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A Graph Search-Empowered Integrative Database of Arabidopsis Signaling Transduction, Metabolism and Gene Regulation Networks   
Location:  Home > Details for node AT1G50680
Type: Protein GRN ID: np11945 Name:
Annotation: AP2/B3 transcription factor family protein
Gene Locus: AT1G50680
Transcription factor /
transcriptional regulator:		 transcription factor family RAV
Gene Expression (Affy ATH1 probeset): 257581_s_at    
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 Protein modification
 Protein-protein interaction
        also include predicted relationship
 Compound-protein interaction
 TF-target gene regulation
 Small RNA-target regulation
        also include predicted relationship
 Carrier and transported molecule
 Catalytic chemical reaction
 Co-expressed gene pair
        with mutual information value >

  Ignore nodes having > relationships
 
Relationship type:  protein modification     catalytic chemical reaction     protein-protein interaction    
compound-protein interaction     TF-target gene regulation     small RNA-target regulation    
co-expressed gene pair     carrier and transported molecule     family/complex and member
Relationship evidence:  Solid line: validated          Dashed line: predicted
Relationship direction: Arrow: positive          T shape: negative          None arrow: unknown or n/a
Hormone association: Thicker line: hormone related relationship         : hormone related Node
Node type:  Transcription factor or transcriptional regulator       Compound       Kinase
 Small regulatory RNA (miRNA & ta-siRNA)       Other nodes
No. Path
2 AT1G50680  --  interacts with  --  CHR3; SYD
3 AT1G50680  --  interacts with  --  ATSWI3B?
4 AT1G50680  --  interacts with  --  TPR2
5 AT1G50680  --  interacts with  --  CHR3; SYD  --  interacts with  --  LBD35
6 AT1G50680  --  interacts with  --  CHR3; SYD  --  interacts with  --  LBD40
7 AT1G50680  --  interacts with  --  CHR3; SYD  --  interacts with  --  ARF18
8 AT1G50680  --  interacts with  --  CHR3; SYD  --  interacts with  --  ARF3
9 AT1G50680  --  interacts with  --  CHR3; SYD  --  interacts with  --  HSI2; VAL1
10 AT1G50680  --  interacts with  --  CHR3; SYD  --  interacts with  --  AT1G51120
11 AT1G50680  --  interacts with  --  CHR3; SYD  --  interacts with  --  ATE2FA; E2F3
12 AT1G50680  --  interacts with  --  CHR3; SYD  --  interacts with  --  HMGB4; NFD04; NFD4
13 AT1G50680  --  interacts with  --  CHR3; SYD  --  interacts with  --  TCP5
14 AT1G50680  --  interacts with  --  CHR3; SYD  --  interacts with  --  AT5G51910
15 AT1G50680  --  interacts with  --  CHR3; SYD  --  interacts with  --  TCP16
16 AT1G50680  --  interacts with  --  CHR3; SYD  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD
17 AT1G50680  --  interacts with  --  CHR3; SYD  --  interacts with  --  AT1G72010
18 AT1G50680  --  interacts with  --  CHR3; SYD  --  interacts with  --  TCP3
19 AT1G50680  --  interacts with  --  CHR3; SYD  --  interacts with  --  FAF1
20 AT1G50680  --  interacts with  --  CHR3; SYD  --  interacts with  --  AT1G76870
21 AT1G50680  --  interacts with  --  CHR3; SYD  --  interacts with  --  ARLIM15; ATDMC1; DMC1
22 AT1G50680  --  interacts with  --  CHR3; SYD  --  interacts with  --  NF-YA5; NFYA5
23 AT1G50680  --  interacts with  --  CHR3; SYD  --  interacts with  --  AT2G26940
24 AT1G50680  --  interacts with  --  CHR3; SYD  --  interacts with  --  KNAT3
25 AT1G50680  --  interacts with  --  CHR3; SYD  --  interacts with  --  anac046; NAC046
26 AT1G50680  --  interacts with  --  CHR3; SYD  --  interacts with  --  RSL4
27 AT1G50680  --  interacts with  --  CHR3; SYD  --  interacts with  --  RSL2
28 AT1G50680  --  interacts with  --  CHR3; SYD  --  interacts with  --  TOE2
29 AT1G50680  --  interacts with  --  CHR3; SYD  --  interacts with  --  Rap2.6L
30 AT1G50680  --  interacts with  --  CHR3; SYD  --  interacts with  --  AtbZIP70; bZIP70
31 AT1G50680  --  interacts with  --  CHR3; SYD  --  interacts with  --  ATBZIP42; bZIP42
32 AT1G50680  --  interacts with  --  CHR3; SYD  --  interacts with  --  AtbZIP3; bZIP3
33 AT1G50680  --  interacts with  --  CHR3; SYD  --  interacts with  --  LFY
34 AT1G50680  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  ASL16; LBD29
35 AT1G50680  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  AT-TCP20; ATTCP20; PCF1; TCP20
36 AT1G50680  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  AT3G24860
37 AT1G50680  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  AtHAM4; HAM4
38 AT1G50680  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  AT3G50650
39 AT1G50680  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  SCL1
40 AT1G50680  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  AT-HSFA6A; HSFA6A
41 AT1G50680  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  AT-HSFA3; HSFA3
42 AT1G50680  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  PHL1
43 AT1G50680  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  AT5G06800
44 AT1G50680  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  AtIDD16; IDD16
45 AT1G50680  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  AT1G48150
46 AT1G50680  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  HB-1
47 AT1G50680  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  ATHB40; HB-5; HB40
48 AT1G50680  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  anac032; NAC032
49 AT1G50680  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  AT1G72210
50 AT1G50680  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  AT1G22490
51 AT1G50680  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  AT3G61950
52 AT1G50680  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  BHLH42; TT8
53 AT1G50680  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  ATMYC2
54 AT1G50680  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  AT2G22760
55 AT1G50680  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  NAI1
56 AT1G50680  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  AT1G06170
57 AT1G50680  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  AT2G42280
58 AT1G50680  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  AT1G51140
59 AT1G50680  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  AT1G35460
60 AT1G50680  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  HEC1
61 AT1G50680  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  UNE12
62 AT1G50680  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  LRL3
63 AT1G50680  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  ATRSL1; RSL1
64 AT1G50680  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  ATWRKY53
65 AT1G50680  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  ATWRKY44; DSL1; TTG2; WRKY44
66 AT1G50680  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  ATBET10; BET10
67 AT1G50680  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  AT4G17780
68 AT1G50680  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  ATMYB64; ATMYB92; MYB92
69 AT1G50680  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  ATMYB35; TDF1
70 AT1G50680  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  ATMYB26; MS35; MYB26
71 AT1G50680  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  ATMYB122; MYB122
72 AT1G50680  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  AtMYB60; MYB60
73 AT1G50680  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  AtMYB41; MYB41
74 AT1G50680  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  CRF6
75 AT1G50680  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  AT2G22200
76 AT1G50680  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  ATERF38; ERF38
77 AT1G50680  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  RAP2.1
78 AT1G50680  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  bZIP19
79 AT1G50680  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  OBF4
80 AT1G50680  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  AtbZIP52; bZIP52
81 AT1G50680  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  ATBZIP2; bZIP2; GBF5
82 AT1G50680  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  AT1G60250
83 AT1G50680  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  AT4G15250
84 AT1G50680  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  CO; FG
85 AT1G50680  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  FCA
86 AT1G50680  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  ABI1 family46, coding gene
87 AT1G50680  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  BSH; CHE1
88 AT1G50680  --  interacts with  --  TPR2  --  interacts with  --  AT3G21890
89 AT1G50680  --  interacts with  --  TPR2  --  interacts with  --  AT1G25550
90 AT1G50680  --  interacts with  --  TPR2  --  interacts with  --  AtbZIP67; DPBF2
91 AT1G50680  --  interacts with  --  TPR2  --  interacts with  --  ATWRKY6; WRKY6
92 AT1G50680  --  interacts with  --  TPR2  --  interacts with  --  OBF5
93 AT1G50680  --  interacts with  --  TPR2  --  interacts with  --  GATA16
94 AT1G50680  --  interacts with  --  TPR2  --  interacts with  --  ATAUX2-11; IAA4
95 AT1G50680  --  interacts with  --  TPR2  --  interacts with  --  IAA3
96 AT1G50680  --  interacts with  --  TPR2  --  interacts with  --  ZFP4
97 AT1G50680  --  interacts with  --  TPR2  --  interacts with  --  RVE1
98 AT1G50680  --  interacts with  --  TPR2  --  interacts with  --  ATZFP10; ZFP10
99 AT1G50680  --  interacts with  --  TPR2  --  interacts with  --  AGL15
100 AT1G50680  --  interacts with  --  TPR2  --  interacts with  --  AT2G33550
101 AT1G50680  --  interacts with  --  TPR2  --  interacts with  --  AT1G68670
102 AT1G50680  --  interacts with  --  TPR2  --  interacts with  --  IAA13
103 AT1G50680  --  interacts with  --  TPR2  --  interacts with  --  ATMYB73; MYB73
104 AT1G50680  --  interacts with  --  TPR2  --  interacts with  --  SOC1
105 AT1G50680  --  interacts with  --  TPR2  --  interacts with  --  MEE35; TCP4
106 AT1G50680  --  interacts with  --  TPR2  --  interacts with  --  ATMYB3R2; MYB3R-2; MYB3R2; PC-MYB2
107 AT1G50680  --  interacts with  --  TPR2  --  interacts with  --  AT-HSFB2B; HSFB2B
108 AT1G50680  --  interacts with  --  TPR2  --  interacts with  --  IAA19
109 AT1G50680  --  interacts with  --  TPR2  --  interacts with  --  AP2; FL1; FLO2
110 AT1G50680  --  interacts with  --  TPR2  --  interacts with  --  SPL1
111 AT1G50680  --  interacts with  --  TPR2  --  interacts with  --  RAV1
112 AT1G50680  --  interacts with  --  TPR2  --  interacts with  --  bZIP23
113 AT1G50680  --  interacts with  --  TPR2  --  interacts with  --  ATBZIP9; BZIP9; BZO2H2
114 AT1G50680  --  interacts with  --  TPR2  --  interacts with  --  AS1
115 AT1G50680  --  interacts with  --  TPR2  --  interacts with  --  IAA11
116 AT1G50680  --  interacts with  --  TPR2  --  interacts with  --  AXR5
117 AT1G50680  --  interacts with  --  TPR2  --  interacts with  --  ARF17
118 AT1G50680  --  interacts with  --  TPR2  --  interacts with  --  IAA2
119 AT1G50680  --  interacts with  --  TPR2  --  interacts with  --  IAA10
120 AT1G50680  --  interacts with  --  TPR2  --  interacts with  --  RAP2.7; TOE1
121 AT1G50680  --  interacts with  --  TPR2  --  interacts with  --  CHR4; PKR1
122 AT1G50680  --  interacts with  --  TPR2  --  interacts with  --  TCP8
123 AT1G50680  --  interacts with  --  TPR2  --  interacts with  --  IAA8
124 AT1G50680  --  interacts with  --  TPR2  --  interacts with  --  ATMYB7; ATY49; MYB7
125 AT1G50680  --  interacts with  --  TPR2  --  interacts with  --  AT-HSFB1; ATHSF4; HSF4; HSFB1
126 AT1G50680  --  interacts with  --  TPR2  --  interacts with  --  AT1G25560
127 AT1G50680  --  interacts with  --  TPR2  --  interacts with  --  EPR1; RVE7
128 AT1G50680  --  interacts with  --  TPR2  --  interacts with  --  ASL39; LBD37
129 AT1G50680  --  interacts with  --  TPR2  --  interacts with  --  LBD41
130 AT1G50680  --  interacts with  --  TPR2  --  interacts with  --  AtHsp90.2; ERD8; HSP81-2; HSP90.2
131 AT1G50680  --  interacts with  --  TPR2  --  interacts with  --  NZZ; SPL
132 AT1G50680  --  interacts with  --  TPR2  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.846075) with  --  GTE4
   Funding by the National Science Foundation    Funding by the Oklahoma Center for the Advancement of Science & Technology    Additional funding by the Samuel Roberts Noble Foundation

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