  is transported by  --  ATL9
14 PS2  --  transport  --  Protein-cysteine  --  is transported by  --  AT2G34990
15 PS2  --  transport  --  Protein-cysteine  --  is transported by  --  ATCB5-B; B5 #4; CB5-B
16 PS2  --  transport  --  Protein-cysteine  --  is transported by  --  TPP
17 PS2  --  transport  --  Protein-cysteine  --  is transported by  --  AT2G29220
18 PS2  --  transport  --  Protein-cysteine  --  is transported by  --  AT2G28970
19 PS2  --  transport  --  Protein-cysteine  --  is transported by  --  AT2G28960
20 PS2  --  transport  --  Protein-cysteine  --  is transported by  --  AT2G27940
21 PS2  --  transport  --  Protein-cysteine  --  is transported by  --  PDF1.2b
22 PS2  --  transport  --  Protein-cysteine  --  is transported by  --  PDF1.3
23 PS2  --  transport  --  Protein-cysteine  --  is transported by  --  AT2G23450
24 PS2  --  transport  --  Protein-cysteine  --  is transported by  --  AT2G20840
25 PS2  --  transport  --  Protein-cysteine  --  is transported by  --  AT2G20360
26 PS2  --  transport  --  Protein-cysteine  --  is transported by  --  ATTRN1; TRN1
27 PS2  --  transport  --  Protein-cysteine  --  is transported by  --  AT2G16940
28 PS2  --  transport  --  Protein-cysteine  --  is transported by  --  ATPRB1; PRB1
29 PS2  --  transport  --  Protein-cysteine  --  is transported by  --  AT2G03140
30 PS2  --  transport  --  Protein-cysteine  --  is transported by  --  ATMAP65-6; MAP65-6
31 PS2  --  transport  --  Protein-cysteine  --  is transported by  --  AHK4
32 PS2  --  transport  --  Protein-cysteine  --  is transported by  --  AT2G01820
33 PS2  --  transport  --  Protein-cysteine  --  is transported by  --  MEE65
34 PS2  --  transport  --  Protein-cysteine  --  is transported by  --  MDAR6
35 PS2  --  transport  --  Protein-cysteine  --  is transported by  --  ATCSLA03; ATCSLA3; CSLA03; CSLA03; CSLA3
36 PS2  --  transport  --  Protein-cysteine  --  is transported by  --  AT1G14820
37 PS2  --  transport  --  Bile salt  --  is transported by  --  FIP2
38 PS2  --  transport  --  Bile salt  --  is transported by  --  AT5G54860
39 PS2  --  transport  --  Bile salt  --  is transported by  --  ATGPT1; GPT1
40 PS2  --  transport  --  Bile salt  --  is transported by  --  AT5G54720
41 PS2  --  transport  --  Bile salt  --  is transported by  --  AT5G54710
42 PS2  --  transport  --  Bile salt  --  is transported by  --  ATNDT1; NDT1
43 PS2  --  transport  --  Bile salt  --  is transported by  --  AtBOR1; BOR1
44 PS2  --  transport  --  Bile salt  --  is transported by  --  RLK
45 PS2  --  transport  --  HCO3-  --  has product (in catalytic reaction)  --  3-Methylglutaconyl-CoA
46 PS2  --  transport  --  HCO3-  --  has product (in catalytic reaction)  --  Malonyl-CoA
47 PS2  --  transport  --  HCO3-  --  has product (in catalytic reaction)  --  Carbamoyl phosphate
48 PS2  --  transport  --  HCO3-  --  has product (in catalytic reaction)  --  Carbamate
49 PS2  --  transport  --  HCO3-  --  is product (in catalytic reaction) of  --  ATPPC3; PPC3
50 PS2  --  transport  --  HCO3-  --  is product (in catalytic reaction) of  --  ATPPC2; PPC2
51 PS2  --  transport  --  HCO3-  --  is product (in catalytic reaction) of  --  ATPPC4; PPC4
52 PS2  --  transport  --  HCO3-  --  is product (in catalytic reaction) of  --  ATPEPC1; ATPPC1; PEPC1; PPC1
53 PS2  --  transport  --  HCO3-  --  is product (in catalytic reaction) of  --  ALDH6B2
54 PS2  --  transport  --  HCO3-  --  is product (in catalytic reaction) of  --  2-Methyl-3-oxopropanoate
55 PS2  --  transport  --  HCO3-  --  is transported by  --  AT2G03810
56 PS2  --  transport  --  HCO3-  --  is transported by  --  AT1G65240
57 PS2  --  transport  --  HCO3-  --  is transported by  --  AT1G57620
58 PS2  --  transport  --  HCO3-  --  is transported by  --  AT1G56720
59 PS2  --  transport  --  HCO3-  --  is transported by  --  AT1G54150
60 PS2  --  transport  --  HCO3-  --  is transported by  --  AT1G51900
61 PS2  --  transport  --  HCO3-  --  is transported by  --  RHS6
62 PS2  --  transport  --  HCO3-  --  is transported by  --  AT1G51790
63 PS2  --  transport  --  HCO3-  --  is transported by  --  ATSERK2; SERK2
64 PS2  --  transport  --  HCO3-  --  is transported by  --  AT1G26690
65 PS2  --  transport  --  HCO3-  --  is transported by  --  ATPUB44; PUB44; SAUL1
66 PS2  --  transport  --  HCO3-  --  is transported by  --  BIP3
67 PS2  --  transport  --  HCO3-  --  is transported by  --  iam hyd
68 PS2  --  transport  --  HCO3-  --  is transported by  --  PEX6
   Funding by the National Science Foundation    Funding by the Oklahoma Center for the Advancement of Science & Technology    Additional funding by the Samuel Roberts Noble Foundation

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