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A Graph Search-Empowered Integrative Database of Arabidopsis Signaling Transduction, Metabolism and Gene Regulation Networks   
Location:  Home > Details for node AT4G05160
Type: Protein GRN ID: np30754 Name:
Annotation: AMP-dependent synthetase and ligase family protein [TCDB:3.A.3.23] [TCDB:3.A.3.3] [TCDB:3.A.3.30] [TCDB:3.A.3.4] [EC:6.2.1.12]
Gene Locus: AT4G05160
Gene Expression (Affy ATH1 probeset): 255263_at    
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 as format     
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 Protein modification
 Protein-protein interaction
        also include predicted relationship
 Compound-protein interaction
 TF-target gene regulation
 Small RNA-target regulation
        also include predicted relationship
 Carrier and transported molecule
 Catalytic chemical reaction
 Co-expressed gene pair
        with mutual information value >

  Ignore nodes having > relationships
 
Relationship type:  protein modification     catalytic chemical reaction     protein-protein interaction    
compound-protein interaction     TF-target gene regulation     small RNA-target regulation    
co-expressed gene pair     carrier and transported molecule     family/complex and member
Relationship evidence:  Solid line: validated          Dashed line: predicted
Relationship direction: Arrow: positive          T shape: negative          None arrow: unknown or n/a
Hormone association: Thicker line: hormone related relationship         : hormone related Node
Node type:  Transcription factor or transcriptional regulator       Compound       Kinase
 Small regulatory RNA (miRNA & ta-siRNA)       Other nodes
No. Path
2 AT4G05160  --  has product (in catalytic reaction)  --  p-Coumaroyl-CoA
3 AT4G05160  --  transport  --  Nickel(2+)
4 AT4G05160  --  has product (in catalytic reaction)  --  p-Coumaroyl-CoA  --  has product (in catalytic reaction)  --  4-Coumaroylshikimate
5 AT4G05160  --  has product (in catalytic reaction)  --  p-Coumaroyl-CoA  --  has product (in catalytic reaction)  --  Naringenin chalcone
6 AT4G05160  --  has product (in catalytic reaction)  --  p-Coumaroyl-CoA  --  has product (in catalytic reaction)  --  p-Coumaroylagmatine
7 AT4G05160  --  has product (in catalytic reaction)  --  p-Coumaroyl-CoA  --  is product (in catalytic reaction) of  --  para-Coumaric acid
8 AT4G05160  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  NAD4L
9 AT4G05160  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  NAD1; NAD1C
10 AT4G05160  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  NAD5; NAD5.1; NAD5A
11 AT4G05160  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  NAD7
12 AT4G05160  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  NAD6
13 AT4G05160  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  COB
14 AT4G05160  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  HCF164
15 AT4G05160  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  sks15
16 AT4G05160  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  AT4G32600
17 AT4G05160  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  AT4G31290
18 AT4G05160  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  AT4G31210
19 AT4G05160  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  AT4G24920
20 AT4G05160  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  AtPPT1; PPT1
21 AT4G05160  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  CRK23
22 AT4G05160  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  CRK21
23 AT4G05160  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  CRK20
24 AT4G05160  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  CRK19
25 AT4G05160  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  APT3
26 AT4G05160  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  AT4G22550
27 AT4G05160  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  ALMT12; ATALMT12
28 AT4G05160  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  AT4G17790
29 AT4G05160  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  UGLYAH
30 AT4G05160  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  AT4G16450
31 AT4G05160  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  AT4G14730
32 AT4G05160  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  AT4G09810
33 AT4G05160  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  AT4G09760
34 AT4G05160  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  AT4G09640
35 AT4G05160  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  AT4G09580
36 AT4G05160  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  CPK4
37 AT4G05160  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  AT4G05380
38 AT4G05160  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  AT4G05350
39 AT4G05160  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  CRK25
40 AT4G05160  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  AT4G05150
41 AT4G05160  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  AT4G02690
42 AT4G05160  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  AT4G01440
43 AT4G05160  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  UBA2A
44 AT4G05160  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  TOM20-1
45 AT4G05160  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  AT3G09340
46 AT4G05160  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  AT3G09330
47 AT4G05160  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  AT3G09030
48 AT4G05160  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  AT2G47560
49 AT4G05160  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  AT2G46210
50 AT4G05160  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  AT2G42960
51 AT4G05160  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  ATSZF2; CZF1; SZF2; ZFAR1
52 AT4G05160  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  WLIM2a
53 AT4G05160  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  BP80-3;2; VSR3;2; VSR5
54 AT4G05160  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  LHB1B2; LHCB1.5
55 AT4G05160  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  ATXID; XID
56 AT4G05160  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  HSP70T-2
57 AT4G05160  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  AT2G22530
58 AT4G05160  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  UBA1A
59 AT4G05160  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  NDB4
60 AT4G05160  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  AT2G14520
61 AT4G05160  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  ATGSTZ1; GST18; GSTZ1
62 AT4G05160  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  ATTIM23-2; TIM23-2
63 AT4G05160  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  AT1G64450
64 AT4G05160  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  LCR66; PDF2.4
65 AT4G05160  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  sks14
66 AT4G05160  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  TSA1
67 AT4G05160  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  AT1G30600
68 AT4G05160  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  HERK2
69 AT4G05160  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  AAE14
70 AT4G05160  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  AT1G29740
71 AT4G05160  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  ATCB5-A; B5 #6; CB5-A
72 AT4G05160  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  LRR XI-23; RLK7
73 AT4G05160  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  ATGPAT4; GPAT4
74 AT4G05160  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  ATFRO1; FRO1
   Funding by the National Science Foundation    Funding by the Oklahoma Center for the Advancement of Science & Technology    Additional funding by the Samuel Roberts Noble Foundation

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