Screen Resolution:     
Welcome to HRGRN
A Graph Search-Empowered Integrative Database of Arabidopsis Signaling Transduction, Metabolism and Gene Regulation Networks   
Location:  Home > Details for node DEL1; E2FE; E2L3
Type: Protein GRN ID: np29823 Name: DEL1; E2FE; E2L3
Annotation: DEL1, E2L3, E2FE | DP-E2F-like 1
Gene Locus: AT3G48160
Transcription factor /
transcriptional regulator:
transcription factor family E2F-DP
Gene Expression (Affy ATH1 probeset):
Graph Customization
   
Choose color for highlight:  
Display edge: validated and predicted
Display node/edge prompt:
Layout:
 as format     
Data Filter
 Protein modification
 Protein-protein interaction
        also include predicted relationship
 Compound-protein interaction
 TF-target gene regulation
 Small RNA-target regulation
        also include predicted relationship
 Carrier and transported molecule
 Catalytic chemical reaction
 Co-expressed gene pair
        with mutual information value >

  Ignore nodes having > relationships
 
Relationship type:  protein modification     catalytic chemical reaction     protein-protein interaction    
compound-protein interaction     TF-target gene regulation     small RNA-target regulation    
co-expressed gene pair     carrier and transported molecule     family/complex and member
Relationship evidence:  Solid line: validated          Dashed line: predicted
Relationship direction: Arrow: positive          T shape: negative          None arrow: unknown or n/a
Hormone association: Thicker line: hormone related relationship         : hormone related Node
Node type:  Transcription factor or transcriptional regulator       Compound       Kinase
 Small regulatory RNA (miRNA & ta-siRNA)       Other nodes
No. Path
2 DEL1; E2FE; E2L3  --  interacts with  --  AT3G54390
3 DEL1; E2FE; E2L3  --  interacts with  --  AT4G25660
4 DEL1; E2FE; E2L3  --  interacts with  --  CAK1AT; CDKF;1
5 DEL1; E2FE; E2L3  --  interacts with  --  APFI; GAMMA CA2
6 DEL1; E2FE; E2L3  --  interacts with  --  ICK1; KRP1
7 DEL1; E2FE; E2L3  --  interacts with  --  CYCD5;1
8 DEL1; E2FE; E2L3  --  interacts with  --  CKS2
9 DEL1; E2FE; E2L3  --  interacts with  --  CKS1; CKS1AT
10 DEL1; E2FE; E2L3  --  regulates the expression of   --  ATMSH6; MSH6; MSH6-1
11 DEL1; E2FE; E2L3  --  interacts with  --  AT3G54390  --  interacts with  --  AT4G39820
12 DEL1; E2FE; E2L3  --  interacts with  --  AT3G54390  --  interacts with  --  AT5G52547
13 DEL1; E2FE; E2L3  --  interacts with  --  AT3G54390  --  interacts with  --  AT3G54826
14 DEL1; E2FE; E2L3  --  interacts with  --  AT3G54390  --  interacts with  --  AtTic22-IV; Tic22-IV
15 DEL1; E2FE; E2L3  --  interacts with  --  AT3G54390  --  interacts with  --  AT5G50335
16 DEL1; E2FE; E2L3  --  interacts with  --  AT3G54390  --  interacts with  --  AT4G11175
17 DEL1; E2FE; E2L3  --  interacts with  --  AT3G54390  --  interacts with  --  AT5G54750
18 DEL1; E2FE; E2L3  --  interacts with  --  AT3G54390  --  interacts with  --  AT5G41520
19 DEL1; E2FE; E2L3  --  interacts with  --  AT3G54390  --  interacts with  --  AT4G37280
20 DEL1; E2FE; E2L3  --  interacts with  --  AT3G54390  --  interacts with  --  ATWRKY36; WRKY36
21 DEL1; E2FE; E2L3  --  interacts with  --  AT3G54390  --  interacts with  --  AT3G16120
22 DEL1; E2FE; E2L3  --  interacts with  --  AT3G54390  --  interacts with  --  AT1G20770
23 DEL1; E2FE; E2L3  --  interacts with  --  AT3G54390  --  interacts with  --  CSI1
24 DEL1; E2FE; E2L3  --  interacts with  --  AT3G54390  --  interacts with  --  HIPP20
25 DEL1; E2FE; E2L3  --  interacts with  --  AT3G54390  --  interacts with  --  AT3G19120
26 DEL1; E2FE; E2L3  --  interacts with  --  AT3G54390  --  interacts with  --  AT2G36145
27 DEL1; E2FE; E2L3  --  interacts with  --  AT3G54390  --  interacts with  --  AT1G17970
28 DEL1; E2FE; E2L3  --  interacts with  --  AT3G54390  --  interacts with  --  NFD6
29 DEL1; E2FE; E2L3  --  interacts with  --  AT3G54390  --  interacts with  --  ABCI18; ATNAP4; NAP4
30 DEL1; E2FE; E2L3  --  interacts with  --  AT3G54390  --  interacts with  --  AT2G17670
31 DEL1; E2FE; E2L3  --  interacts with  --  AT3G54390  --  interacts with  --  AT2G25730
32 DEL1; E2FE; E2L3  --  interacts with  --  AT3G54390  --  interacts with  --  PQL1; PQL2
33 DEL1; E2FE; E2L3  --  interacts with  --  AT3G54390  --  interacts with  --  ATHAP3; ATNF-YB1; HAP3; HAP3A; NF-YB1
34 DEL1; E2FE; E2L3  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  AT5G58750
35 DEL1; E2FE; E2L3  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  AT5G65925
36 DEL1; E2FE; E2L3  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  AT4G31830
37 DEL1; E2FE; E2L3  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  AT5G28690
38 DEL1; E2FE; E2L3  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  AT5G47310
39 DEL1; E2FE; E2L3  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  emb2735
40 DEL1; E2FE; E2L3  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  AT4G27610
41 DEL1; E2FE; E2L3  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  PRA1.B5
42 DEL1; E2FE; E2L3  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  AT5G04740
43 DEL1; E2FE; E2L3  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  ATRAB1A; ATRABD2B; RAB1A
44 DEL1; E2FE; E2L3  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  AT5G51180
45 DEL1; E2FE; E2L3  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  AT5G57300
46 DEL1; E2FE; E2L3  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  AT5G24990
47 DEL1; E2FE; E2L3  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  AT5G09450
48 DEL1; E2FE; E2L3  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  AT5G12010
49 DEL1; E2FE; E2L3  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  AT4G25680
50 DEL1; E2FE; E2L3  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  AT5G16250
51 DEL1; E2FE; E2L3  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  PRA1.B6
52 DEL1; E2FE; E2L3  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  ATRAB-F2A; ATRAB5A; ATRABF2A; RAB-F2A; RAB5A; RABF2A; RHA1
53 DEL1; E2FE; E2L3  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  AT1G71480
54 DEL1; E2FE; E2L3  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  PRA1.B2
55 DEL1; E2FE; E2L3  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  AT1G14340
56 DEL1; E2FE; E2L3  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  ARA-3; ARA3; ATRAB8A; ATRABE1C; RAB8A; RABE1c
57 DEL1; E2FE; E2L3  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  AT2G44970
58 DEL1; E2FE; E2L3  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  AT2G34460
59 DEL1; E2FE; E2L3  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  AT2G40765
60 DEL1; E2FE; E2L3  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  AT1G59710
61 DEL1; E2FE; E2L3  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  AT1G55160
62 DEL1; E2FE; E2L3  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  ASAR1; ATSAR2; ATSARA1C; SAR2
63 DEL1; E2FE; E2L3  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  AT1G29850
64 DEL1; E2FE; E2L3  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  AT1G07840
65 DEL1; E2FE; E2L3  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  ATSAR1; ATSARA1A; SARA1A
66 DEL1; E2FE; E2L3  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  NodGS
67 DEL1; E2FE; E2L3  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  AT4G20150
68 DEL1; E2FE; E2L3  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  AT1G67860
69 DEL1; E2FE; E2L3  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  ATNFU2; NFU4
70 DEL1; E2FE; E2L3  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  AT1G67865
71 DEL1; E2FE; E2L3  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  GLX2-4
72 DEL1; E2FE; E2L3  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  PRA1.F2; PRA7
73 DEL1; E2FE; E2L3  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  AT1G08480
74 DEL1; E2FE; E2L3  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  AT2G30880
75 DEL1; E2FE; E2L3  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  AT3G13845
76 DEL1; E2FE; E2L3  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  ATISU1; ISU1
77 DEL1; E2FE; E2L3  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  AT1G49850
78 DEL1; E2FE; E2L3  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  AT3G20680
79 DEL1; E2FE; E2L3  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  ATIMPALPHA3; IMPA-3; MOS6
80 DEL1; E2FE; E2L3  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  ATRAB8; AtRab8B; AtRABE1a; RAB8
81 DEL1; E2FE; E2L3  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  AT4G17486
82 DEL1; E2FE; E2L3  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  IMPA-2
83 DEL1; E2FE; E2L3  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  AT1G78140
84 DEL1; E2FE; E2L3  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  PRA1.F3; PRA8
85 DEL1; E2FE; E2L3  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  PRA1.B4
86 DEL1; E2FE; E2L3  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  PRA1.F4
87 DEL1; E2FE; E2L3  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  AT4G17720
88 DEL1; E2FE; E2L3  --  interacts with  --  CAK1AT; CDKF;1  --  interacts with  --  ICK5; ICN6; KRP7
89 DEL1; E2FE; E2L3  --  interacts with  --  CAK1AT; CDKF;1  --  interacts with  --  CYCH;1
90 DEL1; E2FE; E2L3  --  interacts with  --  CAK1AT; CDKF;1  --  interacts with  --  CYCD4;2
91 DEL1; E2FE; E2L3  --  interacts with  --  CAK1AT; CDKF;1  --  interacts with  --  CYCD4;1
92 DEL1; E2FE; E2L3  --  interacts with  --  CAK1AT; CDKF;1  --  interacts with  --  CYCA3;4
93 DEL1; E2FE; E2L3  --  interacts with  --  CAK1AT; CDKF;1  --  interacts with  --  AT1G67580
94 DEL1; E2FE; E2L3  --  interacts with  --  CAK1AT; CDKF;1  --  interacts with  --  AT2G21237
95 DEL1; E2FE; E2L3  --  interacts with  --  CAK1AT; CDKF;1  --  interacts with  --  AT4G16444
96 DEL1; E2FE; E2L3  --  interacts with  --  CAK1AT; CDKF;1  --  interacts with  --  AKIN11; ATKIN11; KIN11; SNRK1.2
97 DEL1; E2FE; E2L3  --  interacts with  --  CAK1AT; CDKF;1  --  interacts with  --  AT;CDCKD;3; CAK2AT; CDKD1;3
98 DEL1; E2FE; E2L3  --  interacts with  --  CAK1AT; CDKF;1  --  interacts with  --  ACK2; ICK7; KRP4; KRP4
99 DEL1; E2FE; E2L3  --  interacts with  --  CAK1AT; CDKF;1  --  interacts with  --  ATDPB; DPB
100 DEL1; E2FE; E2L3  --  interacts with  --  CAK1AT; CDKF;1  --  interacts with  --  DPA
101 DEL1; E2FE; E2L3  --  interacts with  --  CAK1AT; CDKF;1  --  interacts with  --  DEL3; E2FF; E2L2
102 DEL1; E2FE; E2L3  --  interacts with  --  CAK1AT; CDKF;1  --  interacts with  --  DEL2; E2FD; E2L1
103 DEL1; E2FE; E2L3  --  interacts with  --  CAK1AT; CDKF;1  --  interacts with  --  CDKB2;2
104 DEL1; E2FE; E2L3  --  interacts with  --  CAK1AT; CDKF;1  --  interacts with  --  AT;CDKD;2; CAK4; CAK4AT; CDKD1;2; CDKD;2
105 DEL1; E2FE; E2L3  --  interacts with  --  CAK1AT; CDKF;1  --  interacts with  --  AT;CDKD;1; CAK3AT; CDKD1;1
106 DEL1; E2FE; E2L3  --  interacts with  --  CAK1AT; CDKF;1  --  interacts with  --  CDKB2;1
107 DEL1; E2FE; E2L3  --  interacts with  --  CAK1AT; CDKF;1  --  interacts with  --  CDKB1;2
108 DEL1; E2FE; E2L3  --  interacts with  --  CAK1AT; CDKF;1  --  interacts with  --  CDC2B; CDKB1;1
109 DEL1; E2FE; E2L3  --  interacts with  --  CAK1AT; CDKF;1  --  modify  --  MED22B
110 DEL1; E2FE; E2L3  --  interacts with  --  APFI; GAMMA CA2  --  interacts with  --  AT5G18910
111 DEL1; E2FE; E2L3  --  interacts with  --  APFI; GAMMA CA2  --  interacts with  --  DMS3; IDN1
112 DEL1; E2FE; E2L3  --  interacts with  --  APFI; GAMMA CA2  --  interacts with  --  AT3G43230
113 DEL1; E2FE; E2L3  --  interacts with  --  APFI; GAMMA CA2  --  interacts with  --  BPA1
114 DEL1; E2FE; E2L3  --  interacts with  --  APFI; GAMMA CA2  --  interacts with  --  AT5G16880
115 DEL1; E2FE; E2L3  --  interacts with  --  APFI; GAMMA CA2  --  interacts with  --  ATSAR1; ATSAR1B; ATSARA1B; SAR1; SAR1B
116 DEL1; E2FE; E2L3  --  interacts with  --  APFI; GAMMA CA2  --  interacts with  --  AT3G07480
117 DEL1; E2FE; E2L3  --  interacts with  --  APFI; GAMMA CA2  --  interacts with  --  AT5G50100
118 DEL1; E2FE; E2L3  --  interacts with  --  APFI; GAMMA CA2  --  interacts with  --  AT5G55200
119 DEL1; E2FE; E2L3  --  interacts with  --  APFI; GAMMA CA2  --  interacts with  --  AtCAL2; GAMMA CAL2
120 DEL1; E2FE; E2L3  --  interacts with  --  APFI; GAMMA CA2  --  interacts with  --  GAMMA CAL1
121 DEL1; E2FE; E2L3  --  interacts with  --  APFI; GAMMA CA2  --  interacts with  --  AT4G35320
122 DEL1; E2FE; E2L3  --  interacts with  --  APFI; GAMMA CA2  --  interacts with  --  AT1G33810
123 DEL1; E2FE; E2L3  --  interacts with  --  APFI; GAMMA CA2  --  interacts with  --  PAF2
124 DEL1; E2FE; E2L3  --  interacts with  --  APFI; GAMMA CA2  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.80375) with  --  ERG28
125 DEL1; E2FE; E2L3  --  interacts with  --  ICK1; KRP1  --  interacts with  --  CYCD6;1
126 DEL1; E2FE; E2L3  --  interacts with  --  ICK1; KRP1  --  interacts with  --  CYCD3;3
127 DEL1; E2FE; E2L3  --  interacts with  --  ICK1; KRP1  --  interacts with  --  CYCD3;2
128 DEL1; E2FE; E2L3  --  interacts with  --  ICK1; KRP1  --  interacts with  --  CYCA3;2
129 DEL1; E2FE; E2L3  --  interacts with  --  ICK1; KRP1  --  interacts with  --  CYCA3;1
130 DEL1; E2FE; E2L3  --  interacts with  --  ICK1; KRP1  --  interacts with  --  CYCA2;4
131 DEL1; E2FE; E2L3  --  interacts with  --  ICK1; KRP1  --  interacts with  --  CYCA2;3
132 DEL1; E2FE; E2L3  --  interacts with  --  ICK1; KRP1  --  interacts with  --  ATCYCD2;1; CYCD2;1
133 DEL1; E2FE; E2L3  --  interacts with  --  ICK1; KRP1  --  interacts with  --  RKP
134 DEL1; E2FE; E2L3  --  interacts with  --  ICK1; KRP1  --  interacts with  --  CYCD3; CYCD3;1
135 DEL1; E2FE; E2L3  --  interacts with  --  ICK1; KRP1  --  interacts with  --  ABP; ABP1
136 DEL1; E2FE; E2L3  --  interacts with  --  CYCD5;1  --  interacts with  --  ACK1; ICK4; KRP6
137 DEL1; E2FE; E2L3  --  interacts with  --  CYCD5;1  --  interacts with  --  ICK6; KRP3
138 DEL1; E2FE; E2L3  --  interacts with  --  CYCD5;1  --  interacts with  --  ICK2; KRP2
139 DEL1; E2FE; E2L3  --  interacts with  --  CYCD5;1  --  interacts with  --  ATE2F2; ATE2FC; E2FC
140 DEL1; E2FE; E2L3  --  interacts with  --  CYCD5;1  --  interacts with  --  CYCB2;3
141 DEL1; E2FE; E2L3  --  interacts with  --  CYCD5;1  --  interacts with  --  CYCB2;2
142 DEL1; E2FE; E2L3  --  interacts with  --  CYCD5;1  --  interacts with  --  CYCA2;1
143 DEL1; E2FE; E2L3  --  interacts with  --  CYCD5;1  --  interacts with  --  ICK3; KRP5
144 DEL1; E2FE; E2L3  --  interacts with  --  CYCD5;1  --  interacts with  --  ATCDK8; CDKE;1; HEN3
145 DEL1; E2FE; E2L3  --  interacts with  --  CKS2  --  interacts with  --  FZR3
146 DEL1; E2FE; E2L3  --  interacts with  --  CKS2  --  interacts with  --  NDL1
147 DEL1; E2FE; E2L3  --  interacts with  --  CKS2  --  interacts with  --  AT4G14310
148 DEL1; E2FE; E2L3  --  interacts with  --  CKS2  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.818974) with  --  HTA11
149 DEL1; E2FE; E2L3  --  interacts with  --  CKS1; CKS1AT  --  interacts with  --  CYCB1;4
   Funding by the National Science Foundation    Funding by the Oklahoma Center for the Advancement of Science & Technology    Additional funding by the Samuel Roberts Noble Foundation


Copyright © The Zhao Lab