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Welcome to HRGRN
A Graph Search-Empowered Integrative Database of Arabidopsis Signaling Transduction, Metabolism and Gene Regulation Networks   
Location:  Home > Details for node AG
Type: Protein GRN ID: np34559 Name: AG
Annotation: AG | K-box region and MADS-box transcription factor family protein
Gene Locus: AT4G18960
Transcription factor /
transcriptional regulator:
transcription factor family MADS-MIKC
Gene Expression (Affy ATH1 probeset): 254595_at    
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 as format     
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 Protein modification
 Protein-protein interaction
        also include predicted relationship
 Compound-protein interaction
 TF-target gene regulation
 Small RNA-target regulation
        also include predicted relationship
 Carrier and transported molecule
 Catalytic chemical reaction
 Co-expressed gene pair
        with mutual information value >

  Ignore nodes having > relationships
 
Relationship type:  protein modification     catalytic chemical reaction     protein-protein interaction    
compound-protein interaction     TF-target gene regulation     small RNA-target regulation    
co-expressed gene pair     carrier and transported molecule     family/complex and member
Relationship evidence:  Solid line: validated          Dashed line: predicted
Relationship direction: Arrow: positive          T shape: negative          None arrow: unknown or n/a
Hormone association: Thicker line: hormone related relationship         : hormone related Node
Node type:  Transcription factor or transcriptional regulator       Compound       Kinase
 Small regulatory RNA (miRNA & ta-siRNA)       Other nodes
No. Path
2 AG  --  interacts with  --  AGL16
3 AG  --  interacts with  --  AGL13
4 AG  --  interacts with  --  ful
5 AG  --  interacts with  --  AGL6
6 AG  --  interacts with  --  AGL4; SEP2
7 AG  --  interacts with  --  AGL2; SEP1
8 AG  --  interacts with  --  PI
9 AG  --  interacts with  --  ap1
10 AG  --  interacts with  --  FLOR1; FLR1
11 AG  --  interacts with  --  AGL97
12 AG  --  interacts with  --  AT1G48150
13 AG  --  interacts with  --  AGL39
14 AG  --  interacts with  --  AGL24
15 AG  --  interacts with  --  AGL21
16 AG  --  interacts with  --  AGL15
17 AG  --  regulates the expression of   --  ATH1
18 AG  --  regulates the expression of   --  AP3; ATAP3
19 AG  --  regulates the expression of   --  AT3G11000
20 AG  --  regulates the expression of   --  CRC
21 AG  --  regulates the expression of   --  AT1G47610
22 AG  --  regulates the expression of   --  AGL9; SEP3
23 AG  --  regulates the expression of   --  ATGA3OX1
24 AG  --  regulates the expression of   --  JGL; NUB
25 AG  --  is regulated by  --  LFY
26 AG  --  is regulated by  --  BLH9; BLR; HB-6; LSN; PNY; RPL; VAN
27 AG  --  is regulated by  --  PGA6; WUS; WUS1
28 AG  --  interacts with  --  AGL16  --  interacts with  --  FLC
29 AG  --  interacts with  --  AGL16  --  interacts with  --  AGL63; GOA
30 AG  --  interacts with  --  AGL16  --  interacts with  --  AGL44; ANR1
31 AG  --  interacts with  --  AGL16  --  interacts with  --  AGL17
32 AG  --  interacts with  --  AGL16  --  interacts with  --  AGL12; XAL1
33 AG  --  interacts with  --  AGL16  --  interacts with  --  AGL53
34 AG  --  interacts with  --  AGL16  --  interacts with  --  AGL42
35 AG  --  interacts with  --  AGL16  --  interacts with  --  AGL14
36 AG  --  interacts with  --  AGL16  --  is the target gene of  --  ath-miR824
37 AG  --  interacts with  --  ful  --  interacts with  --  LSU1
38 AG  --  interacts with  --  ful  --  interacts with  --  AT3G09250
39 AG  --  interacts with  --  ful  --  interacts with  --  AGL3; SEP4
40 AG  --  interacts with  --  AGL6  --  interacts with  --  AGL92
41 AG  --  interacts with  --  AGL6  --  interacts with  --  AGL86
42 AG  --  interacts with  --  AGL6  --  interacts with  --  AGL78
43 AG  --  interacts with  --  AGL6  --  interacts with  --  AGL66
44 AG  --  interacts with  --  AGL2; SEP1  --  interacts with  --  AGL71
45 AG  --  interacts with  --  AGL2; SEP1  --  interacts with  --  OCP3
46 AG  --  interacts with  --  AGL2; SEP1  --  interacts with  --  ATIMPALPHA3; IMPA-3; MOS6
47 AG  --  interacts with  --  AGL2; SEP1  --  interacts with  --  AT4G03150
48 AG  --  interacts with  --  AGL2; SEP1  --  interacts with  --  AT4G17486
49 AG  --  interacts with  --  PI  --  regulates the expression of   --  PRE1
50 AG  --  interacts with  --  PI  --  interacts with  --  CERK1; LYSM RLK1
51 AG  --  interacts with  --  PI  --  interacts with  --  AtTCP15; TCP15
52 AG  --  interacts with  --  ap1  --  interacts with  --  BOP2
53 AG  --  interacts with  --  ap1  --  interacts with  --  BOP1
54 AG  --  interacts with  --  ap1  --  interacts with  --  ATVIT1; VIT1
55 AG  --  interacts with  --  ap1  --  is regulated by  --  FT?
56 AG  --  interacts with  --  ap1  --  is regulated by  --  SPL8
57 AG  --  interacts with  --  AGL97  --  interacts with  --  AGL26
58 AG  --  interacts with  --  AGL97  --  interacts with  --  AGL104
59 AG  --  interacts with  --  AGL97  --  interacts with  --  AGL103
60 AG  --  interacts with  --  AGL97  --  interacts with  --  AGL101
61 AG  --  interacts with  --  AGL97  --  interacts with  --  AGL90
62 AG  --  interacts with  --  AGL97  --  interacts with  --  AGL89
63 AG  --  interacts with  --  AGL97  --  interacts with  --  AGL87
64 AG  --  interacts with  --  AGL97  --  interacts with  --  AGL82
65 AG  --  interacts with  --  AGL97  --  interacts with  --  AGL77
66 AG  --  interacts with  --  AGL97  --  interacts with  --  AGL76
67 AG  --  interacts with  --  AGL97  --  interacts with  --  AGL65
68 AG  --  interacts with  --  AGL97  --  interacts with  --  AGL62
69 AG  --  interacts with  --  AGL97  --  interacts with  --  AGL52
70 AG  --  interacts with  --  AGL97  --  interacts with  --  AGL43
71 AG  --  interacts with  --  AGL97  --  interacts with  --  AGL37; PHE1
72 AG  --  interacts with  --  AT1G48150  --  interacts with  --  AGL96
73 AG  --  interacts with  --  AT1G48150  --  interacts with  --  AGL72
74 AG  --  interacts with  --  AT1G48150  --  interacts with  --  AGL56
75 AG  --  interacts with  --  AT1G48150  --  interacts with  --  AGL55
76 AG  --  interacts with  --  AT1G48150  --  interacts with  --  AGL49
77 AG  --  interacts with  --  AT1G48150  --  interacts with  --  ATSWI3B?
78 AG  --  interacts with  --  AGL24  --  interacts with  --  IMK3; MRLK
79 AG  --  interacts with  --  AGL24  --  is regulated by  --  FD
80 AG  --  interacts with  --  AGL21  --  interacts with  --  AGL19; GL19
81 AG  --  interacts with  --  AGL21  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.932882) with  --  AT1G22440
82 AG  --  interacts with  --  AGL15  --  regulates the expression of   --  DTA2
83 AG  --  interacts with  --  AGL15  --  regulates the expression of   --  DTA4
84 AG  --  interacts with  --  AGL15  --  regulates the expression of   --  ATGA2OX6
85 AG  --  interacts with  --  AGL15  --  interacts with  --  ATHD1; ATHDA19; HD1; HDA1; HDA19; RPD3A
86 AG  --  interacts with  --  AGL15  --  interacts with  --  ATSAP18; SAP18
87 AG  --  interacts with  --  AGL15  --  interacts with  --  TPR2
88 AG  --  interacts with  --  AGL15  --  is modified by  --  ATMPK8; MPK8
89 AG  --  regulates the expression of   --  ATH1  --  interacts with  --  KNAT6; KNAT6L; KNAT6S
90 AG  --  regulates the expression of   --  ATH1  --  interacts with  --  ATK1; KNAT2
91 AG  --  regulates the expression of   --  ATH1  --  interacts with  --  KNAT4
92 AG  --  regulates the expression of   --  ATH1  --  interacts with  --  IXR11; KNAT7
93 AG  --  regulates the expression of   --  ATH1  --  interacts with  --  ATOFP1; OFP1
94 AG  --  regulates the expression of   --  ATH1  --  interacts with  --  AT5G04830
95 AG  --  regulates the expression of   --  ATH1  --  interacts with  --  APA1; ATAPA1
96 AG  --  regulates the expression of   --  ATH1  --  interacts with  --  CIB5
97 AG  --  regulates the expression of   --  ATH1  --  interacts with  --  BUM; BUM1; SHL; STM; WAM; WAM1
98 AG  --  regulates the expression of   --  ATH1  --  interacts with  --  BLH4; SAW2
99 AG  --  regulates the expression of   --  ATH1  --  interacts with  --  BLH1; EDA29
100 AG  --  regulates the expression of   --  ATH1  --  interacts with  --  BP; BP1; KNAT1
101 AG  --  regulates the expression of   --  ATH1  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.853866) with  --  AT2G24060
102 AG  --  regulates the expression of   --  ATH1  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.862189) with  --  FUG1
103 AG  --  regulates the expression of   --  ATH1  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.834768) with  --  AT1G49975
104 AG  --  regulates the expression of   --  ATH1  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.882641) with  --  AT1G14270
105 AG  --  regulates the expression of   --  ATH1  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.885688) with  --  AT3G05180
106 AG  --  regulates the expression of   --  ATH1  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.831983) with  --  ANTR2; PHT4;4
107 AG  --  regulates the expression of   --  ATH1  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.836286) with  --  AT3G48200
108 AG  --  regulates the expression of   --  ATH1  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.842105) with  --  CRR7
109 AG  --  regulates the expression of   --  ATH1  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.908006) with  --  APO2; emb1629
110 AG  --  regulates the expression of   --  ATH1  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.809465) with  --  RPL9
111 AG  --  regulates the expression of   --  ATH1  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.855279) with  --  AT5G20935
112 AG  --  regulates the expression of   --  AP3; ATAP3  --  interacts with  --  SEU
113 AG  --  regulates the expression of   --  AGL9; SEP3  --  interacts with  --  AGL22; SVP
114 AG  --  regulates the expression of   --  AGL9; SEP3  --  interacts with  --  SOC1
115 AG  --  regulates the expression of   --  AGL9; SEP3  --  interacts with  --  AGL11; STK
116 AG  --  regulates the expression of   --  AGL9; SEP3  --  interacts with  --  AGL5; SHP2
117 AG  --  regulates the expression of   --  AGL9; SEP3  --  interacts with  --  AGL1; SHP1
118 AG  --  regulates the expression of   --  AGL9; SEP3  --  interacts with  --  ABS; AGL32; TT16
119 AG  --  regulates the expression of   --  AGL9; SEP3  --  interacts with  --  CAL
120 AG  --  regulates the expression of   --  ATGA3OX1  --  interacts with  --  AGF1
121 AG  --  regulates the expression of   --  ATGA3OX1  --  has product (in catalytic reaction)  --  GA1
122 AG  --  regulates the expression of   --  ATGA3OX1  --  is a member of  --  ATGA3OX1 family94, coding gene
123 AG  --  regulates the expression of   --  ATGA3OX1  --  is regulated by  --  DAG1/PIL5
124 AG  --  regulates the expression of   --  ATGA3OX1  --  is regulated by  --  som
125 AG  --  regulates the expression of   --  ATGA3OX1  --  is regulated by  --  fus3
126 AG  --  is regulated by  --  LFY  --  is regulated by  --  spl family, transcription factor gene
127 AG  --  is regulated by  --  LFY  --  is regulated by  --  GAMYB33
128 AG  --  is regulated by  --  LFY  --  is regulated by  --  GBF1
129 AG  --  is regulated by  --  LFY  --  interacts with  --  CHR3; SYD
130 AG  --  is regulated by  --  LFY  --  interacts with  --  MYB17
131 AG  --  is regulated by  --  LFY  --  interacts with  --  UFO
132 AG  --  is regulated by  --  LFY  --  is modified by  --  CKL6; PAPK1
133 AG  --  is regulated by  --  BLH9; BLR; HB-6; LSN; PNY; RPL; VAN  --  interacts with  --  KNAT3
134 AG  --  is regulated by  --  BLH9; BLR; HB-6; LSN; PNY; RPL; VAN  --  interacts with  --  KNAT5
135 AG  --  is regulated by  --  BLH9; BLR; HB-6; LSN; PNY; RPL; VAN  --  interacts with  --  BLH3
136 AG  --  is regulated by  --  PGA6; WUS; WUS1  --  regulates the expression of   --  ARR15
137 AG  --  is regulated by  --  PGA6; WUS; WUS1  --  regulates the expression of   --  ARR7
138 AG  --  is regulated by  --  PGA6; WUS; WUS1  --  interacts with  --  ATCLV1; CLV1; FAS3; FLO5
139 AG  --  is regulated by  --  PGA6; WUS; WUS1  --  interacts with  --  AtLa1; La1
   Funding by the National Science Foundation    Funding by the Oklahoma Center for the Advancement of Science & Technology    Additional funding by the Samuel Roberts Noble Foundation


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