Screen Resolution:     
Welcome to HRGRN
A Graph Search-Empowered Integrative Database of Arabidopsis Signaling Transduction, Metabolism and Gene Regulation Networks   
Location:  Home > Details for node ftsh4
Type: Protein GRN ID: np19536 Name: ftsh4
Annotation: ftsh4 | FTSH protease 4 [TCDB:3.A.1.114] [TCDB:3.A.1.3] [TCDB:3.A.1.5] [TCDB:3.A.1.6] [TCDB:8.A.25.1]
Gene Locus: AT2G26140
Gene Expression (Affy ATH1 probeset): 266842_at    
Graph Customization
   
Choose color for highlight:  
Display edge: validated and predicted
Display node/edge prompt:
Layout:
 as format     
Data Filter
 Protein modification
 Protein-protein interaction
        also include predicted relationship
 Compound-protein interaction
 TF-target gene regulation
 Small RNA-target regulation
        also include predicted relationship
 Carrier and transported molecule
 Catalytic chemical reaction
 Co-expressed gene pair
        with mutual information value >

  Ignore nodes having > relationships
 
Relationship type:  protein modification     catalytic chemical reaction     protein-protein interaction    
compound-protein interaction     TF-target gene regulation     small RNA-target regulation    
co-expressed gene pair     carrier and transported molecule     family/complex and member
Relationship evidence:  Solid line: validated          Dashed line: predicted
Relationship direction: Arrow: positive          T shape: negative          None arrow: unknown or n/a
Hormone association: Thicker line: hormone related relationship         : hormone related Node
Node type:  Transcription factor or transcriptional regulator       Compound       Kinase
 Small regulatory RNA (miRNA & ta-siRNA)       Other nodes
No. Path
2 ftsh4  --  interacts with  --  FTSH2; VAR2
3 ftsh4  --  transport  --  ortho-Vanadate
4 ftsh4  --  transport  --  Molybdate
5 ftsh4  --  transport  --  Glycolipid
6 ftsh4  --  transport  --  Nopaline
7 ftsh4  --  transport  --  Ornithine
8 ftsh4  --  transport  --  Cystine
9 ftsh4  --  transport  --  Thiosulfate
10 ftsh4  --  transport  --  Sulfate
11 ftsh4  --  interacts with  --  FTSH2; VAR2  --  interacts with  --  ATWRKY60; WRKY60
12 ftsh4  --  interacts with  --  FTSH2; VAR2  --  transport  --  Lead
13 ftsh4  --  interacts with  --  FTSH2; VAR2  --  transport  --  Sterol
14 ftsh4  --  interacts with  --  FTSH2; VAR2  --  has similar expression pattern (mutual information value=1.10182) with  --  CRB; CSP41B; HIP1.3
15 ftsh4  --  interacts with  --  FTSH2; VAR2  --  has similar expression pattern (mutual information value=1.13809) with  --  AOAT1; GGAT1; GGT1
16 ftsh4  --  interacts with  --  FTSH2; VAR2  --  has similar expression pattern (mutual information value=1.00283) with  --  NDH-O
17 ftsh4  --  interacts with  --  FTSH2; VAR2  --  has similar expression pattern (mutual information value=1.09539) with  --  ATCDSP32; CDSP32
18 ftsh4  --  interacts with  --  FTSH2; VAR2  --  has similar expression pattern (mutual information value=1.02794) with  --  ATKEA1; KEA1
19 ftsh4  --  interacts with  --  FTSH2; VAR2  --  has similar expression pattern (mutual information value=1.01694) with  --  CHUP1
20 ftsh4  --  interacts with  --  FTSH2; VAR2  --  has similar expression pattern (mutual information value=1.10639) with  --  ACD1-LIKE; PTC52; TIC55-IV
21 ftsh4  --  interacts with  --  FTSH2; VAR2  --  has similar expression pattern (mutual information value=1.17451) with  --  CSP41A
22 ftsh4  --  interacts with  --  FTSH2; VAR2  --  has similar expression pattern (mutual information value=1.05888) with  --  ADG2; APL1
23 ftsh4  --  interacts with  --  FTSH2; VAR2  --  has similar expression pattern (mutual information value=1.06768) with  --  HCF136
24 ftsh4  --  interacts with  --  FTSH2; VAR2  --  has similar expression pattern (mutual information value=1.10324) with  --  FTSH5; VAR1
25 ftsh4  --  interacts with  --  FTSH2; VAR2  --  has similar expression pattern (mutual information value=1.1326) with  --  ATHSP93-V; CLPC; CLPC1; DCA1; HSP93-V
26 ftsh4  --  interacts with  --  FTSH2; VAR2  --  has similar expression pattern (mutual information value=1.40663) with  --  CLB4; CSB3; GCPE; HDS; ISPG
27 ftsh4  --  interacts with  --  FTSH2; VAR2  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.823208) with  --  tgg2/myrosinase 2
28 ftsh4  --  interacts with  --  FTSH2; VAR2  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.823208) with  --  tgg1/myrosinase 1
29 ftsh4  --  interacts with  --  FTSH2; VAR2  --  has similar expression pattern (mutual information value=1.20195) with  --  FD-GOGAT; GLS1; GLU1; GLUS
30 ftsh4  --  transport  --  ortho-Vanadate  --  is transported by  --  AT2G42030
31 ftsh4  --  transport  --  ortho-Vanadate  --  is transported by  --  AT2G30940
32 ftsh4  --  transport  --  ortho-Vanadate  --  is transported by  --  ATXIG; XIG
33 ftsh4  --  transport  --  ortho-Vanadate  --  is transported by  --  AT2G02370
34 ftsh4  --  transport  --  Molybdate  --  has product (in catalytic reaction)  --  Molybdoenzyme molybdenum cofactor
35 ftsh4  --  transport  --  Molybdate  --  is transported by  --  AT1G65240
36 ftsh4  --  transport  --  Molybdate  --  is transported by  --  AT1G56720
37 ftsh4  --  transport  --  Molybdate  --  is transported by  --  AT1G54150
38 ftsh4  --  transport  --  Molybdate  --  is transported by  --  AT1G51900
39 ftsh4  --  transport  --  Molybdate  --  is transported by  --  RHS6
40 ftsh4  --  transport  --  Molybdate  --  is transported by  --  AT1G51790
41 ftsh4  --  transport  --  Molybdate  --  is transported by  --  ATSERK2; SERK2
42 ftsh4  --  transport  --  Molybdate  --  is transported by  --  AT1G26690
43 ftsh4  --  transport  --  Molybdate  --  is transported by  --  ATCSLA03; ATCSLA3; CSLA03; CSLA03; CSLA3
44 ftsh4  --  transport  --  Molybdate  --  is transported by  --  AT1G22700
45 ftsh4  --  transport  --  Molybdate  --  is transported by  --  BIP3
46 ftsh4  --  transport  --  Molybdate  --  is transported by  --  iam hyd
47 ftsh4  --  transport  --  Molybdate  --  is transported by  --  PEX6
48 ftsh4  --  transport  --  Glycolipid  --  is transported by  --  AT2G18190
49 ftsh4  --  transport  --  Ornithine  --  is transported by  --  COX1
50 ftsh4  --  transport  --  Ornithine  --  is transported by  --  NAD2; NAD2.2; NAD2B
51 ftsh4  --  transport  --  Ornithine  --  is transported by  --  ORF291
52 ftsh4  --  transport  --  Ornithine  --  is transported by  --  NAD1; NAD1A; ND1
53 ftsh4  --  transport  --  Ornithine  --  is transported by  --  NAD1; NAD1B
54 ftsh4  --  transport  --  Ornithine  --  is transported by  --  NAD3
55 ftsh4  --  transport  --  Ornithine  --  is transported by  --  ABCI3; CCB256
56 ftsh4  --  transport  --  Ornithine  --  is transported by  --  COX3
57 ftsh4  --  transport  --  Ornithine  --  is transported by  --  NAD5; NAD5.2; NAD5B
58 ftsh4  --  transport  --  Ornithine  --  is transported by  --  NAD4L
59 ftsh4  --  transport  --  Ornithine  --  is transported by  --  pin2/AGR
60 ftsh4  --  transport  --  Ornithine  --  is transported by  --  PR1
61 ftsh4  --  transport  --  Ornithine  --  is transported by  --  AT2G07718
62 ftsh4  --  transport  --  Ornithine  --  is transported by  --  RIE1
63 ftsh4  --  transport  --  Thiosulfate  --  has product (in catalytic reaction)  --  Thiocyanate
64 ftsh4  --  transport  --  Thiosulfate  --  has product (in catalytic reaction)  --  Sulfite
65 ftsh4  --  transport  --  Sulfate  --  has product (in catalytic reaction)  --  Adenylyl sulfate
66 ftsh4  --  transport  --  Sulfate  --  is product (in catalytic reaction) of  --  AT-SO; AtSO; SOX
67 ftsh4  --  transport  --  Sulfate  --  is transported by  --  ACA8; AT-ACA8
68 ftsh4  --  transport  --  Sulfate  --  is transported by  --  PM-ANT
69 ftsh4  --  transport  --  Sulfate  --  is transported by  --  ATOPT1; OPT1
70 ftsh4  --  transport  --  Sulfate  --  is transported by  --  ATOPT9; OPT9
71 ftsh4  --  transport  --  Sulfate  --  is transported by  --  ACBP; ACBP1
72 ftsh4  --  transport  --  Sulfate  --  is transported by  --  AT4G01440
73 ftsh4  --  transport  --  Sulfate  --  is transported by  --  AKR4C8
74 ftsh4  --  transport  --  Sulfate  --  is transported by  --  HSP70T-2
75 ftsh4  --  transport  --  Sulfate  --  is transported by  --  AtJ8; AtToc12; J8; Toc12
76 ftsh4  --  transport  --  Sulfate  --  is transported by  --  AT1G80870
77 ftsh4  --  transport  --  Sulfate  --  is transported by  --  PDE318
78 ftsh4  --  transport  --  Sulfate  --  is transported by  --  TPR12
79 ftsh4  --  transport  --  Sulfate  --  is transported by  --  AT1G65090
80 ftsh4  --  transport  --  Sulfate  --  is transported by  --  4CL3
81 ftsh4  --  transport  --  Sulfate  --  is transported by  --  AtHrd1B; Hrd1B
82 ftsh4  --  transport  --  Sulfate  --  is transported by  --  SC3
83 ftsh4  --  transport  --  Sulfate  --  is transported by  --  AT1G51940
84 ftsh4  --  transport  --  Sulfate  --  is transported by  --  AT1G51930
85 ftsh4  --  transport  --  Sulfate  --  is transported by  --  AT1G44960
86 ftsh4  --  transport  --  Sulfate  --  is transported by  --  AT1G33910
87 ftsh4  --  transport  --  Sulfate  --  is transported by  --  AT1G33900
88 ftsh4  --  transport  --  Sulfate  --  is transported by  --  AT1G31250
89 ftsh4  --  transport  --  Sulfate  --  is transported by  --  AT1G21540
90 ftsh4  --  transport  --  Sulfate  --  is transported by  --  AT1G21530
91 ftsh4  --  transport  --  Sulfate  --  is transported by  --  AT1G18320
92 ftsh4  --  transport  --  Sulfate  --  is transported by  --  ATLAC1; LAC1
93 ftsh4  --  transport  --  Sulfate  --  is transported by  --  MEE4
   Funding by the National Science Foundation    Funding by the Oklahoma Center for the Advancement of Science & Technology    Additional funding by the Samuel Roberts Noble Foundation

Copyright © The Zhao Lab

Disclaimer | Contact