Screen Resolution:     
Welcome to HRGRN
A Graph Search-Empowered Integrative Database of Arabidopsis Signaling Transduction, Metabolism and Gene Regulation Networks   
Location:  Home > Details for node BSH; CHE1
Type: Protein GRN ID: np30645 Name: BSH; CHE1
Annotation: BSH, CHE1 | transcription regulatory protein SNF5, putative (BSH)
Gene Locus: AT3G17590
Gene Expression (Affy ATH1 probeset): 258405_at    
Graph Customization
   
Choose color for highlight:  
Display edge: validated and predicted
Display node/edge prompt:
Layout:
 as format     
Data Filter
 Protein modification
 Protein-protein interaction
        also include predicted relationship
 Compound-protein interaction
 TF-target gene regulation
 Small RNA-target regulation
        also include predicted relationship
 Carrier and transported molecule
 Catalytic chemical reaction
 Co-expressed gene pair
        with mutual information value >

  Ignore nodes having > relationships
 
Relationship type:  protein modification     catalytic chemical reaction     protein-protein interaction    
compound-protein interaction     TF-target gene regulation     small RNA-target regulation    
co-expressed gene pair     carrier and transported molecule     family/complex and member
Relationship evidence:  Solid line: validated          Dashed line: predicted
Relationship direction: Arrow: positive          T shape: negative          None arrow: unknown or n/a
Hormone association: Thicker line: hormone related relationship         : hormone related Node
Node type:  Transcription factor or transcriptional regulator       Compound       Kinase
 Small regulatory RNA (miRNA & ta-siRNA)       Other nodes
No. Path
2 BSH; CHE1  --  interacts with  --  AT1G51120
3 BSH; CHE1  --  interacts with  --  TCP5
4 BSH; CHE1  --  interacts with  --  AT-TCP20; ATTCP20; PCF1; TCP20
5 BSH; CHE1  --  interacts with  --  TCP8
6 BSH; CHE1  --  interacts with  --  STOP1
7 BSH; CHE1  --  interacts with  --  KNAT3
8 BSH; CHE1  --  interacts with  --  ATSWI3B?
9 BSH; CHE1  --  interacts with  --  AT1G51120  --  interacts with  --  CHR3; SYD
10 BSH; CHE1  --  interacts with  --  AT1G51120  --  interacts with  --  TPR4; WSIP2
11 BSH; CHE1  --  interacts with  --  AT1G51120  --  interacts with  --  TPR3
12 BSH; CHE1  --  interacts with  --  AT1G51120  --  interacts with  --  TPR2
13 BSH; CHE1  --  interacts with  --  TCP5  --  interacts with  --  ATWRKY28; WRKY28
14 BSH; CHE1  --  interacts with  --  TCP5  --  interacts with  --  NZZ; SPL
15 BSH; CHE1  --  interacts with  --  TCP5  --  interacts with  --  AtTCP11; TCP11
16 BSH; CHE1  --  interacts with  --  TCP5  --  interacts with  --  AtTCP15; TCP15
17 BSH; CHE1  --  interacts with  --  TCP5  --  interacts with  --  AT5G51910
18 BSH; CHE1  --  interacts with  --  TCP5  --  interacts with  --  AT1G35560
19 BSH; CHE1  --  interacts with  --  TCP5  --  interacts with  --  AT2G37000
20 BSH; CHE1  --  interacts with  --  TCP5  --  interacts with  --  TCP3
21 BSH; CHE1  --  interacts with  --  TCP5  --  interacts with  --  MEE35; TCP4
22 BSH; CHE1  --  interacts with  --  TCP5  --  interacts with  --  TCP2; TCP2
23 BSH; CHE1  --  interacts with  --  TCP5  --  interacts with  --  TCP10
24 BSH; CHE1  --  interacts with  --  TCP5  --  interacts with  --  ATTCP24; TCP24
25 BSH; CHE1  --  interacts with  --  TCP5  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD
26 BSH; CHE1  --  interacts with  --  TCP5  --  interacts with  --  TCP17
27 BSH; CHE1  --  interacts with  --  AT-TCP20; ATTCP20; PCF1; TCP20  --  interacts with  --  ANAC019; NAC019
28 BSH; CHE1  --  interacts with  --  AT-TCP20; ATTCP20; PCF1; TCP20  --  interacts with  --  SARD1
29 BSH; CHE1  --  interacts with  --  AT-TCP20; ATTCP20; PCF1; TCP20  --  interacts with  --  SRFR1
30 BSH; CHE1  --  interacts with  --  AT-TCP20; ATTCP20; PCF1; TCP20  --  interacts with  --  RGA1
31 BSH; CHE1  --  interacts with  --  AT-TCP20; ATTCP20; PCF1; TCP20  --  interacts with  --  PUR ALPHA-1
32 BSH; CHE1  --  interacts with  --  AT-TCP20; ATTCP20; PCF1; TCP20  --  regulates the expression of   --  CYC1; CYCB1; CYCB1;1
33 BSH; CHE1  --  interacts with  --  AT-TCP20; ATTCP20; PCF1; TCP20  --  regulates the expression of   --  XTH32
34 BSH; CHE1  --  interacts with  --  AT-TCP20; ATTCP20; PCF1; TCP20  --  regulates the expression of   --  ATPCNA2; PCNA2
35 BSH; CHE1  --  interacts with  --  AT-TCP20; ATTCP20; PCF1; TCP20  --  regulates the expression of   --  ATCYTC-A; CYTC-1
36 BSH; CHE1  --  interacts with  --  TCP8  --  interacts with  --  AT5G23280
37 BSH; CHE1  --  interacts with  --  TCP8  --  interacts with  --  PNM1
38 BSH; CHE1  --  interacts with  --  STOP1  --  interacts with  --  ARR14
39 BSH; CHE1  --  interacts with  --  STOP1  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.840281) with  --  AT2G37660
40 BSH; CHE1  --  interacts with  --  STOP1  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.811429) with  --  AT2G25830
41 BSH; CHE1  --  interacts with  --  STOP1  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.825676) with  --  AT2G24060
42 BSH; CHE1  --  interacts with  --  STOP1  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.806256) with  --  ZKT
43 BSH; CHE1  --  interacts with  --  STOP1  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.801007) with  --  AT1G77090
44 BSH; CHE1  --  interacts with  --  STOP1  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.80302) with  --  Aty2; ty2
45 BSH; CHE1  --  interacts with  --  STOP1  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.839272) with  --  AT1G74730
46 BSH; CHE1  --  interacts with  --  STOP1  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.882467) with  --  AT1G44000
47 BSH; CHE1  --  interacts with  --  STOP1  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.814014) with  --  ATPRX Q
48 BSH; CHE1  --  interacts with  --  STOP1  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.832986) with  --  CP33; PDE322
49 BSH; CHE1  --  interacts with  --  STOP1  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.886793) with  --  AT1G18060
50 BSH; CHE1  --  interacts with  --  STOP1  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.830941) with  --  ANTR2; PHT4;4
51 BSH; CHE1  --  interacts with  --  STOP1  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.803688) with  --  AT4G02530
52 BSH; CHE1  --  interacts with  --  STOP1  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.836806) with  --  AOP2
53 BSH; CHE1  --  interacts with  --  STOP1  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.82887) with  --  CH-42; CH42; CHL11; CHLI-1; CHLI1
54 BSH; CHE1  --  interacts with  --  STOP1  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.829147) with  --  ACP4
55 BSH; CHE1  --  interacts with  --  STOP1  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.835984) with  --  PSB28
56 BSH; CHE1  --  interacts with  --  STOP1  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.806628) with  --  41518
57 BSH; CHE1  --  interacts with  --  STOP1  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.877122) with  --  CYP20-3; ROC4
58 BSH; CHE1  --  interacts with  --  STOP1  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.800868) with  --  AT3G61870
59 BSH; CHE1  --  interacts with  --  STOP1  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.8052) with  --  APG1; E37; IEP37; VTE3
60 BSH; CHE1  --  interacts with  --  STOP1  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.861806) with  --  AT5G25770
61 BSH; CHE1  --  interacts with  --  STOP1  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.938682) with  --  AT5G35370
62 BSH; CHE1  --  interacts with  --  STOP1  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.841914) with  --  RPL9
63 BSH; CHE1  --  interacts with  --  STOP1  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.833677) with  --  AT5G28500
64 BSH; CHE1  --  interacts with  --  STOP1  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.859379) with  --  LIL3:1
65 BSH; CHE1  --  interacts with  --  KNAT3  --  interacts with  --  KNAT4
66 BSH; CHE1  --  interacts with  --  KNAT3  --  interacts with  --  ATOFP2; OFP2
67 BSH; CHE1  --  interacts with  --  KNAT3  --  interacts with  --  ATOFP1; OFP1
68 BSH; CHE1  --  interacts with  --  KNAT3  --  interacts with  --  ATOFP4; OFP4
69 BSH; CHE1  --  interacts with  --  KNAT3  --  interacts with  --  ATOFP12; OFP12
70 BSH; CHE1  --  interacts with  --  KNAT3  --  interacts with  --  ATOFP14; OFP14
71 BSH; CHE1  --  interacts with  --  KNAT3  --  interacts with  --  CIB5
72 BSH; CHE1  --  interacts with  --  KNAT3  --  interacts with  --  APA1; ATAPA1
73 BSH; CHE1  --  interacts with  --  KNAT3  --  interacts with  --  AT4G37130
74 BSH; CHE1  --  interacts with  --  KNAT3  --  interacts with  --  EMB2819
75 BSH; CHE1  --  interacts with  --  KNAT3  --  interacts with  --  BLH9; BLR; HB-6; LSN; PNY; RPL; VAN
76 BSH; CHE1  --  interacts with  --  KNAT3  --  interacts with  --  BLH7
77 BSH; CHE1  --  interacts with  --  KNAT3  --  interacts with  --  BLH6
78 BSH; CHE1  --  interacts with  --  KNAT3  --  interacts with  --  BLH5
79 BSH; CHE1  --  interacts with  --  KNAT3  --  interacts with  --  BLH4; SAW2
80 BSH; CHE1  --  interacts with  --  KNAT3  --  interacts with  --  BLH3
81 BSH; CHE1  --  interacts with  --  KNAT3  --  interacts with  --  BLH2; SAW1
82 BSH; CHE1  --  interacts with  --  KNAT3  --  interacts with  --  BLH1; EDA29
83 BSH; CHE1  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  ASL16; LBD29
84 BSH; CHE1  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  ARF3
85 BSH; CHE1  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  AT1G50680
86 BSH; CHE1  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  TCP16
87 BSH; CHE1  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  AT3G24860
88 BSH; CHE1  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  AtHAM4; HAM4
89 BSH; CHE1  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  AT3G50650
90 BSH; CHE1  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  SCL1
91 BSH; CHE1  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  AT-HSFA6A; HSFA6A
92 BSH; CHE1  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  AT-HSFA3; HSFA3
93 BSH; CHE1  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  ARLIM15; ATDMC1; DMC1
94 BSH; CHE1  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  PHL1
95 BSH; CHE1  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  AT5G06800
96 BSH; CHE1  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  NF-YA5; NFYA5
97 BSH; CHE1  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  AtIDD16; IDD16
98 BSH; CHE1  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  AT1G48150
99 BSH; CHE1  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  HB-1
100 BSH; CHE1  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  ATHB40; HB-5; HB40
101 BSH; CHE1  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  anac032; NAC032
102 BSH; CHE1  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  AT1G72210
103 BSH; CHE1  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  AT1G22490
104 BSH; CHE1  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  AT3G61950
105 BSH; CHE1  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  BHLH42; TT8
106 BSH; CHE1  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  ATMYC2
107 BSH; CHE1  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  AT2G22760
108 BSH; CHE1  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  NAI1
109 BSH; CHE1  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  AT1G06170
110 BSH; CHE1  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  AT2G42280
111 BSH; CHE1  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  AT1G51140
112 BSH; CHE1  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  AT1G35460
113 BSH; CHE1  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  HEC1
114 BSH; CHE1  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  UNE12
115 BSH; CHE1  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  LRL3
116 BSH; CHE1  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  ATRSL1; RSL1
117 BSH; CHE1  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  ATWRKY53
118 BSH; CHE1  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  ATWRKY44; DSL1; TTG2; WRKY44
119 BSH; CHE1  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  ATBET10; BET10
120 BSH; CHE1  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  AT4G17780
121 BSH; CHE1  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  ATMYB64; ATMYB92; MYB92
122 BSH; CHE1  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  ATMYB35; TDF1
123 BSH; CHE1  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  ATMYB26; MS35; MYB26
124 BSH; CHE1  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  ATMYB122; MYB122
125 BSH; CHE1  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  AtMYB60; MYB60
126 BSH; CHE1  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  AtMYB41; MYB41
127 BSH; CHE1  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  CRF6
128 BSH; CHE1  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  AT2G22200
129 BSH; CHE1  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  ATERF38; ERF38
130 BSH; CHE1  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  RAP2.1
131 BSH; CHE1  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  bZIP19
132 BSH; CHE1  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  OBF4
133 BSH; CHE1  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  AtbZIP52; bZIP52
134 BSH; CHE1  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  ATBZIP2; bZIP2; GBF5
135 BSH; CHE1  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  AT1G60250
136 BSH; CHE1  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  AT4G15250
137 BSH; CHE1  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  CO; FG
138 BSH; CHE1  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  FCA
139 BSH; CHE1  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  ABI1 family46, coding gene
   Funding by the National Science Foundation    Funding by the Oklahoma Center for the Advancement of Science & Technology    Additional funding by the Samuel Roberts Noble Foundation

Copyright © The Zhao Lab

Disclaimer | Contact