Screen Resolution:     
Welcome to HRGRN
A Graph Search-Empowered Integrative Database of Arabidopsis Signaling Transduction, Metabolism and Gene Regulation Networks   
Location:  Home > Details for node ATE2FA; E2F3
Type: Protein GRN ID: np23252 Name: ATE2FA; E2F3
Annotation: E2F3, ATE2FA | E2F transcription factor 3
Gene Locus: AT2G36010
Transcription factor /
transcriptional regulator:
transcription factor family E2F-DP
Gene Expression (Affy ATH1 probeset): 263955_at    
Graph Customization
   
Choose color for highlight:  
Display edge: validated and predicted
Display node/edge prompt:
Layout:
 as format     
Data Filter
 Protein modification
 Protein-protein interaction
        also include predicted relationship
 Compound-protein interaction
 TF-target gene regulation
 Small RNA-target regulation
        also include predicted relationship
 Carrier and transported molecule
 Catalytic chemical reaction
 Co-expressed gene pair
        with mutual information value >

  Ignore nodes having > relationships
 
Relationship type:  protein modification     catalytic chemical reaction     protein-protein interaction    
compound-protein interaction     TF-target gene regulation     small RNA-target regulation    
co-expressed gene pair     carrier and transported molecule     family/complex and member
Relationship evidence:  Solid line: validated          Dashed line: predicted
Relationship direction: Arrow: positive          T shape: negative          None arrow: unknown or n/a
Hormone association: Thicker line: hormone related relationship         : hormone related Node
Node type:  Transcription factor or transcriptional regulator       Compound       Kinase
 Small regulatory RNA (miRNA & ta-siRNA)       Other nodes
No. Path
2 ATE2FA; E2F3  --  is modified by  --  TOR
3 ATE2FA; E2F3  --  interacts with  --  ATDPB; DPB
4 ATE2FA; E2F3  --  interacts with  --  DPA
5 ATE2FA; E2F3  --  interacts with  --  CHR3; SYD
6 ATE2FA; E2F3  --  interacts with  --  AT;CDCKD;3; CAK2AT; CDKD1;3
7 ATE2FA; E2F3  --  interacts with  --  AT;CDKD;2; CAK4; CAK4AT; CDKD1;2; CDKD;2
8 ATE2FA; E2F3  --  interacts with  --  CDKB1;2
9 ATE2FA; E2F3  --  is modified by  --  TOR  --  modify  --  ATPK19; ATPK2; ATS6K2; S6K2
10 ATE2FA; E2F3  --  is modified by  --  TOR  --  modify  --  TAP46
11 ATE2FA; E2F3  --  is modified by  --  TOR  --  is modified by  --  EMB71; MAPKKK4; YDA
12 ATE2FA; E2F3  --  is modified by  --  TOR  --  is the target gene of  --  ath-miR5664
13 ATE2FA; E2F3  --  interacts with  --  ATDPB; DPB  --  interacts with  --  SKP2A
14 ATE2FA; E2F3  --  interacts with  --  ATDPB; DPB  --  interacts with  --  ATE2F2; ATE2FC; E2FC
15 ATE2FA; E2F3  --  interacts with  --  ATDPB; DPB  --  interacts with  --  ATE2FB; E2F1; E2FB
16 ATE2FA; E2F3  --  interacts with  --  ATDPB; DPB  --  interacts with  --  ETG1
17 ATE2FA; E2F3  --  interacts with  --  ATDPB; DPB  --  interacts with  --  CYCB2;3
18 ATE2FA; E2F3  --  interacts with  --  ATDPB; DPB  --  interacts with  --  CKS1; CKS1AT
19 ATE2FA; E2F3  --  interacts with  --  ATDPB; DPB  --  interacts with  --  CAK1AT; CDKF;1
20 ATE2FA; E2F3  --  interacts with  --  ATDPB; DPB  --  interacts with  --  CYC2BAT; CYC3B; CYCA2;2
21 ATE2FA; E2F3  --  interacts with  --  ATDPB; DPB  --  interacts with  --  CYCB3;1
22 ATE2FA; E2F3  --  interacts with  --  ATDPB; DPB  --  interacts with  --  CDKB2;1
23 ATE2FA; E2F3  --  interacts with  --  DPA  --  interacts with  --  AT1G06510
24 ATE2FA; E2F3  --  interacts with  --  DPA  --  interacts with  --  CYCD3;2
25 ATE2FA; E2F3  --  interacts with  --  DPA  --  interacts with  --  ATCYCD1;1; CYCD1;1
26 ATE2FA; E2F3  --  interacts with  --  DPA  --  is the target gene of  --  ath-miR397b
27 ATE2FA; E2F3  --  interacts with  --  CHR3; SYD  --  interacts with  --  LBD35
28 ATE2FA; E2F3  --  interacts with  --  CHR3; SYD  --  interacts with  --  LBD40
29 ATE2FA; E2F3  --  interacts with  --  CHR3; SYD  --  interacts with  --  ARF18
30 ATE2FA; E2F3  --  interacts with  --  CHR3; SYD  --  interacts with  --  ARF3
31 ATE2FA; E2F3  --  interacts with  --  CHR3; SYD  --  interacts with  --  HSI2; VAL1
32 ATE2FA; E2F3  --  interacts with  --  CHR3; SYD  --  interacts with  --  AT1G51120
33 ATE2FA; E2F3  --  interacts with  --  CHR3; SYD  --  interacts with  --  AT1G50680
34 ATE2FA; E2F3  --  interacts with  --  CHR3; SYD  --  interacts with  --  HMGB4; NFD04; NFD4
35 ATE2FA; E2F3  --  interacts with  --  CHR3; SYD  --  interacts with  --  TCP5
36 ATE2FA; E2F3  --  interacts with  --  CHR3; SYD  --  interacts with  --  AT5G51910
37 ATE2FA; E2F3  --  interacts with  --  CHR3; SYD  --  interacts with  --  TCP16
38 ATE2FA; E2F3  --  interacts with  --  CHR3; SYD  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD
39 ATE2FA; E2F3  --  interacts with  --  CHR3; SYD  --  interacts with  --  AT1G72010
40 ATE2FA; E2F3  --  interacts with  --  CHR3; SYD  --  interacts with  --  TCP3
41 ATE2FA; E2F3  --  interacts with  --  CHR3; SYD  --  interacts with  --  FAF1
42 ATE2FA; E2F3  --  interacts with  --  CHR3; SYD  --  interacts with  --  AT1G76870
43 ATE2FA; E2F3  --  interacts with  --  CHR3; SYD  --  interacts with  --  ARLIM15; ATDMC1; DMC1
44 ATE2FA; E2F3  --  interacts with  --  CHR3; SYD  --  interacts with  --  NF-YA5; NFYA5
45 ATE2FA; E2F3  --  interacts with  --  CHR3; SYD  --  interacts with  --  AT2G26940
46 ATE2FA; E2F3  --  interacts with  --  CHR3; SYD  --  interacts with  --  KNAT3
47 ATE2FA; E2F3  --  interacts with  --  CHR3; SYD  --  interacts with  --  anac046; NAC046
48 ATE2FA; E2F3  --  interacts with  --  CHR3; SYD  --  interacts with  --  RSL4
49 ATE2FA; E2F3  --  interacts with  --  CHR3; SYD  --  interacts with  --  RSL2
50 ATE2FA; E2F3  --  interacts with  --  CHR3; SYD  --  interacts with  --  TOE2
51 ATE2FA; E2F3  --  interacts with  --  CHR3; SYD  --  interacts with  --  Rap2.6L
52 ATE2FA; E2F3  --  interacts with  --  CHR3; SYD  --  interacts with  --  AtbZIP70; bZIP70
53 ATE2FA; E2F3  --  interacts with  --  CHR3; SYD  --  interacts with  --  ATBZIP42; bZIP42
54 ATE2FA; E2F3  --  interacts with  --  CHR3; SYD  --  interacts with  --  AtbZIP3; bZIP3
55 ATE2FA; E2F3  --  interacts with  --  CHR3; SYD  --  interacts with  --  LFY
56 ATE2FA; E2F3  --  interacts with  --  AT;CDCKD;3; CAK2AT; CDKD1;3  --  interacts with  --  FIB
57 ATE2FA; E2F3  --  interacts with  --  AT;CDCKD;3; CAK2AT; CDKD1;3  --  interacts with  --  ICK5; ICN6; KRP7
58 ATE2FA; E2F3  --  interacts with  --  AT;CDCKD;3; CAK2AT; CDKD1;3  --  interacts with  --  ACK1; ICK4; KRP6
59 ATE2FA; E2F3  --  interacts with  --  AT;CDCKD;3; CAK2AT; CDKD1;3  --  interacts with  --  ICK3; KRP5
60 ATE2FA; E2F3  --  interacts with  --  AT;CDCKD;3; CAK2AT; CDKD1;3  --  interacts with  --  ACK2; ICK7; KRP4; KRP4
61 ATE2FA; E2F3  --  interacts with  --  AT;CDCKD;3; CAK2AT; CDKD1;3  --  interacts with  --  ICK6; KRP3
62 ATE2FA; E2F3  --  interacts with  --  AT;CDCKD;3; CAK2AT; CDKD1;3  --  interacts with  --  ICK2; KRP2
63 ATE2FA; E2F3  --  interacts with  --  AT;CDCKD;3; CAK2AT; CDKD1;3  --  interacts with  --  ICK1; KRP1
64 ATE2FA; E2F3  --  interacts with  --  AT;CDCKD;3; CAK2AT; CDKD1;3  --  interacts with  --  CYCD6;1
65 ATE2FA; E2F3  --  interacts with  --  AT;CDCKD;3; CAK2AT; CDKD1;3  --  interacts with  --  CYCD5;1
66 ATE2FA; E2F3  --  interacts with  --  AT;CDCKD;3; CAK2AT; CDKD1;3  --  interacts with  --  CYCD4;1
67 ATE2FA; E2F3  --  interacts with  --  AT;CDCKD;3; CAK2AT; CDKD1;3  --  interacts with  --  CYC2; CYCB1;3
68 ATE2FA; E2F3  --  interacts with  --  AT;CDCKD;3; CAK2AT; CDKD1;3  --  interacts with  --  CYCA3;4
69 ATE2FA; E2F3  --  interacts with  --  AT;CDCKD;3; CAK2AT; CDKD1;3  --  interacts with  --  CYCA3;2
70 ATE2FA; E2F3  --  interacts with  --  AT;CDCKD;3; CAK2AT; CDKD1;3  --  interacts with  --  CYCA3;1
71 ATE2FA; E2F3  --  interacts with  --  AT;CDCKD;3; CAK2AT; CDKD1;3  --  interacts with  --  CYCA2;4
72 ATE2FA; E2F3  --  interacts with  --  AT;CDCKD;3; CAK2AT; CDKD1;3  --  interacts with  --  CYCA2;3
73 ATE2FA; E2F3  --  interacts with  --  AT;CDCKD;3; CAK2AT; CDKD1;3  --  interacts with  --  CYCA2;1
74 ATE2FA; E2F3  --  interacts with  --  AT;CDCKD;3; CAK2AT; CDKD1;3  --  interacts with  --  CYCA1;1
75 ATE2FA; E2F3  --  interacts with  --  AT;CDCKD;3; CAK2AT; CDKD1;3  --  interacts with  --  CKS2
76 ATE2FA; E2F3  --  interacts with  --  AT;CDCKD;3; CAK2AT; CDKD1;3  --  interacts with  --  CYCH;1
77 ATE2FA; E2F3  --  interacts with  --  AT;CDCKD;3; CAK2AT; CDKD1;3  --  interacts with  --  CDC2B; CDKB1;1
78 ATE2FA; E2F3  --  interacts with  --  AT;CDCKD;3; CAK2AT; CDKD1;3  --  is modified by  --  ATWEE1; WEE1
79 ATE2FA; E2F3  --  interacts with  --  AT;CDKD;2; CAK4; CAK4AT; CDKD1;2; CDKD;2  --  interacts with  --  CYCD4;2
80 ATE2FA; E2F3  --  interacts with  --  AT;CDKD;2; CAK4; CAK4AT; CDKD1;2; CDKD;2  --  interacts with  --  ATCDK8; CDKE;1; HEN3
81 ATE2FA; E2F3  --  interacts with  --  AT;CDKD;2; CAK4; CAK4AT; CDKD1;2; CDKD;2  --  interacts with  --  AT3G21140
82 ATE2FA; E2F3  --  interacts with  --  AT;CDKD;2; CAK4; CAK4AT; CDKD1;2; CDKD;2  --  interacts with  --  ATCYCD2;1; CYCD2;1
83 ATE2FA; E2F3  --  interacts with  --  CDKB1;2  --  interacts with  --  CYC1; CYCB1; CYCB1;1
84 ATE2FA; E2F3  --  interacts with  --  CDKB1;2  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.861266) with  --  ATTOPII; TOPII
85 ATE2FA; E2F3  --  interacts with  --  CDKB1;2  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.922259) with  --  IMK2
   Funding by the National Science Foundation    Funding by the Oklahoma Center for the Advancement of Science & Technology    Additional funding by the Samuel Roberts Noble Foundation


Copyright © The Zhao Lab