Screen Resolution:     
Welcome to HRGRN
A Graph Search-Empowered Integrative Database of Arabidopsis Signaling Transduction, Metabolism and Gene Regulation Networks   
Location:  Home > Details for node AT5G52547
Type: Protein GRN ID: np37842 Name:
Annotation: BEST Arabidopsis thaliana protein match is: DNA binding (TAIR:AT3G47680.1); Has 35333 Blast hits to 34131 proteins in 2444 species: Archae - 798; Bacteria - 22429; Metazoa - 974; Fungi - 991; Plants - 531; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 9610 (source: NCBI BLink).
Gene Locus: AT5G52547
Gene Expression (Affy ATH1 probeset):
Graph Customization
   
Choose color for highlight:  
Display edge: validated and predicted
Display node/edge prompt:
Layout:
 as format     
Data Filter
 Protein modification
 Protein-protein interaction
        also include predicted relationship
 Compound-protein interaction
 TF-target gene regulation
 Small RNA-target regulation
        also include predicted relationship
 Carrier and transported molecule
 Catalytic chemical reaction
 Co-expressed gene pair
        with mutual information value >

  Ignore nodes having > relationships
 
Relationship type:  protein modification     catalytic chemical reaction     protein-protein interaction    
compound-protein interaction     TF-target gene regulation     small RNA-target regulation    
co-expressed gene pair     carrier and transported molecule     family/complex and member
Relationship evidence:  Solid line: validated          Dashed line: predicted
Relationship direction: Arrow: positive          T shape: negative          None arrow: unknown or n/a
Hormone association: Thicker line: hormone related relationship         : hormone related Node
Node type:  Transcription factor or transcriptional regulator       Compound       Kinase
 Small regulatory RNA (miRNA & ta-siRNA)       Other nodes
No. Path
2 AT5G52547  --  interacts with  --  AT3G54390
3 AT5G52547  --  interacts with  --  ATAUX2-11; IAA4
4 AT5G52547  --  interacts with  --  ASIL1
5 AT5G52547  --  interacts with  --  AT2G25650
6 AT5G52547  --  interacts with  --  AT4G00238
7 AT5G52547  --  interacts with  --  AT1G66820
8 AT5G52547  --  interacts with  --  IAA2
9 AT5G52547  --  interacts with  --  UBA2A
10 AT5G52547  --  interacts with  --  IAA11
11 AT5G52547  --  interacts with  --  AT3G54390  --  interacts with  --  AT4G39820
12 AT5G52547  --  interacts with  --  AT3G54390  --  interacts with  --  AT3G54826
13 AT5G52547  --  interacts with  --  AT3G54390  --  interacts with  --  AtTic22-IV; Tic22-IV
14 AT5G52547  --  interacts with  --  AT3G54390  --  interacts with  --  AT5G50335
15 AT5G52547  --  interacts with  --  AT3G54390  --  interacts with  --  AT4G11175
16 AT5G52547  --  interacts with  --  AT3G54390  --  interacts with  --  AT5G54750
17 AT5G52547  --  interacts with  --  AT3G54390  --  interacts with  --  AT5G41520
18 AT5G52547  --  interacts with  --  AT3G54390  --  interacts with  --  AT4G37280
19 AT5G52547  --  interacts with  --  AT3G54390  --  interacts with  --  ATWRKY36; WRKY36
20 AT5G52547  --  interacts with  --  AT3G54390  --  interacts with  --  AT3G16120
21 AT5G52547  --  interacts with  --  AT3G54390  --  interacts with  --  AT1G20770
22 AT5G52547  --  interacts with  --  AT3G54390  --  interacts with  --  CSI1
23 AT5G52547  --  interacts with  --  AT3G54390  --  interacts with  --  DEL1; E2FE; E2L3
24 AT5G52547  --  interacts with  --  AT3G54390  --  interacts with  --  HIPP20
25 AT5G52547  --  interacts with  --  AT3G54390  --  interacts with  --  AT3G19120
26 AT5G52547  --  interacts with  --  AT3G54390  --  interacts with  --  AT2G36145
27 AT5G52547  --  interacts with  --  AT3G54390  --  interacts with  --  AT1G17970
28 AT5G52547  --  interacts with  --  AT3G54390  --  interacts with  --  NFD6
29 AT5G52547  --  interacts with  --  AT3G54390  --  interacts with  --  ABCI18; ATNAP4; NAP4
30 AT5G52547  --  interacts with  --  AT3G54390  --  interacts with  --  AT2G17670
31 AT5G52547  --  interacts with  --  AT3G54390  --  interacts with  --  AT2G25730
32 AT5G52547  --  interacts with  --  AT3G54390  --  interacts with  --  PQL1; PQL2
33 AT5G52547  --  interacts with  --  AT3G54390  --  interacts with  --  ATHAP3; ATNF-YB1; HAP3; HAP3A; NF-YB1
34 AT5G52547  --  interacts with  --  ATAUX2-11; IAA4  --  interacts with  --  ARF11
35 AT5G52547  --  interacts with  --  ATAUX2-11; IAA4  --  interacts with  --  ARF7
36 AT5G52547  --  interacts with  --  ATAUX2-11; IAA4  --  interacts with  --  ARF6
37 AT5G52547  --  interacts with  --  ATAUX2-11; IAA4  --  interacts with  --  ARF5
38 AT5G52547  --  interacts with  --  ATAUX2-11; IAA4  --  interacts with  --  IAA20
39 AT5G52547  --  interacts with  --  ATAUX2-11; IAA4  --  interacts with  --  IAA28
40 AT5G52547  --  interacts with  --  ATAUX2-11; IAA4  --  interacts with  --  IAA8
41 AT5G52547  --  interacts with  --  ATAUX2-11; IAA4  --  interacts with  --  IAA9
42 AT5G52547  --  interacts with  --  ATAUX2-11; IAA4  --  interacts with  --  IAA10
43 AT5G52547  --  interacts with  --  ATAUX2-11; IAA4  --  interacts with  --  BDL
44 AT5G52547  --  interacts with  --  ATAUX2-11; IAA4  --  interacts with  --  IAA13
45 AT5G52547  --  interacts with  --  ATAUX2-11; IAA4  --  interacts with  --  IAA14
46 AT5G52547  --  interacts with  --  ATAUX2-11; IAA4  --  interacts with  --  IAA16
47 AT5G52547  --  interacts with  --  ATAUX2-11; IAA4  --  interacts with  --  IAA18
48 AT5G52547  --  interacts with  --  ATAUX2-11; IAA4  --  interacts with  --  IAA19
49 AT5G52547  --  interacts with  --  ATAUX2-11; IAA4  --  interacts with  --  ARF4
50 AT5G52547  --  interacts with  --  ATAUX2-11; IAA4  --  interacts with  --  ARF13
51 AT5G52547  --  interacts with  --  ATAUX2-11; IAA4  --  interacts with  --  ARF9
52 AT5G52547  --  interacts with  --  ATAUX2-11; IAA4  --  interacts with  --  ARF8
53 AT5G52547  --  interacts with  --  ATAUX2-11; IAA4  --  interacts with  --  IAA27; PAP2
54 AT5G52547  --  interacts with  --  ATAUX2-11; IAA4  --  interacts with  --  IAA30
55 AT5G52547  --  interacts with  --  ATAUX2-11; IAA4  --  interacts with  --  IAA34
56 AT5G52547  --  interacts with  --  ATAUX2-11; IAA4  --  interacts with  --  ATAUX2-27; AUX2-27; IAA5
57 AT5G52547  --  interacts with  --  ATAUX2-11; IAA4  --  interacts with  --  IAA15
58 AT5G52547  --  interacts with  --  ATAUX2-11; IAA4  --  interacts with  --  AXR3
59 AT5G52547  --  interacts with  --  ATAUX2-11; IAA4  --  interacts with  --  IAA3
60 AT5G52547  --  interacts with  --  ATAUX2-11; IAA4  --  interacts with  --  AXR5
61 AT5G52547  --  interacts with  --  ATAUX2-11; IAA4  --  interacts with  --  TPR2
62 AT5G52547  --  interacts with  --  ASIL1  --  interacts with  --  HIPP21
63 AT5G52547  --  interacts with  --  ASIL1  --  interacts with  --  AT3G15395
64 AT5G52547  --  interacts with  --  ASIL1  --  interacts with  --  AT4G36515
65 AT5G52547  --  interacts with  --  ASIL1  --  interacts with  --  AT1G80890
66 AT5G52547  --  interacts with  --  ASIL1  --  interacts with  --  AT1G71480
67 AT5G52547  --  interacts with  --  ASIL1  --  interacts with  --  HIPP27
68 AT5G52547  --  interacts with  --  ASIL1  --  interacts with  --  AT1G70350
69 AT5G52547  --  interacts with  --  ASIL1  --  interacts with  --  AT2G32160
70 AT5G52547  --  interacts with  --  ASIL1  --  interacts with  --  DVL11; RTFL8
71 AT5G52547  --  interacts with  --  ASIL1  --  interacts with  --  AT1G57620
72 AT5G52547  --  interacts with  --  ASIL1  --  interacts with  --  AT2G32840
73 AT5G52547  --  interacts with  --  ASIL1  --  interacts with  --  AT3G61790
74 AT5G52547  --  interacts with  --  ASIL1  --  interacts with  --  AT2G31490
75 AT5G52547  --  interacts with  --  ASIL1  --  interacts with  --  AT2G02570
76 AT5G52547  --  interacts with  --  ASIL1  --  interacts with  --  AT3G11590
77 AT5G52547  --  interacts with  --  ASIL1  --  interacts with  --  AT4G20300
78 AT5G52547  --  interacts with  --  ASIL1  --  interacts with  --  AT5G62030
79 AT5G52547  --  interacts with  --  ASIL1  --  interacts with  --  AT4G29240
80 AT5G52547  --  interacts with  --  ASIL1  --  interacts with  --  AT5G02870
81 AT5G52547  --  interacts with  --  ASIL1  --  interacts with  --  AT4G00585
82 AT5G52547  --  interacts with  --  ASIL1  --  interacts with  --  ATRTL2; RTL2
83 AT5G52547  --  interacts with  --  ASIL1  --  interacts with  --  AT4G33666
84 AT5G52547  --  interacts with  --  ASIL1  --  interacts with  --  UBL5
85 AT5G52547  --  interacts with  --  ASIL1  --  interacts with  --  PDE334
86 AT5G52547  --  interacts with  --  ASIL1  --  interacts with  --  AT4G17270
87 AT5G52547  --  interacts with  --  ASIL1  --  interacts with  --  EXL2
88 AT5G52547  --  interacts with  --  ASIL1  --  interacts with  --  AT3G47675
89 AT5G52547  --  interacts with  --  ASIL1  --  interacts with  --  DVL13; RTFL2
90 AT5G52547  --  interacts with  --  ASIL1  --  interacts with  --  AT2G16890
91 AT5G52547  --  interacts with  --  ASIL1  --  interacts with  --  AT3G24860
92 AT5G52547  --  interacts with  --  ASIL1  --  interacts with  --  AT5G60160
93 AT5G52547  --  interacts with  --  ASIL1  --  interacts with  --  FRL1
94 AT5G52547  --  interacts with  --  ASIL1  --  interacts with  --  AKIN11; ATKIN11; KIN11; SNRK1.2
95 AT5G52547  --  interacts with  --  ASIL1  --  interacts with  --  AT1G58070
96 AT5G52547  --  interacts with  --  ASIL1  --  interacts with  --  AT1G51355
97 AT5G52547  --  interacts with  --  ASIL1  --  interacts with  --  AT1G31050
98 AT5G52547  --  interacts with  --  ASIL1  --  interacts with  --  FRS11
99 AT5G52547  --  interacts with  --  ASIL1  --  interacts with  --  TOM6
100 AT5G52547  --  interacts with  --  ASIL1  --  interacts with  --  AT1G05710
101 AT5G52547  --  interacts with  --  AT2G25650  --  interacts with  --  AHBP-1B
102 AT5G52547  --  interacts with  --  AT2G25650  --  interacts with  --  ATUBC4; UBC4
103 AT5G52547  --  interacts with  --  AT2G25650  --  interacts with  --  CPFTSY; FRD4
104 AT5G52547  --  interacts with  --  AT2G25650  --  interacts with  --  UBC5
105 AT5G52547  --  interacts with  --  AT2G25650  --  interacts with  --  AT1G01630
106 AT5G52547  --  interacts with  --  AT4G00238  --  interacts with  --  CW7
107 AT5G52547  --  interacts with  --  AT1G66820  --  interacts with  --  PYRR; UPP
108 AT5G52547  --  interacts with  --  AT1G66820  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.984438) with  --  AT2G42130
109 AT5G52547  --  interacts with  --  AT1G66820  --  has similar expression pattern (mutual information value=1.00983) with  --  YCF37
110 AT5G52547  --  interacts with  --  AT1G66820  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.928111) with  --  ATSULA; GC1; SULA
111 AT5G52547  --  interacts with  --  AT1G66820  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.932187) with  --  AT1G60000
112 AT5G52547  --  interacts with  --  AT1G66820  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.970925) with  --  AT2G17240
113 AT5G52547  --  interacts with  --  AT1G66820  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.978818) with  --  Aty2; ty2
114 AT5G52547  --  interacts with  --  AT1G66820  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.941553) with  --  CP33; PDE322
115 AT5G52547  --  interacts with  --  AT1G66820  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.909568) with  --  GDC1; LTD
116 AT5G52547  --  interacts with  --  AT1G66820  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.960249) with  --  AT3G47650
117 AT5G52547  --  interacts with  --  AT1G66820  --  has similar expression pattern (mutual information value=1.02342) with  --  AT5G11450
118 AT5G52547  --  interacts with  --  IAA2  --  interacts with  --  IAA33
119 AT5G52547  --  interacts with  --  IAA2  --  interacts with  --  AXR2
120 AT5G52547  --  interacts with  --  IAA2  --  interacts with  --  MBD1
121 AT5G52547  --  interacts with  --  IAA2  --  interacts with  --  YUC6
122 AT5G52547  --  interacts with  --  IAA2  --  interacts with  --  TPR4; WSIP2
123 AT5G52547  --  interacts with  --  IAA2  --  interacts with  --  TPR3
124 AT5G52547  --  interacts with  --  IAA2  --  interacts with  --  TPR1
125 AT5G52547  --  interacts with  --  UBA2A  --  interacts with  --  AT2G41060
126 AT5G52547  --  interacts with  --  UBA2A  --  transport  --  Nickel(2+)
127 AT5G52547  --  interacts with  --  IAA11  --  interacts with  --  VPS9B
128 AT5G52547  --  interacts with  --  IAA11  --  interacts with  --  ATSPX1; SPX1
129 AT5G52547  --  interacts with  --  IAA11  --  interacts with  --  AT5G65130
130 AT5G52547  --  interacts with  --  IAA11  --  interacts with  --  AT5G65683
131 AT5G52547  --  interacts with  --  IAA11  --  interacts with  --  ATCIPK14; ATSR1; CIPK14; PKS24; SnRK3.15; SR1
132 AT5G52547  --  interacts with  --  IAA11  --  interacts with  --  ATSOS2; CIPK24; SNRK3.11; SOS2
133 AT5G52547  --  interacts with  --  IAA11  --  interacts with  --  ATP8; AtRCD1; CEO; CEO1; RCD1
134 AT5G52547  --  interacts with  --  IAA11  --  interacts with  --  AT3G01300
135 AT5G52547  --  interacts with  --  IAA11  --  interacts with  --  AtPPR2; EMB2750; PPR2
136 AT5G52547  --  interacts with  --  IAA11  --  interacts with  --  ATMBD8; MBD8
137 AT5G52547  --  interacts with  --  IAA11  --  interacts with  --  AT3G05640
138 AT5G52547  --  interacts with  --  IAA11  --  interacts with  --  DRIP2
139 AT5G52547  --  interacts with  --  IAA11  --  interacts with  --  AT2G02410
140 AT5G52547  --  interacts with  --  IAA11  --  interacts with  --  CIPK22; SnRK3.19
141 AT5G52547  --  interacts with  --  IAA11  --  interacts with  --  CIPK9; PKS6; SnRK3.12
142 AT5G52547  --  interacts with  --  IAA11  --  interacts with  --  AT2G33450
143 AT5G52547  --  interacts with  --  IAA11  --  interacts with  --  AT3G23390
   Funding by the National Science Foundation    Funding by the Oklahoma Center for the Advancement of Science & Technology    Additional funding by the Samuel Roberts Noble Foundation

Copyright © The Zhao Lab

Disclaimer | Contact