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Welcome to HRGRN
A Graph Search-Empowered Integrative Database of Arabidopsis Signaling Transduction, Metabolism and Gene Regulation Networks   
Location:  Home > Details for node AT2G20840
Type: Protein GRN ID: np22448 Name:
Annotation: Secretory carrier membrane protein (SCAMP) family protein [TCDB:3.A.1.208]
Gene Locus: AT2G20840
Gene Expression (Affy ATH1 probeset): 265419_at    
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 Protein modification
 Protein-protein interaction
        also include predicted relationship
 Compound-protein interaction
 TF-target gene regulation
 Small RNA-target regulation
        also include predicted relationship
 Carrier and transported molecule
 Catalytic chemical reaction
 Co-expressed gene pair
        with mutual information value >

  Ignore nodes having > relationships
 
Relationship type:  protein modification     catalytic chemical reaction     protein-protein interaction    
compound-protein interaction     TF-target gene regulation     small RNA-target regulation    
co-expressed gene pair     carrier and transported molecule     family/complex and member
Relationship evidence:  Solid line: validated          Dashed line: predicted
Relationship direction: Arrow: positive          T shape: negative          None arrow: unknown or n/a
Hormone association: Thicker line: hormone related relationship         : hormone related Node
Node type:  Transcription factor or transcriptional regulator       Compound       Kinase
 Small regulatory RNA (miRNA & ta-siRNA)       Other nodes
No. Path
2 AT2G20840  --  transport  --  Protein-cysteine
3 AT2G20840  --  transport  --  Bile salt
4 AT2G20840  --  transport  --  HCO3-
5 AT2G20840  --  transport  --  Protein-cysteine  --  has product (in catalytic reaction)  --  S-Farnesyl protein
6 AT2G20840  --  transport  --  Protein-cysteine  --  is transported by  --  AT2G43550
7 AT2G20840  --  transport  --  Protein-cysteine  --  is transported by  --  OWL1
8 AT2G20840  --  transport  --  Protein-cysteine  --  is transported by  --  AT2G35540
9 AT2G20840  --  transport  --  Protein-cysteine  --  is transported by  --  ATL9
10 AT2G20840  --  transport  --  Protein-cysteine  --  is transported by  --  AT2G34990
11 AT2G20840  --  transport  --  Protein-cysteine  --  is transported by  --  ATCB5-B; B5 #4; CB5-B
12 AT2G20840  --  transport  --  Protein-cysteine  --  is transported by  --  TPP
13 AT2G20840  --  transport  --  Protein-cysteine  --  is transported by  --  PS2
14 AT2G20840  --  transport  --  Protein-cysteine  --  is transported by  --  AT2G29220
15 AT2G20840  --  transport  --  Protein-cysteine  --  is transported by  --  AT2G28970
16 AT2G20840  --  transport  --  Protein-cysteine  --  is transported by  --  AT2G28960
17 AT2G20840  --  transport  --  Protein-cysteine  --  is transported by  --  AT2G27940
18 AT2G20840  --  transport  --  Protein-cysteine  --  is transported by  --  PDF1.2b
19 AT2G20840  --  transport  --  Protein-cysteine  --  is transported by  --  PDF1.3
20 AT2G20840  --  transport  --  Protein-cysteine  --  is transported by  --  AT2G23450
21 AT2G20840  --  transport  --  Protein-cysteine  --  is transported by  --  AT2G20360
22 AT2G20840  --  transport  --  Protein-cysteine  --  is transported by  --  ATTRN1; TRN1
23 AT2G20840  --  transport  --  Protein-cysteine  --  is transported by  --  AT2G16940
24 AT2G20840  --  transport  --  Protein-cysteine  --  is transported by  --  ATPRB1; PRB1
25 AT2G20840  --  transport  --  Protein-cysteine  --  is transported by  --  AT2G03140
26 AT2G20840  --  transport  --  Protein-cysteine  --  is transported by  --  ATMAP65-6; MAP65-6
27 AT2G20840  --  transport  --  Protein-cysteine  --  is transported by  --  AHK4
28 AT2G20840  --  transport  --  Protein-cysteine  --  is transported by  --  AT2G01820
29 AT2G20840  --  transport  --  Protein-cysteine  --  is transported by  --  MEE65
30 AT2G20840  --  transport  --  Protein-cysteine  --  is transported by  --  MDAR6
31 AT2G20840  --  transport  --  Protein-cysteine  --  is transported by  --  ATCSLA03; ATCSLA3; CSLA03; CSLA03; CSLA3
32 AT2G20840  --  transport  --  Protein-cysteine  --  is transported by  --  AT1G14820
33 AT2G20840  --  transport  --  Bile salt  --  is transported by  --  FIP2
34 AT2G20840  --  transport  --  Bile salt  --  is transported by  --  AT5G54860
35 AT2G20840  --  transport  --  Bile salt  --  is transported by  --  ATGPT1; GPT1
36 AT2G20840  --  transport  --  Bile salt  --  is transported by  --  AT5G54720
37 AT2G20840  --  transport  --  Bile salt  --  is transported by  --  AT5G54710
38 AT2G20840  --  transport  --  Bile salt  --  is transported by  --  ATNDT1; NDT1
39 AT2G20840  --  transport  --  Bile salt  --  is transported by  --  AtBOR1; BOR1
40 AT2G20840  --  transport  --  Bile salt  --  is transported by  --  RLK
41 AT2G20840  --  transport  --  HCO3-  --  has product (in catalytic reaction)  --  3-Methylglutaconyl-CoA
42 AT2G20840  --  transport  --  HCO3-  --  has product (in catalytic reaction)  --  Malonyl-CoA
43 AT2G20840  --  transport  --  HCO3-  --  has product (in catalytic reaction)  --  Carbamoyl phosphate
44 AT2G20840  --  transport  --  HCO3-  --  has product (in catalytic reaction)  --  Carbamate
45 AT2G20840  --  transport  --  HCO3-  --  is product (in catalytic reaction) of  --  ATPPC3; PPC3
46 AT2G20840  --  transport  --  HCO3-  --  is product (in catalytic reaction) of  --  ATPPC2; PPC2
47 AT2G20840  --  transport  --  HCO3-  --  is product (in catalytic reaction) of  --  ATPPC4; PPC4
48 AT2G20840  --  transport  --  HCO3-  --  is product (in catalytic reaction) of  --  ATPEPC1; ATPPC1; PEPC1; PPC1
49 AT2G20840  --  transport  --  HCO3-  --  is product (in catalytic reaction) of  --  ALDH6B2
50 AT2G20840  --  transport  --  HCO3-  --  is product (in catalytic reaction) of  --  2-Methyl-3-oxopropanoate
51 AT2G20840  --  transport  --  HCO3-  --  is transported by  --  AT2G03810
52 AT2G20840  --  transport  --  HCO3-  --  is transported by  --  AT1G65240
53 AT2G20840  --  transport  --  HCO3-  --  is transported by  --  AT1G57620
54 AT2G20840  --  transport  --  HCO3-  --  is transported by  --  AT1G56720
55 AT2G20840  --  transport  --  HCO3-  --  is transported by  --  AT1G54150
56 AT2G20840  --  transport  --  HCO3-  --  is transported by  --  AT1G51900
57 AT2G20840  --  transport  --  HCO3-  --  is transported by  --  RHS6
58 AT2G20840  --  transport  --  HCO3-  --  is transported by  --  AT1G51790
59 AT2G20840  --  transport  --  HCO3-  --  is transported by  --  ATSERK2; SERK2
60 AT2G20840  --  transport  --  HCO3-  --  is transported by  --  AT1G26690
61 AT2G20840  --  transport  --  HCO3-  --  is transported by  --  ATPUB44; PUB44; SAUL1
62 AT2G20840  --  transport  --  HCO3-  --  is transported by  --  BIP3
63 AT2G20840  --  transport  --  HCO3-  --  is transported by  --  iam hyd
64 AT2G20840  --  transport  --  HCO3-  --  is transported by  --  PEX6
   Funding by the National Science Foundation    Funding by the Oklahoma Center for the Advancement of Science & Technology    Additional funding by the Samuel Roberts Noble Foundation

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