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A Graph Search-Empowered Integrative Database of Arabidopsis Signaling Transduction, Metabolism and Gene Regulation Networks   
Location:  Home > Details for node AT3G28960
Type: Protein GRN ID: np27299 Name:
Annotation: Transmembrane amino acid transporter family protein [TCDB:1.A.8.10] [TCDB:1.A.8.12] [TCDB:1.A.8.16] [TCDB:1.A.8.8] [TCDB:4.A.1.2]
Gene Locus: AT3G28960
Gene Expression (Affy ATH1 probeset): 257543_at    
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 as format     
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 Protein modification
 Protein-protein interaction
        also include predicted relationship
 Compound-protein interaction
 TF-target gene regulation
 Small RNA-target regulation
        also include predicted relationship
 Carrier and transported molecule
 Catalytic chemical reaction
 Co-expressed gene pair
        with mutual information value >

  Ignore nodes having > relationships
 
Relationship type:  protein modification     catalytic chemical reaction     protein-protein interaction    
compound-protein interaction     TF-target gene regulation     small RNA-target regulation    
co-expressed gene pair     carrier and transported molecule     family/complex and member
Relationship evidence:  Solid line: validated          Dashed line: predicted
Relationship direction: Arrow: positive          T shape: negative          None arrow: unknown or n/a
Hormone association: Thicker line: hormone related relationship         : hormone related Node
Node type:  Transcription factor or transcriptional regulator       Compound       Kinase
 Small regulatory RNA (miRNA & ta-siRNA)       Other nodes
No. Path
2 AT3G28960  --  transport  --  Boric acid
3 AT3G28960  --  transport  --  Arsenite
4 AT3G28960  --  transport  --  Silicon
5 AT3G28960  --  transport  --  Selenite
6 AT3G28960  --  transport  --  Formamide
7 AT3G28960  --  transport  --  Glycerol
8 AT3G28960  --  transport  --  Sucrose
9 AT3G28960  --  transport  --  Urea
10 AT3G28960  --  transport  --  Boric acid  --  is transported by  --  ABCA5; ATATH4; ATH4
11 AT3G28960  --  transport  --  Boric acid  --  is transported by  --  ABCA4; ATATH3
12 AT3G28960  --  transport  --  Boric acid  --  is transported by  --  ABCA3; ATATH2; ATH2
13 AT3G28960  --  transport  --  Boric acid  --  is transported by  --  ABCA2; ATATH1; ATH1
14 AT3G28960  --  transport  --  Boric acid  --  is transported by  --  TIP5;1
15 AT3G28960  --  transport  --  Boric acid  --  is transported by  --  ATPS3; PS3
16 AT3G28960  --  transport  --  Boric acid  --  is transported by  --  PHT4;3
17 AT3G28960  --  transport  --  Boric acid  --  is transported by  --  ATUTR5; UTR5
18 AT3G28960  --  transport  --  Boric acid  --  is transported by  --  AT3G30390
19 AT3G28960  --  transport  --  Boric acid  --  is transported by  --  ABCB19/ATMDR1
20 AT3G28960  --  transport  --  Boric acid  --  is transported by  --  ABCB17; PGP17
21 AT3G28960  --  transport  --  Boric acid  --  is transported by  --  AT3G28080
22 AT3G28960  --  transport  --  Selenite  --  is transported by  --  PHT3;1
23 AT3G28960  --  transport  --  Selenite  --  is transported by  --  ZIFL1
24 AT3G28960  --  transport  --  Selenite  --  is transported by  --  ZIF1
25 AT3G28960  --  transport  --  Selenite  --  is transported by  --  AT5G13670
26 AT3G28960  --  transport  --  Selenite  --  is transported by  --  ABCG6
27 AT3G28960  --  transport  --  Selenite  --  is transported by  --  SULTR4;1
28 AT3G28960  --  transport  --  Selenite  --  is transported by  --  KEG
29 AT3G28960  --  transport  --  Selenite  --  is transported by  --  AAC2
30 AT3G28960  --  transport  --  Selenite  --  is transported by  --  AT4G01440
31 AT3G28960  --  transport  --  Selenite  --  is transported by  --  EDA13; EDA19; SWA1
32 AT3G28960  --  transport  --  Selenite  --  is transported by  --  AT2G46520
33 AT3G28960  --  transport  --  Selenite  --  is transported by  --  AT2G44920
34 AT3G28960  --  transport  --  Selenite  --  is transported by  --  TPR15
35 AT3G28960  --  transport  --  Selenite  --  is transported by  --  ER; QRP1
36 AT3G28960  --  transport  --  Selenite  --  is transported by  --  AT2G23780
37 AT3G28960  --  transport  --  Selenite  --  is transported by  --  AT2G21120
38 AT3G28960  --  transport  --  Formamide  --  has product (in catalytic reaction)  --  Formate
39 AT3G28960  --  transport  --  Formamide  --  is transported by  --  ABCB22
40 AT3G28960  --  transport  --  Formamide  --  is transported by  --  ABCB16; PGP16
41 AT3G28960  --  transport  --  Formamide  --  is transported by  --  ABCB15; MDR13
42 AT3G28960  --  transport  --  Formamide  --  is transported by  --  AT3G28130
43 AT3G28960  --  transport  --  Formamide  --  is transported by  --  AT3G28100
44 AT3G28960  --  transport  --  Glycerol  --  has product (in catalytic reaction)  --  sn-Glycerol 3-phosphate
45 AT3G28960  --  transport  --  Glycerol  --  is transported by  --  JK224; NPH1; PHOT1; RPT1
46 AT3G28960  --  transport  --  Glycerol  --  is transported by  --  AT3G45720
47 AT3G28960  --  transport  --  Glycerol  --  is transported by  --  AT3G45710
48 AT3G28960  --  transport  --  Glycerol  --  is transported by  --  AT3G45700
49 AT3G28960  --  transport  --  Glycerol  --  is transported by  --  AT3G45690
50 AT3G28960  --  transport  --  Glycerol  --  is transported by  --  AT3G45680
51 AT3G28960  --  transport  --  Glycerol  --  is transported by  --  AT3G45660
52 AT3G28960  --  transport  --  Glycerol  --  is transported by  --  NAXT1
53 AT3G28960  --  transport  --  Glycerol  --  is transported by  --  ATNRT2.6; NRT2.6
54 AT3G28960  --  transport  --  Glycerol  --  is transported by  --  ATCHX10; CHX10
55 AT3G28960  --  transport  --  Glycerol  --  is transported by  --  ATCHX11; CHX11
56 AT3G28960  --  transport  --  Glycerol  --  is transported by  --  ATCHX12; CHX12
57 AT3G28960  --  transport  --  Glycerol  --  is transported by  --  ATCHX4; CHX4
58 AT3G28960  --  transport  --  Glycerol  --  is transported by  --  ZIFL2
59 AT3G28960  --  transport  --  Glycerol  --  is transported by  --  AHA8; HA8
60 AT3G28960  --  transport  --  Glycerol  --  is transported by  --  AT3G30340
61 AT3G28960  --  transport  --  Glycerol  --  is transported by  --  ABCB18; PGP18
62 AT3G28960  --  transport  --  Glycerol  --  is transported by  --  SCM; SRF9; SUB
63 AT3G28960  --  transport  --  Sucrose  --  has product (in catalytic reaction)  --  Raffinose
64 AT3G28960  --  transport  --  Sucrose  --  has product (in catalytic reaction)  --  myo-Inositol
65 AT3G28960  --  transport  --  Sucrose  --  is product (in catalytic reaction) of  --  ATSUS2; SSA; SUS2
66 AT3G28960  --  transport  --  Sucrose  --  is product (in catalytic reaction) of  --  D-Fructose
67 AT3G28960  --  transport  --  Sucrose  --  is product (in catalytic reaction) of  --  NDP-glucose
68 AT3G28960  --  transport  --  Sucrose  --  is product (in catalytic reaction) of  --  ATSUS5; SUS5
69 AT3G28960  --  transport  --  Sucrose  --  is product (in catalytic reaction) of  --  ASUS1; atsus1; SUS1
70 AT3G28960  --  transport  --  Sucrose  --  is product (in catalytic reaction) of  --  ATSUS3; SUS3
71 AT3G28960  --  transport  --  Sucrose  --  is product (in catalytic reaction) of  --  ATSUS4; SUS4
72 AT3G28960  --  transport  --  Sucrose  --  is product (in catalytic reaction) of  --  ATSUS6; SUS6
73 AT3G28960  --  transport  --  Sucrose  --  is transported by  --  ATCNGC1; CNGC1
74 AT3G28960  --  transport  --  Sucrose  --  is transported by  --  AT5G53010
75 AT3G28960  --  transport  --  Sucrose  --  is transported by  --  ABCG8
76 AT3G28960  --  transport  --  Sucrose  --  is transported by  --  AT5G52450
77 AT3G28960  --  transport  --  Sucrose  --  is transported by  --  HCF106
78 AT3G28960  --  transport  --  Sucrose  --  is transported by  --  AT5G52050
79 AT3G28960  --  transport  --  Sucrose  --  is transported by  --  ATKEA5; KEA5
80 AT3G28960  --  transport  --  Sucrose  --  is transported by  --  AT5G51160
81 AT3G28960  --  transport  --  Sucrose  --  is transported by  --  AT5G51050
82 AT3G28960  --  transport  --  Sucrose  --  is transported by  --  AT5G50140
83 AT3G28960  --  transport  --  Sucrose  --  is transported by  --  AT5G49990
84 AT3G28960  --  transport  --  Sucrose  --  is transported by  --  AKR4C8
85 AT3G28960  --  transport  --  Sucrose  --  is transported by  --  LHB1B2; LHCB1.5
86 AT3G28960  --  transport  --  Sucrose  --  is transported by  --  HSP70T-2
87 AT3G28960  --  transport  --  Sucrose  --  is transported by  --  PR1
88 AT3G28960  --  transport  --  Sucrose  --  is transported by  --  AT2G07718
89 AT3G28960  --  transport  --  Sucrose  --  is transported by  --  RIE1
90 AT3G28960  --  transport  --  Urea  --  is product (in catalytic reaction) of  --  AT4G08900
91 AT3G28960  --  transport  --  Urea  --  is product (in catalytic reaction) of  --  L-Arginine
92 AT3G28960  --  transport  --  Urea  --  is product (in catalytic reaction) of  --  AT4G08870
93 AT3G28960  --  transport  --  Urea  --  is transported by  --  ATYSL3; YSL3
94 AT3G28960  --  transport  --  Urea  --  is transported by  --  GONST5
95 AT3G28960  --  transport  --  Urea  --  is transported by  --  AT1G21070
96 AT3G28960  --  transport  --  Urea  --  is transported by  --  ATSPL14; FBR6; SPL14; SPL1R2
97 AT3G28960  --  transport  --  Urea  --  is transported by  --  ABCI14; TGD1
   Funding by the National Science Foundation    Funding by the Oklahoma Center for the Advancement of Science & Technology    Additional funding by the Samuel Roberts Noble Foundation

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