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Welcome to HRGRN
A Graph Search-Empowered Integrative Database of Arabidopsis Signaling Transduction, Metabolism and Gene Regulation Networks   
Location:  Home > Details for node NodGS
Type: Protein GRN ID: np27909 Name: NodGS
Annotation: glutamate-ammonia ligases;catalytics;glutamate-ammonia ligases
Gene Locus: AT3G53180
Gene Expression (Affy ATH1 probeset): 251973_at    
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 as format     
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 Protein modification
 Protein-protein interaction
        also include predicted relationship
 Compound-protein interaction
 TF-target gene regulation
 Small RNA-target regulation
        also include predicted relationship
 Carrier and transported molecule
 Catalytic chemical reaction
 Co-expressed gene pair
        with mutual information value >

  Ignore nodes having > relationships
 
Relationship type:  protein modification     catalytic chemical reaction     protein-protein interaction    
compound-protein interaction     TF-target gene regulation     small RNA-target regulation    
co-expressed gene pair     carrier and transported molecule     family/complex and member
Relationship evidence:  Solid line: validated          Dashed line: predicted
Relationship direction: Arrow: positive          T shape: negative          None arrow: unknown or n/a
Hormone association: Thicker line: hormone related relationship         : hormone related Node
Node type:  Transcription factor or transcriptional regulator       Compound       Kinase
 Small regulatory RNA (miRNA & ta-siRNA)       Other nodes
No. Path
2 NodGS  --  interacts with  --  AT3G54120
3 NodGS  --  interacts with  --  AT4G25660
4 NodGS  --  interacts with  --  PRA1.B6
5 NodGS  --  interacts with  --  AT1G14340
6 NodGS  --  interacts with  --  CNX2
7 NodGS  --  interacts with  --  PRA1.F4
8 NodGS  --  interacts with  --  PRA1.B2
9 NodGS  --  interacts with  --  AT3G54120  --  interacts with  --  AT5G58750
10 NodGS  --  interacts with  --  AT3G54120  --  interacts with  --  BTI3; RTNLB4
11 NodGS  --  interacts with  --  AT3G54120  --  interacts with  --  AT5G50180
12 NodGS  --  interacts with  --  AT3G54120  --  interacts with  --  BTI2; RTNLB2
13 NodGS  --  interacts with  --  AT3G54120  --  interacts with  --  AT5G07730
14 NodGS  --  interacts with  --  AT3G54120  --  interacts with  --  AT1G52220
15 NodGS  --  interacts with  --  AT3G54120  --  interacts with  --  ATSAR1; ATSAR1B; ATSARA1B; SAR1; SAR1B
16 NodGS  --  interacts with  --  AT3G54120  --  interacts with  --  AT1G67865
17 NodGS  --  interacts with  --  AT3G54120  --  interacts with  --  AT3G10260
18 NodGS  --  interacts with  --  AT3G54120  --  interacts with  --  ATFP8; ATRABD1; RABD1
19 NodGS  --  interacts with  --  AT3G54120  --  interacts with  --  AT2G30880
20 NodGS  --  interacts with  --  AT3G54120  --  interacts with  --  LCV1
21 NodGS  --  interacts with  --  AT3G54120  --  interacts with  --  AT3G29270
22 NodGS  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  AT5G65925
23 NodGS  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  AT4G31830
24 NodGS  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  AT5G28690
25 NodGS  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  AT5G47310
26 NodGS  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  emb2735
27 NodGS  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  AT4G27610
28 NodGS  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  PRA1.B5
29 NodGS  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  AT5G04740
30 NodGS  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  ATRAB1A; ATRABD2B; RAB1A
31 NodGS  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  AT5G51180
32 NodGS  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  AT5G57300
33 NodGS  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  AT5G24990
34 NodGS  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  AT5G09450
35 NodGS  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  AtTic22-IV; Tic22-IV
36 NodGS  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  AT5G12010
37 NodGS  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  AT4G25680
38 NodGS  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  AT5G16250
39 NodGS  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  ATRAB-F2A; ATRAB5A; ATRABF2A; RAB-F2A; RAB5A; RABF2A; RHA1
40 NodGS  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  AT1G71480
41 NodGS  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  ARA-3; ARA3; ATRAB8A; ATRABE1C; RAB8A; RABE1c
42 NodGS  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  AT2G44970
43 NodGS  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  AT2G34460
44 NodGS  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  AT2G40765
45 NodGS  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  AT1G59710
46 NodGS  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  AT1G55160
47 NodGS  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  ASAR1; ATSAR2; ATSARA1C; SAR2
48 NodGS  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  AT1G29850
49 NodGS  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  AT1G07840
50 NodGS  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  ATSAR1; ATSARA1A; SARA1A
51 NodGS  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  AT4G20150
52 NodGS  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  AT1G67860
53 NodGS  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  ATNFU2; NFU4
54 NodGS  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  GLX2-4
55 NodGS  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  PRA1.F2; PRA7
56 NodGS  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  AT1G08480
57 NodGS  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  AT3G13845
58 NodGS  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  ATISU1; ISU1
59 NodGS  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  AT1G49850
60 NodGS  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  DEL1; E2FE; E2L3
61 NodGS  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  AT3G20680
62 NodGS  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  ATIMPALPHA3; IMPA-3; MOS6
63 NodGS  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  ATRAB8; AtRab8B; AtRABE1a; RAB8
64 NodGS  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  AT4G17486
65 NodGS  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  IMPA-2
66 NodGS  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  AT1G78140
67 NodGS  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  PRA1.F3; PRA8
68 NodGS  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  PRA1.B4
69 NodGS  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  APFI; GAMMA CA2
70 NodGS  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  AT4G17720
71 NodGS  --  interacts with  --  PRA1.B6  --  interacts with  --  AT5G56020
72 NodGS  --  interacts with  --  AT1G14340  --  interacts with  --  AT3G01660
73 NodGS  --  interacts with  --  AT1G14340  --  interacts with  --  HIPP27
74 NodGS  --  interacts with  --  AT1G14340  --  interacts with  --  AtRABA1f; RABA1f
75 NodGS  --  interacts with  --  AT1G14340  --  interacts with  --  ATPEN3; PEN3
76 NodGS  --  interacts with  --  AT1G14340  --  interacts with  --  AT2G33390
77 NodGS  --  interacts with  --  AT1G14340  --  interacts with  --  ARLA1A; ATARLA1A
78 NodGS  --  interacts with  --  AT1G14340  --  interacts with  --  BPA1
79 NodGS  --  interacts with  --  AT1G14340  --  interacts with  --  AT5G06370
80 NodGS  --  interacts with  --  AT1G14340  --  interacts with  --  AT3G07670
81 NodGS  --  interacts with  --  AT1G14340  --  interacts with  --  GH3.9
82 NodGS  --  interacts with  --  AT1G14340  --  interacts with  --  BIGYIN; FIS1A
83 NodGS  --  interacts with  --  AT1G14340  --  interacts with  --  AT4G30490
84 NodGS  --  interacts with  --  AT1G14340  --  interacts with  --  AT5G55200
85 NodGS  --  interacts with  --  AT1G14340  --  interacts with  --  AT5G49000
86 NodGS  --  interacts with  --  AT1G14340  --  interacts with  --  ATGDI2; GDI2
87 NodGS  --  interacts with  --  CNX2  --  interacts with  --  ATCCS; CCS
88 NodGS  --  interacts with  --  PRA1.F4  --  interacts with  --  AT4G30240
89 NodGS  --  interacts with  --  PRA1.F4  --  interacts with  --  AT1G10650
90 NodGS  --  interacts with  --  PRA1.F4  --  interacts with  --  AT2G01540
91 NodGS  --  interacts with  --  PRA1.F4  --  interacts with  --  COPT5
92 NodGS  --  interacts with  --  PRA1.F4  --  interacts with  --  ARAD2
93 NodGS  --  interacts with  --  PRA1.F4  --  interacts with  --  AT3G43230
94 NodGS  --  interacts with  --  PRA1.F4  --  interacts with  --  XBAT35
95 NodGS  --  interacts with  --  PRA1.F4  --  interacts with  --  HIPP21
96 NodGS  --  interacts with  --  PRA1.F4  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.912774) with  --  AT1G09740
97 NodGS  --  interacts with  --  PRA1.F4  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.9131) with  --  AR411; ATWRKY14; WRKY14
98 NodGS  --  interacts with  --  PRA1.B2  --  interacts with  --  AT1G52550
99 NodGS  --  interacts with  --  PRA1.B2  --  interacts with  --  AT4G16444
100 NodGS  --  interacts with  --  PRA1.B2  --  interacts with  --  AT2G16250
   Funding by the National Science Foundation    Funding by the Oklahoma Center for the Advancement of Science & Technology    Additional funding by the Samuel Roberts Noble Foundation

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