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A Graph Search-Empowered Integrative Database of Arabidopsis Signaling Transduction, Metabolism and Gene Regulation Networks   
Location:  Home > Details for node AT4G17720
Type: Protein GRN ID: np33646 Name:
Annotation: RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein
Gene Locus: AT4G17720
Gene Expression (Affy ATH1 probeset): 245365_at    
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 Protein modification
 Protein-protein interaction
        also include predicted relationship
 Compound-protein interaction
 TF-target gene regulation
 Small RNA-target regulation
        also include predicted relationship
 Carrier and transported molecule
 Catalytic chemical reaction
 Co-expressed gene pair
        with mutual information value >

  Ignore nodes having > relationships
 
Relationship type:  protein modification     catalytic chemical reaction     protein-protein interaction    
compound-protein interaction     TF-target gene regulation     small RNA-target regulation    
co-expressed gene pair     carrier and transported molecule     family/complex and member
Relationship evidence:  Solid line: validated          Dashed line: predicted
Relationship direction: Arrow: positive          T shape: negative          None arrow: unknown or n/a
Hormone association: Thicker line: hormone related relationship         : hormone related Node
Node type:  Transcription factor or transcriptional regulator       Compound       Kinase
 Small regulatory RNA (miRNA & ta-siRNA)       Other nodes
No. Path
2 AT4G17720  --  is modified by  --  CDPK6
3 AT4G17720  --  interacts with  --  AtRABA1f; RABA1f
4 AT4G17720  --  interacts with  --  AT4G25680
5 AT4G17720  --  interacts with  --  AT4G25660
6 AT4G17720  --  interacts with  --  AT5G58750
7 AT4G17720  --  interacts with  --  ARA-3; ARA3; ATRAB8A; ATRABE1C; RAB8A; RABE1c
8 AT4G17720  --  interacts with  --  ATSAR1; ATSAR1B; ATSARA1B; SAR1; SAR1B
9 AT4G17720  --  interacts with  --  ATFP8; ATRABD1; RABD1
10 AT4G17720  --  interacts with  --  ATRAB-A2A; ATRAB11C; ATRABA2A; RAB-A2A; RAB11c
11 AT4G17720  --  interacts with  --  APFI; GAMMA CA2
12 AT4G17720  --  is modified by  --  CDPK6  --  interacts with  --  AT1G21940
13 AT4G17720  --  is modified by  --  CDPK6  --  interacts with  --  SKS1
14 AT4G17720  --  is modified by  --  CDPK6  --  interacts with  --  AT4G29020
15 AT4G17720  --  is modified by  --  CDPK6  --  interacts with  --  AT2G39360
16 AT4G17720  --  is modified by  --  CDPK6  --  interacts with  --  AT2G29250
17 AT4G17720  --  is modified by  --  CDPK6  --  interacts with  --  AT4G16980
18 AT4G17720  --  is modified by  --  CDPK6  --  interacts with  --  OCP3
19 AT4G17720  --  is modified by  --  CDPK6  --  interacts with  --  ADF1; atadf; ATADF1
20 AT4G17720  --  is modified by  --  CDPK6  --  interacts with  --  KAB1; KV-BETA1
21 AT4G17720  --  is modified by  --  CDPK6  --  interacts with  --  ATKCO1; ATTPK1; KCO1; KCO1; TPK1
22 AT4G17720  --  is modified by  --  CDPK6  --  interacts with  --  HMGB5; HMGD; NFD05; NFD5
23 AT4G17720  --  is modified by  --  CDPK6  --  interacts with  --  AT2G39050
24 AT4G17720  --  is modified by  --  CDPK6  --  interacts with  --  ORP2A
25 AT4G17720  --  is modified by  --  CDPK6  --  interacts with  --  APX3
26 AT4G17720  --  is modified by  --  CDPK6  --  interacts with  --  PIN4
27 AT4G17720  --  is modified by  --  CDPK6  --  interacts with  --  AT1G47530
28 AT4G17720  --  is modified by  --  CDPK6  --  interacts with  --  SLAC1 CDI3
29 AT4G17720  --  is modified by  --  CDPK6  --  modify  --  ATF2KP; F2KP; FKFBP
30 AT4G17720  --  is modified by  --  CDPK6  --  modify  --  PIP2;7; PIP3; PIP3A; SIMIP
31 AT4G17720  --  is modified by  --  CDPK6  --  modify  --  AT-HSFB2A; HSFB2A
32 AT4G17720  --  is modified by  --  CDPK6  --  modify  --  AT3G15260
33 AT4G17720  --  is modified by  --  CDPK6  --  modify  --  PAPP2C
34 AT4G17720  --  is modified by  --  CDPK6  --  modify  --  OMTF3
35 AT4G17720  --  is modified by  --  CDPK6  --  modify  --  SS2
36 AT4G17720  --  is modified by  --  CDPK6  --  modify  --  ATVDAC1; VDAC1
37 AT4G17720  --  is modified by  --  CDPK6  --  modify  --  ATVDAC2; VDAC2
38 AT4G17720  --  is modified by  --  CDPK6  --  modify  --  ADH; ADH1; ATADH; ATADH1
39 AT4G17720  --  is modified by  --  CDPK6  --  modify  --  AT-P4H-2
40 AT4G17720  --  is modified by  --  CDPK6  --  modify  --  14-3-3OMEGA
41 AT4G17720  --  is modified by  --  CDPK6  --  modify  --  FIP1
42 AT4G17720  --  is modified by  --  CDPK6  --  modify  --  AT5G07340
43 AT4G17720  --  is modified by  --  CDPK6  --  modify  --  ATHOL3; HOL3
44 AT4G17720  --  is modified by  --  CDPK6  --  modify  --  GF14 UPSILON; GRF5
45 AT4G17720  --  is modified by  --  CDPK6  --  modify  --  CHA19; CHR19; ETL1
46 AT4G17720  --  is modified by  --  CDPK6  --  modify  --  ATRNS1; RNS1
47 AT4G17720  --  is modified by  --  CDPK6  --  modify  --  ATRAB7B; ATRABG3F; RAB71; RAB7B; RAB7B; RABG3F
48 AT4G17720  --  is modified by  --  CDPK6  --  modify  --  AT5G19440
49 AT4G17720  --  is modified by  --  CDPK6  --  modify  --  AT3G02750
50 AT4G17720  --  is modified by  --  CDPK6  --  modify  --  GRF3; RCI1
51 AT4G17720  --  is modified by  --  CDPK6  --  modify  --  AtCRT1a; CRT1; CRT1a
52 AT4G17720  --  is modified by  --  CDPK6  --  modify  --  AtCRT1b; CRT1b
53 AT4G17720  --  is modified by  --  CDPK6  --  modify  --  AT1G53070
54 AT4G17720  --  is modified by  --  CDPK6  --  modify  --  AT3G18240
55 AT4G17720  --  is modified by  --  CDPK6  --  modify  --  AT2G45820
56 AT4G17720  --  is modified by  --  CDPK6  --  modify  --  ATGSTF10; ATGSTF4; ERD13; GSTF10
57 AT4G17720  --  is modified by  --  CDPK6  --  modify  --  ATSZF2; CZF1; SZF2; ZFAR1
58 AT4G17720  --  is modified by  --  CDPK6  --  modify  --  ATERF1
59 AT4G17720  --  is modified by  --  CDPK6  --  is modified by  --  ATMPK8; MPK8
60 AT4G17720  --  is modified by  --  CDPK6  --  is a member of  --  ATCDPK3 CPK4 CDPK6 ATCDPK2 CPK11 ATCDPK2 ( alias ) CPK11 ATCDPK2 ( alias ) CPK11 cpk21, coding gene
61 AT4G17720  --  interacts with  --  AtRABA1f; RABA1f  --  interacts with  --  AT1G14340
62 AT4G17720  --  interacts with  --  AtRABA1f; RABA1f  --  interacts with  --  AthREP; REP
63 AT4G17720  --  interacts with  --  AT4G25680  --  interacts with  --  AtTic22-IV; Tic22-IV
64 AT4G17720  --  interacts with  --  AT4G25680  --  interacts with  --  PRA1.B6
65 AT4G17720  --  interacts with  --  AT4G25680  --  interacts with  --  PRA1.B4
66 AT4G17720  --  interacts with  --  AT4G25680  --  interacts with  --  AT3G20680
67 AT4G17720  --  interacts with  --  AT4G25680  --  interacts with  --  ASAR1; ATSAR2; ATSARA1C; SAR2
68 AT4G17720  --  interacts with  --  AT4G25680  --  interacts with  --  ATSAR1; ATSARA1A; SARA1A
69 AT4G17720  --  interacts with  --  AT4G25680  --  interacts with  --  AT4G17486
70 AT4G17720  --  interacts with  --  AT4G25680  --  interacts with  --  PRA1.F4
71 AT4G17720  --  interacts with  --  AT4G25680  --  interacts with  --  ATISU1; ISU1
72 AT4G17720  --  interacts with  --  AT4G25680  --  interacts with  --  AT2G30880
73 AT4G17720  --  interacts with  --  AT4G25680  --  interacts with  --  AT1G12810
74 AT4G17720  --  interacts with  --  AT4G25680  --  interacts with  --  PRA1.F2; PRA7
75 AT4G17720  --  interacts with  --  AT4G25680  --  interacts with  --  PRA1.F3; PRA8
76 AT4G17720  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  AT5G65925
77 AT4G17720  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  AT4G31830
78 AT4G17720  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  AT5G28690
79 AT4G17720  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  AT5G47310
80 AT4G17720  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  emb2735
81 AT4G17720  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  AT4G27610
82 AT4G17720  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  PRA1.B5
83 AT4G17720  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  AT5G04740
84 AT4G17720  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  AT5G51180
85 AT4G17720  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  AT5G57300
86 AT4G17720  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  AT5G24990
87 AT4G17720  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  AT5G09450
88 AT4G17720  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  AT5G12010
89 AT4G17720  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  AT5G16250
90 AT4G17720  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  ATRAB-F2A; ATRAB5A; ATRABF2A; RAB-F2A; RAB5A; RABF2A; RHA1
91 AT4G17720  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  AT1G71480
92 AT4G17720  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  PRA1.B2
93 AT4G17720  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  AT2G44970
94 AT4G17720  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  AT2G34460
95 AT4G17720  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  AT2G40765
96 AT4G17720  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  AT1G59710
97 AT4G17720  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  AT1G55160
98 AT4G17720  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  AT1G29850
99 AT4G17720  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  AT1G07840
100 AT4G17720  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  NodGS
101 AT4G17720  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  AT4G20150
102 AT4G17720  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  AT1G67860
103 AT4G17720  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  ATNFU2; NFU4
104 AT4G17720  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  AT1G67865
105 AT4G17720  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  GLX2-4
106 AT4G17720  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  AT1G08480
107 AT4G17720  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  AT3G13845
108 AT4G17720  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  AT1G49850
109 AT4G17720  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  DEL1; E2FE; E2L3
110 AT4G17720  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  ATIMPALPHA3; IMPA-3; MOS6
111 AT4G17720  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  IMPA-2
112 AT4G17720  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  AT1G78140
113 AT4G17720  --  interacts with  --  AT5G58750  --  interacts with  --  AT4G26550
114 AT4G17720  --  interacts with  --  AT5G58750  --  interacts with  --  AT3G54120
115 AT4G17720  --  interacts with  --  ARA-3; ARA3; ATRAB8A; ATRABE1C; RAB8A; RABE1c  --  interacts with  --  BTI3; RTNLB4
116 AT4G17720  --  interacts with  --  ARA-3; ARA3; ATRAB8A; ATRABE1C; RAB8A; RABE1c  --  interacts with  --  ATPEX7; PEX7
117 AT4G17720  --  interacts with  --  ATSAR1; ATSAR1B; ATSARA1B; SAR1; SAR1B  --  interacts with  --  AJH2; CSN5; CSN5B
118 AT4G17720  --  interacts with  --  ATSAR1; ATSAR1B; ATSARA1B; SAR1; SAR1B  --  interacts with  --  PRA1.A1
119 AT4G17720  --  interacts with  --  ATSAR1; ATSAR1B; ATSARA1B; SAR1; SAR1B  --  interacts with  --  AT3G43230
120 AT4G17720  --  interacts with  --  ATSAR1; ATSAR1B; ATSARA1B; SAR1; SAR1B  --  interacts with  --  LCV1
121 AT4G17720  --  interacts with  --  ATSAR1; ATSAR1B; ATSARA1B; SAR1; SAR1B  --  interacts with  --  TET6
122 AT4G17720  --  interacts with  --  ATSAR1; ATSAR1B; ATSARA1B; SAR1; SAR1B  --  interacts with  --  SEC61 BETA
123 AT4G17720  --  interacts with  --  ATSAR1; ATSAR1B; ATSARA1B; SAR1; SAR1B  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.813988) with  --  RTNLB3
124 AT4G17720  --  interacts with  --  ATFP8; ATRABD1; RABD1  --  interacts with  --  ATMYA2; MYA2; XI-2; XI-6
125 AT4G17720  --  interacts with  --  ATFP8; ATRABD1; RABD1  --  interacts with  --  ABCG13
126 AT4G17720  --  interacts with  --  ATRAB-A2A; ATRAB11C; ATRABA2A; RAB-A2A; RAB11c  --  interacts with  --  NAPRT2
127 AT4G17720  --  interacts with  --  APFI; GAMMA CA2  --  interacts with  --  AT5G18910
128 AT4G17720  --  interacts with  --  APFI; GAMMA CA2  --  interacts with  --  DMS3; IDN1
129 AT4G17720  --  interacts with  --  APFI; GAMMA CA2  --  interacts with  --  AT5G16880
130 AT4G17720  --  interacts with  --  APFI; GAMMA CA2  --  interacts with  --  AT3G07480
131 AT4G17720  --  interacts with  --  APFI; GAMMA CA2  --  interacts with  --  AT4G39820
132 AT4G17720  --  interacts with  --  APFI; GAMMA CA2  --  interacts with  --  AT5G50100
133 AT4G17720  --  interacts with  --  APFI; GAMMA CA2  --  interacts with  --  AT5G55200
134 AT4G17720  --  interacts with  --  APFI; GAMMA CA2  --  interacts with  --  AtCAL2; GAMMA CAL2
135 AT4G17720  --  interacts with  --  APFI; GAMMA CA2  --  interacts with  --  GAMMA CAL1
136 AT4G17720  --  interacts with  --  APFI; GAMMA CA2  --  interacts with  --  AT4G35320
137 AT4G17720  --  interacts with  --  APFI; GAMMA CA2  --  interacts with  --  AT1G33810
138 AT4G17720  --  interacts with  --  APFI; GAMMA CA2  --  interacts with  --  PAF2
139 AT4G17720  --  interacts with  --  APFI; GAMMA CA2  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.80375) with  --  ERG28
   Funding by the National Science Foundation    Funding by the Oklahoma Center for the Advancement of Science & Technology    Additional funding by the Samuel Roberts Noble Foundation

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