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A Graph Search-Empowered Integrative Database of Arabidopsis Signaling Transduction, Metabolism and Gene Regulation Networks   
Location:  Home > Details for node UFD1
Type: Protein GRN ID: np23495 Name: UFD1
Annotation: UFD1 | ubiquitin fusion degradation 1 [TCDB:1.F.1.1] [TCDB:3.A.16.1] [TCDB:9.A.42.1] [TCDB:9.A.48.1] [TCDB:9.A.5.1]
Gene Locus: AT2G21270
Gene Expression (Affy ATH1 probeset): 263756_at    
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 as format     
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 Protein modification
 Protein-protein interaction
        also include predicted relationship
 Compound-protein interaction
 TF-target gene regulation
 Small RNA-target regulation
        also include predicted relationship
 Carrier and transported molecule
 Catalytic chemical reaction
 Co-expressed gene pair
        with mutual information value >

  Ignore nodes having > relationships
 
Relationship type:  protein modification     catalytic chemical reaction     protein-protein interaction    
compound-protein interaction     TF-target gene regulation     small RNA-target regulation    
co-expressed gene pair     carrier and transported molecule     family/complex and member
Relationship evidence:  Solid line: validated          Dashed line: predicted
Relationship direction: Arrow: positive          T shape: negative          None arrow: unknown or n/a
Hormone association: Thicker line: hormone related relationship         : hormone related Node
Node type:  Transcription factor or transcriptional regulator       Compound       Kinase
 Small regulatory RNA (miRNA & ta-siRNA)       Other nodes
No. Path
2 UFD1  --  interacts with  --  ATPI4K GAMMA 4; PI4K GAMMA 4; UBDK GAMMA 4
3 UFD1  --  transport  --  Polypeptide
4 UFD1  --  interacts with  --  ATPI4K GAMMA 4; PI4K GAMMA 4; UBDK GAMMA 4  --  interacts with  --  CPK13
5 UFD1  --  interacts with  --  ATPI4K GAMMA 4; PI4K GAMMA 4; UBDK GAMMA 4  --  interacts with  --  NDL1
6 UFD1  --  interacts with  --  ATPI4K GAMMA 4; PI4K GAMMA 4; UBDK GAMMA 4  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.835876) with  --  ANAC062; NAC062; NTL6
7 UFD1  --  interacts with  --  ATPI4K GAMMA 4; PI4K GAMMA 4; UBDK GAMMA 4  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.811376) with  --  scpl35
8 UFD1  --  interacts with  --  ATPI4K GAMMA 4; PI4K GAMMA 4; UBDK GAMMA 4  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.814931) with  --  AT5G11650
9 UFD1  --  interacts with  --  ATPI4K GAMMA 4; PI4K GAMMA 4; UBDK GAMMA 4  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.882529) with  --  ALX8; ATSAL1; FRY1; HOS2; RON1; SAL1
10 UFD1  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  ALDH22A1
11 UFD1  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  LHCA2
12 UFD1  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT3G59440
13 UFD1  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT3G59320
14 UFD1  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  CP33; PDE322
15 UFD1  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  ATG4; CHLG; G4; PDE325
16 UFD1  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT3G51730
17 UFD1  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  FERONIA
18 UFD1  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  BAM2
19 UFD1  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT3G49560
20 UFD1  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT3G44160
21 UFD1  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT3G43630
22 UFD1  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT3G36659
23 UFD1  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT3G22845
24 UFD1  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT3G19300
25 UFD1  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AtHrd1A; Hrd1A
26 UFD1  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT3G13070
27 UFD1  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  SRF4
28 UFD1  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT3G11325
29 UFD1  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT3G09700
30 UFD1  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  LAC7
31 UFD1  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  ATERDJ3A; TMS1
32 UFD1  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT3G08610
33 UFD1  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  ATCSLC06; ATCSLC6; CSLC06; CSLC6
34 UFD1  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  SEC
35 UFD1  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  ATDCL2; DCL2
36 UFD1  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  ATPDI11; ATPDIL2-1; MEE30; PDI11; UNE5
37 UFD1  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  CER8; LACS1
38 UFD1  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT2G46493
39 UFD1  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  TIF3I1; TRIP-1
40 UFD1  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  SEC61 BETA
41 UFD1  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT2G44920
42 UFD1  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT2G44581
43 UFD1  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT2G44578
44 UFD1  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  ATOEP37; OEP37
45 UFD1  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AtPP5; PAPP5; PP5; PP5.2
46 UFD1  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  ATOEP16-3; OEP16-3
47 UFD1  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  TPR15
48 UFD1  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT2G41000
49 UFD1  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  ATSZF2; CZF1; SZF2; ZFAR1
50 UFD1  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  LHCB4.3
51 UFD1  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT2G39630
52 UFD1  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT2G38195
53 UFD1  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT2G38185
54 UFD1  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AKR4C8
55 UFD1  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  ATTIM17-2; TIM17; TIM17-2
56 UFD1  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT2G37050
57 UFD1  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT2G35330
58 UFD1  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT2G34560
59 UFD1  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  LCR75; LCR79
60 UFD1  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  LCR76
61 UFD1  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT2G30940
62 UFD1  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AtVSR2; BP80-1;2; VSR1;2; VSR2
63 UFD1  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  ATCYP5; CYP19-4; CYP5
64 UFD1  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT2G25570
65 UFD1  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT2G25220
66 UFD1  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  UBP19
67 UFD1  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT2G24420
68 UFD1  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  ALDH11A3
69 UFD1  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT2G23450
70 UFD1  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  ATRER1C1
71 UFD1  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT2G23140
72 UFD1  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  UBA1A
73 UFD1  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  ATSYTA; NTMC2T1.1; NTMC2TYPE1.1; SYT1; SYTA
74 UFD1  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT2G19880
75 UFD1  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT2G18240
76 UFD1  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT2G17500
77 UFD1  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT2G16960
78 UFD1  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  ATTRN1; TRN1
79 UFD1  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT2G16940
80 UFD1  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT2G16460
81 UFD1  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  ATVSR3; BP80-2;2; VSR2;2; VSR3; VSR3
82 UFD1  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  BP80-2;1; MTV4; VSR2;1; VSR4
83 UFD1  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  ALDH6B2
84 UFD1  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  ELF8; VIP6
85 UFD1  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT2G05810
86 UFD1  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  ATG8D
87 UFD1  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  LACS8
88 UFD1  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  ATUPS3; UPS3
89 UFD1  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT2G03140
90 UFD1  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT2G02370
91 UFD1  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  LCR73
92 UFD1  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  ATMAP65-6; MAP65-6
93 UFD1  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AHK4
   Funding by the National Science Foundation    Funding by the Oklahoma Center for the Advancement of Science & Technology    Additional funding by the Samuel Roberts Noble Foundation

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