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A Graph Search-Empowered Integrative Database of Arabidopsis Signaling Transduction, Metabolism and Gene Regulation Networks   
Location:  Home > Details for node Ornithine
Type: Compound GRN ID: nc51602 Name: Ornithine
Annotation: Ornithine; 2,5-Diaminovaleric acid; 2,5-Diaminopentanoic acid; 2,5-Diaminopentanoate
KEGG Acc.: C01602
CHEBI ID:
Formula: C5H12N2O2
M.W.: 132.161
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 Protein modification
 Protein-protein interaction
        also include predicted relationship
 Compound-protein interaction
 TF-target gene regulation
 Small RNA-target regulation
        also include predicted relationship
 Carrier and transported molecule
 Catalytic chemical reaction
 Co-expressed gene pair
        with mutual information value >

  Ignore nodes having > relationships
 
Relationship type:  protein modification     catalytic chemical reaction     protein-protein interaction    
compound-protein interaction     TF-target gene regulation     small RNA-target regulation    
co-expressed gene pair     carrier and transported molecule     family/complex and member
Relationship evidence:  Solid line: validated          Dashed line: predicted
Relationship direction: Arrow: positive          T shape: negative          None arrow: unknown or n/a
Hormone association: Thicker line: hormone related relationship         : hormone related Node
Node type:  Transcription factor or transcriptional regulator       Compound       Kinase
 Small regulatory RNA (miRNA & ta-siRNA)       Other nodes
No. Path
2 Ornithine  --  is transported by  --  COX1
3 Ornithine  --  is transported by  --  NAD2; NAD2.2; NAD2B
4 Ornithine  --  is transported by  --  ORF291
5 Ornithine  --  is transported by  --  NAD1; NAD1A; ND1
6 Ornithine  --  is transported by  --  NAD1; NAD1B
7 Ornithine  --  is transported by  --  NAD3
8 Ornithine  --  is transported by  --  ABCI3; CCB256
9 Ornithine  --  is transported by  --  COX3
10 Ornithine  --  is transported by  --  NAD5; NAD5.2; NAD5B
11 Ornithine  --  is transported by  --  NAD4L
12 Ornithine  --  is transported by  --  pin2/AGR
13 Ornithine  --  is transported by  --  ftsh4
14 Ornithine  --  is transported by  --  ATXIG; XIG
15 Ornithine  --  is transported by  --  PR1
16 Ornithine  --  is transported by  --  AT2G07718
17 Ornithine  --  is transported by  --  RIE1
18 Ornithine  --  is transported by  --  COX1  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.896409) with  --  AT2G07711
19 Ornithine  --  is transported by  --  COX1  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.896409) with  --  NAD5; NAD5.1; NAD5A
20 Ornithine  --  is transported by  --  COX1  --  transport  --  Lithium
21 Ornithine  --  is transported by  --  COX1  --  transport  --  L-2,4-Diaminobutanoate
22 Ornithine  --  is transported by  --  COX1  --  transport  --  Phenylalanine
23 Ornithine  --  is transported by  --  COX1  --  transport  --  4-Aminobutanoate
24 Ornithine  --  is transported by  --  COX1  --  transport  --  Methylamine
25 Ornithine  --  is transported by  --  COX1  --  transport  --  L-Leucine
26 Ornithine  --  is transported by  --  COX1  --  transport  --  Phenylalanine
27 Ornithine  --  is transported by  --  COX1  --  transport  --  L-Trp
28 Ornithine  --  is transported by  --  COX1  --  transport  --  L-Lysine
29 Ornithine  --  is transported by  --  NAD3  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.985876) with  --  ORF114
30 Ornithine  --  is transported by  --  COX3  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.845401) with  --  ATP6-2
31 Ornithine  --  is transported by  --  COX3  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.845401) with  --  AT2G07699
32 Ornithine  --  is transported by  --  COX3  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.845401) with  --  AT2G07741
33 Ornithine  --  is transported by  --  COX3  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.845401) with  --  ATP6; ATP6-1
34 Ornithine  --  is transported by  --  NAD4L  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.977602) with  --  NAD9
35 Ornithine  --  is transported by  --  NAD4L  --  has similar expression pattern (mutual information value=1.06286) with  --  ORF25
36 Ornithine  --  is transported by  --  NAD4L  --  transport  --  Nickel(2+)
37 Ornithine  --  is transported by  --  NAD4L  --  transport  --  L-Methionine
38 Ornithine  --  is transported by  --  NAD4L  --  transport  --  Cu2+
39 Ornithine  --  is transported by  --  NAD4L  --  transport  --  Zinc cation
40 Ornithine  --  is transported by  --  pin2/AGR  --  interacts with  --  ALX8; ATSAL1; FRY1; HOS2; RON1; SAL1
41 Ornithine  --  is transported by  --  pin2/AGR  --  interacts with  --  RCN1 ATB BETA BETA
42 Ornithine  --  is transported by  --  pin2/AGR  --  interacts with  --  AtFYPP1; FYPP1
43 Ornithine  --  is transported by  --  pin2/AGR  --  interacts with  --  clathrin family, coding gene
44 Ornithine  --  is transported by  --  pin2/AGR  --  interacts with  --  RIC1
45 Ornithine  --  is transported by  --  pin2/AGR  --  interacts with  --  ARAC3; ATROP6; RAC3; RHO1PS; ROP6
46 Ornithine  --  is transported by  --  pin2/AGR  --  interacts with  --  AT4G16444
47 Ornithine  --  is transported by  --  pin2/AGR  --  interacts with  --  AT3G21690
48 Ornithine  --  is transported by  --  pin2/AGR  --  interacts with  --  CRK5; RLK6
49 Ornithine  --  is transported by  --  pin2/AGR  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.927024) with  --  AT2G25980
50 Ornithine  --  is transported by  --  pin2/AGR  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.907272) with  --  CYP705A8
51 Ornithine  --  is transported by  --  pin2/AGR  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.808201) with  --  AT2G34020
52 Ornithine  --  is transported by  --  pin2/AGR  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.829153) with  --  LBD13
53 Ornithine  --  is transported by  --  pin2/AGR  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.824798) with  --  AT4G28650
54 Ornithine  --  is transported by  --  pin2/AGR  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.907908) with  --  AT5G62340
55 Ornithine  --  is transported by  --  pin2/AGR  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.852022) with  --  GMD1
56 Ornithine  --  is transported by  --  pin2/AGR  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.864781) with  --  ATMYB66; MYB66; WER; WER1
57 Ornithine  --  is transported by  --  pin2/AGR  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.974083) with  --  AHK5; CKI2; HK5
58 Ornithine  --  is transported by  --  pin2/AGR  --  transport  --  Cl-
59 Ornithine  --  is transported by  --  pin2/AGR  --  transport  --  Carnitine
60 Ornithine  --  is transported by  --  pin2/AGR  --  transport  --  Adenine
61 Ornithine  --  is transported by  --  pin2/AGR  --  is a member of  --  ATPIN1 family27, coding gene
62 Ornithine  --  is transported by  --  pin2/AGR  --  is modified by  --  D6PK
63 Ornithine  --  is transported by  --  pin2/AGR  --  is modified by  --  CRK
64 Ornithine  --  is transported by  --  pin2/AGR  --  is modified by  --  WAG2
65 Ornithine  --  is transported by  --  pin2/AGR  --  is modified by  --  ABR; PID
66 Ornithine  --  is transported by  --  pin2/AGR  --  is modified by  --  PK3AT; WAG1
67 Ornithine  --  is transported by  --  ftsh4  --  interacts with  --  FTSH2; VAR2
68 Ornithine  --  is transported by  --  ftsh4  --  transport  --  ortho-Vanadate
69 Ornithine  --  is transported by  --  ftsh4  --  transport  --  Molybdate
70 Ornithine  --  is transported by  --  ftsh4  --  transport  --  Glycolipid
71 Ornithine  --  is transported by  --  ftsh4  --  transport  --  Nopaline
72 Ornithine  --  is transported by  --  ftsh4  --  transport  --  Cystine
73 Ornithine  --  is transported by  --  ftsh4  --  transport  --  Thiosulfate
74 Ornithine  --  is transported by  --  ftsh4  --  transport  --  Sulfate
75 Ornithine  --  is transported by  --  PR1  --  interacts with  --  MKK7
76 Ornithine  --  is transported by  --  PR1  --  interacts with  --  GRX480; roxy19
77 Ornithine  --  is transported by  --  PR1  --  interacts with  --  ATSIZ1
78 Ornithine  --  is transported by  --  PR1  --  interacts with  --  PAD4
79 Ornithine  --  is transported by  --  PR1  --  interacts with  --  SSI4
80 Ornithine  --  is transported by  --  PR1  --  interacts with  --  SNI1
81 Ornithine  --  is transported by  --  PR1  --  interacts with  --  DTH9
82 Ornithine  --  is transported by  --  PR1  --  transport  --  Fe3+
83 Ornithine  --  is transported by  --  PR1  --  transport  --  Aluminium
84 Ornithine  --  is transported by  --  PR1  --  transport  --  DL-Glycerol 1-phosphate
85 Ornithine  --  is transported by  --  PR1  --  transport  --  Mannitol
86 Ornithine  --  is transported by  --  PR1  --  transport  --  Thiamine
87 Ornithine  --  is transported by  --  PR1  --  transport  --  Lactose
88 Ornithine  --  is transported by  --  PR1  --  transport  --  Maltose
89 Ornithine  --  is transported by  --  PR1  --  transport  --  Sucrose
90 Ornithine  --  is transported by  --  PR1  --  transport  --  Iron
91 Ornithine  --  is transported by  --  PR1  --  is a member of  --  PR1 family109, coding gene
92 Ornithine  --  is transported by  --  PR1  --  is regulated by  --  ARR2 complex18
93 Ornithine  --  is transported by  --  PR1  --  is regulated by  --  OBF4
94 Ornithine  --  is transported by  --  PR1  --  is regulated by  --  TGA1
95 Ornithine  --  is transported by  --  PR1  --  is regulated by  --  BZIP45
96 Ornithine  --  is transported by  --  PR1  --  is regulated by  --  OBF5
97 Ornithine  --  is transported by  --  PR1  --  is regulated by  --  PTAC/ATUHY1/ATWHY1
98 Ornithine  --  is transported by  --  PR1  --  is regulated by  --  AHBP-1B
99 Ornithine  --  is transported by  --  PR1  --  is regulated by  --  TGA3
100 Ornithine  --  is transported by  --  PR1  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.893456) with  --  CRK6
101 Ornithine  --  is transported by  --  PR1  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.893456) with  --  CRK8
102 Ornithine  --  is transported by  --  PR1  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.831662) with  --  AT5G10760
103 Ornithine  --  is transported by  --  AT2G07718  --  transport  --  Lindane
104 Ornithine  --  is transported by  --  AT2G07718  --  transport  --  beta-Sitosterol
105 Ornithine  --  is transported by  --  AT2G07718  --  transport  --  Steroid
106 Ornithine  --  is transported by  --  AT2G07718  --  transport  --  Cholesterol
   Funding by the National Science Foundation    Funding by the Oklahoma Center for the Advancement of Science & Technology    Additional funding by the Samuel Roberts Noble Foundation

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