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A Graph Search-Empowered Integrative Database of Arabidopsis Signaling Transduction, Metabolism and Gene Regulation Networks   
Location:  Home > Details for node LHCB4.3
Type: Protein GRN ID: np20001 Name: LHCB4.3
Annotation: LHCB4.3 | light harvesting complex photosystem II [TCDB:1.F.1.1] [TCDB:3.A.1.14] [TCDB:3.A.16.1] [TCDB:9.A.5.1]
Gene Locus: AT2G40100
Gene Expression (Affy ATH1 probeset): 265722_at    
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 as format     
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 Protein modification
 Protein-protein interaction
        also include predicted relationship
 Compound-protein interaction
 TF-target gene regulation
 Small RNA-target regulation
        also include predicted relationship
 Carrier and transported molecule
 Catalytic chemical reaction
 Co-expressed gene pair
        with mutual information value >

  Ignore nodes having > relationships
 
Relationship type:  protein modification     catalytic chemical reaction     protein-protein interaction    
compound-protein interaction     TF-target gene regulation     small RNA-target regulation    
co-expressed gene pair     carrier and transported molecule     family/complex and member
Relationship evidence:  Solid line: validated          Dashed line: predicted
Relationship direction: Arrow: positive          T shape: negative          None arrow: unknown or n/a
Hormone association: Thicker line: hormone related relationship         : hormone related Node
Node type:  Transcription factor or transcriptional regulator       Compound       Kinase
 Small regulatory RNA (miRNA & ta-siRNA)       Other nodes
No. Path
2 LHCB4.3  --  transport  --  Ferrichrome
3 LHCB4.3  --  transport  --  Fe(III)hydroxamate
4 LHCB4.3  --  transport  --  Aerobactin
5 LHCB4.3  --  transport  --  Polypeptide
6 LHCB4.3  --  transport  --  Ferrichrome  --  is transported by  --  AT2G37220
7 LHCB4.3  --  transport  --  Ferrichrome  --  is transported by  --  ATVAMP723; VAMP723; VAMP723
8 LHCB4.3  --  transport  --  Ferrichrome  --  is transported by  --  AT2G24040
9 LHCB4.3  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  ALDH22A1
10 LHCB4.3  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  LHCA2
11 LHCB4.3  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT3G59440
12 LHCB4.3  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT3G59320
13 LHCB4.3  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  CP33; PDE322
14 LHCB4.3  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  CPK13
15 LHCB4.3  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  ATG4; CHLG; G4; PDE325
16 LHCB4.3  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT3G51730
17 LHCB4.3  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  FERONIA
18 LHCB4.3  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  BAM2
19 LHCB4.3  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT3G49560
20 LHCB4.3  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT3G44160
21 LHCB4.3  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT3G43630
22 LHCB4.3  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT3G36659
23 LHCB4.3  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT3G22845
24 LHCB4.3  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT3G19300
25 LHCB4.3  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AtHrd1A; Hrd1A
26 LHCB4.3  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT3G13070
27 LHCB4.3  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  SRF4
28 LHCB4.3  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT3G11325
29 LHCB4.3  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT3G09700
30 LHCB4.3  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  LAC7
31 LHCB4.3  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  ATERDJ3A; TMS1
32 LHCB4.3  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT3G08610
33 LHCB4.3  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  ATCSLC06; ATCSLC6; CSLC06; CSLC6
34 LHCB4.3  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  SEC
35 LHCB4.3  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  ATDCL2; DCL2
36 LHCB4.3  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  ATPDI11; ATPDIL2-1; MEE30; PDI11; UNE5
37 LHCB4.3  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  CER8; LACS1
38 LHCB4.3  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT2G46493
39 LHCB4.3  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  TIF3I1; TRIP-1
40 LHCB4.3  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  SEC61 BETA
41 LHCB4.3  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT2G44920
42 LHCB4.3  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT2G44581
43 LHCB4.3  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT2G44578
44 LHCB4.3  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  ATOEP37; OEP37
45 LHCB4.3  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AtPP5; PAPP5; PP5; PP5.2
46 LHCB4.3  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  ATOEP16-3; OEP16-3
47 LHCB4.3  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  TPR15
48 LHCB4.3  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT2G41000
49 LHCB4.3  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  ATSZF2; CZF1; SZF2; ZFAR1
50 LHCB4.3  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT2G39630
51 LHCB4.3  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT2G38195
52 LHCB4.3  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT2G38185
53 LHCB4.3  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AKR4C8
54 LHCB4.3  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  ATTIM17-2; TIM17; TIM17-2
55 LHCB4.3  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT2G37050
56 LHCB4.3  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT2G35330
57 LHCB4.3  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT2G34560
58 LHCB4.3  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  LCR75; LCR79
59 LHCB4.3  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  LCR76
60 LHCB4.3  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT2G30940
61 LHCB4.3  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AtVSR2; BP80-1;2; VSR1;2; VSR2
62 LHCB4.3  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  ATCYP5; CYP19-4; CYP5
63 LHCB4.3  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT2G25570
64 LHCB4.3  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT2G25220
65 LHCB4.3  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  UBP19
66 LHCB4.3  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT2G24420
67 LHCB4.3  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  ALDH11A3
68 LHCB4.3  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT2G23450
69 LHCB4.3  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  ATRER1C1
70 LHCB4.3  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT2G23140
71 LHCB4.3  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  UBA1A
72 LHCB4.3  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  UFD1
73 LHCB4.3  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  ATSYTA; NTMC2T1.1; NTMC2TYPE1.1; SYT1; SYTA
74 LHCB4.3  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT2G19880
75 LHCB4.3  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT2G18240
76 LHCB4.3  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT2G17500
77 LHCB4.3  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT2G16960
78 LHCB4.3  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  ATTRN1; TRN1
79 LHCB4.3  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT2G16940
80 LHCB4.3  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT2G16460
81 LHCB4.3  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  ATVSR3; BP80-2;2; VSR2;2; VSR3; VSR3
82 LHCB4.3  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  BP80-2;1; MTV4; VSR2;1; VSR4
83 LHCB4.3  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  ALDH6B2
84 LHCB4.3  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  ELF8; VIP6
85 LHCB4.3  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT2G05810
86 LHCB4.3  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  ATG8D
87 LHCB4.3  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  LACS8
88 LHCB4.3  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  ATUPS3; UPS3
89 LHCB4.3  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT2G03140
90 LHCB4.3  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT2G02370
91 LHCB4.3  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  LCR73
92 LHCB4.3  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  ATMAP65-6; MAP65-6
93 LHCB4.3  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AHK4
   Funding by the National Science Foundation    Funding by the Oklahoma Center for the Advancement of Science & Technology    Additional funding by the Samuel Roberts Noble Foundation

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