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Welcome to HRGRN
A Graph Search-Empowered Integrative Database of Arabidopsis Signaling Transduction, Metabolism and Gene Regulation Networks   
Location:  Home > Details for node FCA
Type: Protein GRN ID: np32539 Name: FCA
Annotation: FCA | RNA binding;abscisic acid binding
Gene Locus: AT4G16280
Gene Expression (Affy ATH1 probeset): 245489_at    
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 as format     
Data Filter
 Protein modification
 Protein-protein interaction
        also include predicted relationship
 Compound-protein interaction
 TF-target gene regulation
 Small RNA-target regulation
        also include predicted relationship
 Carrier and transported molecule
 Catalytic chemical reaction
 Co-expressed gene pair
        with mutual information value >

  Ignore nodes having > relationships
 
Relationship type:  protein modification     catalytic chemical reaction     protein-protein interaction    
compound-protein interaction     TF-target gene regulation     small RNA-target regulation    
co-expressed gene pair     carrier and transported molecule     family/complex and member
Relationship evidence:  Solid line: validated          Dashed line: predicted
Relationship direction: Arrow: positive          T shape: negative          None arrow: unknown or n/a
Hormone association: Thicker line: hormone related relationship         : hormone related Node
Node type:  Transcription factor or transcriptional regulator       Compound       Kinase
 Small regulatory RNA (miRNA & ta-siRNA)       Other nodes
No. Path
2 FCA  --  interacts with  --  ABI5
3 FCA  --  interacts with  --  PIF4
4 FCA  --  interacts with  --  FY
5 FCA  --  interacts with  --  ATSWI3B?
6 FCA  --  interacts with  --  ABI5  --  regulates the expression of   --  ABI4
7 FCA  --  interacts with  --  ABI5  --  regulates the expression of   --  ABF1 family47, transcription factor gene
8 FCA  --  interacts with  --  ABI5  --  regulates the expression of   --  FLC
9 FCA  --  interacts with  --  ABI5  --  regulates the expression of   --  ATEM6; EM6; GEA6
10 FCA  --  interacts with  --  ABI5  --  is regulated by  --  AtWRKY2
11 FCA  --  interacts with  --  ABI5  --  is regulated by  --  sdir1
12 FCA  --  interacts with  --  ABI5  --  is regulated by  --  AFP1
13 FCA  --  interacts with  --  ABI5  --  is regulated by  --  ABI3
14 FCA  --  interacts with  --  ABI5  --  is regulated by  --  SNRK2-3 family52, coding gene
15 FCA  --  interacts with  --  ABI5  --  is regulated by  --  ARR6
16 FCA  --  interacts with  --  ABI5  --  is regulated by  --  ARR5
17 FCA  --  interacts with  --  ABI5  --  is regulated by  --  ARR4
18 FCA  --  interacts with  --  ABI5  --  is regulated by  --  WRKY18
19 FCA  --  interacts with  --  ABI5  --  is regulated by  --  W-BOX
20 FCA  --  interacts with  --  ABI5  --  is regulated by  --  ATWRKY60; WRKY60
21 FCA  --  interacts with  --  ABI5  --  is regulated by  --  HY5
22 FCA  --  interacts with  --  ABI5  --  interacts with  --  AHG3/pp2ca
23 FCA  --  interacts with  --  ABI5  --  interacts with  --  ATCDPK2/CPK11
24 FCA  --  interacts with  --  ABI5  --  interacts with  --  ABF3
25 FCA  --  interacts with  --  ABI5  --  interacts with  --  ABF1
26 FCA  --  interacts with  --  ABI5  --  interacts with  --  AHG1
27 FCA  --  interacts with  --  ABI5  --  interacts with  --  SNRK2-3
28 FCA  --  interacts with  --  ABI5  --  interacts with  --  SNRK2-2
29 FCA  --  interacts with  --  ABI5  --  interacts with  --  HAI1
30 FCA  --  interacts with  --  ABI5  --  interacts with  --  COR27
31 FCA  --  interacts with  --  ABI5  --  interacts with  --  CIR1; RVE2
32 FCA  --  interacts with  --  ABI5  --  interacts with  --  AO
33 FCA  --  interacts with  --  ABI5  --  interacts with  --  ATCAD5; CAD-5; CAD5
34 FCA  --  interacts with  --  ABI5  --  interacts with  --  AT4G23050
35 FCA  --  interacts with  --  ABI5  --  interacts with  --  AT4G16670
36 FCA  --  interacts with  --  ABI5  --  interacts with  --  AT3G48510
37 FCA  --  interacts with  --  ABI5  --  interacts with  --  AFP4; TMAC2
38 FCA  --  interacts with  --  ABI5  --  interacts with  --  AFP2
39 FCA  --  interacts with  --  ABI5  --  interacts with  --  AT1G10585
40 FCA  --  interacts with  --  ABI5  --  interacts with  --  ATBZIP12; DPBF4; EEL
41 FCA  --  interacts with  --  ABI5  --  interacts with  --  ACS10
42 FCA  --  interacts with  --  ABI5  --  interacts with  --  DRB1
43 FCA  --  interacts with  --  ABI5  --  interacts with  --  CCH/CHLH/GUN5
44 FCA  --  interacts with  --  ABI5  --  interacts with  --  ATGSK1; ATSK2-3; ATSK22; BIL2; GSK1; SK22
45 FCA  --  interacts with  --  ABI5  --  interacts with  --  ASKdZeta
46 FCA  --  interacts with  --  ABI5  --  interacts with  --  AtMYB49; MYB49
47 FCA  --  interacts with  --  ABI5  --  interacts with  --  SSP4
48 FCA  --  interacts with  --  ABI5  --  interacts with  --  ANAC072; RD26
49 FCA  --  interacts with  --  ABI5  --  interacts with  --  ABI1
50 FCA  --  interacts with  --  ABI5  --  interacts with  --  AT4G25160
51 FCA  --  interacts with  --  ABI5  --  interacts with  --  ATWNK2; WNK2; ZIK3
52 FCA  --  interacts with  --  ABI5  --  interacts with  --  AtCLO3; CLO-3; CLO3; RD20
53 FCA  --  interacts with  --  ABI5  --  interacts with  --  ATPP2-B11; PP2-B11
54 FCA  --  interacts with  --  ABI5  --  interacts with  --  anac032; NAC032
55 FCA  --  interacts with  --  ABI5  --  interacts with  --  AT1G76210
56 FCA  --  interacts with  --  ABI5  --  interacts with  --  ATPP2-A5; PP2-A5
57 FCA  --  interacts with  --  ABI5  --  interacts with  --  ANAC019; NAC019
58 FCA  --  interacts with  --  ABI5  --  interacts with  --  RAP2.4
59 FCA  --  interacts with  --  ABI5  --  interacts with  --  DCAF1
60 FCA  --  interacts with  --  ABI5  --  interacts with  --  TAP46
61 FCA  --  interacts with  --  ABI5  --  interacts with  --  AtFYPP1; FYPP1
62 FCA  --  interacts with  --  ABI5  --  interacts with  --  ATSIZ1
63 FCA  --  interacts with  --  ABI5  --  interacts with  --  PFT1
64 FCA  --  interacts with  --  ABI5  --  interacts with  --  KEG
65 FCA  --  interacts with  --  ABI5  --  is modified by  --  AT5G21326
66 FCA  --  interacts with  --  PIF4  --  regulates the expression of   --  PRE1
67 FCA  --  interacts with  --  PIF4  --  regulates the expression of   --  YUUCA8
68 FCA  --  interacts with  --  PIF4  --  regulates the expression of   --  BES1
69 FCA  --  interacts with  --  PIF4  --  is regulated by  --  della family, transcription factor gene
70 FCA  --  interacts with  --  PIF4  --  interacts with  --  ARF6
71 FCA  --  interacts with  --  PIF4  --  interacts with  --  ATDET1; DET1; FUS2
72 FCA  --  interacts with  --  PIF4  --  interacts with  --  FBI1; HFR1; REP1; RSF1
73 FCA  --  interacts with  --  PIF4  --  interacts with  --  Phytochrome B (PhyB)
74 FCA  --  interacts with  --  PIF4  --  interacts with  --  Phytochrome A (PhyA)
75 FCA  --  interacts with  --  PIF4  --  interacts with  --  ELF3; PYK20
76 FCA  --  interacts with  --  PIF4  --  interacts with  --  HLH2; PAR2
77 FCA  --  interacts with  --  PIF4  --  interacts with  --  HLH1; PAR1
78 FCA  --  interacts with  --  PIF4  --  interacts with  --  pil5
79 FCA  --  interacts with  --  PIF4  --  interacts with  --  RGL2
80 FCA  --  interacts with  --  PIF4  --  interacts with  --  PIF3
81 FCA  --  interacts with  --  PIF4  --  interacts with  --  RGA1
82 FCA  --  interacts with  --  PIF4  --  interacts with  --  APRR1; AtTOC1; PRR1; TOC1
83 FCA  --  interacts with  --  PIF4  --  has similar expression pattern (mutual information value=1.06025) with  --  PSAE-2
84 FCA  --  interacts with  --  PIF4  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.972127) with  --  ATGPX1; GPX1
85 FCA  --  interacts with  --  PIF4  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.889819) with  --  COR413-TM1; COR413IM1; COR414-TM1
86 FCA  --  interacts with  --  PIF4  --  has similar expression pattern (mutual information value=1.00437) with  --  PIFI
87 FCA  --  interacts with  --  PIF4  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.897162) with  --  AT3G18050
88 FCA  --  interacts with  --  PIF4  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.830596) with  --  CYP71B4
89 FCA  --  interacts with  --  PIF4  --  has similar expression pattern (mutual information value=1.104) with  --  AT5G02160
90 FCA  --  interacts with  --  PIF4  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.816775) with  --  AILP1; ATAILP1
91 FCA  --  interacts with  --  PIF4  --  has similar expression pattern (mutual information value=1.05488) with  --  AT5G19940
92 FCA  --  interacts with  --  FY  --  interacts with  --  ATCPSF100; CPSF100; EMB1265; ESP5
93 FCA  --  interacts with  --  FY  --  interacts with  --  DDB1A
94 FCA  --  interacts with  --  FY  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.803281) with  --  AT1G07970
95 FCA  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  ASL16; LBD29
96 FCA  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  ARF3
97 FCA  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  AT1G50680
98 FCA  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  TCP16
99 FCA  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  AT-TCP20; ATTCP20; PCF1; TCP20
100 FCA  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  TCP3
101 FCA  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  AT3G24860
102 FCA  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  AtHAM4; HAM4
103 FCA  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  AT3G50650
104 FCA  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  SCL1
105 FCA  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  AT-HSFA6A; HSFA6A
106 FCA  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  AT-HSFA3; HSFA3
107 FCA  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  ARLIM15; ATDMC1; DMC1
108 FCA  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  PHL1
109 FCA  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  AT5G06800
110 FCA  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  NF-YA5; NFYA5
111 FCA  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  AtIDD16; IDD16
112 FCA  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  AT1G48150
113 FCA  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  KNAT3
114 FCA  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  HB-1
115 FCA  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  ATHB40; HB-5; HB40
116 FCA  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  AT1G72210
117 FCA  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  AT1G22490
118 FCA  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  AT3G61950
119 FCA  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  BHLH42; TT8
120 FCA  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  ATMYC2
121 FCA  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  AT2G22760
122 FCA  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  NAI1
123 FCA  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  AT1G06170
124 FCA  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  AT2G42280
125 FCA  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  AT1G51140
126 FCA  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  AT1G35460
127 FCA  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  HEC1
128 FCA  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  UNE12
129 FCA  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  LRL3
130 FCA  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  ATRSL1; RSL1
131 FCA  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  ATWRKY53
132 FCA  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  ATWRKY44; DSL1; TTG2; WRKY44
133 FCA  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  ATBET10; BET10
134 FCA  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  AT4G17780
135 FCA  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  ATMYB64; ATMYB92; MYB92
136 FCA  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  ATMYB35; TDF1
137 FCA  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  ATMYB26; MS35; MYB26
138 FCA  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  ATMYB122; MYB122
139 FCA  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  AtMYB60; MYB60
140 FCA  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  AtMYB41; MYB41
141 FCA  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  CRF6
142 FCA  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  AT2G22200
143 FCA  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  ATERF38; ERF38
144 FCA  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  RAP2.1
145 FCA  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  bZIP19
146 FCA  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  OBF4
147 FCA  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  AtbZIP52; bZIP52
148 FCA  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  ATBZIP2; bZIP2; GBF5
149 FCA  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  AT1G60250
150 FCA  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  AT4G15250
151 FCA  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  CO; FG
152 FCA  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  ABI1 family46, coding gene
153 FCA  --  interacts with  --  ATSWI3B?  --  interacts with  --  BSH; CHE1
   Funding by the National Science Foundation    Funding by the Oklahoma Center for the Advancement of Science & Technology    Additional funding by the Samuel Roberts Noble Foundation

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