Screen Resolution:     
Welcome to HRGRN
A Graph Search-Empowered Integrative Database of Arabidopsis Signaling Transduction, Metabolism and Gene Regulation Networks   
Location:  Home > Details for node AT5G65925
Type: Protein GRN ID: np39433 Name:
Annotation: unknown protein; BEST Arabidopsis thaliana protein match is: unknown protein (TAIR:AT3G49820.1); Has 45 Blast hits to 45 proteins in 6 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 0; Fungi - 0; Plants - 45; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 0 (source: NCBI BLink).
Gene Locus: AT5G65925
Gene Expression (Affy ATH1 probeset):
Graph Customization
   
Choose color for highlight:  
Display edge: validated and predicted
Display node/edge prompt:
Layout:
 as format     
Data Filter
 Protein modification
 Protein-protein interaction
        also include predicted relationship
 Compound-protein interaction
 TF-target gene regulation
 Small RNA-target regulation
        also include predicted relationship
 Carrier and transported molecule
 Catalytic chemical reaction
 Co-expressed gene pair
        with mutual information value >

  Ignore nodes having > relationships
 
Relationship type:  protein modification     catalytic chemical reaction     protein-protein interaction    
compound-protein interaction     TF-target gene regulation     small RNA-target regulation    
co-expressed gene pair     carrier and transported molecule     family/complex and member
Relationship evidence:  Solid line: validated          Dashed line: predicted
Relationship direction: Arrow: positive          T shape: negative          None arrow: unknown or n/a
Hormone association: Thicker line: hormone related relationship         : hormone related Node
Node type:  Transcription factor or transcriptional regulator       Compound       Kinase
 Small regulatory RNA (miRNA & ta-siRNA)       Other nodes
No. Path
2 AT5G65925  --  interacts with  --  AT4G25660
3 AT5G65925  --  interacts with  --  PRA1.F2; PRA7
4 AT5G65925  --  interacts with  --  AT1G14340
5 AT5G65925  --  interacts with  --  ATB' DELTA
6 AT5G65925  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  AT5G58750
7 AT5G65925  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  AT4G31830
8 AT5G65925  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  AT5G28690
9 AT5G65925  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  AT5G47310
10 AT5G65925  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  emb2735
11 AT5G65925  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  AT4G27610
12 AT5G65925  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  PRA1.B5
13 AT5G65925  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  AT5G04740
14 AT5G65925  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  ATRAB1A; ATRABD2B; RAB1A
15 AT5G65925  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  AT5G51180
16 AT5G65925  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  AT5G57300
17 AT5G65925  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  AT5G24990
18 AT5G65925  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  AT5G09450
19 AT5G65925  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  AtTic22-IV; Tic22-IV
20 AT5G65925  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  AT5G12010
21 AT5G65925  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  AT4G25680
22 AT5G65925  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  AT5G16250
23 AT5G65925  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  PRA1.B6
24 AT5G65925  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  ATRAB-F2A; ATRAB5A; ATRABF2A; RAB-F2A; RAB5A; RABF2A; RHA1
25 AT5G65925  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  AT1G71480
26 AT5G65925  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  PRA1.B2
27 AT5G65925  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  ARA-3; ARA3; ATRAB8A; ATRABE1C; RAB8A; RABE1c
28 AT5G65925  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  AT2G44970
29 AT5G65925  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  AT2G34460
30 AT5G65925  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  AT2G40765
31 AT5G65925  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  AT1G59710
32 AT5G65925  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  AT1G55160
33 AT5G65925  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  ASAR1; ATSAR2; ATSARA1C; SAR2
34 AT5G65925  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  AT1G29850
35 AT5G65925  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  AT1G07840
36 AT5G65925  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  ATSAR1; ATSARA1A; SARA1A
37 AT5G65925  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  NodGS
38 AT5G65925  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  AT4G20150
39 AT5G65925  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  AT1G67860
40 AT5G65925  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  ATNFU2; NFU4
41 AT5G65925  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  AT1G67865
42 AT5G65925  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  GLX2-4
43 AT5G65925  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  AT1G08480
44 AT5G65925  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  AT2G30880
45 AT5G65925  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  AT3G13845
46 AT5G65925  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  ATISU1; ISU1
47 AT5G65925  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  AT1G49850
48 AT5G65925  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  DEL1; E2FE; E2L3
49 AT5G65925  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  AT3G20680
50 AT5G65925  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  ATIMPALPHA3; IMPA-3; MOS6
51 AT5G65925  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  ATRAB8; AtRab8B; AtRABE1a; RAB8
52 AT5G65925  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  AT4G17486
53 AT5G65925  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  IMPA-2
54 AT5G65925  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  AT1G78140
55 AT5G65925  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  PRA1.F3; PRA8
56 AT5G65925  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  PRA1.B4
57 AT5G65925  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  PRA1.F4
58 AT5G65925  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  APFI; GAMMA CA2
59 AT5G65925  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  AT4G17720
60 AT5G65925  --  interacts with  --  PRA1.F2; PRA7  --  interacts with  --  AT1G76185
61 AT5G65925  --  interacts with  --  PRA1.F2; PRA7  --  interacts with  --  BTI3; RTNLB4
62 AT5G65925  --  interacts with  --  PRA1.F2; PRA7  --  interacts with  --  AT5G10730
63 AT5G65925  --  interacts with  --  PRA1.F2; PRA7  --  interacts with  --  AT3G29270
64 AT5G65925  --  interacts with  --  PRA1.F2; PRA7  --  interacts with  --  AT5G49000
65 AT5G65925  --  interacts with  --  PRA1.F2; PRA7  --  interacts with  --  ACD11
66 AT5G65925  --  interacts with  --  PRA1.F2; PRA7  --  interacts with  --  BPA1
67 AT5G65925  --  interacts with  --  AT1G14340  --  interacts with  --  AT3G01660
68 AT5G65925  --  interacts with  --  AT1G14340  --  interacts with  --  HIPP27
69 AT5G65925  --  interacts with  --  AT1G14340  --  interacts with  --  AtRABA1f; RABA1f
70 AT5G65925  --  interacts with  --  AT1G14340  --  interacts with  --  ATPEN3; PEN3
71 AT5G65925  --  interacts with  --  AT1G14340  --  interacts with  --  AT2G33390
72 AT5G65925  --  interacts with  --  AT1G14340  --  interacts with  --  ARLA1A; ATARLA1A
73 AT5G65925  --  interacts with  --  AT1G14340  --  interacts with  --  ATSAR1; ATSAR1B; ATSARA1B; SAR1; SAR1B
74 AT5G65925  --  interacts with  --  AT1G14340  --  interacts with  --  AT5G06370
75 AT5G65925  --  interacts with  --  AT1G14340  --  interacts with  --  ATFP8; ATRABD1; RABD1
76 AT5G65925  --  interacts with  --  AT1G14340  --  interacts with  --  AT3G07670
77 AT5G65925  --  interacts with  --  AT1G14340  --  interacts with  --  GH3.9
78 AT5G65925  --  interacts with  --  AT1G14340  --  interacts with  --  BIGYIN; FIS1A
79 AT5G65925  --  interacts with  --  AT1G14340  --  interacts with  --  AT4G30490
80 AT5G65925  --  interacts with  --  AT1G14340  --  interacts with  --  AT5G55200
81 AT5G65925  --  interacts with  --  AT1G14340  --  interacts with  --  ATGDI2; GDI2
82 AT5G65925  --  interacts with  --  ATB' DELTA  --  interacts with  --  AT5G67620
83 AT5G65925  --  interacts with  --  ATB' DELTA  --  interacts with  --  AT1G21010
84 AT5G65925  --  interacts with  --  ATB' DELTA  --  interacts with  --  AT2G24550
85 AT5G65925  --  interacts with  --  ATB' DELTA  --  interacts with  --  AT1G76600
86 AT5G65925  --  interacts with  --  ATB' DELTA  --  interacts with  --  AT1G10530
87 AT5G65925  --  interacts with  --  ATB' DELTA  --  interacts with  --  RECA3
   Funding by the National Science Foundation    Funding by the Oklahoma Center for the Advancement of Science & Technology    Additional funding by the Samuel Roberts Noble Foundation

Copyright © The Zhao Lab

Disclaimer | Contact