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A Graph Search-Empowered Integrative Database of Arabidopsis Signaling Transduction, Metabolism and Gene Regulation Networks   
Location:  Home > Details for node RIE1
Type: Protein GRN ID: np22950 Name: RIE1
Annotation: RIE1 | RING-finger protein for embryogenesis [TCDB:3.A.1.1] [TCDB:3.A.1.10] [TCDB:3.A.1.125] [TCDB:3.A.1.23] [TCDB:3.A.1.26] [TCDB:3.A.1.6]
Gene Locus: AT2G01735
Transcription factor /
transcriptional regulator:		 transcription factor family C2H2
Gene Expression (Affy ATH1 probeset): 265888_at    
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 as format     
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 Protein modification
 Protein-protein interaction
        also include predicted relationship
 Compound-protein interaction
 TF-target gene regulation
 Small RNA-target regulation
        also include predicted relationship
 Carrier and transported molecule
 Catalytic chemical reaction
 Co-expressed gene pair
        with mutual information value >

  Ignore nodes having > relationships
 
Relationship type:  protein modification     catalytic chemical reaction     protein-protein interaction    
compound-protein interaction     TF-target gene regulation     small RNA-target regulation    
co-expressed gene pair     carrier and transported molecule     family/complex and member
Relationship evidence:  Solid line: validated          Dashed line: predicted
Relationship direction: Arrow: positive          T shape: negative          None arrow: unknown or n/a
Hormone association: Thicker line: hormone related relationship         : hormone related Node
Node type:  Transcription factor or transcriptional regulator       Compound       Kinase
 Small regulatory RNA (miRNA & ta-siRNA)       Other nodes
No. Path
2 RIE1  --  transport  --  Fe3+
3 RIE1  --  transport  --  Aluminium
4 RIE1  --  transport  --  DL-Glycerol 1-phosphate
5 RIE1  --  transport  --  Ornithine
6 RIE1  --  transport  --  Mannitol
7 RIE1  --  transport  --  Thiamine
8 RIE1  --  transport  --  Lactose
9 RIE1  --  transport  --  Maltose
10 RIE1  --  transport  --  Sucrose
11 RIE1  --  transport  --  Iron
12 RIE1  --  transport  --  Fe3+  --  is product (in catalytic reaction) of  --  ATFER1; FER1
13 RIE1  --  transport  --  Fe3+  --  is product (in catalytic reaction) of  --  ATFER3; FER3
14 RIE1  --  transport  --  Fe3+  --  is product (in catalytic reaction) of  --  ATFER2; FER2
15 RIE1  --  transport  --  Fe3+  --  is product (in catalytic reaction) of  --  ATFER4; FER4
16 RIE1  --  transport  --  Fe3+  --  is transported by  --  AT5G59130
17 RIE1  --  transport  --  Fe3+  --  is transported by  --  AT5G26900
18 RIE1  --  transport  --  Fe3+  --  is transported by  --  ATFRO5; FRO5
19 RIE1  --  transport  --  Fe3+  --  is transported by  --  LAC14
20 RIE1  --  transport  --  Fe3+  --  is transported by  --  AT4G36960
21 RIE1  --  transport  --  Fe3+  --  is transported by  --  AT4G32600
22 RIE1  --  transport  --  Fe3+  --  is transported by  --  AT4G27585
23 RIE1  --  transport  --  Fe3+  --  is transported by  --  AtSWEET14; SWEET14
24 RIE1  --  transport  --  Fe3+  --  is transported by  --  AMY1; ATAMY1
25 RIE1  --  transport  --  Fe3+  --  is transported by  --  AT4G24920
26 RIE1  --  transport  --  Fe3+  --  is transported by  --  CRK18
27 RIE1  --  transport  --  Fe3+  --  is transported by  --  CRK17; DUF26-21; EMB1290; RKC1
28 RIE1  --  transport  --  Fe3+  --  is transported by  --  UGLYAH
29 RIE1  --  transport  --  Fe3+  --  is transported by  --  AT4G14730
30 RIE1  --  transport  --  Fe3+  --  is transported by  --  AT4G09950
31 RIE1  --  transport  --  Fe3+  --  is transported by  --  AT4G09760
32 RIE1  --  transport  --  Fe3+  --  is transported by  --  AT4G09640
33 RIE1  --  transport  --  Fe3+  --  is transported by  --  AT4G05380
34 RIE1  --  transport  --  Fe3+  --  is transported by  --  AT4G05350
35 RIE1  --  transport  --  Fe3+  --  is transported by  --  AT4G02690
36 RIE1  --  transport  --  Fe3+  --  is transported by  --  ATSZF2; CZF1; SZF2; ZFAR1
37 RIE1  --  transport  --  Fe3+  --  is transported by  --  AT2G18600
38 RIE1  --  transport  --  Fe3+  --  is transported by  --  PR1
39 RIE1  --  transport  --  Fe3+  --  is transported by  --  AT2G07718
40 RIE1  --  transport  --  Fe3+  --  is transported by  --  ATTIM23-2; TIM23-2
41 RIE1  --  transport  --  Fe3+  --  is transported by  --  AT1G64450
42 RIE1  --  transport  --  Fe3+  --  is transported by  --  TSA1
43 RIE1  --  transport  --  Fe3+  --  is transported by  --  AT1G30600
44 RIE1  --  transport  --  Fe3+  --  is transported by  --  HERK2
45 RIE1  --  transport  --  Fe3+  --  is transported by  --  AAE14
46 RIE1  --  transport  --  Fe3+  --  is transported by  --  ATCB5-A; B5 #6; CB5-A
47 RIE1  --  transport  --  Fe3+  --  is transported by  --  LRR XI-23; RLK7
48 RIE1  --  transport  --  Fe3+  --  is transported by  --  ATGPAT4; GPAT4
49 RIE1  --  transport  --  Fe3+  --  is transported by  --  ATFRO1; FRO1
50 RIE1  --  transport  --  DL-Glycerol 1-phosphate  --  is transported by  --  AT5G10420
51 RIE1  --  transport  --  DL-Glycerol 1-phosphate  --  is transported by  --  AT5G10190
52 RIE1  --  transport  --  DL-Glycerol 1-phosphate  --  is transported by  --  AST68; SULTR2;1
53 RIE1  --  transport  --  DL-Glycerol 1-phosphate  --  is transported by  --  ABCF2
54 RIE1  --  transport  --  DL-Glycerol 1-phosphate  --  is transported by  --  ATMGT7; MGT7; MRS2-7
55 RIE1  --  transport  --  DL-Glycerol 1-phosphate  --  is transported by  --  AKR4C8
56 RIE1  --  transport  --  DL-Glycerol 1-phosphate  --  is transported by  --  LHB1B2; LHCB1.5
57 RIE1  --  transport  --  DL-Glycerol 1-phosphate  --  is transported by  --  HSP70T-2
58 RIE1  --  transport  --  Ornithine  --  is transported by  --  COX1
59 RIE1  --  transport  --  Ornithine  --  is transported by  --  NAD2; NAD2.2; NAD2B
60 RIE1  --  transport  --  Ornithine  --  is transported by  --  ORF291
61 RIE1  --  transport  --  Ornithine  --  is transported by  --  NAD1; NAD1A; ND1
62 RIE1  --  transport  --  Ornithine  --  is transported by  --  NAD1; NAD1B
63 RIE1  --  transport  --  Ornithine  --  is transported by  --  NAD3
64 RIE1  --  transport  --  Ornithine  --  is transported by  --  ABCI3; CCB256
65 RIE1  --  transport  --  Ornithine  --  is transported by  --  COX3
66 RIE1  --  transport  --  Ornithine  --  is transported by  --  NAD5; NAD5.2; NAD5B
67 RIE1  --  transport  --  Ornithine  --  is transported by  --  NAD4L
68 RIE1  --  transport  --  Ornithine  --  is transported by  --  pin2/AGR
69 RIE1  --  transport  --  Ornithine  --  is transported by  --  ftsh4
70 RIE1  --  transport  --  Ornithine  --  is transported by  --  ATXIG; XIG
71 RIE1  --  transport  --  Thiamine  --  has product (in catalytic reaction)  --  Thiamin diphosphate
72 RIE1  --  transport  --  Thiamine  --  is transported by  --  LACS8
73 RIE1  --  transport  --  Thiamine  --  is transported by  --  AT1G80400
74 RIE1  --  transport  --  Thiamine  --  is transported by  --  CDPK1A/CPK30
75 RIE1  --  transport  --  Thiamine  --  is transported by  --  AT1G60900
76 RIE1  --  transport  --  Thiamine  --  is transported by  --  AT1G51350
77 RIE1  --  transport  --  Thiamine  --  is transported by  --  AT1G09440
78 RIE1  --  transport  --  Lactose  --  is transported by  --  MSS3
79 RIE1  --  transport  --  Lactose  --  is transported by  --  sks16
80 RIE1  --  transport  --  Lactose  --  is transported by  --  ATSYTA; NTMC2T1.1; NTMC2TYPE1.1; SYT1; SYTA
81 RIE1  --  transport  --  Lactose  --  is transported by  --  PSAE-2
82 RIE1  --  transport  --  Lactose  --  is transported by  --  AT2G18240
83 RIE1  --  transport  --  Lactose  --  is transported by  --  LHCB2; LHCB2.2
84 RIE1  --  transport  --  Maltose  --  is transported by  --  ATCNGC1; CNGC1
85 RIE1  --  transport  --  Maltose  --  is transported by  --  AT5G53010
86 RIE1  --  transport  --  Maltose  --  is transported by  --  ABCG8
87 RIE1  --  transport  --  Maltose  --  is transported by  --  AT5G52450
88 RIE1  --  transport  --  Maltose  --  is transported by  --  HCF106
89 RIE1  --  transport  --  Maltose  --  is transported by  --  AT5G52050
90 RIE1  --  transport  --  Maltose  --  is transported by  --  ATKEA5; KEA5
91 RIE1  --  transport  --  Maltose  --  is transported by  --  AT5G51160
92 RIE1  --  transport  --  Maltose  --  is transported by  --  AT5G51050
93 RIE1  --  transport  --  Maltose  --  is transported by  --  AT5G50140
94 RIE1  --  transport  --  Maltose  --  is transported by  --  AT5G49990
95 RIE1  --  transport  --  Maltose  --  is transported by  --  PSD
96 RIE1  --  transport  --  Maltose  --  is transported by  --  BIP3
97 RIE1  --  transport  --  Sucrose  --  has product (in catalytic reaction)  --  Raffinose
98 RIE1  --  transport  --  Sucrose  --  has product (in catalytic reaction)  --  myo-Inositol
99 RIE1  --  transport  --  Sucrose  --  is product (in catalytic reaction) of  --  ATSUS2; SSA; SUS2
100 RIE1  --  transport  --  Sucrose  --  is product (in catalytic reaction) of  --  D-Fructose
101 RIE1  --  transport  --  Sucrose  --  is product (in catalytic reaction) of  --  NDP-glucose
102 RIE1  --  transport  --  Sucrose  --  is product (in catalytic reaction) of  --  ATSUS5; SUS5
103 RIE1  --  transport  --  Sucrose  --  is product (in catalytic reaction) of  --  ASUS1; atsus1; SUS1
104 RIE1  --  transport  --  Sucrose  --  is product (in catalytic reaction) of  --  ATSUS3; SUS3
105 RIE1  --  transport  --  Sucrose  --  is product (in catalytic reaction) of  --  ATSUS4; SUS4
106 RIE1  --  transport  --  Sucrose  --  is product (in catalytic reaction) of  --  ATSUS6; SUS6
107 RIE1  --  transport  --  Sucrose  --  is transported by  --  AT3G28960
108 RIE1  --  transport  --  Sucrose  --  is transported by  --  ABCB19/ATMDR1
109 RIE1  --  transport  --  Iron  --  is transported by  --  CP31B
110 RIE1  --  transport  --  Iron  --  is transported by  --  AT5G05820
111 RIE1  --  transport  --  Iron  --  is transported by  --  AT2G42960
112 RIE1  --  transport  --  Iron  --  is transported by  --  BP80-3;2; VSR3;2; VSR5
113 RIE1  --  transport  --  Iron  --  is transported by  --  AT2G22530
114 RIE1  --  transport  --  Iron  --  is transported by  --  UBA1A
115 RIE1  --  transport  --  Iron  --  is transported by  --  NDB4
116 RIE1  --  transport  --  Iron  --  is transported by  --  AT2G14520
117 RIE1  --  transport  --  Iron  --  is transported by  --  AT2G14255
118 RIE1  --  transport  --  Iron  --  is transported by  --  ALDH6B2
   Funding by the National Science Foundation    Funding by the Oklahoma Center for the Advancement of Science & Technology    Additional funding by the Samuel Roberts Noble Foundation

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