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A Graph Search-Empowered Integrative Database of Arabidopsis Signaling Transduction, Metabolism and Gene Regulation Networks   
Location:  Home > Details for node SRF4
Type: Protein GRN ID: np24194 Name: SRF4
Annotation: SRF4 | STRUBBELIG-receptor family 4 [TCDB:3.A.16.1] [TCDB:9.A.5.1]
Gene Locus: AT3G13065
Gene Expression (Affy ATH1 probeset): 257850_at    
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 as format     
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 Protein modification
 Protein-protein interaction
        also include predicted relationship
 Compound-protein interaction
 TF-target gene regulation
 Small RNA-target regulation
        also include predicted relationship
 Carrier and transported molecule
 Catalytic chemical reaction
 Co-expressed gene pair
        with mutual information value >

  Ignore nodes having > relationships
 
Relationship type:  protein modification     catalytic chemical reaction     protein-protein interaction    
compound-protein interaction     TF-target gene regulation     small RNA-target regulation    
co-expressed gene pair     carrier and transported molecule     family/complex and member
Relationship evidence:  Solid line: validated          Dashed line: predicted
Relationship direction: Arrow: positive          T shape: negative          None arrow: unknown or n/a
Hormone association: Thicker line: hormone related relationship         : hormone related Node
Node type:  Transcription factor or transcriptional regulator       Compound       Kinase
 Small regulatory RNA (miRNA & ta-siRNA)       Other nodes
No. Path
2 SRF4  --  interacts with  --  AT4G01450
3 SRF4  --  transport  --  Polypeptide
4 SRF4  --  interacts with  --  AT4G01450  --  interacts with  --  ATRBL2; RBL2
5 SRF4  --  interacts with  --  AT4G01450  --  interacts with  --  AT3G62560
6 SRF4  --  interacts with  --  AT4G01450  --  interacts with  --  PGPS2
7 SRF4  --  interacts with  --  AT4G01450  --  interacts with  --  AT3G07680
8 SRF4  --  interacts with  --  AT4G01450  --  transport  --  Sugar
9 SRF4  --  interacts with  --  AT4G01450  --  transport  --  Phosphorus
10 SRF4  --  interacts with  --  AT4G01450  --  transport  --  Dicarboxylate
11 SRF4  --  interacts with  --  AT4G01450  --  transport  --  D-Glyceraldehyde 3-phosphate
12 SRF4  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  ALDH22A1
13 SRF4  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  LHCA2
14 SRF4  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT3G59440
15 SRF4  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT3G59320
16 SRF4  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  CP33; PDE322
17 SRF4  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  CPK13
18 SRF4  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  ATG4; CHLG; G4; PDE325
19 SRF4  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT3G51730
20 SRF4  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  FERONIA
21 SRF4  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  BAM2
22 SRF4  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT3G49560
23 SRF4  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT3G44160
24 SRF4  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT3G43630
25 SRF4  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT3G36659
26 SRF4  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT3G22845
27 SRF4  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT3G19300
28 SRF4  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AtHrd1A; Hrd1A
29 SRF4  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT3G13070
30 SRF4  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT3G11325
31 SRF4  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT3G09700
32 SRF4  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  LAC7
33 SRF4  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  ATERDJ3A; TMS1
34 SRF4  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT3G08610
35 SRF4  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  ATCSLC06; ATCSLC6; CSLC06; CSLC6
36 SRF4  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  SEC
37 SRF4  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  ATDCL2; DCL2
38 SRF4  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  ATPDI11; ATPDIL2-1; MEE30; PDI11; UNE5
39 SRF4  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  CER8; LACS1
40 SRF4  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT2G46493
41 SRF4  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  TIF3I1; TRIP-1
42 SRF4  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  SEC61 BETA
43 SRF4  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT2G44920
44 SRF4  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT2G44581
45 SRF4  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT2G44578
46 SRF4  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  ATOEP37; OEP37
47 SRF4  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AtPP5; PAPP5; PP5; PP5.2
48 SRF4  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  ATOEP16-3; OEP16-3
49 SRF4  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  TPR15
50 SRF4  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT2G41000
51 SRF4  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  ATSZF2; CZF1; SZF2; ZFAR1
52 SRF4  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  LHCB4.3
53 SRF4  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT2G39630
54 SRF4  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT2G38195
55 SRF4  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT2G38185
56 SRF4  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AKR4C8
57 SRF4  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  ATTIM17-2; TIM17; TIM17-2
58 SRF4  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT2G37050
59 SRF4  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT2G35330
60 SRF4  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT2G34560
61 SRF4  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  LCR75; LCR79
62 SRF4  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  LCR76
63 SRF4  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT2G30940
64 SRF4  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AtVSR2; BP80-1;2; VSR1;2; VSR2
65 SRF4  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  ATCYP5; CYP19-4; CYP5
66 SRF4  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT2G25570
67 SRF4  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT2G25220
68 SRF4  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  UBP19
69 SRF4  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT2G24420
70 SRF4  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  ALDH11A3
71 SRF4  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT2G23450
72 SRF4  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  ATRER1C1
73 SRF4  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT2G23140
74 SRF4  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  UBA1A
75 SRF4  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  UFD1
76 SRF4  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  ATSYTA; NTMC2T1.1; NTMC2TYPE1.1; SYT1; SYTA
77 SRF4  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT2G19880
78 SRF4  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT2G18240
79 SRF4  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT2G17500
80 SRF4  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT2G16960
81 SRF4  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  ATTRN1; TRN1
82 SRF4  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT2G16940
83 SRF4  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT2G16460
84 SRF4  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  ATVSR3; BP80-2;2; VSR2;2; VSR3; VSR3
85 SRF4  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  BP80-2;1; MTV4; VSR2;1; VSR4
86 SRF4  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  ALDH6B2
87 SRF4  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  ELF8; VIP6
88 SRF4  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT2G05810
89 SRF4  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  ATG8D
90 SRF4  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  LACS8
91 SRF4  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  ATUPS3; UPS3
92 SRF4  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT2G03140
93 SRF4  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AT2G02370
94 SRF4  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  LCR73
95 SRF4  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  ATMAP65-6; MAP65-6
96 SRF4  --  transport  --  Polypeptide  --  is transported by  --  AHK4
   Funding by the National Science Foundation    Funding by the Oklahoma Center for the Advancement of Science & Technology    Additional funding by the Samuel Roberts Noble Foundation

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