Screen Resolution:     
Welcome to HRGRN
A Graph Search-Empowered Integrative Database of Arabidopsis Signaling Transduction, Metabolism and Gene Regulation Networks   
Location:  Home > Details for node AT5G03050
Type: Protein GRN ID: np40293 Name:
Annotation: unknown protein; Has 33 Blast hits to 33 proteins in 10 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 0; Fungi - 0; Plants - 33; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 0 (source: NCBI BLink).
Gene Locus: AT5G03050
Gene Expression (Affy ATH1 probeset): 250975_at    
Graph Customization
   
Choose color for highlight:  
Display edge: validated and predicted
Display node/edge prompt:
Layout:
 as format     
Data Filter
 Protein modification
 Protein-protein interaction
        also include predicted relationship
 Compound-protein interaction
 TF-target gene regulation
 Small RNA-target regulation
        also include predicted relationship
 Carrier and transported molecule
 Catalytic chemical reaction
 Co-expressed gene pair
        with mutual information value >

  Ignore nodes having > relationships
 
Relationship type:  protein modification     catalytic chemical reaction     protein-protein interaction    
compound-protein interaction     TF-target gene regulation     small RNA-target regulation    
co-expressed gene pair     carrier and transported molecule     family/complex and member
Relationship evidence:  Solid line: validated          Dashed line: predicted
Relationship direction: Arrow: positive          T shape: negative          None arrow: unknown or n/a
Hormone association: Thicker line: hormone related relationship         : hormone related Node
Node type:  Transcription factor or transcriptional regulator       Compound       Kinase
 Small regulatory RNA (miRNA & ta-siRNA)       Other nodes
No. Path
2 AT5G03050  --  interacts with  --  EMB40; FASS; FASS 2; FS1; GDO; TON2
3 AT5G03050  --  interacts with  --  AT1G20770
4 AT5G03050  --  interacts with  --  BP; BP1; KNAT1
5 AT5G03050  --  interacts with  --  AT3G47675
6 AT5G03050  --  interacts with  --  EMB2819
7 AT5G03050  --  interacts with  --  ATCOQ3; COQ3; COQ3; EMB3002
8 AT5G03050  --  interacts with  --  ATPUB44; PUB44; SAUL1
9 AT5G03050  --  interacts with  --  AT3G08780
10 AT5G03050  --  interacts with  --  EMB40; FASS; FASS 2; FS1; GDO; TON2  --  interacts with  --  PP2AA3
11 AT5G03050  --  interacts with  --  EMB40; FASS; FASS 2; FS1; GDO; TON2  --  interacts with  --  AT1G73660
12 AT5G03050  --  interacts with  --  EMB40; FASS; FASS 2; FS1; GDO; TON2  --  interacts with  --  AT1G03040
13 AT5G03050  --  interacts with  --  EMB40; FASS; FASS 2; FS1; GDO; TON2  --  interacts with  --  KAN; KAN1
14 AT5G03050  --  interacts with  --  AT1G20770  --  interacts with  --  ATSPX4; SPX4
15 AT5G03050  --  interacts with  --  AT1G20770  --  interacts with  --  AT3G54390
16 AT5G03050  --  interacts with  --  AT1G20770  --  interacts with  --  AT3G06530
17 AT5G03050  --  interacts with  --  AT1G20770  --  interacts with  --  ATMAP70-2; MAP70-2
18 AT5G03050  --  interacts with  --  AT1G20770  --  interacts with  --  AT4G24840
19 AT5G03050  --  interacts with  --  AT1G20770  --  interacts with  --  AT4G02620
20 AT5G03050  --  interacts with  --  AT1G20770  --  interacts with  --  AT4G24050
21 AT5G03050  --  interacts with  --  AT1G20770  --  interacts with  --  RCN1 ATB BETA BETA
22 AT5G03050  --  interacts with  --  BP; BP1; KNAT1  --  interacts with  --  AT5G28690
23 AT5G03050  --  interacts with  --  BP; BP1; KNAT1  --  interacts with  --  AT5G38420
24 AT5G03050  --  interacts with  --  BP; BP1; KNAT1  --  interacts with  --  AT4G08520
25 AT5G03050  --  interacts with  --  BP; BP1; KNAT1  --  interacts with  --  SLK2
26 AT5G03050  --  interacts with  --  BP; BP1; KNAT1  --  interacts with  --  ATSAE1B; SAE1B
27 AT5G03050  --  interacts with  --  BP; BP1; KNAT1  --  interacts with  --  AT-SAE1-2; SAE1B
28 AT5G03050  --  interacts with  --  BP; BP1; KNAT1  --  interacts with  --  AT5G50100
29 AT5G03050  --  interacts with  --  BP; BP1; KNAT1  --  interacts with  --  AT4G12450
30 AT5G03050  --  interacts with  --  BP; BP1; KNAT1  --  interacts with  --  KNAT4
31 AT5G03050  --  interacts with  --  BP; BP1; KNAT1  --  interacts with  --  IXR11; KNAT7
32 AT5G03050  --  interacts with  --  BP; BP1; KNAT1  --  interacts with  --  ATOFP2; OFP2
33 AT5G03050  --  interacts with  --  BP; BP1; KNAT1  --  interacts with  --  ATOFP1; OFP1
34 AT5G03050  --  interacts with  --  BP; BP1; KNAT1  --  interacts with  --  ATOFP4; OFP4
35 AT5G03050  --  interacts with  --  BP; BP1; KNAT1  --  interacts with  --  ATOFP6; OFP6
36 AT5G03050  --  interacts with  --  BP; BP1; KNAT1  --  interacts with  --  ATOFP12; OFP12
37 AT5G03050  --  interacts with  --  BP; BP1; KNAT1  --  interacts with  --  APA1; ATAPA1
38 AT5G03050  --  interacts with  --  BP; BP1; KNAT1  --  interacts with  --  ATH1
39 AT5G03050  --  interacts with  --  BP; BP1; KNAT1  --  interacts with  --  BLH3
40 AT5G03050  --  interacts with  --  BP; BP1; KNAT1  --  interacts with  --  BLH9; BLR; HB-6; LSN; PNY; RPL; VAN
41 AT5G03050  --  interacts with  --  BP; BP1; KNAT1  --  interacts with  --  AT1G72030
42 AT5G03050  --  interacts with  --  BP; BP1; KNAT1  --  interacts with  --  AT3G19120
43 AT5G03050  --  interacts with  --  BP; BP1; KNAT1  --  interacts with  --  AT2G30120
44 AT5G03050  --  interacts with  --  BP; BP1; KNAT1  --  interacts with  --  ATCYTC-A; CYTC-1
45 AT5G03050  --  interacts with  --  BP; BP1; KNAT1  --  interacts with  --  ATEXO70H1; EXO70H1
46 AT5G03050  --  interacts with  --  BP; BP1; KNAT1  --  interacts with  --  CIPK9; PKS6; SnRK3.12
47 AT5G03050  --  interacts with  --  BP; BP1; KNAT1  --  interacts with  --  PSAD-2
48 AT5G03050  --  interacts with  --  BP; BP1; KNAT1  --  interacts with  --  AT2G39100
49 AT5G03050  --  interacts with  --  BP; BP1; KNAT1  --  interacts with  --  AT2G22680
50 AT5G03050  --  interacts with  --  BP; BP1; KNAT1  --  interacts with  --  AT1G49850
51 AT5G03050  --  interacts with  --  BP; BP1; KNAT1  --  interacts with  --  ARR14
52 AT5G03050  --  interacts with  --  BP; BP1; KNAT1  --  interacts with  --  AGL67
53 AT5G03050  --  interacts with  --  BP; BP1; KNAT1  --  interacts with  --  ATCAND1
54 AT5G03050  --  interacts with  --  BP; BP1; KNAT1  --  interacts with  --  AT3G12930
55 AT5G03050  --  interacts with  --  BP; BP1; KNAT1  --  interacts with  --  AT1G22630
56 AT5G03050  --  interacts with  --  BP; BP1; KNAT1  --  interacts with  --  WRKY21
57 AT5G03050  --  interacts with  --  BP; BP1; KNAT1  --  interacts with  --  BLH8; PNF
58 AT5G03050  --  interacts with  --  BP; BP1; KNAT1  --  interacts with  --  BLH7
59 AT5G03050  --  interacts with  --  BP; BP1; KNAT1  --  interacts with  --  BLH6
60 AT5G03050  --  interacts with  --  BP; BP1; KNAT1  --  interacts with  --  BLH4; SAW2
61 AT5G03050  --  interacts with  --  BP; BP1; KNAT1  --  interacts with  --  BLH2; SAW1
62 AT5G03050  --  interacts with  --  BP; BP1; KNAT1  --  interacts with  --  BEL1
63 AT5G03050  --  interacts with  --  BP; BP1; KNAT1  --  is regulated by  --  AS COMPLEX
64 AT5G03050  --  interacts with  --  BP; BP1; KNAT1  --  is regulated by  --  TCPS family2, transcription factor gene
65 AT5G03050  --  interacts with  --  AT3G47675  --  interacts with  --  UNE12
66 AT5G03050  --  interacts with  --  AT3G47675  --  interacts with  --  ASIL1
67 AT5G03050  --  interacts with  --  EMB2819  --  interacts with  --  AT5G65683
68 AT5G03050  --  interacts with  --  EMB2819  --  interacts with  --  ATHSP23.6-MITO; HSP23.6-MITO
69 AT5G03050  --  interacts with  --  EMB2819  --  interacts with  --  BOI; RING
70 AT5G03050  --  interacts with  --  EMB2819  --  interacts with  --  HLH1; PAR1
71 AT5G03050  --  interacts with  --  EMB2819  --  interacts with  --  KNAT3
72 AT5G03050  --  interacts with  --  ATCOQ3; COQ3; COQ3; EMB3002  --  interacts with  --  AT3G27960
73 AT5G03050  --  interacts with  --  ATCOQ3; COQ3; COQ3; EMB3002  --  interacts with  --  AT3G56270
74 AT5G03050  --  interacts with  --  ATPUB44; PUB44; SAUL1  --  interacts with  --  ARK3; RK3
75 AT5G03050  --  interacts with  --  ATPUB44; PUB44; SAUL1  --  transport  --  Lead
76 AT5G03050  --  interacts with  --  ATPUB44; PUB44; SAUL1  --  transport  --  Mercury(2+)
77 AT5G03050  --  interacts with  --  ATPUB44; PUB44; SAUL1  --  transport  --  HCO3-
78 AT5G03050  --  interacts with  --  ATPUB44; PUB44; SAUL1  --  transport  --  Cu2+
79 AT5G03050  --  interacts with  --  ATPUB44; PUB44; SAUL1  --  transport  --  Zinc cation
80 AT5G03050  --  interacts with  --  AT3G08780  --  interacts with  --  ATFIP37; FIP37
81 AT5G03050  --  interacts with  --  AT3G08780  --  interacts with  --  ASIL2
82 AT5G03050  --  interacts with  --  AT3G08780  --  interacts with  --  AT4G32190
   Funding by the National Science Foundation    Funding by the Oklahoma Center for the Advancement of Science & Technology    Additional funding by the Samuel Roberts Noble Foundation

Copyright © The Zhao Lab

Disclaimer | Contact