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A Graph Search-Empowered Integrative Database of Arabidopsis Signaling Transduction, Metabolism and Gene Regulation Networks   
Location:  Home > Details for node AT2G27940
Type: Protein GRN ID: np22123 Name:
Annotation: RING/U-box superfamily protein [TCDB:3.A.1.208]
Gene Locus: AT2G27940
Transcription factor /
transcriptional regulator:		 transcription factor family C2H2
Gene Expression (Affy ATH1 probeset): 257429_at    
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 Protein modification
 Protein-protein interaction
        also include predicted relationship
 Compound-protein interaction
 TF-target gene regulation
 Small RNA-target regulation
        also include predicted relationship
 Carrier and transported molecule
 Catalytic chemical reaction
 Co-expressed gene pair
        with mutual information value >

  Ignore nodes having > relationships
 
Relationship type:  protein modification     catalytic chemical reaction     protein-protein interaction    
compound-protein interaction     TF-target gene regulation     small RNA-target regulation    
co-expressed gene pair     carrier and transported molecule     family/complex and member
Relationship evidence:  Solid line: validated          Dashed line: predicted
Relationship direction: Arrow: positive          T shape: negative          None arrow: unknown or n/a
Hormone association: Thicker line: hormone related relationship         : hormone related Node
Node type:  Transcription factor or transcriptional regulator       Compound       Kinase
 Small regulatory RNA (miRNA & ta-siRNA)       Other nodes
No. Path
2 AT2G27940  --  interacts with  --  AT4G17430
3 AT2G27940  --  interacts with  --  TOM20-4
4 AT2G27940  --  transport  --  Protein-cysteine
5 AT2G27940  --  transport  --  Bile salt
6 AT2G27940  --  transport  --  HCO3-
7 AT2G27940  --  interacts with  --  AT4G17430  --  interacts with  --  ATBCB; BCB; BCB; SAG14
8 AT2G27940  --  interacts with  --  AT4G17430  --  interacts with  --  COR314-TM2; COR413IM2
9 AT2G27940  --  interacts with  --  AT4G17430  --  interacts with  --  AT1G72300
10 AT2G27940  --  interacts with  --  AT4G17430  --  interacts with  --  AT3G02880
11 AT2G27940  --  interacts with  --  AT4G17430  --  interacts with  --  AAP3; ATAAP3
12 AT2G27940  --  interacts with  --  AT4G17430  --  interacts with  --  AT2G29180
13 AT2G27940  --  interacts with  --  AT4G17430  --  interacts with  --  AT2G41610
14 AT2G27940  --  interacts with  --  AT4G17430  --  interacts with  --  AT3G13950
15 AT2G27940  --  interacts with  --  AT4G17430  --  interacts with  --  AT4G29450
16 AT2G27940  --  interacts with  --  AT4G17430  --  interacts with  --  AtPERK15; PERK15
17 AT2G27940  --  interacts with  --  AT4G17430  --  interacts with  --  AT1G49230
18 AT2G27940  --  interacts with  --  AT4G17430  --  interacts with  --  AT2G29020
19 AT2G27940  --  interacts with  --  AT4G17430  --  interacts with  --  AT3G15710
20 AT2G27940  --  interacts with  --  AT4G17430  --  interacts with  --  AT4G12950
21 AT2G27940  --  interacts with  --  AT4G17430  --  interacts with  --  AT5G07475
22 AT2G27940  --  interacts with  --  AT4G17430  --  interacts with  --  PDLP8
23 AT2G27940  --  interacts with  --  TOM20-4  --  interacts with  --  AT2G46550
24 AT2G27940  --  transport  --  Protein-cysteine  --  has product (in catalytic reaction)  --  S-Farnesyl protein
25 AT2G27940  --  transport  --  Protein-cysteine  --  is transported by  --  AT2G43550
26 AT2G27940  --  transport  --  Protein-cysteine  --  is transported by  --  OWL1
27 AT2G27940  --  transport  --  Protein-cysteine  --  is transported by  --  AT2G35540
28 AT2G27940  --  transport  --  Protein-cysteine  --  is transported by  --  ATL9
29 AT2G27940  --  transport  --  Protein-cysteine  --  is transported by  --  AT2G34990
30 AT2G27940  --  transport  --  Protein-cysteine  --  is transported by  --  ATCB5-B; B5 #4; CB5-B
31 AT2G27940  --  transport  --  Protein-cysteine  --  is transported by  --  TPP
32 AT2G27940  --  transport  --  Protein-cysteine  --  is transported by  --  PS2
33 AT2G27940  --  transport  --  Protein-cysteine  --  is transported by  --  AT2G29220
34 AT2G27940  --  transport  --  Protein-cysteine  --  is transported by  --  AT2G28970
35 AT2G27940  --  transport  --  Protein-cysteine  --  is transported by  --  AT2G28960
36 AT2G27940  --  transport  --  Protein-cysteine  --  is transported by  --  PDF1.2b
37 AT2G27940  --  transport  --  Protein-cysteine  --  is transported by  --  PDF1.3
38 AT2G27940  --  transport  --  Protein-cysteine  --  is transported by  --  AT2G23450
39 AT2G27940  --  transport  --  Protein-cysteine  --  is transported by  --  AT2G20840
40 AT2G27940  --  transport  --  Protein-cysteine  --  is transported by  --  AT2G20360
41 AT2G27940  --  transport  --  Protein-cysteine  --  is transported by  --  ATTRN1; TRN1
42 AT2G27940  --  transport  --  Protein-cysteine  --  is transported by  --  AT2G16940
43 AT2G27940  --  transport  --  Protein-cysteine  --  is transported by  --  ATPRB1; PRB1
44 AT2G27940  --  transport  --  Protein-cysteine  --  is transported by  --  AT2G03140
45 AT2G27940  --  transport  --  Protein-cysteine  --  is transported by  --  ATMAP65-6; MAP65-6
46 AT2G27940  --  transport  --  Protein-cysteine  --  is transported by  --  AHK4
47 AT2G27940  --  transport  --  Protein-cysteine  --  is transported by  --  AT2G01820
48 AT2G27940  --  transport  --  Protein-cysteine  --  is transported by  --  MEE65
49 AT2G27940  --  transport  --  Protein-cysteine  --  is transported by  --  MDAR6
50 AT2G27940  --  transport  --  Protein-cysteine  --  is transported by  --  ATCSLA03; ATCSLA3; CSLA03; CSLA03; CSLA3
51 AT2G27940  --  transport  --  Protein-cysteine  --  is transported by  --  AT1G14820
52 AT2G27940  --  transport  --  Bile salt  --  is transported by  --  FIP2
53 AT2G27940  --  transport  --  Bile salt  --  is transported by  --  AT5G54860
54 AT2G27940  --  transport  --  Bile salt  --  is transported by  --  ATGPT1; GPT1
55 AT2G27940  --  transport  --  Bile salt  --  is transported by  --  AT5G54720
56 AT2G27940  --  transport  --  Bile salt  --  is transported by  --  AT5G54710
57 AT2G27940  --  transport  --  Bile salt  --  is transported by  --  ATNDT1; NDT1
58 AT2G27940  --  transport  --  Bile salt  --  is transported by  --  AtBOR1; BOR1
59 AT2G27940  --  transport  --  Bile salt  --  is transported by  --  RLK
60 AT2G27940  --  transport  --  HCO3-  --  has product (in catalytic reaction)  --  3-Methylglutaconyl-CoA
61 AT2G27940  --  transport  --  HCO3-  --  has product (in catalytic reaction)  --  Malonyl-CoA
62 AT2G27940  --  transport  --  HCO3-  --  has product (in catalytic reaction)  --  Carbamoyl phosphate
63 AT2G27940  --  transport  --  HCO3-  --  has product (in catalytic reaction)  --  Carbamate
64 AT2G27940  --  transport  --  HCO3-  --  is product (in catalytic reaction) of  --  ATPPC3; PPC3
65 AT2G27940  --  transport  --  HCO3-  --  is product (in catalytic reaction) of  --  ATPPC2; PPC2
66 AT2G27940  --  transport  --  HCO3-  --  is product (in catalytic reaction) of  --  ATPPC4; PPC4
67 AT2G27940  --  transport  --  HCO3-  --  is product (in catalytic reaction) of  --  ATPEPC1; ATPPC1; PEPC1; PPC1
68 AT2G27940  --  transport  --  HCO3-  --  is product (in catalytic reaction) of  --  ALDH6B2
69 AT2G27940  --  transport  --  HCO3-  --  is product (in catalytic reaction) of  --  2-Methyl-3-oxopropanoate
70 AT2G27940  --  transport  --  HCO3-  --  is transported by  --  AT2G03810
71 AT2G27940  --  transport  --  HCO3-  --  is transported by  --  AT1G65240
72 AT2G27940  --  transport  --  HCO3-  --  is transported by  --  AT1G57620
73 AT2G27940  --  transport  --  HCO3-  --  is transported by  --  AT1G56720
74 AT2G27940  --  transport  --  HCO3-  --  is transported by  --  AT1G54150
75 AT2G27940  --  transport  --  HCO3-  --  is transported by  --  AT1G51900
76 AT2G27940  --  transport  --  HCO3-  --  is transported by  --  RHS6
77 AT2G27940  --  transport  --  HCO3-  --  is transported by  --  AT1G51790
78 AT2G27940  --  transport  --  HCO3-  --  is transported by  --  ATSERK2; SERK2
79 AT2G27940  --  transport  --  HCO3-  --  is transported by  --  AT1G26690
80 AT2G27940  --  transport  --  HCO3-  --  is transported by  --  ATPUB44; PUB44; SAUL1
81 AT2G27940  --  transport  --  HCO3-  --  is transported by  --  BIP3
82 AT2G27940  --  transport  --  HCO3-  --  is transported by  --  iam hyd
83 AT2G27940  --  transport  --  HCO3-  --  is transported by  --  PEX6
   Funding by the National Science Foundation    Funding by the Oklahoma Center for the Advancement of Science & Technology    Additional funding by the Samuel Roberts Noble Foundation

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