Screen Resolution:     
Welcome to HRGRN
A Graph Search-Empowered Integrative Database of Arabidopsis Signaling Transduction, Metabolism and Gene Regulation Networks   
Location:  Home > Details for node AT1G18660
Type: Protein GRN ID: np13968 Name:
Annotation: zinc finger (C3HC4-type RING finger) family protein [TCDB:9.A.14.1]
Gene Locus: AT1G18660
Transcription factor /
transcriptional regulator:		 transcription factor family C2H2
Gene Expression (Affy ATH1 probeset): 261376_at    
Graph Customization
   
Choose color for highlight:  
Display edge: validated and predicted
Display node/edge prompt:
Layout:
 as format     
Data Filter
 Protein modification
 Protein-protein interaction
        also include predicted relationship
 Compound-protein interaction
 TF-target gene regulation
 Small RNA-target regulation
        also include predicted relationship
 Carrier and transported molecule
 Catalytic chemical reaction
 Co-expressed gene pair
        with mutual information value >

  Ignore nodes having > relationships
 
Relationship type:  protein modification     catalytic chemical reaction     protein-protein interaction    
compound-protein interaction     TF-target gene regulation     small RNA-target regulation    
co-expressed gene pair     carrier and transported molecule     family/complex and member
Relationship evidence:  Solid line: validated          Dashed line: predicted
Relationship direction: Arrow: positive          T shape: negative          None arrow: unknown or n/a
Hormone association: Thicker line: hormone related relationship         : hormone related Node
Node type:  Transcription factor or transcriptional regulator       Compound       Kinase
 Small regulatory RNA (miRNA & ta-siRNA)       Other nodes
No. Path
2 AT1G18660  --  interacts with  --  PYRR; UPP
3 AT1G18660  --  interacts with  --  NPL41
4 AT1G18660  --  interacts with  --  AT2G37190
5 AT1G18660  --  interacts with  --  JAI3
6 AT1G18660  --  interacts with  --  ATP8; AtRCD1; CEO; CEO1; RCD1
7 AT1G18660  --  interacts with  --  UREF
8 AT1G18660  --  interacts with  --  AT4G32175
9 AT1G18660  --  interacts with  --  MARD1
10 AT1G18660  --  interacts with  --  AtTCP11; TCP11
11 AT1G18660  --  interacts with  --  BLH1; EDA29
12 AT1G18660  --  interacts with  --  PYRR; UPP  --  interacts with  --  AHL20
13 AT1G18660  --  interacts with  --  PYRR; UPP  --  interacts with  --  PETC; PGR1
14 AT1G18660  --  interacts with  --  PYRR; UPP  --  interacts with  --  AT5G10060
15 AT1G18660  --  interacts with  --  PYRR; UPP  --  interacts with  --  APX4; TL29
16 AT1G18660  --  interacts with  --  PYRR; UPP  --  interacts with  --  AT1G51355
17 AT1G18660  --  interacts with  --  PYRR; UPP  --  interacts with  --  ATY1; TRX-Y1; TY1
18 AT1G18660  --  interacts with  --  PYRR; UPP  --  interacts with  --  NDF4
19 AT1G18660  --  interacts with  --  PYRR; UPP  --  interacts with  --  AT1G66820
20 AT1G18660  --  interacts with  --  PYRR; UPP  --  interacts with  --  ACR6
21 AT1G18660  --  interacts with  --  PYRR; UPP  --  interacts with  --  CIPK9; PKS6; SnRK3.12
22 AT1G18660  --  interacts with  --  PYRR; UPP  --  interacts with  --  AT1G13520
23 AT1G18660  --  interacts with  --  PYRR; UPP  --  interacts with  --  AT3G46810
24 AT1G18660  --  interacts with  --  PYRR; UPP  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.960332) with  --  EMB1047; EMB156; EMB36; FTSH12
25 AT1G18660  --  interacts with  --  PYRR; UPP  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.838733) with  --  ADSS
26 AT1G18660  --  interacts with  --  PYRR; UPP  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.858046) with  --  DDM2; DMT01; DMT1; MET1; MET2; METI
27 AT1G18660  --  interacts with  --  PYRR; UPP  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.857341) with  --  OVA6; PRORS1
28 AT1G18660  --  interacts with  --  PYRR; UPP  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.962284) with  --  ATCYP20-2; CYP20-2
29 AT1G18660  --  interacts with  --  PYRR; UPP  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.854811) with  --  ATOEP80; EMB213; OEP80; TOC75-V
30 AT1G18660  --  interacts with  --  PYRR; UPP  --  has product (in catalytic reaction)  --  5-Phospho-alpha-D-ribose 1-diphosphate
31 AT1G18660  --  interacts with  --  PYRR; UPP  --  has product (in catalytic reaction)  --  Uracil
32 AT1G18660  --  interacts with  --  NPL41  --  interacts with  --  DSK2
33 AT1G18660  --  interacts with  --  AT2G37190  --  interacts with  --  ATSYP23; SYP23
34 AT1G18660  --  interacts with  --  AT2G37190  --  has similar expression pattern (mutual information value=1.05826) with  --  AteIF3f; EIF2; eIF3F
35 AT1G18660  --  interacts with  --  AT2G37190  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.873027) with  --  TIF3I1; TRIP-1
36 AT1G18660  --  interacts with  --  AT2G37190  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.873027) with  --  AT2G46290
37 AT1G18660  --  interacts with  --  AT2G37190  --  has similar expression pattern (mutual information value=1.12172) with  --  EDA27; NOP10
38 AT1G18660  --  interacts with  --  AT2G37190  --  has similar expression pattern (mutual information value=1.2264) with  --  AT2G36160
39 AT1G18660  --  interacts with  --  AT2G37190  --  has similar expression pattern (mutual information value=1.00118) with  --  AT1G01100
40 AT1G18660  --  interacts with  --  AT2G37190  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.87851) with  --  AT1G74050
41 AT1G18660  --  interacts with  --  AT2G37190  --  has similar expression pattern (mutual information value=1.05509) with  --  AT3G01790
42 AT1G18660  --  interacts with  --  AT2G37190  --  has similar expression pattern (mutual information value=1.15406) with  --  AT3G07110
43 AT1G18660  --  interacts with  --  AT2G37190  --  has similar expression pattern (mutual information value=1.0722) with  --  AT3G02560
44 AT1G18660  --  interacts with  --  AT2G37190  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.993173) with  --  AtGRP4; GR-RBP4; GRP4
45 AT1G18660  --  interacts with  --  AT2G37190  --  has similar expression pattern (mutual information value=1.10844) with  --  AT2G33370
46 AT1G18660  --  interacts with  --  AT2G37190  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.947811) with  --  AT3G45030
47 AT1G18660  --  interacts with  --  AT2G37190  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.934174) with  --  AT5G27700
48 AT1G18660  --  interacts with  --  JAI3  --  regulates the expression of   --  RGA1
49 AT1G18660  --  interacts with  --  JAI3  --  regulates the expression of   --  TPR1
50 AT1G18660  --  interacts with  --  JAI3  --  regulates the expression of   --  FRS3
51 AT1G18660  --  interacts with  --  JAI3  --  regulates the expression of   --  AFO; FIL; YAB1
52 AT1G18660  --  interacts with  --  JAI3  --  is regulated by  --  ATMYC2
53 AT1G18660  --  interacts with  --  JAI3  --  interacts with  --  AIB; ATAIB
54 AT1G18660  --  interacts with  --  JAI3  --  interacts with  --  AT1G01260
55 AT1G18660  --  interacts with  --  JAI3  --  interacts with  --  JAZ9
56 AT1G18660  --  interacts with  --  JAI3  --  interacts with  --  JAZ4
57 AT1G18660  --  interacts with  --  JAI3  --  interacts with  --  KAN; KAN1
58 AT1G18660  --  interacts with  --  JAI3  --  interacts with  --  AT4G15700
59 AT1G18660  --  interacts with  --  JAI3  --  interacts with  --  ATMAP70-5; MAP70-5
60 AT1G18660  --  interacts with  --  JAI3  --  interacts with  --  AT-EXPR; ATEXLB1; ATEXPR1; ATHEXP BETA 3.1; EXLB1; EXPR
61 AT1G18660  --  interacts with  --  JAI3  --  interacts with  --  AT5G38420
62 AT1G18660  --  interacts with  --  JAI3  --  interacts with  --  TOE2
63 AT1G18660  --  interacts with  --  JAI3  --  interacts with  --  AKIN11; ATKIN11; KIN11; SNRK1.2
64 AT1G18660  --  interacts with  --  JAI3  --  interacts with  --  ROXY2
65 AT1G18660  --  interacts with  --  JAI3  --  interacts with  --  CDKC;1
66 AT1G18660  --  interacts with  --  JAI3  --  interacts with  --  AT5G59210
67 AT1G18660  --  interacts with  --  JAI3  --  interacts with  --  AO
68 AT1G18660  --  interacts with  --  JAI3  --  interacts with  --  AT5G60340
69 AT1G18660  --  interacts with  --  JAI3  --  interacts with  --  MYC3
70 AT1G18660  --  interacts with  --  JAI3  --  interacts with  --  MYC4
71 AT1G18660  --  interacts with  --  JAI3  --  interacts with  --  COI1
72 AT1G18660  --  interacts with  --  JAI3  --  interacts with  --  ATICE1; ICE1; SCRM
73 AT1G18660  --  interacts with  --  JAI3  --  interacts with  --  AT5G14240
74 AT1G18660  --  interacts with  --  JAI3  --  interacts with  --  NRPB9A; NRPD9A; NRPE9A
75 AT1G18660  --  interacts with  --  JAI3  --  interacts with  --  AtPPR2; EMB2750; PPR2
76 AT1G18660  --  interacts with  --  JAI3  --  interacts with  --  AT1G15130
77 AT1G18660  --  interacts with  --  JAI3  --  interacts with  --  AT1G52695
78 AT1G18660  --  interacts with  --  JAI3  --  interacts with  --  PDH-E1 BETA
79 AT1G18660  --  interacts with  --  JAI3  --  interacts with  --  AT1G67170
80 AT1G18660  --  interacts with  --  JAI3  --  is a member of  --  JAI3 family107, transcription factor gene
81 AT1G18660  --  interacts with  --  ATP8; AtRCD1; CEO; CEO1; RCD1  --  interacts with  --  RAP2.4; WIND1
82 AT1G18660  --  interacts with  --  ATP8; AtRCD1; CEO; CEO1; RCD1  --  interacts with  --  AT1G19835
83 AT1G18660  --  interacts with  --  ATP8; AtRCD1; CEO; CEO1; RCD1  --  interacts with  --  AT5G08720
84 AT1G18660  --  interacts with  --  ATP8; AtRCD1; CEO; CEO1; RCD1  --  interacts with  --  AT4G09060
85 AT1G18660  --  interacts with  --  ATP8; AtRCD1; CEO; CEO1; RCD1  --  interacts with  --  ATCSLA09; ATCSLA9; CSLA09; CSLA9; RAT4
86 AT1G18660  --  interacts with  --  ATP8; AtRCD1; CEO; CEO1; RCD1  --  interacts with  --  AtIDD5; IDD5
87 AT1G18660  --  interacts with  --  ATP8; AtRCD1; CEO; CEO1; RCD1  --  interacts with  --  AT2G33550
88 AT1G18660  --  interacts with  --  ATP8; AtRCD1; CEO; CEO1; RCD1  --  interacts with  --  AtWRKY47; WRKY47
89 AT1G18660  --  interacts with  --  ATP8; AtRCD1; CEO; CEO1; RCD1  --  interacts with  --  AHBP-1B
90 AT1G18660  --  interacts with  --  ATP8; AtRCD1; CEO; CEO1; RCD1  --  interacts with  --  bZIP23
91 AT1G18660  --  interacts with  --  ATP8; AtRCD1; CEO; CEO1; RCD1  --  interacts with  --  AS1
92 AT1G18660  --  interacts with  --  ATP8; AtRCD1; CEO; CEO1; RCD1  --  interacts with  --  IAA11
93 AT1G18660  --  interacts with  --  ATP8; AtRCD1; CEO; CEO1; RCD1  --  interacts with  --  bHLH105; ILR3
94 AT1G18660  --  interacts with  --  ATP8; AtRCD1; CEO; CEO1; RCD1  --  interacts with  --  AT2G22760
95 AT1G18660  --  interacts with  --  ATP8; AtRCD1; CEO; CEO1; RCD1  --  interacts with  --  bHLH11
96 AT1G18660  --  interacts with  --  ATP8; AtRCD1; CEO; CEO1; RCD1  --  interacts with  --  UNE10
97 AT1G18660  --  interacts with  --  ATP8; AtRCD1; CEO; CEO1; RCD1  --  interacts with  --  PIF7
98 AT1G18660  --  interacts with  --  ATP8; AtRCD1; CEO; CEO1; RCD1  --  interacts with  --  PIF5; PIL6
99 AT1G18660  --  interacts with  --  ATP8; AtRCD1; CEO; CEO1; RCD1  --  interacts with  --  AT5G48250
100 AT1G18660  --  interacts with  --  ATP8; AtRCD1; CEO; CEO1; RCD1  --  interacts with  --  ANAC082; NAC082; VNI1
101 AT1G18660  --  interacts with  --  ATP8; AtRCD1; CEO; CEO1; RCD1  --  interacts with  --  anac046; NAC046
102 AT1G18660  --  interacts with  --  ATP8; AtRCD1; CEO; CEO1; RCD1  --  interacts with  --  ANAC013; ANAC13; NAC13
103 AT1G18660  --  interacts with  --  ATP8; AtRCD1; CEO; CEO1; RCD1  --  interacts with  --  GCL1
104 AT1G18660  --  interacts with  --  ATP8; AtRCD1; CEO; CEO1; RCD1  --  interacts with  --  AtERF48; DREB2C
105 AT1G18660  --  interacts with  --  ATP8; AtRCD1; CEO; CEO1; RCD1  --  interacts with  --  DREB2; DREB2B
106 AT1G18660  --  interacts with  --  ATP8; AtRCD1; CEO; CEO1; RCD1  --  interacts with  --  DREB2; DREB2A
107 AT1G18660  --  interacts with  --  ATP8; AtRCD1; CEO; CEO1; RCD1  --  interacts with  --  OCP3
108 AT1G18660  --  interacts with  --  ATP8; AtRCD1; CEO; CEO1; RCD1  --  interacts with  --  AT3G43590
109 AT1G18660  --  interacts with  --  ATP8; AtRCD1; CEO; CEO1; RCD1  --  interacts with  --  TPR10
110 AT1G18660  --  interacts with  --  ATP8; AtRCD1; CEO; CEO1; RCD1  --  interacts with  --  ATEBP; EBP; ERF72; RAP2.3
111 AT1G18660  --  interacts with  --  ATP8; AtRCD1; CEO; CEO1; RCD1  --  interacts with  --  BBX24; STO
112 AT1G18660  --  interacts with  --  ATP8; AtRCD1; CEO; CEO1; RCD1  --  interacts with  --  ATNHX7; ATSOS1; SOS1
113 AT1G18660  --  interacts with  --  UREF  --  interacts with  --  AT1G49840
114 AT1G18660  --  interacts with  --  UREF  --  interacts with  --  AR401
115 AT1G18660  --  interacts with  --  MARD1  --  interacts with  --  AT5G11980
116 AT1G18660  --  interacts with  --  MARD1  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD
117 AT1G18660  --  interacts with  --  MARD1  --  interacts with  --  ATGRX2; CXIP2
118 AT1G18660  --  interacts with  --  MARD1  --  interacts with  --  ZFP7
119 AT1G18660  --  interacts with  --  MARD1  --  interacts with  --  ATRAPTOR1B; RAPTOR1; RAPTOR1B
120 AT1G18660  --  interacts with  --  MARD1  --  interacts with  --  AT2G31985
121 AT1G18660  --  interacts with  --  AtTCP11; TCP11  --  interacts with  --  AT5G23280
122 AT1G18660  --  interacts with  --  AtTCP11; TCP11  --  interacts with  --  TCP5
123 AT1G18660  --  interacts with  --  AtTCP11; TCP11  --  interacts with  --  ATTCP24; TCP24
124 AT1G18660  --  interacts with  --  AtTCP11; TCP11  --  interacts with  --  TCP3
125 AT1G18660  --  interacts with  --  AtTCP11; TCP11  --  interacts with  --  MEE35; TCP4
126 AT1G18660  --  interacts with  --  AtTCP11; TCP11  --  interacts with  --  TCP8
127 AT1G18660  --  interacts with  --  AtTCP11; TCP11  --  interacts with  --  AT1G35560
128 AT1G18660  --  interacts with  --  AtTCP11; TCP11  --  interacts with  --  AT5G51910
129 AT1G18660  --  interacts with  --  AtTCP11; TCP11  --  interacts with  --  NZZ; SPL
130 AT1G18660  --  interacts with  --  AtTCP11; TCP11  --  interacts with  --  APRR1; AtTOC1; PRR1; TOC1
131 AT1G18660  --  interacts with  --  AtTCP11; TCP11  --  interacts with  --  TCP10
132 AT1G18660  --  interacts with  --  AtTCP11; TCP11  --  interacts with  --  TCP17
133 AT1G18660  --  interacts with  --  AtTCP11; TCP11  --  interacts with  --  TCP2; TCP2
134 AT1G18660  --  interacts with  --  AtTCP11; TCP11  --  interacts with  --  AT2G37000
135 AT1G18660  --  interacts with  --  AtTCP11; TCP11  --  interacts with  --  AtTCP15; TCP15
136 AT1G18660  --  interacts with  --  AtTCP11; TCP11  --  interacts with  --  AT-TCP20; ATTCP20; PCF1; TCP20
137 AT1G18660  --  interacts with  --  AtTCP11; TCP11  --  interacts with  --  NRPB6B; NRPE6B
138 AT1G18660  --  interacts with  --  AtTCP11; TCP11  --  interacts with  --  AT3G18960
139 AT1G18660  --  interacts with  --  AtTCP11; TCP11  --  interacts with  --  ATU2AF65A
140 AT1G18660  --  interacts with  --  AtTCP11; TCP11  --  interacts with  --  PYE
141 AT1G18660  --  interacts with  --  AtTCP11; TCP11  --  interacts with  --  AT1G19000
142 AT1G18660  --  interacts with  --  AtTCP11; TCP11  --  interacts with  --  HB-3; STIP; WOX9; WOX9A
143 AT1G18660  --  interacts with  --  AtTCP11; TCP11  --  interacts with  --  PDE331
144 AT1G18660  --  interacts with  --  AtTCP11; TCP11  --  interacts with  --  BOI; RING
145 AT1G18660  --  interacts with  --  AtTCP11; TCP11  --  interacts with  --  AT2G01710
146 AT1G18660  --  interacts with  --  AtTCP11; TCP11  --  interacts with  --  ATRBP45C
147 AT1G18660  --  interacts with  --  AtTCP11; TCP11  --  interacts with  --  AT4G17680
148 AT1G18660  --  interacts with  --  AtTCP11; TCP11  --  interacts with  --  AT3G28715
149 AT1G18660  --  interacts with  --  AtTCP11; TCP11  --  regulates the expression of   --  AtCCA1; CCA1
150 AT1G18660  --  interacts with  --  AtTCP11; TCP11  --  is regulated by  --  LHY; LHY1
151 AT1G18660  --  interacts with  --  AtTCP11; TCP11  --  is modified by  --  ATMPK8; MPK8
152 AT1G18660  --  interacts with  --  BLH1; EDA29  --  interacts with  --  AT4G32190
153 AT1G18660  --  interacts with  --  BLH1; EDA29  --  interacts with  --  BUM; BUM1; SHL; STM; WAM; WAM1
154 AT1G18660  --  interacts with  --  BLH1; EDA29  --  interacts with  --  BEL10; BLH10
155 AT1G18660  --  interacts with  --  BLH1; EDA29  --  interacts with  --  ATOFP15; OFP15
156 AT1G18660  --  interacts with  --  BLH1; EDA29  --  interacts with  --  BLH2; SAW1
157 AT1G18660  --  interacts with  --  BLH1; EDA29  --  interacts with  --  BLH6
158 AT1G18660  --  interacts with  --  BLH1; EDA29  --  interacts with  --  ATH1
159 AT1G18660  --  interacts with  --  BLH1; EDA29  --  interacts with  --  KNAT3
160 AT1G18660  --  interacts with  --  BLH1; EDA29  --  interacts with  --  KNAT5
161 AT1G18660  --  interacts with  --  BLH1; EDA29  --  interacts with  --  ATOFP3; OFP3
162 AT1G18660  --  interacts with  --  BLH1; EDA29  --  interacts with  --  ATOFP2; OFP2
163 AT1G18660  --  interacts with  --  BLH1; EDA29  --  interacts with  --  ATHSPRO2; HSPRO2
164 AT1G18660  --  interacts with  --  BLH1; EDA29  --  interacts with  --  BLH3
165 AT1G18660  --  interacts with  --  BLH1; EDA29  --  interacts with  --  BLH4; SAW2
166 AT1G18660  --  interacts with  --  BLH1; EDA29  --  interacts with  --  KNAT6; KNAT6L; KNAT6S
167 AT1G18660  --  interacts with  --  BLH1; EDA29  --  interacts with  --  ATOFP1; OFP1
168 AT1G18660  --  interacts with  --  BLH1; EDA29  --  interacts with  --  ATOFP4; OFP4
169 AT1G18660  --  interacts with  --  BLH1; EDA29  --  interacts with  --  ATOFP5; OFP5
170 AT1G18660  --  interacts with  --  BLH1; EDA29  --  interacts with  --  AT1G30590
171 AT1G18660  --  interacts with  --  BLH1; EDA29  --  interacts with  --  AT5G04830
172 AT1G18660  --  interacts with  --  BLH1; EDA29  --  interacts with  --  CIB5
173 AT1G18660  --  interacts with  --  BLH1; EDA29  --  interacts with  --  APA1; ATAPA1
174 AT1G18660  --  interacts with  --  BLH1; EDA29  --  interacts with  --  AT1G51580
175 AT1G18660  --  interacts with  --  BLH1; EDA29  --  interacts with  --  BLOS1
176 AT1G18660  --  interacts with  --  BLH1; EDA29  --  interacts with  --  CW7
177 AT1G18660  --  interacts with  --  BLH1; EDA29  --  interacts with  --  AT2G21380
178 AT1G18660  --  interacts with  --  BLH1; EDA29  --  interacts with  --  BEL1
   Funding by the National Science Foundation    Funding by the Oklahoma Center for the Advancement of Science & Technology    Additional funding by the Samuel Roberts Noble Foundation

Copyright © The Zhao Lab

Disclaimer | Contact