Screen Resolution:     
Welcome to HRGRN
A Graph Search-Empowered Integrative Database of Arabidopsis Signaling Transduction, Metabolism and Gene Regulation Networks   
Location:  Home > Details for node Iron
Type: Compound GRN ID: nc50023 Name: Iron
Annotation: Iron
KEGG Acc.: C00023
CHEBI ID:
Formula: Fe
M.W.: 55.845
Graph Customization
   
Choose color for highlight:  
Display edge: validated and predicted
Display node/edge prompt:
Layout:
 as format     
Data Filter
 Protein modification
 Protein-protein interaction
        also include predicted relationship
 Compound-protein interaction
 TF-target gene regulation
 Small RNA-target regulation
        also include predicted relationship
 Carrier and transported molecule
 Catalytic chemical reaction
 Co-expressed gene pair
        with mutual information value >

  Ignore nodes having > relationships
 
Relationship type:  protein modification     catalytic chemical reaction     protein-protein interaction    
compound-protein interaction     TF-target gene regulation     small RNA-target regulation    
co-expressed gene pair     carrier and transported molecule     family/complex and member
Relationship evidence:  Solid line: validated          Dashed line: predicted
Relationship direction: Arrow: positive          T shape: negative          None arrow: unknown or n/a
Hormone association: Thicker line: hormone related relationship         : hormone related Node
Node type:  Transcription factor or transcriptional regulator       Compound       Kinase
 Small regulatory RNA (miRNA & ta-siRNA)       Other nodes
No. Path
2 Iron  --  is transported by  --  CP31B
3 Iron  --  is transported by  --  AT5G05820
4 Iron  --  is transported by  --  AT2G42960
5 Iron  --  is transported by  --  BP80-3;2; VSR3;2; VSR5
6 Iron  --  is transported by  --  AT2G22530
7 Iron  --  is transported by  --  UBA1A
8 Iron  --  is transported by  --  NDB4
9 Iron  --  is transported by  --  PR1
10 Iron  --  is transported by  --  AT2G14520
11 Iron  --  is transported by  --  AT2G14255
12 Iron  --  is transported by  --  ALDH6B2
13 Iron  --  is transported by  --  AT2G07718
14 Iron  --  is transported by  --  RIE1
15 Iron  --  is transported by  --  CP31B  --  has similar expression pattern (mutual information value=1.06558) with  --  AT1G62780
16 Iron  --  is transported by  --  CP31B  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.990575) with  --  AT1G14030
17 Iron  --  is transported by  --  CP31B  --  has similar expression pattern (mutual information value=1.02961) with  --  PTAC13
18 Iron  --  is transported by  --  CP31B  --  has similar expression pattern (mutual information value=1.13316) with  --  AT3G04550
19 Iron  --  is transported by  --  CP31B  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.850876) with  --  AT3G17930
20 Iron  --  is transported by  --  CP31B  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.955559) with  --  AT3G20930
21 Iron  --  is transported by  --  CP31B  --  has similar expression pattern (mutual information value=1.00267) with  --  AT4G24090
22 Iron  --  is transported by  --  CP31B  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.942293) with  --  AT4G37510
23 Iron  --  is transported by  --  CP31B  --  has similar expression pattern (mutual information value=1.11088) with  --  AT4G39040
24 Iron  --  is transported by  --  CP31B  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.930862) with  --  ATNOA1; ATNOS1; NOA1; NOS1; RIF1
25 Iron  --  is transported by  --  CP31B  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.816714) with  --  FTSZ2-2
26 Iron  --  is transported by  --  CP31B  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.98011) with  --  DEG8; DEGP8
27 Iron  --  is transported by  --  CP31B  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.804177) with  --  PTAC15
28 Iron  --  is transported by  --  CP31B  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.880117) with  --  AT5G63060
29 Iron  --  is transported by  --  CP31B  --  has similar expression pattern (mutual information value=1.02803) with  --  AT5G66470
30 Iron  --  is transported by  --  CP31B  --  transport  --  Zinc cation
31 Iron  --  is transported by  --  CP31B  --  transport  --  Manganese
32 Iron  --  is transported by  --  AT5G05820  --  interacts with  --  AT5G35460
33 Iron  --  is transported by  --  AT5G05820  --  interacts with  --  AT1G76185
34 Iron  --  is transported by  --  AT5G05820  --  interacts with  --  RUS3
35 Iron  --  is transported by  --  AT5G05820  --  interacts with  --  AT3G62560
36 Iron  --  is transported by  --  AT5G05820  --  interacts with  --  AtRABA1c; RABA1c
37 Iron  --  is transported by  --  AT5G05820  --  interacts with  --  AT5G42420
38 Iron  --  is transported by  --  AT5G05820  --  interacts with  --  CYP71B6
39 Iron  --  is transported by  --  AT5G05820  --  interacts with  --  AT1G11940
40 Iron  --  is transported by  --  AT5G05820  --  interacts with  --  ASAR1; ATSAR2; ATSARA1C; SAR2
41 Iron  --  is transported by  --  AT5G05820  --  interacts with  --  ARL
42 Iron  --  is transported by  --  AT5G05820  --  interacts with  --  ATUTR3; UTR3
43 Iron  --  is transported by  --  AT5G05820  --  interacts with  --  ATUTR2; UTR2
44 Iron  --  is transported by  --  AT5G05820  --  interacts with  --  ATFAO3; FAO3
45 Iron  --  is transported by  --  AT5G05820  --  transport  --  Sugar
46 Iron  --  is transported by  --  AT5G05820  --  transport  --  Amiloride
47 Iron  --  is transported by  --  AT5G05820  --  transport  --  Phospholipid
48 Iron  --  is transported by  --  AT5G05820  --  transport  --  Pyridoxamine
49 Iron  --  is transported by  --  AT5G05820  --  transport  --  Pyridoxine
50 Iron  --  is transported by  --  AT5G05820  --  transport  --  Pyridoxal
51 Iron  --  is transported by  --  AT5G05820  --  transport  --  Sulfur
52 Iron  --  is transported by  --  AT2G42960  --  transport  --  Nickel(2+)
53 Iron  --  is transported by  --  UBA1A  --  transport  --  Polypeptide
54 Iron  --  is transported by  --  NDB4  --  has product (in catalytic reaction)  --  Ubiquinol
55 Iron  --  is transported by  --  PR1  --  interacts with  --  MKK7
56 Iron  --  is transported by  --  PR1  --  interacts with  --  GRX480; roxy19
57 Iron  --  is transported by  --  PR1  --  interacts with  --  ATSIZ1
58 Iron  --  is transported by  --  PR1  --  interacts with  --  PAD4
59 Iron  --  is transported by  --  PR1  --  interacts with  --  SSI4
60 Iron  --  is transported by  --  PR1  --  interacts with  --  SNI1
61 Iron  --  is transported by  --  PR1  --  interacts with  --  DTH9
62 Iron  --  is transported by  --  PR1  --  transport  --  Fe3+
63 Iron  --  is transported by  --  PR1  --  transport  --  Aluminium
64 Iron  --  is transported by  --  PR1  --  transport  --  DL-Glycerol 1-phosphate
65 Iron  --  is transported by  --  PR1  --  transport  --  Ornithine
66 Iron  --  is transported by  --  PR1  --  transport  --  Mannitol
67 Iron  --  is transported by  --  PR1  --  transport  --  Thiamine
68 Iron  --  is transported by  --  PR1  --  transport  --  Lactose
69 Iron  --  is transported by  --  PR1  --  transport  --  Maltose
70 Iron  --  is transported by  --  PR1  --  transport  --  Sucrose
71 Iron  --  is transported by  --  PR1  --  is a member of  --  PR1 family109, coding gene
72 Iron  --  is transported by  --  PR1  --  is regulated by  --  ARR2 complex18
73 Iron  --  is transported by  --  PR1  --  is regulated by  --  OBF4
74 Iron  --  is transported by  --  PR1  --  is regulated by  --  TGA1
75 Iron  --  is transported by  --  PR1  --  is regulated by  --  BZIP45
76 Iron  --  is transported by  --  PR1  --  is regulated by  --  OBF5
77 Iron  --  is transported by  --  PR1  --  is regulated by  --  PTAC/ATUHY1/ATWHY1
78 Iron  --  is transported by  --  PR1  --  is regulated by  --  AHBP-1B
79 Iron  --  is transported by  --  PR1  --  is regulated by  --  TGA3
80 Iron  --  is transported by  --  PR1  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.893456) with  --  CRK6
81 Iron  --  is transported by  --  PR1  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.893456) with  --  CRK8
82 Iron  --  is transported by  --  PR1  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.831662) with  --  AT5G10760
83 Iron  --  is transported by  --  AT2G14255  --  interacts with  --  AT3G45840
84 Iron  --  is transported by  --  AT2G14255  --  transport  --  Heme
85 Iron  --  is transported by  --  ALDH6B2  --  has product (in catalytic reaction)  --  HCO3-
86 Iron  --  is transported by  --  ALDH6B2  --  has product (in catalytic reaction)  --  Propanoyl-CoA
87 Iron  --  is transported by  --  AT2G07718  --  transport  --  Lindane
88 Iron  --  is transported by  --  AT2G07718  --  transport  --  beta-Sitosterol
89 Iron  --  is transported by  --  AT2G07718  --  transport  --  Steroid
90 Iron  --  is transported by  --  AT2G07718  --  transport  --  Cholesterol
   Funding by the National Science Foundation    Funding by the Oklahoma Center for the Advancement of Science & Technology    Additional funding by the Samuel Roberts Noble Foundation

Copyright © The Zhao Lab

Disclaimer | Contact