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Welcome to HRGRN
A Graph Search-Empowered Integrative Database of Arabidopsis Signaling Transduction, Metabolism and Gene Regulation Networks   
Location:  Home > Details for node PRA1.F4
Type: Protein GRN ID: np26301 Name: PRA1.F4
Annotation: PRA1.F4 | prenylated RAB acceptor 1.F4
Gene Locus: AT3G13710
Gene Expression (Affy ATH1 probeset): 256770_at    256771_at    
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 Protein modification
 Protein-protein interaction
        also include predicted relationship
 Compound-protein interaction
 TF-target gene regulation
 Small RNA-target regulation
        also include predicted relationship
 Carrier and transported molecule
 Catalytic chemical reaction
 Co-expressed gene pair
        with mutual information value >

  Ignore nodes having > relationships
 
Relationship type:  protein modification     catalytic chemical reaction     protein-protein interaction    
compound-protein interaction     TF-target gene regulation     small RNA-target regulation    
co-expressed gene pair     carrier and transported molecule     family/complex and member
Relationship evidence:  Solid line: validated          Dashed line: predicted
Relationship direction: Arrow: positive          T shape: negative          None arrow: unknown or n/a
Hormone association: Thicker line: hormone related relationship         : hormone related Node
Node type:  Transcription factor or transcriptional regulator       Compound       Kinase
 Small regulatory RNA (miRNA & ta-siRNA)       Other nodes
No. Path
2 PRA1.F4  --  interacts with  --  AT4G30240
3 PRA1.F4  --  interacts with  --  AT1G10650
4 PRA1.F4  --  interacts with  --  AT2G01540
5 PRA1.F4  --  interacts with  --  COPT5
6 PRA1.F4  --  interacts with  --  ARAD2
7 PRA1.F4  --  interacts with  --  AT3G43230
8 PRA1.F4  --  interacts with  --  BPA1
9 PRA1.F4  --  interacts with  --  XBAT35
10 PRA1.F4  --  interacts with  --  AT4G25680
11 PRA1.F4  --  interacts with  --  AT4G25660
12 PRA1.F4  --  interacts with  --  ASAR1; ATSAR2; ATSARA1C; SAR2
13 PRA1.F4  --  interacts with  --  NodGS
14 PRA1.F4  --  interacts with  --  AT5G58750
15 PRA1.F4  --  interacts with  --  AT3G29270
16 PRA1.F4  --  interacts with  --  HIPP21
17 PRA1.F4  --  interacts with  --  ATSAR1; ATSARA1A; SARA1A
18 PRA1.F4  --  interacts with  --  AT1G67865
19 PRA1.F4  --  interacts with  --  ATFP8; ATRABD1; RABD1
20 PRA1.F4  --  interacts with  --  AT3G10260
21 PRA1.F4  --  interacts with  --  AT1G71480
22 PRA1.F4  --  interacts with  --  ATSAR1; ATSAR1B; ATSARA1B; SAR1; SAR1B
23 PRA1.F4  --  interacts with  --  LCV1
24 PRA1.F4  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.912774) with  --  AT1G09740
25 PRA1.F4  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.9131) with  --  AR411; ATWRKY14; WRKY14
26 PRA1.F4  --  interacts with  --  AT4G30240  --  interacts with  --  YUUCA5
27 PRA1.F4  --  interacts with  --  AT4G30240  --  interacts with  --  APE1
28 PRA1.F4  --  interacts with  --  AT4G30240  --  interacts with  --  AT2G29250
29 PRA1.F4  --  interacts with  --  AT4G30240  --  interacts with  --  AT4G16620
30 PRA1.F4  --  interacts with  --  AT4G30240  --  interacts with  --  ALF5
31 PRA1.F4  --  interacts with  --  AT4G30240  --  interacts with  --  AT5G52050
32 PRA1.F4  --  interacts with  --  AT4G30240  --  interacts with  --  AT1G64820
33 PRA1.F4  --  interacts with  --  AT4G30240  --  interacts with  --  AT1G12500
34 PRA1.F4  --  interacts with  --  AT4G30240  --  interacts with  --  CYP708A3
35 PRA1.F4  --  interacts with  --  AT4G30240  --  interacts with  --  AT2G01680
36 PRA1.F4  --  interacts with  --  AT4G30240  --  interacts with  --  AT2G25890
37 PRA1.F4  --  interacts with  --  AT2G01540  --  interacts with  --  AT3G02420
38 PRA1.F4  --  interacts with  --  ARAD2  --  interacts with  --  ARAD1
39 PRA1.F4  --  interacts with  --  AT3G43230  --  interacts with  --  AtTic22-IV; Tic22-IV
40 PRA1.F4  --  interacts with  --  AT3G43230  --  interacts with  --  APFI; GAMMA CA2
41 PRA1.F4  --  interacts with  --  AT3G43230  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.832478) with  --  ARA-2; ARA2; ATRAB11E; ATRABA1A
42 PRA1.F4  --  interacts with  --  AT3G43230  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.868355) with  --  AT5G50230
43 PRA1.F4  --  interacts with  --  AT3G43230  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.939149) with  --  SKIP1
44 PRA1.F4  --  interacts with  --  BPA1  --  interacts with  --  ACD11
45 PRA1.F4  --  interacts with  --  BPA1  --  interacts with  --  PRA1.F3; PRA8
46 PRA1.F4  --  interacts with  --  BPA1  --  interacts with  --  NDL1
47 PRA1.F4  --  interacts with  --  BPA1  --  interacts with  --  AT1G14340
48 PRA1.F4  --  interacts with  --  XBAT35  --  transport  --  Hygromycin B
49 PRA1.F4  --  interacts with  --  AT4G25680  --  interacts with  --  PRA1.B6
50 PRA1.F4  --  interacts with  --  AT4G25680  --  interacts with  --  PRA1.B4
51 PRA1.F4  --  interacts with  --  AT4G25680  --  interacts with  --  AT3G20680
52 PRA1.F4  --  interacts with  --  AT4G25680  --  interacts with  --  AT4G17486
53 PRA1.F4  --  interacts with  --  AT4G25680  --  interacts with  --  ATISU1; ISU1
54 PRA1.F4  --  interacts with  --  AT4G25680  --  interacts with  --  AT2G30880
55 PRA1.F4  --  interacts with  --  AT4G25680  --  interacts with  --  AT1G12810
56 PRA1.F4  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  AT5G65925
57 PRA1.F4  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  AT4G31830
58 PRA1.F4  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  AT5G28690
59 PRA1.F4  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  AT5G47310
60 PRA1.F4  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  emb2735
61 PRA1.F4  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  AT4G27610
62 PRA1.F4  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  PRA1.B5
63 PRA1.F4  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  AT5G04740
64 PRA1.F4  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  ATRAB1A; ATRABD2B; RAB1A
65 PRA1.F4  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  AT5G51180
66 PRA1.F4  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  AT5G57300
67 PRA1.F4  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  AT5G24990
68 PRA1.F4  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  AT5G09450
69 PRA1.F4  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  AT5G12010
70 PRA1.F4  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  AT5G16250
71 PRA1.F4  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  ATRAB-F2A; ATRAB5A; ATRABF2A; RAB-F2A; RAB5A; RABF2A; RHA1
72 PRA1.F4  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  PRA1.B2
73 PRA1.F4  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  ARA-3; ARA3; ATRAB8A; ATRABE1C; RAB8A; RABE1c
74 PRA1.F4  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  AT2G44970
75 PRA1.F4  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  AT2G34460
76 PRA1.F4  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  AT2G40765
77 PRA1.F4  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  AT1G59710
78 PRA1.F4  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  AT1G55160
79 PRA1.F4  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  AT1G29850
80 PRA1.F4  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  AT1G07840
81 PRA1.F4  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  AT4G20150
82 PRA1.F4  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  AT1G67860
83 PRA1.F4  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  ATNFU2; NFU4
84 PRA1.F4  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  GLX2-4
85 PRA1.F4  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  AT1G08480
86 PRA1.F4  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  AT3G13845
87 PRA1.F4  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  AT1G49850
88 PRA1.F4  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  DEL1; E2FE; E2L3
89 PRA1.F4  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  ATIMPALPHA3; IMPA-3; MOS6
90 PRA1.F4  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  ATRAB8; AtRab8B; AtRABE1a; RAB8
91 PRA1.F4  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  IMPA-2
92 PRA1.F4  --  interacts with  --  AT4G25660  --  interacts with  --  AT1G78140
93 PRA1.F4  --  interacts with  --  ASAR1; ATSAR2; ATSARA1C; SAR2  --  interacts with  --  AT5G05820
94 PRA1.F4  --  interacts with  --  ASAR1; ATSAR2; ATSARA1C; SAR2  --  interacts with  --  AtENODL15; ENODL15
95 PRA1.F4  --  interacts with  --  ASAR1; ATSAR2; ATSARA1C; SAR2  --  interacts with  --  AT3G26110
96 PRA1.F4  --  interacts with  --  ASAR1; ATSAR2; ATSARA1C; SAR2  --  interacts with  --  AJH2; CSN5; CSN5B
97 PRA1.F4  --  interacts with  --  NodGS  --  interacts with  --  AT3G54120
98 PRA1.F4  --  interacts with  --  NodGS  --  interacts with  --  CNX2
99 PRA1.F4  --  interacts with  --  AT5G58750  --  interacts with  --  AT4G26550
100 PRA1.F4  --  interacts with  --  AT3G29270  --  interacts with  --  ATYLMG2; YLMG2
101 PRA1.F4  --  interacts with  --  AT3G29270  --  interacts with  --  AT5G03345
102 PRA1.F4  --  interacts with  --  AT3G29270  --  interacts with  --  AT1G16170
103 PRA1.F4  --  interacts with  --  AT3G29270  --  interacts with  --  TBL32
104 PRA1.F4  --  interacts with  --  AT3G29270  --  interacts with  --  AT1G14020
105 PRA1.F4  --  interacts with  --  AT3G29270  --  interacts with  --  AT4G26770
106 PRA1.F4  --  interacts with  --  AT3G29270  --  interacts with  --  ATFACE-2; ATFACE2; FACE2; RCE1
107 PRA1.F4  --  interacts with  --  AT3G29270  --  interacts with  --  ATMHX; ATMHX1; MHX; MHX1
108 PRA1.F4  --  interacts with  --  AT3G29270  --  interacts with  --  AtHSD7; HSD7
109 PRA1.F4  --  interacts with  --  AT3G29270  --  interacts with  --  AtHSD4; HSD4
110 PRA1.F4  --  interacts with  --  AT3G29270  --  interacts with  --  AT3G50920
111 PRA1.F4  --  interacts with  --  AT3G29270  --  interacts with  --  ATCSLC05; ATCSLC5; CSLC05; CSLC5
112 PRA1.F4  --  interacts with  --  AT3G29270  --  interacts with  --  AAP4
113 PRA1.F4  --  interacts with  --  AT3G29270  --  interacts with  --  ATRBL15; RBL15
114 PRA1.F4  --  interacts with  --  AT3G29270  --  interacts with  --  AT5G61340
115 PRA1.F4  --  interacts with  --  AT3G29270  --  interacts with  --  RUS6
116 PRA1.F4  --  interacts with  --  AT3G29270  --  interacts with  --  AT3G51510
117 PRA1.F4  --  interacts with  --  AT3G29270  --  interacts with  --  PRA1.A1
118 PRA1.F4  --  interacts with  --  AT3G29270  --  interacts with  --  OLE2; OLEO2
119 PRA1.F4  --  interacts with  --  AT3G29270  --  interacts with  --  BTI3; RTNLB4
120 PRA1.F4  --  interacts with  --  AT3G29270  --  interacts with  --  MEE55
121 PRA1.F4  --  interacts with  --  AT3G29270  --  interacts with  --  OLE1; OLEO1
122 PRA1.F4  --  interacts with  --  AT3G29270  --  interacts with  --  AT4G40042
123 PRA1.F4  --  interacts with  --  AT3G29270  --  interacts with  --  AT5G24130
124 PRA1.F4  --  interacts with  --  AT3G29270  --  interacts with  --  AT5G58782
125 PRA1.F4  --  interacts with  --  AT3G29270  --  interacts with  --  ATGP4
126 PRA1.F4  --  interacts with  --  AT3G29270  --  interacts with  --  AT3G59500
127 PRA1.F4  --  interacts with  --  AT3G29270  --  interacts with  --  AT5G56020
128 PRA1.F4  --  interacts with  --  AT3G29270  --  interacts with  --  ABC4
129 PRA1.F4  --  interacts with  --  AT3G29270  --  interacts with  --  AT3G01570
130 PRA1.F4  --  interacts with  --  AT3G29270  --  interacts with  --  AT1G35430
131 PRA1.F4  --  interacts with  --  AT3G29270  --  interacts with  --  AT1G67360
132 PRA1.F4  --  interacts with  --  AT3G29270  --  interacts with  --  AT1G10040
133 PRA1.F4  --  interacts with  --  AT3G29270  --  interacts with  --  AT1G47740
134 PRA1.F4  --  interacts with  --  AT3G29270  --  interacts with  --  AT3G18570
135 PRA1.F4  --  interacts with  --  AT3G29270  --  interacts with  --  MMZ2; UEV1B
136 PRA1.F4  --  interacts with  --  AT3G29270  --  interacts with  --  AtCLO3; CLO-3; CLO3; RD20
137 PRA1.F4  --  interacts with  --  AT3G29270  --  interacts with  --  AT1G01230
138 PRA1.F4  --  interacts with  --  AT3G29270  --  interacts with  --  HIPP20
139 PRA1.F4  --  interacts with  --  AT3G29270  --  interacts with  --  AT3G19460
140 PRA1.F4  --  interacts with  --  AT3G29270  --  interacts with  --  ARL
141 PRA1.F4  --  interacts with  --  AT3G29270  --  interacts with  --  AT3G09690
142 PRA1.F4  --  interacts with  --  HIPP21  --  interacts with  --  ATHB29; ZFHD1; ZHD11
143 PRA1.F4  --  interacts with  --  HIPP21  --  interacts with  --  AT3G50910
144 PRA1.F4  --  interacts with  --  HIPP21  --  interacts with  --  ASIL1
145 PRA1.F4  --  interacts with  --  ATFP8; ATRABD1; RABD1  --  interacts with  --  ATMYA2; MYA2; XI-2; XI-6
146 PRA1.F4  --  interacts with  --  ATFP8; ATRABD1; RABD1  --  interacts with  --  ABCG13
147 PRA1.F4  --  interacts with  --  AT3G10260  --  interacts with  --  AT5G43670
148 PRA1.F4  --  interacts with  --  AT3G10260  --  interacts with  --  AT4G01150
149 PRA1.F4  --  interacts with  --  AT3G10260  --  interacts with  --  AT3G55600
150 PRA1.F4  --  interacts with  --  AT3G10260  --  interacts with  --  AT3G22570
151 PRA1.F4  --  interacts with  --  AT3G10260  --  interacts with  --  AT5G07730
152 PRA1.F4  --  interacts with  --  AT3G10260  --  interacts with  --  AT4G08230
153 PRA1.F4  --  interacts with  --  AT3G10260  --  interacts with  --  ATLCB1; EMB2779; FBR11; LCB1
154 PRA1.F4  --  interacts with  --  AT3G10260  --  interacts with  --  AT3G61300
155 PRA1.F4  --  interacts with  --  AT3G10260  --  interacts with  --  ERG28
156 PRA1.F4  --  interacts with  --  AT3G10260  --  interacts with  --  AT1G17080
157 PRA1.F4  --  interacts with  --  AT3G10260  --  interacts with  --  ANAC001; NAC001
158 PRA1.F4  --  interacts with  --  AT3G10260  --  interacts with  --  AT1G72170
159 PRA1.F4  --  interacts with  --  AT3G10260  --  interacts with  --  ATSYP61; OSM1; SYP61
160 PRA1.F4  --  interacts with  --  AT3G10260  --  interacts with  --  ATRNS1; RNS1
161 PRA1.F4  --  interacts with  --  AT1G71480  --  interacts with  --  AT4G38150
162 PRA1.F4  --  interacts with  --  AT1G71480  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.859011) with  --  PSBP-2
163 PRA1.F4  --  interacts with  --  AT1G71480  --  has similar expression pattern (mutual information value=1.13243) with  --  AT2G23840
164 PRA1.F4  --  interacts with  --  AT1G71480  --  has similar expression pattern (mutual information value=1.065) with  --  AT2G29360
165 PRA1.F4  --  interacts with  --  AT1G71480  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.995766) with  --  AT2G37240
166 PRA1.F4  --  interacts with  --  AT1G71480  --  has similar expression pattern (mutual information value=1.22146) with  --  AT1G79510
167 PRA1.F4  --  interacts with  --  AT1G71480  --  has similar expression pattern (mutual information value=1.03492) with  --  APG2; PGA2; TATC; UNE3
168 PRA1.F4  --  interacts with  --  AT1G71480  --  has similar expression pattern (mutual information value=1.04114) with  --  AT1G07700
169 PRA1.F4  --  interacts with  --  AT1G71480  --  has similar expression pattern (mutual information value=1.31117) with  --  AT1G52870
170 PRA1.F4  --  interacts with  --  AT1G71480  --  has similar expression pattern (mutual information value=1.14528) with  --  AT1G76730
171 PRA1.F4  --  interacts with  --  AT1G71480  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.899145) with  --  ADR2; WRR4
172 PRA1.F4  --  interacts with  --  AT1G71480  --  has similar expression pattern (mutual information value=1.10927) with  --  AT3G19800
173 PRA1.F4  --  interacts with  --  AT1G71480  --  has similar expression pattern (mutual information value=1.17946) with  --  AT4G32590
174 PRA1.F4  --  interacts with  --  AT1G71480  --  has similar expression pattern (mutual information value=1.06078) with  --  AT3G53470
175 PRA1.F4  --  interacts with  --  AT1G71480  --  has similar expression pattern (mutual information value=1.02907) with  --  GSTL3
176 PRA1.F4  --  interacts with  --  AT1G71480  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.865674) with  --  anac084; NAC084
177 PRA1.F4  --  interacts with  --  AT1G71480  --  has similar expression pattern (mutual information value=1.03579) with  --  ATF2; TRXF2
178 PRA1.F4  --  interacts with  --  AT1G71480  --  has similar expression pattern (mutual information value=1.18025) with  --  AT5G40500
179 PRA1.F4  --  interacts with  --  AT1G71480  --  has similar expression pattern (mutual information value=1.06126) with  --  AT5G57040
180 PRA1.F4  --  interacts with  --  AT1G71480  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.990578) with  --  HCF164
181 PRA1.F4  --  interacts with  --  AT1G71480  --  has similar expression pattern (mutual information value=1.09442) with  --  CSK
182 PRA1.F4  --  interacts with  --  ATSAR1; ATSAR1B; ATSARA1B; SAR1; SAR1B  --  interacts with  --  TET6
183 PRA1.F4  --  interacts with  --  ATSAR1; ATSAR1B; ATSARA1B; SAR1; SAR1B  --  interacts with  --  SEC61 BETA
184 PRA1.F4  --  interacts with  --  ATSAR1; ATSAR1B; ATSARA1B; SAR1; SAR1B  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.813988) with  --  RTNLB3
185 PRA1.F4  --  interacts with  --  LCV1  --  interacts with  --  AT4G37445
186 PRA1.F4  --  interacts with  --  LCV1  --  interacts with  --  AtFAD3; FAD3
187 PRA1.F4  --  interacts with  --  LCV1  --  interacts with  --  AT5G01430
188 PRA1.F4  --  interacts with  --  LCV1  --  interacts with  --  TOM20-3
189 PRA1.F4  --  interacts with  --  LCV1  --  interacts with  --  ATCESA3
190 PRA1.F4  --  interacts with  --  LCV1  --  interacts with  --  ATPPT2; PPT2
191 PRA1.F4  --  interacts with  --  LCV1  --  interacts with  --  SC3
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193 PRA1.F4  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.912774) with  --  AT1G09740  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.837342) with  --  AT2G04800
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197 PRA1.F4  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.912774) with  --  AT1G09740  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.901667) with  --  AT3G26440
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199 PRA1.F4  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.912774) with  --  AT1G09740  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.811694) with  --  ZFP6
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202 PRA1.F4  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.912774) with  --  AT1G09740  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.829098) with  --  AT5G08400
203 PRA1.F4  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.912774) with  --  AT1G09740  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.840775) with  --  AT4G15400
204 PRA1.F4  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.9131) with  --  AR411; ATWRKY14; WRKY14  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.956598) with  --  AT2G21045
205 PRA1.F4  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.9131) with  --  AR411; ATWRKY14; WRKY14  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.993497) with  --  AT4G30170
206 PRA1.F4  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.9131) with  --  AR411; ATWRKY14; WRKY14  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.898403) with  --  AT3G54770
207 PRA1.F4  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.9131) with  --  AR411; ATWRKY14; WRKY14  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.855954) with  --  ATMYB68; MYB68
208 PRA1.F4  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.9131) with  --  AR411; ATWRKY14; WRKY14  --  is the target gene of  --  ath-miR5021
   Funding by the National Science Foundation    Funding by the Oklahoma Center for the Advancement of Science & Technology    Additional funding by the Samuel Roberts Noble Foundation

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