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A Graph Search-Empowered Integrative Database of Arabidopsis Signaling Transduction, Metabolism and Gene Regulation Networks   
Location:  Home > Details for node NDB4
Type: Protein GRN ID: np22627 Name: NDB4
Annotation: NDB4 | NAD(P)H dehydrogenase B4 [TCDB:3.A.1.106] [TCDB:3.A.1.210] [EC:1.6.5.9]
Gene Locus: AT2G20800
Gene Expression (Affy ATH1 probeset): 265422_at    
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 Protein modification
 Protein-protein interaction
        also include predicted relationship
 Compound-protein interaction
 TF-target gene regulation
 Small RNA-target regulation
        also include predicted relationship
 Carrier and transported molecule
 Catalytic chemical reaction
 Co-expressed gene pair
        with mutual information value >

  Ignore nodes having > relationships
 
Relationship type:  protein modification     catalytic chemical reaction     protein-protein interaction    
compound-protein interaction     TF-target gene regulation     small RNA-target regulation    
co-expressed gene pair     carrier and transported molecule     family/complex and member
Relationship evidence:  Solid line: validated          Dashed line: predicted
Relationship direction: Arrow: positive          T shape: negative          None arrow: unknown or n/a
Hormone association: Thicker line: hormone related relationship         : hormone related Node
Node type:  Transcription factor or transcriptional regulator       Compound       Kinase
 Small regulatory RNA (miRNA & ta-siRNA)       Other nodes
No. Path
2 NDB4  --  has product (in catalytic reaction)  --  Ubiquinol
3 NDB4  --  transport  --  Nickel(2+)
4 NDB4  --  transport  --  Sulfur
5 NDB4  --  transport  --  Iron
6 NDB4  --  has product (in catalytic reaction)  --  Ubiquinol  --  has product (in catalytic reaction)  --  Ubiquinone
7 NDB4  --  has product (in catalytic reaction)  --  Ubiquinol  --  is product (in catalytic reaction) of  --  NDC1
8 NDB4  --  has product (in catalytic reaction)  --  Ubiquinol  --  is product (in catalytic reaction) of  --  CI76; EMB1467
9 NDB4  --  has product (in catalytic reaction)  --  Ubiquinol  --  is product (in catalytic reaction) of  --  AT5G11770
10 NDB4  --  has product (in catalytic reaction)  --  Ubiquinol  --  is product (in catalytic reaction) of  --  CI51
11 NDB4  --  has product (in catalytic reaction)  --  Ubiquinol  --  is product (in catalytic reaction) of  --  AT4G02580
12 NDB4  --  has product (in catalytic reaction)  --  Ubiquinol  --  is product (in catalytic reaction) of  --  AT2G07785
13 NDB4  --  has product (in catalytic reaction)  --  Ubiquinol  --  is product (in catalytic reaction) of  --  AT2G07751
14 NDB4  --  has product (in catalytic reaction)  --  Ubiquinol  --  is product (in catalytic reaction) of  --  AT2G07689
15 NDB4  --  has product (in catalytic reaction)  --  Ubiquinol  --  is product (in catalytic reaction) of  --  AT1G79010
16 NDB4  --  has product (in catalytic reaction)  --  Ubiquinol  --  is product (in catalytic reaction) of  --  AT1G16700
17 NDB4  --  has product (in catalytic reaction)  --  Ubiquinol  --  is product (in catalytic reaction) of  --  ETFQO
18 NDB4  --  has product (in catalytic reaction)  --  Ubiquinol  --  is product (in catalytic reaction) of  --  Reduced electron-transferring flavoprotein
19 NDB4  --  has product (in catalytic reaction)  --  Ubiquinol  --  is product (in catalytic reaction) of  --  SDH1-1
20 NDB4  --  has product (in catalytic reaction)  --  Ubiquinol  --  is product (in catalytic reaction) of  --  SDH2-3
21 NDB4  --  has product (in catalytic reaction)  --  Ubiquinol  --  is product (in catalytic reaction) of  --  SDH2-2
22 NDB4  --  has product (in catalytic reaction)  --  Ubiquinol  --  is product (in catalytic reaction) of  --  SDH2-1
23 NDB4  --  has product (in catalytic reaction)  --  Ubiquinol  --  is product (in catalytic reaction) of  --  SDH1-2
24 NDB4  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  NAD4L
25 NDB4  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  NAD1; NAD1C
26 NDB4  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  NAD5; NAD5.1; NAD5A
27 NDB4  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  NAD7
28 NDB4  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  NAD6
29 NDB4  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  COB
30 NDB4  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  HCF164
31 NDB4  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  sks15
32 NDB4  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  AT4G32600
33 NDB4  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  AT4G31290
34 NDB4  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  AT4G31210
35 NDB4  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  AT4G24920
36 NDB4  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  AtPPT1; PPT1
37 NDB4  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  CRK23
38 NDB4  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  CRK21
39 NDB4  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  CRK20
40 NDB4  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  CRK19
41 NDB4  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  APT3
42 NDB4  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  AT4G22550
43 NDB4  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  ALMT12; ATALMT12
44 NDB4  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  AT4G17790
45 NDB4  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  UGLYAH
46 NDB4  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  AT4G16450
47 NDB4  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  AT4G14730
48 NDB4  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  AT4G09810
49 NDB4  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  AT4G09760
50 NDB4  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  AT4G09640
51 NDB4  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  AT4G09580
52 NDB4  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  CPK4
53 NDB4  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  AT4G05380
54 NDB4  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  AT4G05350
55 NDB4  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  CRK25
56 NDB4  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  AT4G05160
57 NDB4  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  AT4G05150
58 NDB4  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  AT4G02690
59 NDB4  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  AT4G01440
60 NDB4  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  UBA2A
61 NDB4  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  TOM20-1
62 NDB4  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  AT3G09340
63 NDB4  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  AT3G09330
64 NDB4  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  AT3G09030
65 NDB4  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  AT2G47560
66 NDB4  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  AT2G46210
67 NDB4  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  AT2G42960
68 NDB4  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  ATSZF2; CZF1; SZF2; ZFAR1
69 NDB4  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  WLIM2a
70 NDB4  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  BP80-3;2; VSR3;2; VSR5
71 NDB4  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  LHB1B2; LHCB1.5
72 NDB4  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  ATXID; XID
73 NDB4  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  HSP70T-2
74 NDB4  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  AT2G22530
75 NDB4  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  UBA1A
76 NDB4  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  AT2G14520
77 NDB4  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  ATGSTZ1; GST18; GSTZ1
78 NDB4  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  ATTIM23-2; TIM23-2
79 NDB4  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  AT1G64450
80 NDB4  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  LCR66; PDF2.4
81 NDB4  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  sks14
82 NDB4  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  TSA1
83 NDB4  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  AT1G30600
84 NDB4  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  HERK2
85 NDB4  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  AAE14
86 NDB4  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  AT1G29740
87 NDB4  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  ATCB5-A; B5 #6; CB5-A
88 NDB4  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  LRR XI-23; RLK7
89 NDB4  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  ATGPAT4; GPAT4
90 NDB4  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  ATFRO1; FRO1
91 NDB4  --  transport  --  Sulfur  --  has product (in catalytic reaction)  --  S-Sulfanylglutathione
92 NDB4  --  transport  --  Sulfur  --  has product (in catalytic reaction)  --  Sulfite
93 NDB4  --  transport  --  Sulfur  --  is transported by  --  AT5G05820
94 NDB4  --  transport  --  Iron  --  is transported by  --  CP31B
95 NDB4  --  transport  --  Iron  --  is transported by  --  PR1
96 NDB4  --  transport  --  Iron  --  is transported by  --  AT2G14255
97 NDB4  --  transport  --  Iron  --  is transported by  --  ALDH6B2
98 NDB4  --  transport  --  Iron  --  is transported by  --  AT2G07718
99 NDB4  --  transport  --  Iron  --  is transported by  --  RIE1
   Funding by the National Science Foundation    Funding by the Oklahoma Center for the Advancement of Science & Technology    Additional funding by the Samuel Roberts Noble Foundation

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