Screen Resolution:     
Welcome to HRGRN
A Graph Search-Empowered Integrative Database of Arabidopsis Signaling Transduction, Metabolism and Gene Regulation Networks   
Location:  Home > Details for node CSI1
Type: Protein GRN ID: np19942 Name: CSI1
Annotation: CSI1 | binding
Gene Locus: AT2G22125
Gene Expression (Affy ATH1 probeset): 263456_at    
Graph Customization
   
Choose color for highlight:  
Display edge: validated and predicted
Display node/edge prompt:
Layout:
 as format     
Data Filter
 Protein modification
 Protein-protein interaction
        also include predicted relationship
 Compound-protein interaction
 TF-target gene regulation
 Small RNA-target regulation
        also include predicted relationship
 Carrier and transported molecule
 Catalytic chemical reaction
 Co-expressed gene pair
        with mutual information value >

  Ignore nodes having > relationships
 
Relationship type:  protein modification     catalytic chemical reaction     protein-protein interaction    
compound-protein interaction     TF-target gene regulation     small RNA-target regulation    
co-expressed gene pair     carrier and transported molecule     family/complex and member
Relationship evidence:  Solid line: validated          Dashed line: predicted
Relationship direction: Arrow: positive          T shape: negative          None arrow: unknown or n/a
Hormone association: Thicker line: hormone related relationship         : hormone related Node
Node type:  Transcription factor or transcriptional regulator       Compound       Kinase
 Small regulatory RNA (miRNA & ta-siRNA)       Other nodes
No. Path
2 CSI1  --  interacts with  --  AT3G54390
3 CSI1  --  interacts with  --  TUA5
4 CSI1  --  interacts with  --  CESA6; E112; IXR2; PRC1
5 CSI1  --  interacts with  --  ATCESA3
6 CSI1  --  interacts with  --  AtCESA1; CESA1; RSW1
7 CSI1  --  interacts with  --  AT3G54390  --  interacts with  --  AT4G39820
8 CSI1  --  interacts with  --  AT3G54390  --  interacts with  --  AT5G52547
9 CSI1  --  interacts with  --  AT3G54390  --  interacts with  --  AT3G54826
10 CSI1  --  interacts with  --  AT3G54390  --  interacts with  --  AtTic22-IV; Tic22-IV
11 CSI1  --  interacts with  --  AT3G54390  --  interacts with  --  AT5G50335
12 CSI1  --  interacts with  --  AT3G54390  --  interacts with  --  AT4G11175
13 CSI1  --  interacts with  --  AT3G54390  --  interacts with  --  AT5G54750
14 CSI1  --  interacts with  --  AT3G54390  --  interacts with  --  AT5G41520
15 CSI1  --  interacts with  --  AT3G54390  --  interacts with  --  AT4G37280
16 CSI1  --  interacts with  --  AT3G54390  --  interacts with  --  ATWRKY36; WRKY36
17 CSI1  --  interacts with  --  AT3G54390  --  interacts with  --  AT3G16120
18 CSI1  --  interacts with  --  AT3G54390  --  interacts with  --  AT1G20770
19 CSI1  --  interacts with  --  AT3G54390  --  interacts with  --  DEL1; E2FE; E2L3
20 CSI1  --  interacts with  --  AT3G54390  --  interacts with  --  HIPP20
21 CSI1  --  interacts with  --  AT3G54390  --  interacts with  --  AT3G19120
22 CSI1  --  interacts with  --  AT3G54390  --  interacts with  --  AT2G36145
23 CSI1  --  interacts with  --  AT3G54390  --  interacts with  --  AT1G17970
24 CSI1  --  interacts with  --  AT3G54390  --  interacts with  --  NFD6
25 CSI1  --  interacts with  --  AT3G54390  --  interacts with  --  ABCI18; ATNAP4; NAP4
26 CSI1  --  interacts with  --  AT3G54390  --  interacts with  --  AT2G17670
27 CSI1  --  interacts with  --  AT3G54390  --  interacts with  --  AT2G25730
28 CSI1  --  interacts with  --  AT3G54390  --  interacts with  --  PQL1; PQL2
29 CSI1  --  interacts with  --  AT3G54390  --  interacts with  --  ATHAP3; ATNF-YB1; HAP3; HAP3A; NF-YB1
30 CSI1  --  interacts with  --  TUA5  --  interacts with  --  MAP65-2
31 CSI1  --  interacts with  --  CESA6; E112; IXR2; PRC1  --  interacts with  --  ATGH9A1; DEC; GH9A1; IRX2; KOR; KOR1; RSW2; TSD1
32 CSI1  --  interacts with  --  CESA6; E112; IXR2; PRC1  --  interacts with  --  ATCESA8; CESA8; IRX1; LEW2
33 CSI1  --  interacts with  --  CESA6; E112; IXR2; PRC1  --  interacts with  --  ATCESA7; CESA7; IRX3; MUR10
34 CSI1  --  interacts with  --  CESA6; E112; IXR2; PRC1  --  interacts with  --  CESA4; IRX5; NWS2
35 CSI1  --  interacts with  --  CESA6; E112; IXR2; PRC1  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.927276) with  --  ATH4; ATTRX4
36 CSI1  --  interacts with  --  CESA6; E112; IXR2; PRC1  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.938599) with  --  EMB2752
37 CSI1  --  interacts with  --  CESA6; E112; IXR2; PRC1  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.815112) with  --  AT3G54400
38 CSI1  --  interacts with  --  CESA6; E112; IXR2; PRC1  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.821858) with  --  AT5G54930
39 CSI1  --  interacts with  --  ATCESA3  --  interacts with  --  AT5G35460
40 CSI1  --  interacts with  --  ATCESA3  --  interacts with  --  GPT
41 CSI1  --  interacts with  --  ATCESA3  --  interacts with  --  AT4G34220
42 CSI1  --  interacts with  --  ATCESA3  --  interacts with  --  AT4G12590
43 CSI1  --  interacts with  --  ATCESA3  --  interacts with  --  AT1G14020
44 CSI1  --  interacts with  --  ATCESA3  --  interacts with  --  AtMAPR2; MAPR2
45 CSI1  --  interacts with  --  ATCESA3  --  interacts with  --  AT5G25940
46 CSI1  --  interacts with  --  ATCESA3  --  interacts with  --  AT5G07340
47 CSI1  --  interacts with  --  ATCESA3  --  interacts with  --  AT1G05640
48 CSI1  --  interacts with  --  ATCESA3  --  interacts with  --  LPAT2
49 CSI1  --  interacts with  --  ATCESA3  --  interacts with  --  AT4G26770
50 CSI1  --  interacts with  --  ATCESA3  --  interacts with  --  ATH3; ATTRX3; ATTRXH3; TRX3; TRXH3
51 CSI1  --  interacts with  --  ATCESA3  --  interacts with  --  ARL
52 CSI1  --  interacts with  --  ATCESA3  --  interacts with  --  ATUTR3; UTR3
53 CSI1  --  interacts with  --  ATCESA3  --  interacts with  --  LAG1 HOMOLOG 2; LOH2
54 CSI1  --  interacts with  --  ATCESA3  --  interacts with  --  AtMAPR5; ATMP1; MSBP1
55 CSI1  --  interacts with  --  ATCESA3  --  interacts with  --  ATUTR2; UTR2
56 CSI1  --  interacts with  --  ATCESA3  --  interacts with  --  GONST5
57 CSI1  --  interacts with  --  ATCESA3  --  interacts with  --  AtMYB51; BW51A; BW51B; HIG1; MYB51
58 CSI1  --  interacts with  --  ATCESA3  --  interacts with  --  LCV1
59 CSI1  --  interacts with  --  AtCESA1; CESA1; RSW1  --  interacts with  --  AT3G15800
60 CSI1  --  interacts with  --  AtCESA1; CESA1; RSW1  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.81118) with  --  POLD4
   Funding by the National Science Foundation    Funding by the Oklahoma Center for the Advancement of Science & Technology    Additional funding by the Samuel Roberts Noble Foundation

Copyright © The Zhao Lab

Disclaimer | Contact