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A Graph Search-Empowered Integrative Database of Arabidopsis Signaling Transduction, Metabolism and Gene Regulation Networks   
Location:  Home > Details for node SEC
Type: Protein GRN ID: np23975 Name: SEC
Annotation: SEC | Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein [TCDB:1.F.1.1] [TCDB:3.A.16.1] [TCDB:9.A.5.1]
Gene Locus: AT3G04240
Gene Expression (Affy ATH1 probeset): 258575_at    
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 Protein modification
 Protein-protein interaction
        also include predicted relationship
 Compound-protein interaction
 TF-target gene regulation
 Small RNA-target regulation
        also include predicted relationship
 Carrier and transported molecule
 Catalytic chemical reaction
 Co-expressed gene pair
        with mutual information value >

  Ignore nodes having > relationships
 
Relationship type:  protein modification     catalytic chemical reaction     protein-protein interaction    
compound-protein interaction     TF-target gene regulation     small RNA-target regulation    
co-expressed gene pair     carrier and transported molecule     family/complex and member
Relationship evidence:  Solid line: validated          Dashed line: predicted
Relationship direction: Arrow: positive          T shape: negative          None arrow: unknown or n/a
Hormone association: Thicker line: hormone related relationship         : hormone related Node
Node type:  Transcription factor or transcriptional regulator       Compound       Kinase
 Small regulatory RNA (miRNA & ta-siRNA)       Other nodes
No. Path
2 SEC  --  interacts with  --  AT5G38420
3 SEC  --  interacts with  --  MOM; MOM; MOM1
4 SEC  --  transport  --  Polypeptide
5 SEC  --  interacts with  --  AT5G38420  --  has product (in catalytic reaction)  --  D-Ribulose 1,5-bisphosphate
6 SEC  --  interacts with  --  AT5G38420  --  interacts with  --  AT1G09660
7 SEC  --  interacts with  --  AT5G38420  --  interacts with  --  BOP2
8 SEC  --  interacts with  --  AT5G38420  --  interacts with  --  ARF16
9 SEC  --  interacts with  --  AT5G38420  --  interacts with  --  AT3G14120
10 SEC  --  interacts with  --  AT5G38420  --  interacts with  --  ACD31.2; ACD32.1
11 SEC  --  interacts with  --  AT5G38420  --  interacts with  --  AT3G27960
12 SEC  --  interacts with  --  AT5G38420  --  interacts with  --  LSU2
13 SEC  --  interacts with  --  AT5G38420  --  interacts with  --  JAI3
14 SEC  --  interacts with  --  AT5G38420  --  interacts with  --  BP; BP1; KNAT1
15 SEC  --  interacts with  --  AT5G38420  --  interacts with  --  AT1G01440
16 SEC  --  interacts with  --  AT5G38420  --  interacts with  --  AT4G17680
17 SEC  --  interacts with  --  AT5G38420  --  interacts with  --  AT5G32440
18 SEC  --  interacts with  --  AT5G38420  --  interacts with  --  PDF2
19 SEC  --  interacts with  --  AT5G38420  --  interacts with  --  AT5G28050
20 SEC  --  interacts with  --  AT5G38420  --  interacts with  --  LSU1
21 SEC  --  interacts with  --  AT5G38420  --  interacts with  --  AtTCP11; TCP11
22 SEC  --  interacts with  --  AT5G38420  --  interacts with  --  BLH1; EDA29
23 SEC  --  interacts with  --  AT5G38420  --  interacts with  --  ATHDG11; EDT1; HDG11
24 SEC  --  interacts with  --  AT5G38420  --  interacts with  --  AtTCP15; TCP15
25 SEC  --  interacts with  --  AT5G38420  --  interacts with  --  AT5G11980
26 SEC  --  interacts with  --  AT5G38420  --  has similar expression pattern (mutual information value=1.02909) with  --  DRT112; PETE2
27 SEC  --  interacts with  --  AT5G38420  --  has similar expression pattern (mutual information value=1.02964) with  --  AT5G28450
28 SEC  --  interacts with  --  AT5G38420  --  has similar expression pattern (mutual information value=1.02964) with  --  LHCA2
29 SEC  --  interacts with  --  MOM; MOM; MOM1  --  interacts with  --  AT5G13810
30 SEC  --  interacts with  --  MOM; MOM; MOM1  --  interacts with  --  ATSUMO2; SUM2; SUMO 2; SUMO2
31 SEC  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  ALDH22A1
32 SEC  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT3G59440
33 SEC  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT3G59320
34 SEC  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  CP33; PDE322
35 SEC  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  CPK13
36 SEC  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  ATG4; CHLG; G4; PDE325
37 SEC  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT3G51730
38 SEC  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  FERONIA
39 SEC  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  BAM2
40 SEC  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT3G49560
41 SEC  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT3G44160
42 SEC  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT3G43630
43 SEC  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT3G36659
44 SEC  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT3G22845
45 SEC  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT3G19300
46 SEC  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AtHrd1A; Hrd1A
47 SEC  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT3G13070
48 SEC  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  SRF4
49 SEC  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT3G11325
50 SEC  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT3G09700
51 SEC  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  LAC7
52 SEC  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  ATERDJ3A; TMS1
53 SEC  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT3G08610
54 SEC  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  ATCSLC06; ATCSLC6; CSLC06; CSLC6
55 SEC  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  ATDCL2; DCL2
56 SEC  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  ATPDI11; ATPDIL2-1; MEE30; PDI11; UNE5
57 SEC  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  CER8; LACS1
58 SEC  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT2G46493
59 SEC  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  TIF3I1; TRIP-1
60 SEC  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  SEC61 BETA
61 SEC  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT2G44920
62 SEC  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT2G44581
63 SEC  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT2G44578
64 SEC  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  ATOEP37; OEP37
65 SEC  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AtPP5; PAPP5; PP5; PP5.2
66 SEC  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  ATOEP16-3; OEP16-3
67 SEC  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  TPR15
68 SEC  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT2G41000
69 SEC  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  ATSZF2; CZF1; SZF2; ZFAR1
70 SEC  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  LHCB4.3
71 SEC  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT2G39630
72 SEC  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT2G38195
73 SEC  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT2G38185
74 SEC  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AKR4C8
75 SEC  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  ATTIM17-2; TIM17; TIM17-2
76 SEC  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT2G37050
77 SEC  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT2G35330
78 SEC  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT2G34560
79 SEC  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  LCR75; LCR79
80 SEC  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  LCR76
81 SEC  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT2G30940
82 SEC  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AtVSR2; BP80-1;2; VSR1;2; VSR2
83 SEC  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  ATCYP5; CYP19-4; CYP5
84 SEC  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT2G25570
85 SEC  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT2G25220
86 SEC  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  UBP19
87 SEC  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT2G24420
88 SEC  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  ALDH11A3
89 SEC  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT2G23450
90 SEC  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  ATRER1C1
91 SEC  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT2G23140
92 SEC  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  UBA1A
93 SEC  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  UFD1
94 SEC  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  ATSYTA; NTMC2T1.1; NTMC2TYPE1.1; SYT1; SYTA
95 SEC  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT2G19880
96 SEC  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT2G18240
97 SEC  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT2G17500
98 SEC  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT2G16960
99 SEC  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  ATTRN1; TRN1
100 SEC  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT2G16940
101 SEC  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT2G16460
102 SEC  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  ATVSR3; BP80-2;2; VSR2;2; VSR3; VSR3
103 SEC  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  BP80-2;1; MTV4; VSR2;1; VSR4
104 SEC  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  ALDH6B2
105 SEC  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  ELF8; VIP6
106 SEC  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT2G05810
107 SEC  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  ATG8D
108 SEC  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  LACS8
109 SEC  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  ATUPS3; UPS3
110 SEC  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT2G03140
111 SEC  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT2G02370
112 SEC  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  LCR73
113 SEC  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  ATMAP65-6; MAP65-6
114 SEC  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AHK4
   Funding by the National Science Foundation    Funding by the Oklahoma Center for the Advancement of Science & Technology    Additional funding by the Samuel Roberts Noble Foundation

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