Screen Resolution:     
Welcome to HRGRN
A Graph Search-Empowered Integrative Database of Arabidopsis Signaling Transduction, Metabolism and Gene Regulation Networks   
Location:  Home > Details for node AT4G05350
Type: Protein GRN ID: np31034 Name:
Annotation: RING/U-box superfamily protein [TCDB:3.A.3.5] [TCDB:3.A.3.6]
Gene Locus: AT4G05350
Transcription factor /
transcriptional regulator:		 transcription factor family C2H2
Gene Expression (Affy ATH1 probeset): 254865_s_at    
Graph Customization
   
Choose color for highlight:  
Display edge: validated and predicted
Display node/edge prompt:
Layout:
 as format     
Data Filter
 Protein modification
 Protein-protein interaction
        also include predicted relationship
 Compound-protein interaction
 TF-target gene regulation
 Small RNA-target regulation
        also include predicted relationship
 Carrier and transported molecule
 Catalytic chemical reaction
 Co-expressed gene pair
        with mutual information value >

  Ignore nodes having > relationships
 
Relationship type:  protein modification     catalytic chemical reaction     protein-protein interaction    
compound-protein interaction     TF-target gene regulation     small RNA-target regulation    
co-expressed gene pair     carrier and transported molecule     family/complex and member
Relationship evidence:  Solid line: validated          Dashed line: predicted
Relationship direction: Arrow: positive          T shape: negative          None arrow: unknown or n/a
Hormone association: Thicker line: hormone related relationship         : hormone related Node
Node type:  Transcription factor or transcriptional regulator       Compound       Kinase
 Small regulatory RNA (miRNA & ta-siRNA)       Other nodes
No. Path
2 AT4G05350  --  transport  --  Nickel(2+)
3 AT4G05350  --  transport  --  Fe3+
4 AT4G05350  --  transport  --  Silver
5 AT4G05350  --  transport  --  Lead
6 AT4G05350  --  transport  --  Mercury(2+)
7 AT4G05350  --  transport  --  Cu2+
8 AT4G05350  --  transport  --  Zinc cation
9 AT4G05350  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  NAD4L
10 AT4G05350  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  NAD1; NAD1C
11 AT4G05350  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  NAD5; NAD5.1; NAD5A
12 AT4G05350  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  NAD7
13 AT4G05350  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  NAD6
14 AT4G05350  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  COB
15 AT4G05350  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  HCF164
16 AT4G05350  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  sks15
17 AT4G05350  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  AT4G32600
18 AT4G05350  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  AT4G31290
19 AT4G05350  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  AT4G31210
20 AT4G05350  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  AT4G24920
21 AT4G05350  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  AtPPT1; PPT1
22 AT4G05350  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  CRK23
23 AT4G05350  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  CRK21
24 AT4G05350  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  CRK20
25 AT4G05350  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  CRK19
26 AT4G05350  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  APT3
27 AT4G05350  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  AT4G22550
28 AT4G05350  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  ALMT12; ATALMT12
29 AT4G05350  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  AT4G17790
30 AT4G05350  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  UGLYAH
31 AT4G05350  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  AT4G16450
32 AT4G05350  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  AT4G14730
33 AT4G05350  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  AT4G09810
34 AT4G05350  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  AT4G09760
35 AT4G05350  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  AT4G09640
36 AT4G05350  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  AT4G09580
37 AT4G05350  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  CPK4
38 AT4G05350  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  AT4G05380
39 AT4G05350  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  CRK25
40 AT4G05350  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  AT4G05160
41 AT4G05350  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  AT4G05150
42 AT4G05350  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  AT4G02690
43 AT4G05350  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  AT4G01440
44 AT4G05350  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  UBA2A
45 AT4G05350  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  TOM20-1
46 AT4G05350  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  AT3G09340
47 AT4G05350  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  AT3G09330
48 AT4G05350  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  AT3G09030
49 AT4G05350  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  AT2G47560
50 AT4G05350  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  AT2G46210
51 AT4G05350  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  AT2G42960
52 AT4G05350  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  ATSZF2; CZF1; SZF2; ZFAR1
53 AT4G05350  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  WLIM2a
54 AT4G05350  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  BP80-3;2; VSR3;2; VSR5
55 AT4G05350  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  LHB1B2; LHCB1.5
56 AT4G05350  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  ATXID; XID
57 AT4G05350  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  HSP70T-2
58 AT4G05350  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  AT2G22530
59 AT4G05350  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  UBA1A
60 AT4G05350  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  NDB4
61 AT4G05350  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  AT2G14520
62 AT4G05350  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  ATGSTZ1; GST18; GSTZ1
63 AT4G05350  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  ATTIM23-2; TIM23-2
64 AT4G05350  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  AT1G64450
65 AT4G05350  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  LCR66; PDF2.4
66 AT4G05350  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  sks14
67 AT4G05350  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  TSA1
68 AT4G05350  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  AT1G30600
69 AT4G05350  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  HERK2
70 AT4G05350  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  AAE14
71 AT4G05350  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  AT1G29740
72 AT4G05350  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  ATCB5-A; B5 #6; CB5-A
73 AT4G05350  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  LRR XI-23; RLK7
74 AT4G05350  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  ATGPAT4; GPAT4
75 AT4G05350  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  ATFRO1; FRO1
76 AT4G05350  --  transport  --  Fe3+  --  is product (in catalytic reaction) of  --  ATFER1; FER1
77 AT4G05350  --  transport  --  Fe3+  --  is product (in catalytic reaction) of  --  ATFER3; FER3
78 AT4G05350  --  transport  --  Fe3+  --  is product (in catalytic reaction) of  --  ATFER2; FER2
79 AT4G05350  --  transport  --  Fe3+  --  is product (in catalytic reaction) of  --  ATFER4; FER4
80 AT4G05350  --  transport  --  Fe3+  --  is transported by  --  AT5G59130
81 AT4G05350  --  transport  --  Fe3+  --  is transported by  --  AT5G26900
82 AT4G05350  --  transport  --  Fe3+  --  is transported by  --  ATFRO5; FRO5
83 AT4G05350  --  transport  --  Fe3+  --  is transported by  --  LAC14
84 AT4G05350  --  transport  --  Fe3+  --  is transported by  --  AT4G36960
85 AT4G05350  --  transport  --  Fe3+  --  is transported by  --  AT4G27585
86 AT4G05350  --  transport  --  Fe3+  --  is transported by  --  AtSWEET14; SWEET14
87 AT4G05350  --  transport  --  Fe3+  --  is transported by  --  AMY1; ATAMY1
88 AT4G05350  --  transport  --  Fe3+  --  is transported by  --  CRK18
89 AT4G05350  --  transport  --  Fe3+  --  is transported by  --  CRK17; DUF26-21; EMB1290; RKC1
90 AT4G05350  --  transport  --  Fe3+  --  is transported by  --  AT4G09950
91 AT4G05350  --  transport  --  Fe3+  --  is transported by  --  AT2G18600
92 AT4G05350  --  transport  --  Fe3+  --  is transported by  --  PR1
93 AT4G05350  --  transport  --  Fe3+  --  is transported by  --  AT2G07718
94 AT4G05350  --  transport  --  Fe3+  --  is transported by  --  RIE1
95 AT4G05350  --  transport  --  Silver  --  is transported by  --  AT3G28070
96 AT4G05350  --  transport  --  Silver  --  is transported by  --  AT3G28050
97 AT4G05350  --  transport  --  Silver  --  is transported by  --  AT3G27870
98 AT4G05350  --  transport  --  Silver  --  is transported by  --  AT3G27240
99 AT4G05350  --  transport  --  Lead  --  is transported by  --  AT2G47320
100 AT4G05350  --  transport  --  Lead  --  is transported by  --  LAC6
101 AT4G05350  --  transport  --  Lead  --  is transported by  --  AT2G44410
102 AT4G05350  --  transport  --  Lead  --  is transported by  --  AT2G43530
103 AT4G05350  --  transport  --  Lead  --  is transported by  --  ATTI2; TI2
104 AT4G05350  --  transport  --  Lead  --  is transported by  --  ATTI1; TI1
105 AT4G05350  --  transport  --  Lead  --  is transported by  --  AT2G39360
106 AT4G05350  --  transport  --  Lead  --  is transported by  --  ATCRR2; CCR2
107 AT4G05350  --  transport  --  Lead  --  is transported by  --  ATIREG1; FPN1; IREG1
108 AT4G05350  --  transport  --  Lead  --  is transported by  --  AT2G37050
109 AT4G05350  --  transport  --  Lead  --  is transported by  --  AT2G36695
110 AT4G05350  --  transport  --  Lead  --  is transported by  --  AT2G36630
111 AT4G05350  --  transport  --  Lead  --  is transported by  --  AT2G36570
112 AT4G05350  --  transport  --  Lead  --  is transported by  --  ATCSLA07; ATCSLA7; CSLA07; CSLA07; CSLA7
113 AT4G05350  --  transport  --  Lead  --  is transported by  --  LHB1B1; LHCB1.4
114 AT4G05350  --  transport  --  Lead  --  is transported by  --  AT2G34020
115 AT4G05350  --  transport  --  Lead  --  is transported by  --  AT2G32580
116 AT4G05350  --  transport  --  Lead  --  is transported by  --  AT2G32295
117 AT4G05350  --  transport  --  Lead  --  is transported by  --  FTSH2; VAR2
118 AT4G05350  --  transport  --  Lead  --  is transported by  --  AtVSR2; BP80-1;2; VSR1;2; VSR2
119 AT4G05350  --  transport  --  Lead  --  is transported by  --  LAC3
120 AT4G05350  --  transport  --  Lead  --  is transported by  --  AT2G30050
121 AT4G05350  --  transport  --  Lead  --  is transported by  --  NDA2
122 AT4G05350  --  transport  --  Lead  --  is transported by  --  ATCYP5; CYP19-4; CYP5
123 AT4G05350  --  transport  --  Lead  --  is transported by  --  ATGSTU1; GST19; GSTU1
124 AT4G05350  --  transport  --  Lead  --  is transported by  --  ATGSTU2; GST20; GSTU2
125 AT4G05350  --  transport  --  Lead  --  is transported by  --  AT103-1A; ATGSTU1; ATGSTU5; GSTU5
126 AT4G05350  --  transport  --  Lead  --  is transported by  --  ATGSTU6; GST24; GSTU6
127 AT4G05350  --  transport  --  Lead  --  is transported by  --  ATGSTU7; GST25; GSTU7
128 AT4G05350  --  transport  --  Lead  --  is transported by  --  ATOEP16-1; ATOEP16-L; OEP16; OEP16-1
129 AT4G05350  --  transport  --  Lead  --  is transported by  --  AT2G27680
130 AT4G05350  --  transport  --  Lead  --  is transported by  --  UBP19
131 AT4G05350  --  transport  --  Lead  --  is transported by  --  AT2G24420
132 AT4G05350  --  transport  --  Lead  --  is transported by  --  ALDH11A3
133 AT4G05350  --  transport  --  Lead  --  is transported by  --  ATRER1C1
134 AT4G05350  --  transport  --  Lead  --  is transported by  --  ATRER1B; RER1B
135 AT4G05350  --  transport  --  Lead  --  is transported by  --  AT2G21560
136 AT4G05350  --  transport  --  Lead  --  is transported by  --  AT2G17170
137 AT4G05350  --  transport  --  Lead  --  is transported by  --  AT2G16800
138 AT4G05350  --  transport  --  Lead  --  is transported by  --  AT2G15020
139 AT4G05350  --  transport  --  Lead  --  is transported by  --  AT2G15010
140 AT4G05350  --  transport  --  Lead  --  is transported by  --  AKN1; APK; APK1; ATAKN1
141 AT4G05350  --  transport  --  Lead  --  is transported by  --  ATVSR3; BP80-2;2; VSR2;2; VSR3; VSR3
142 AT4G05350  --  transport  --  Lead  --  is transported by  --  CRCK3
143 AT4G05350  --  transport  --  Lead  --  is transported by  --  AT2G07768
144 AT4G05350  --  transport  --  Lead  --  is transported by  --  AT2G07741
145 AT4G05350  --  transport  --  Lead  --  is transported by  --  AT2G05810
146 AT4G05350  --  transport  --  Lead  --  is transported by  --  ATG8D
147 AT4G05350  --  transport  --  Lead  --  is transported by  --  AT2G04300
148 AT4G05350  --  transport  --  Lead  --  is transported by  --  AIR3
149 AT4G05350  --  transport  --  Lead  --  is transported by  --  AT1G57620
150 AT4G05350  --  transport  --  Lead  --  is transported by  --  AT1G29770
151 AT4G05350  --  transport  --  Lead  --  is transported by  --  ATPUB44; PUB44; SAUL1
152 AT4G05350  --  transport  --  Lead  --  is transported by  --  AT1G11300
153 AT4G05350  --  transport  --  Mercury(2+)  --  is transported by  --  AT1G80000
154 AT4G05350  --  transport  --  Mercury(2+)  --  is transported by  --  AT1G61340
155 AT4G05350  --  transport  --  Cu2+  --  is a member of  --  ETH+ receptors subfamily2 complex23
156 AT4G05350  --  transport  --  Cu2+  --  is a member of  --  ETH receptors subfamily2 complex21
157 AT4G05350  --  transport  --  Cu2+  --  is a member of  --  ETH +receptors subfamily1 complex22
158 AT4G05350  --  transport  --  Cu2+  --  is a member of  --  ETH receptors subfamily1 complex20
159 AT4G05350  --  transport  --  Cu2+  --  is product (in catalytic reaction) of  --  ATRAN1; RAN-1; RAN1
160 AT4G05350  --  transport  --  Cu2+  --  is transported by  --  CKI1
161 AT4G05350  --  transport  --  Cu2+  --  is transported by  --  PR-1-LIKE
162 AT4G05350  --  transport  --  Zinc cation  --  is product (in catalytic reaction) of  --  ATHMA2; HMA2
163 AT4G05350  --  transport  --  Zinc cation  --  is product (in catalytic reaction) of  --  ATHMA4; HMA4
164 AT4G05350  --  transport  --  Zinc cation  --  is transported by  --  CP31B
165 AT4G05350  --  transport  --  Zinc cation  --  is transported by  --  ATCLC-C; CLC-C
166 AT4G05350  --  transport  --  Zinc cation  --  is transported by  --  AT5G47470
167 AT4G05350  --  transport  --  Zinc cation  --  is transported by  --  ATTIP2;3; DELTA-TIP3; TIP2;3
168 AT4G05350  --  transport  --  Zinc cation  --  is transported by  --  BOU
169 AT4G05350  --  transport  --  Zinc cation  --  is transported by  --  ABCB7; PGP7
170 AT4G05350  --  transport  --  Zinc cation  --  is transported by  --  ATKCO2; ATTPK2; KCO2
171 AT4G05350  --  transport  --  Zinc cation  --  is transported by  --  ATKCO3; KCO3
172 AT4G05350  --  transport  --  Zinc cation  --  is transported by  --  KAT1
173 AT4G05350  --  transport  --  Zinc cation  --  is transported by  --  APE2; TPT
174 AT4G05350  --  transport  --  Zinc cation  --  is transported by  --  ALDH6B2
175 AT4G05350  --  transport  --  Zinc cation  --  is transported by  --  AT2G07750
176 AT4G05350  --  transport  --  Zinc cation  --  is transported by  --  ATERDJ2A
177 AT4G05350  --  transport  --  Zinc cation  --  is transported by  --  ATPEX2; PEX2; TED3
178 AT4G05350  --  transport  --  Zinc cation  --  is transported by  --  TMK1
179 AT4G05350  --  transport  --  Zinc cation  --  is transported by  --  AT1G66120
180 AT4G05350  --  transport  --  Zinc cation  --  is transported by  --  AT1G66100
181 AT4G05350  --  transport  --  Zinc cation  --  is transported by  --  DAL2; ZCF61
182 AT4G05350  --  transport  --  Zinc cation  --  is transported by  --  AT1G57600
183 AT4G05350  --  transport  --  Zinc cation  --  is transported by  --  AT1G56120
184 AT4G05350  --  transport  --  Zinc cation  --  is transported by  --  AT1G56050
185 AT4G05350  --  transport  --  Zinc cation  --  is transported by  --  AT1G54110
186 AT4G05350  --  transport  --  Zinc cation  --  is transported by  --  ALDH7B4
187 AT4G05350  --  transport  --  Zinc cation  --  is transported by  --  AT1G42680
188 AT4G05350  --  transport  --  Zinc cation  --  is transported by  --  AT1G34300
189 AT4G05350  --  transport  --  Zinc cation  --  is transported by  --  AT1G34110
190 AT4G05350  --  transport  --  Zinc cation  --  is transported by  --  AB140; CAB1; CAB140; LHCB1.3
191 AT4G05350  --  transport  --  Zinc cation  --  is transported by  --  AB165; CAB2; LHCB1.1
192 AT4G05350  --  transport  --  Zinc cation  --  is transported by  --  AB180; CAB3; LHCB1.2
193 AT4G05350  --  transport  --  Zinc cation  --  is transported by  --  AT1G11180
194 AT4G05350  --  transport  --  Zinc cation  --  is transported by  --  PSAD-2
195 AT4G05350  --  transport  --  Zinc cation  --  is transported by  --  AT1G03070
   Funding by the National Science Foundation    Funding by the Oklahoma Center for the Advancement of Science & Technology    Additional funding by the Samuel Roberts Noble Foundation

Copyright © The Zhao Lab

Disclaimer | Contact