Screen Resolution:     
Welcome to HRGRN
A Graph Search-Empowered Integrative Database of Arabidopsis Signaling Transduction, Metabolism and Gene Regulation Networks   
Location:  Home > Details for node KNAT3
Type: Protein GRN ID: np38134 Name: KNAT3
Annotation: KNAT3 | KNOTTED1-like homeobox gene 3
Gene Locus: AT5G25220
Transcription factor /
transcriptional regulator:		 transcription factor family Homeodomain-TALE-KNOX
Gene Expression (Affy ATH1 probeset): 246930_at    
Graph Customization
   
Choose color for highlight:  
Display edge: validated and predicted
Display node/edge prompt:
Layout:
 as format     
Data Filter
 Protein modification
 Protein-protein interaction
        also include predicted relationship
 Compound-protein interaction
 TF-target gene regulation
 Small RNA-target regulation
        also include predicted relationship
 Carrier and transported molecule
 Catalytic chemical reaction
 Co-expressed gene pair
        with mutual information value >

  Ignore nodes having > relationships
 
Relationship type:  protein modification     catalytic chemical reaction     protein-protein interaction    
compound-protein interaction     TF-target gene regulation     small RNA-target regulation    
co-expressed gene pair     carrier and transported molecule     family/complex and member
Relationship evidence:  Solid line: validated          Dashed line: predicted
Relationship direction: Arrow: positive          T shape: negative          None arrow: unknown or n/a
Hormone association: Thicker line: hormone related relationship         : hormone related Node
Node type:  Transcription factor or transcriptional regulator       Compound       Kinase
 Small regulatory RNA (miRNA & ta-siRNA)       Other nodes
No. Path
2 KNAT3  --  interacts with  --  KNAT4
3 KNAT3  --  interacts with  --  ATOFP2; OFP2
4 KNAT3  --  interacts with  --  ATOFP1; OFP1
5 KNAT3  --  interacts with  --  ATOFP4; OFP4
6 KNAT3  --  interacts with  --  ATOFP12; OFP12
7 KNAT3  --  interacts with  --  ATOFP14; OFP14
8 KNAT3  --  interacts with  --  CIB5
9 KNAT3  --  interacts with  --  APA1; ATAPA1
10 KNAT3  --  interacts with  --  BSH; CHE1
11 KNAT3  --  interacts with  --  CHR3; SYD
12 KNAT3  --  interacts with  --  ATSWI3B?
13 KNAT3  --  interacts with  --  AT4G37130
14 KNAT3  --  interacts with  --  EMB2819
15 KNAT3  --  interacts with  --  BLH9; BLR; HB-6; LSN; PNY; RPL; VAN
16 KNAT3  --  interacts with  --  BLH7
17 KNAT3  --  interacts with  --  BLH6
18 KNAT3  --  interacts with  --  BLH5
19 KNAT3  --  interacts with  --  BLH4; SAW2
20 KNAT3  --  interacts with  --  BLH3
21 KNAT3  --  interacts with  --  BLH2; SAW1
22 KNAT3  --  interacts with  --  BLH1; EDA29
23 KNAT3  --  interacts with  --  KNAT4  --  interacts with  --  IXR11; KNAT7
24 KNAT3  --  interacts with  --  KNAT4  --  interacts with  --  BP; BP1; KNAT1
25 KNAT3  --  interacts with  --  KNAT4  --  interacts with  --  ATH1
26 KNAT3  --  interacts with  --  KNAT4  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.809678) with  --  ATHPT; HPT1; TPT1; VTE2
27 KNAT3  --  interacts with  --  KNAT4  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.888755) with  --  AT2G14080
28 KNAT3  --  interacts with  --  KNAT4  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.836738) with  --  APG2; PGA2; TATC; UNE3
29 KNAT3  --  interacts with  --  KNAT4  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.816963) with  --  ARC12; ATMINE1; MINE1
30 KNAT3  --  interacts with  --  KNAT4  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.827543) with  --  AT1G35420
31 KNAT3  --  interacts with  --  KNAT4  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.825636) with  --  STN7
32 KNAT3  --  interacts with  --  KNAT4  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.895051) with  --  AT1G66130
33 KNAT3  --  interacts with  --  KNAT4  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.820198) with  --  AT3G53470
34 KNAT3  --  interacts with  --  KNAT4  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.892221) with  --  GSTL3
35 KNAT3  --  interacts with  --  KNAT4  --  has similar expression pattern (mutual information value=1.03159) with  --  AT5G05880
36 KNAT3  --  interacts with  --  KNAT4  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.835049) with  --  AT5G38980
37 KNAT3  --  interacts with  --  KNAT4  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.977459) with  --  ATFRO8; FRO8
38 KNAT3  --  interacts with  --  KNAT4  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.827518) with  --  CP1
39 KNAT3  --  interacts with  --  KNAT4  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.871116) with  --  CSK
40 KNAT3  --  interacts with  --  ATOFP2; OFP2  --  interacts with  --  KNAT6; KNAT6L; KNAT6S
41 KNAT3  --  interacts with  --  ATOFP2; OFP2  --  interacts with  --  BEL10; BLH10
42 KNAT3  --  interacts with  --  ATOFP1; OFP1  --  interacts with  --  ATKU70; KU70
43 KNAT3  --  interacts with  --  ATOFP1; OFP1  --  interacts with  --  BEL1
44 KNAT3  --  interacts with  --  ATOFP12; OFP12  --  interacts with  --  ATK1; KNAT2
45 KNAT3  --  interacts with  --  CIB5  --  interacts with  --  CIB1
46 KNAT3  --  interacts with  --  CIB5  --  interacts with  --  AT-PHH1; ATCRY2; CRY2; FHA; PHH1
47 KNAT3  --  interacts with  --  APA1; ATAPA1  --  transport  --  UDP-N-acetyl-D-galactosamine
48 KNAT3  --  interacts with  --  APA1; ATAPA1  --  transport  --  UDP-glucuronate
49 KNAT3  --  interacts with  --  BSH; CHE1  --  interacts with  --  AT1G51120
50 KNAT3  --  interacts with  --  BSH; CHE1  --  interacts with  --  TCP5
51 KNAT3  --  interacts with  --  BSH; CHE1  --  interacts with  --  AT-TCP20; ATTCP20; PCF1; TCP20
52 KNAT3  --  interacts with  --  BSH; CHE1  --  interacts with  --  TCP8
53 KNAT3  --  interacts with  --  BSH; CHE1  --  interacts with  --  STOP1
54 KNAT3  --  interacts with  --  CHR3; SYD  --  interacts with  --  LBD35
55 KNAT3  --  interacts with  --  CHR3; SYD  --  interacts with  --  LBD40
56 KNAT3  --  interacts with  --  CHR3; SYD  --  interacts with  --  ARF18
57 KNAT3  --  interacts with  --  CHR3; SYD  --  interacts with  --  ARF3
58 KNAT3  --  interacts with  --  CHR3; SYD  --  interacts with  --  HSI2; VAL1
59 KNAT3  --  interacts with  --  CHR3; SYD  --  interacts with  --  AT1G50680
60 KNAT3  --  interacts with  --  CHR3; SYD  --  interacts with  --  ATE2FA; E2F3
61 KNAT3  --  interacts with  --  CHR3; SYD  --  interacts with  --  HMGB4; NFD04; NFD4
62 KNAT3  --  interacts with  --  CHR3; SYD  --  interacts with  --  AT5G51910
63 KNAT3  --  interacts with  --  CHR3; SYD  --  interacts with  --  TCP16
64 KNAT3  --  interacts with  --  CHR3; SYD  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD
65 KNAT3  --  interacts with  --  CHR3; SYD  --  interacts with  --  AT1G72010
66 KNAT3  --  interacts with  --  CHR3; SYD  --  interacts with  --  TCP3
67 KNAT3  --  interacts with  --  CHR3; SYD  --  interacts with  --  FAF1
68 KNAT3  --  interacts with  --  CHR3; SYD  --  interacts with  --  AT1G76870
69 KNAT3  --  interacts with  --  CHR3; SYD  --  interacts with  --  ARLIM15; ATDMC1; DMC1
70 KNAT3  --  interacts with  --  CHR3; SYD  --  interacts with  --  NF-YA5; NFYA5
71 KNAT3  --  interacts with  --  CHR3; SYD  --  interacts with  --  AT2G26940
72 KNAT3  --  interacts with  --  CHR3; SYD  --  interacts with  --  anac046; NAC046
73 KNAT3  --  interacts with  --  CHR3; SYD  --  interacts with  --  RSL4
74 KNAT3  --  interacts with  --  CHR3; SYD  --  interacts with  --  RSL2
75 KNAT3  --  interacts with  --  CHR3; SYD  --  interacts with  --  TOE2
76 KNAT3  --  interacts with  --  CHR3; SYD  --  interacts with  --  Rap2.6L
77 KNAT3  --  interacts with  --  CHR3; SYD  --  interacts with  --  AtbZIP70; bZIP70
78 KNAT3  --  interacts with  --  CHR3; SYD  --  interacts with  --  ATBZIP42; bZIP42
79 KNAT3  --  interacts with  --  CHR3; SYD  --  interacts with  --  AtbZIP3; bZIP3
80 KNAT3  --  interacts with  --  CHR3; SYD  --  interacts with  --  LFY
81 KNAT3  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  ASL16; LBD29
82 KNAT3  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  AT3G24860
83 KNAT3  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  AtHAM4; HAM4
84 KNAT3  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  AT3G50650
85 KNAT3  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  SCL1
86 KNAT3  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  AT-HSFA6A; HSFA6A
87 KNAT3  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  AT-HSFA3; HSFA3
88 KNAT3  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  PHL1
89 KNAT3  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  AT5G06800
90 KNAT3  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  AtIDD16; IDD16
91 KNAT3  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  AT1G48150
92 KNAT3  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  HB-1
93 KNAT3  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  ATHB40; HB-5; HB40
94 KNAT3  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  anac032; NAC032
95 KNAT3  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  AT1G72210
96 KNAT3  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  AT1G22490
97 KNAT3  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  AT3G61950
98 KNAT3  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  BHLH42; TT8
99 KNAT3  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  ATMYC2
100 KNAT3  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  AT2G22760
101 KNAT3  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  NAI1
102 KNAT3  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  AT1G06170
103 KNAT3  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  AT2G42280
104 KNAT3  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  AT1G51140
105 KNAT3  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  AT1G35460
106 KNAT3  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  HEC1
107 KNAT3  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  UNE12
108 KNAT3  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  LRL3
109 KNAT3  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  ATRSL1; RSL1
110 KNAT3  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  ATWRKY53
111 KNAT3  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  ATWRKY44; DSL1; TTG2; WRKY44
112 KNAT3  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  ATBET10; BET10
113 KNAT3  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  AT4G17780
114 KNAT3  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  ATMYB64; ATMYB92; MYB92
115 KNAT3  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  ATMYB35; TDF1
116 KNAT3  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  ATMYB26; MS35; MYB26
117 KNAT3  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  ATMYB122; MYB122
118 KNAT3  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  AtMYB60; MYB60
119 KNAT3  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  AtMYB41; MYB41
120 KNAT3  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  CRF6
121 KNAT3  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  AT2G22200
122 KNAT3  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  ATERF38; ERF38
123 KNAT3  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  RAP2.1
124 KNAT3  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  bZIP19
125 KNAT3  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  OBF4
126 KNAT3  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  AtbZIP52; bZIP52
127 KNAT3  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  ATBZIP2; bZIP2; GBF5
128 KNAT3  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  AT1G60250
129 KNAT3  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  AT4G15250
130 KNAT3  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  CO; FG
131 KNAT3  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  FCA
132 KNAT3  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  ABI1 family46, coding gene
133 KNAT3  --  interacts with  --  AT4G37130  --  interacts with  --  AT4G30100
134 KNAT3  --  interacts with  --  AT4G37130  --  interacts with  --  AtPPR2; EMB2750; PPR2
135 KNAT3  --  interacts with  --  AT4G37130  --  interacts with  --  AT3G10250
136 KNAT3  --  interacts with  --  AT4G37130  --  interacts with  --  AT1G49700
137 KNAT3  --  interacts with  --  AT4G37130  --  interacts with  --  DHS2
138 KNAT3  --  interacts with  --  AT4G37130  --  interacts with  --  AtBRCC36A; BRCC36A
139 KNAT3  --  interacts with  --  AT4G37130  --  interacts with  --  ATPC1
140 KNAT3  --  interacts with  --  AT4G37130  --  interacts with  --  AT2G15960
141 KNAT3  --  interacts with  --  AT4G37130  --  interacts with  --  ATHY2; GUN3; HY2
142 KNAT3  --  interacts with  --  AT4G37130  --  interacts with  --  SHM4
143 KNAT3  --  interacts with  --  AT4G37130  --  interacts with  --  AT3G05270
144 KNAT3  --  interacts with  --  AT4G37130  --  interacts with  --  AT3G54630
145 KNAT3  --  interacts with  --  AT4G37130  --  interacts with  --  ATPCB; ATPERX34; PERX34; PRX34; PRXCB
146 KNAT3  --  interacts with  --  AT4G37130  --  interacts with  --  AT5G56160
147 KNAT3  --  interacts with  --  AT4G37130  --  interacts with  --  ACT2; DER1; ENL2; FIZ2; LSR2
148 KNAT3  --  interacts with  --  AT4G37130  --  interacts with  --  ATRHM1; RHM1; ROL1
149 KNAT3  --  interacts with  --  AT4G37130  --  interacts with  --  FTSH1
150 KNAT3  --  interacts with  --  AT4G37130  --  interacts with  --  AT5G58510
151 KNAT3  --  interacts with  --  AT4G37130  --  interacts with  --  AT4G26410
152 KNAT3  --  interacts with  --  AT4G37130  --  interacts with  --  AT5G03500
153 KNAT3  --  interacts with  --  AT4G37130  --  interacts with  --  AT1G21440
154 KNAT3  --  interacts with  --  AT4G37130  --  interacts with  --  AT1G79160
155 KNAT3  --  interacts with  --  AT4G37130  --  interacts with  --  AT3G20720
156 KNAT3  --  interacts with  --  AT4G37130  --  interacts with  --  AT1G79010
157 KNAT3  --  interacts with  --  AT4G37130  --  interacts with  --  ATMYB75; MYB75; PAP1; SIAA1
158 KNAT3  --  interacts with  --  AT4G37130  --  interacts with  --  EMB2766
159 KNAT3  --  interacts with  --  AT4G37130  --  interacts with  --  ACT7
160 KNAT3  --  interacts with  --  AT4G37130  --  interacts with  --  ATVHA-C; DET3
161 KNAT3  --  interacts with  --  AT4G37130  --  interacts with  --  VPS28-1
162 KNAT3  --  interacts with  --  EMB2819  --  interacts with  --  AT5G65683
163 KNAT3  --  interacts with  --  EMB2819  --  interacts with  --  ATHSP23.6-MITO; HSP23.6-MITO
164 KNAT3  --  interacts with  --  EMB2819  --  interacts with  --  AT3G06530
165 KNAT3  --  interacts with  --  EMB2819  --  interacts with  --  AT5G03050
166 KNAT3  --  interacts with  --  EMB2819  --  interacts with  --  BOI; RING
167 KNAT3  --  interacts with  --  EMB2819  --  interacts with  --  AT3G08780
168 KNAT3  --  interacts with  --  EMB2819  --  interacts with  --  HLH1; PAR1
169 KNAT3  --  interacts with  --  EMB2819  --  interacts with  --  AT3G47675
170 KNAT3  --  interacts with  --  BLH9; BLR; HB-6; LSN; PNY; RPL; VAN  --  interacts with  --  BUM; BUM1; SHL; STM; WAM; WAM1
171 KNAT3  --  interacts with  --  BLH9; BLR; HB-6; LSN; PNY; RPL; VAN  --  regulates the expression of   --  AG
172 KNAT3  --  interacts with  --  BLH6  --  interacts with  --  ATOFP5; OFP5
173 KNAT3  --  interacts with  --  BLH4; SAW2  --  interacts with  --  ATHSPRO2; HSPRO2
174 KNAT3  --  interacts with  --  BLH4; SAW2  --  interacts with  --  AT1G30590
175 KNAT3  --  interacts with  --  BLH4; SAW2  --  interacts with  --  AHK4
176 KNAT3  --  interacts with  --  BLH4; SAW2  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.868079) with  --  TCP10
177 KNAT3  --  interacts with  --  BLH4; SAW2  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.820135) with  --  AT2G03980
178 KNAT3  --  interacts with  --  BLH4; SAW2  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.8086) with  --  FMA
179 KNAT3  --  interacts with  --  BLH4; SAW2  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.95613) with  --  ATMT3; MT3
180 KNAT3  --  interacts with  --  BLH4; SAW2  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.87301) with  --  AT4G00780
181 KNAT3  --  interacts with  --  BLH4; SAW2  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.908986) with  --  AT3G47295
182 KNAT3  --  interacts with  --  BLH4; SAW2  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.878211) with  --  iqd21
183 KNAT3  --  interacts with  --  BLH4; SAW2  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.917002) with  --  AT3G62820
184 KNAT3  --  interacts with  --  BLH4; SAW2  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.885753) with  --  AT5G18600
185 KNAT3  --  interacts with  --  BLH4; SAW2  --  is the target gene of  --  ath-miR447a.2-3p
186 KNAT3  --  interacts with  --  BLH4; SAW2  --  is the target gene of  --  ath-miR780.1
187 KNAT3  --  interacts with  --  BLH3  --  interacts with  --  ATOFP3; OFP3
188 KNAT3  --  interacts with  --  BLH3  --  interacts with  --  ATOFP15; OFP15
189 KNAT3  --  interacts with  --  BLH3  --  interacts with  --  AT5G04830
190 KNAT3  --  interacts with  --  BLH3  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.825947) with  --  PLA IIA; PLA2A; PLP2; PLP2
191 KNAT3  --  interacts with  --  BLH1; EDA29  --  interacts with  --  AT4G32190
192 KNAT3  --  interacts with  --  BLH1; EDA29  --  interacts with  --  AT5G38420
193 KNAT3  --  interacts with  --  BLH1; EDA29  --  interacts with  --  AT1G51580
194 KNAT3  --  interacts with  --  BLH1; EDA29  --  interacts with  --  BLOS1
195 KNAT3  --  interacts with  --  BLH1; EDA29  --  interacts with  --  CW7
196 KNAT3  --  interacts with  --  BLH1; EDA29  --  interacts with  --  AT2G21380
197 KNAT3  --  interacts with  --  BLH1; EDA29  --  interacts with  --  AT1G18660
   Funding by the National Science Foundation    Funding by the Oklahoma Center for the Advancement of Science & Technology    Additional funding by the Samuel Roberts Noble Foundation

Copyright © The Zhao Lab

Disclaimer | Contact