Screen Resolution:     
Welcome to HRGRN
A Graph Search-Empowered Integrative Database of Arabidopsis Signaling Transduction, Metabolism and Gene Regulation Networks   
Location:  Home > Details for node AT1G17970
Type: Protein GRN ID: np15854 Name:
Annotation: RING/U-box superfamily protein
Gene Locus: AT1G17970
Transcription factor /
transcriptional regulator:		 transcription factor family C2H2
Gene Expression (Affy ATH1 probeset): 255899_at    
Graph Customization
   
Choose color for highlight:  
Display edge: validated and predicted
Display node/edge prompt:
Layout:
 as format     
Data Filter
 Protein modification
 Protein-protein interaction
        also include predicted relationship
 Compound-protein interaction
 TF-target gene regulation
 Small RNA-target regulation
        also include predicted relationship
 Carrier and transported molecule
 Catalytic chemical reaction
 Co-expressed gene pair
        with mutual information value >

  Ignore nodes having > relationships
 
Relationship type:  protein modification     catalytic chemical reaction     protein-protein interaction    
compound-protein interaction     TF-target gene regulation     small RNA-target regulation    
co-expressed gene pair     carrier and transported molecule     family/complex and member
Relationship evidence:  Solid line: validated          Dashed line: predicted
Relationship direction: Arrow: positive          T shape: negative          None arrow: unknown or n/a
Hormone association: Thicker line: hormone related relationship         : hormone related Node
Node type:  Transcription factor or transcriptional regulator       Compound       Kinase
 Small regulatory RNA (miRNA & ta-siRNA)       Other nodes
No. Path
2 AT1G17970  --  interacts with  --  AT3G22260
3 AT1G17970  --  interacts with  --  AT3G54390
4 AT1G17970  --  interacts with  --  AT3G13672
5 AT1G17970  --  interacts with  --  AT2G36930
6 AT1G17970  --  interacts with  --  AT4G33690
7 AT1G17970  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD
8 AT1G17970  --  interacts with  --  AT3G22260  --  interacts with  --  AT4G25920
9 AT1G17970  --  interacts with  --  AT3G22260  --  interacts with  --  AT5G49000
10 AT1G17970  --  interacts with  --  AT3G22260  --  transport  --  Hygromycin B
11 AT1G17970  --  interacts with  --  AT3G54390  --  interacts with  --  AT4G39820
12 AT1G17970  --  interacts with  --  AT3G54390  --  interacts with  --  AT5G52547
13 AT1G17970  --  interacts with  --  AT3G54390  --  interacts with  --  AT3G54826
14 AT1G17970  --  interacts with  --  AT3G54390  --  interacts with  --  AtTic22-IV; Tic22-IV
15 AT1G17970  --  interacts with  --  AT3G54390  --  interacts with  --  AT5G50335
16 AT1G17970  --  interacts with  --  AT3G54390  --  interacts with  --  AT4G11175
17 AT1G17970  --  interacts with  --  AT3G54390  --  interacts with  --  AT5G54750
18 AT1G17970  --  interacts with  --  AT3G54390  --  interacts with  --  AT5G41520
19 AT1G17970  --  interacts with  --  AT3G54390  --  interacts with  --  AT4G37280
20 AT1G17970  --  interacts with  --  AT3G54390  --  interacts with  --  ATWRKY36; WRKY36
21 AT1G17970  --  interacts with  --  AT3G54390  --  interacts with  --  AT3G16120
22 AT1G17970  --  interacts with  --  AT3G54390  --  interacts with  --  AT1G20770
23 AT1G17970  --  interacts with  --  AT3G54390  --  interacts with  --  CSI1
24 AT1G17970  --  interacts with  --  AT3G54390  --  interacts with  --  DEL1; E2FE; E2L3
25 AT1G17970  --  interacts with  --  AT3G54390  --  interacts with  --  HIPP20
26 AT1G17970  --  interacts with  --  AT3G54390  --  interacts with  --  AT3G19120
27 AT1G17970  --  interacts with  --  AT3G54390  --  interacts with  --  AT2G36145
28 AT1G17970  --  interacts with  --  AT3G54390  --  interacts with  --  NFD6
29 AT1G17970  --  interacts with  --  AT3G54390  --  interacts with  --  ABCI18; ATNAP4; NAP4
30 AT1G17970  --  interacts with  --  AT3G54390  --  interacts with  --  AT2G17670
31 AT1G17970  --  interacts with  --  AT3G54390  --  interacts with  --  AT2G25730
32 AT1G17970  --  interacts with  --  AT3G54390  --  interacts with  --  PQL1; PQL2
33 AT1G17970  --  interacts with  --  AT3G54390  --  interacts with  --  ATHAP3; ATNF-YB1; HAP3; HAP3A; NF-YB1
34 AT1G17970  --  interacts with  --  AT3G13672  --  interacts with  --  AT5G63370
35 AT1G17970  --  interacts with  --  AT3G13672  --  interacts with  --  ATCSLC06; ATCSLC6; CSLC06; CSLC6
36 AT1G17970  --  interacts with  --  AT2G36930  --  interacts with  --  AT3G49160
37 AT1G17970  --  interacts with  --  AT2G36930  --  interacts with  --  AHL29; SOB3
38 AT1G17970  --  interacts with  --  AT2G36930  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.872392) with  --  AtELP3; EAST1; ELO3; ELP3; HAC8; HAG3
39 AT1G17970  --  interacts with  --  AT4G33690  --  interacts with  --  MED19A
40 AT1G17970  --  interacts with  --  AT4G33690  --  interacts with  --  AT5G55100
41 AT1G17970  --  interacts with  --  AT4G33690  --  interacts with  --  AT5G53800
42 AT1G17970  --  interacts with  --  AT4G33690  --  interacts with  --  ATEXO70E2; EXO70E2
43 AT1G17970  --  interacts with  --  AT4G33690  --  interacts with  --  AT5G22310
44 AT1G17970  --  interacts with  --  AT4G33690  --  interacts with  --  ATMAP70-5; MAP70-5
45 AT1G17970  --  interacts with  --  AT4G33690  --  interacts with  --  AT2G29210
46 AT1G17970  --  interacts with  --  AT4G33690  --  interacts with  --  AT4G13540
47 AT1G17970  --  interacts with  --  AT4G33690  --  interacts with  --  AT4G02720
48 AT1G17970  --  interacts with  --  AT4G33690  --  interacts with  --  GIF2
49 AT1G17970  --  interacts with  --  AT4G33690  --  interacts with  --  HAP1; MAGO; MEE63
50 AT1G17970  --  interacts with  --  AT4G33690  --  interacts with  --  AtHB32; HB32; ZHD14
51 AT1G17970  --  interacts with  --  AT4G33690  --  interacts with  --  AT3G21490
52 AT1G17970  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  TCP8
53 AT1G17970  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  AtTCP15; TCP15
54 AT1G17970  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  AtTCP11; TCP11
55 AT1G17970  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  AT-TCP20; ATTCP20; PCF1; TCP20
56 AT1G17970  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  AT1G35560
57 AT1G17970  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  AT5G51910
58 AT1G17970  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  TCP3
59 AT1G17970  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  MEE35; TCP4
60 AT1G17970  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  TCP2; TCP2
61 AT1G17970  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  TCP5
62 AT1G17970  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  ATTCP24; TCP24
63 AT1G17970  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  TCP17
64 AT1G17970  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  AT5G42470
65 AT1G17970  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  NRPB9A; NRPD9A; NRPE9A
66 AT1G17970  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  AT4G15700
67 AT1G17970  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  AT3G55690
68 AT1G17970  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  ATHB-2; ATHB2; HAT4; HB-2
69 AT1G17970  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  AT5G05190
70 AT1G17970  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  AT3G61920
71 AT1G17970  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  NDF4
72 AT1G17970  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  AT5G47310
73 AT1G17970  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  AT5G22355
74 AT1G17970  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  AT4G23770
75 AT1G17970  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  AT5G25490
76 AT1G17970  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  BBX32; EIP6
77 AT1G17970  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  AT4G32295
78 AT1G17970  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  FSD2
79 AT1G17970  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  AT5G50180
80 AT1G17970  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  HCF136
81 AT1G17970  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  AT5G11550
82 AT1G17970  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  AT5G63350
83 AT1G17970  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  AT5G10710
84 AT1G17970  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  TOE2
85 AT1G17970  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  ACX1
86 AT1G17970  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  AT4G32190
87 AT1G17970  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  AT5G38430
88 AT1G17970  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  HDG4
89 AT1G17970  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  AT3G10970
90 AT1G17970  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  AT4G35250
91 AT1G17970  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  CDKC;1
92 AT1G17970  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  AT3G13440
93 AT1G17970  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  ATSEN1; DIN1; SEN1; SEN1
94 AT1G17970  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  AT4G01920
95 AT1G17970  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  ASE2; ATASE2; ATPURF2; CIA1
96 AT1G17970  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  MARD1
97 AT1G17970  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  ATAIG1; BHLH32; TMO5
98 AT1G17970  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  ATGRXCP; CXIP1
99 AT1G17970  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  AT3G15640
100 AT1G17970  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  ASHR3; SDG4
101 AT1G17970  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  ATVAMP714; VAMP714; VAMP714
102 AT1G17970  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  VPS9B
103 AT1G17970  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  AT4G17486
104 AT1G17970  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  AO
105 AT1G17970  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  ROXY2
106 AT1G17970  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  AT3G09250
107 AT1G17970  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  NZZ; SPL
108 AT1G17970  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  CHR3; SYD
109 AT1G17970  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  AT2G37000
110 AT1G17970  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  TCP10
111 AT1G17970  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  ATY1; TRX-Y1; TY1
112 AT1G17970  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  ATRBP45B; RBP45B
113 AT1G17970  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  AT1G05710
114 AT1G17970  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  AT2G32160
115 AT1G17970  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  ZFP7
116 AT1G17970  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  AT1G06450
117 AT1G17970  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  ATMKK9
118 AT1G17970  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  CAO; CPSRP43
119 AT1G17970  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  AT1G11800
120 AT1G17970  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  NTRC
121 AT1G17970  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  KDSB
122 AT1G17970  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  APL; WDY
123 AT1G17970  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  AT2G38000
124 AT1G17970  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  PDH-E1 BETA
125 AT1G17970  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  ANAC041; NAC041
126 AT1G17970  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  AT1G09660
127 AT1G17970  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  AT1G12810
128 AT1G17970  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  PSAD-2
129 AT1G17970  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  SKL2
130 AT1G17970  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  AT2G03500
131 AT1G17970  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  AT2G21860
132 AT1G17970  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  SMU1
133 AT1G17970  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  AT2G45850
134 AT1G17970  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  TAF15
135 AT1G17970  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD  --  interacts with  --  AT2G24860
   Funding by the National Science Foundation    Funding by the Oklahoma Center for the Advancement of Science & Technology    Additional funding by the Samuel Roberts Noble Foundation

Copyright © The Zhao Lab

Disclaimer | Contact