Screen Resolution:     
Welcome to HRGRN
A Graph Search-Empowered Integrative Database of Arabidopsis Signaling Transduction, Metabolism and Gene Regulation Networks   
Location:  Home > Details for node WLIM2a
Type: Protein GRN ID: np19742 Name: WLIM2a
Annotation: GATA type zinc finger transcription factor family protein [TCDB:3.A.1.120] [TCDB:3.A.1.121]
Gene Locus: AT2G39900
Transcription factor /
transcriptional regulator:		 transcription factor interactor and regulator family LIM
Gene Expression (Affy ATH1 probeset): 267355_at    
Graph Customization
   
Choose color for highlight:  
Display edge: validated and predicted
Display node/edge prompt:
Layout:
 as format     
Data Filter
 Protein modification
 Protein-protein interaction
        also include predicted relationship
 Compound-protein interaction
 TF-target gene regulation
 Small RNA-target regulation
        also include predicted relationship
 Carrier and transported molecule
 Catalytic chemical reaction
 Co-expressed gene pair
        with mutual information value >

  Ignore nodes having > relationships
 
Relationship type:  protein modification     catalytic chemical reaction     protein-protein interaction    
compound-protein interaction     TF-target gene regulation     small RNA-target regulation    
co-expressed gene pair     carrier and transported molecule     family/complex and member
Relationship evidence:  Solid line: validated          Dashed line: predicted
Relationship direction: Arrow: positive          T shape: negative          None arrow: unknown or n/a
Hormone association: Thicker line: hormone related relationship         : hormone related Node
Node type:  Transcription factor or transcriptional regulator       Compound       Kinase
 Small regulatory RNA (miRNA & ta-siRNA)       Other nodes
No. Path
2 WLIM2a  --  interacts with  --  BOI; RING
3 WLIM2a  --  transport  --  Nickel(2+)
4 WLIM2a  --  transport  --  Oleandomycin
5 WLIM2a  --  transport  --  Tylosin
6 WLIM2a  --  transport  --  Cu2+
7 WLIM2a  --  transport  --  Zinc cation
8 WLIM2a  --  interacts with  --  BOI; RING  --  interacts with  --  AT3G25805
9 WLIM2a  --  interacts with  --  BOI; RING  --  interacts with  --  AT1G79390
10 WLIM2a  --  interacts with  --  BOI; RING  --  interacts with  --  AT1G61170
11 WLIM2a  --  interacts with  --  BOI; RING  --  interacts with  --  AT5G35460
12 WLIM2a  --  interacts with  --  BOI; RING  --  interacts with  --  UBP20
13 WLIM2a  --  interacts with  --  BOI; RING  --  interacts with  --  AT5G56890
14 WLIM2a  --  interacts with  --  BOI; RING  --  interacts with  --  AT3G60080
15 WLIM2a  --  interacts with  --  BOI; RING  --  interacts with  --  ATPUP18; PUP18
16 WLIM2a  --  interacts with  --  BOI; RING  --  interacts with  --  AT5G59500
17 WLIM2a  --  interacts with  --  BOI; RING  --  interacts with  --  AT1G04970
18 WLIM2a  --  interacts with  --  BOI; RING  --  interacts with  --  AT4G01410
19 WLIM2a  --  interacts with  --  BOI; RING  --  interacts with  --  ATEXO70E2; EXO70E2
20 WLIM2a  --  interacts with  --  BOI; RING  --  interacts with  --  ABCB25; ATATM3; ATM3; STA1
21 WLIM2a  --  interacts with  --  BOI; RING  --  interacts with  --  5PTASE13; AT5PTASE13
22 WLIM2a  --  interacts with  --  BOI; RING  --  interacts with  --  AFB1
23 WLIM2a  --  interacts with  --  BOI; RING  --  interacts with  --  WAT1
24 WLIM2a  --  interacts with  --  BOI; RING  --  interacts with  --  ATRABA1B; RAB11; RABA1b
25 WLIM2a  --  interacts with  --  BOI; RING  --  interacts with  --  AT4G20300
26 WLIM2a  --  interacts with  --  BOI; RING  --  interacts with  --  AT5G58730
27 WLIM2a  --  interacts with  --  BOI; RING  --  interacts with  --  ATH3; ATTRX3; ATTRXH3; TRX3; TRXH3
28 WLIM2a  --  interacts with  --  BOI; RING  --  interacts with  --  AtTCP11; TCP11
29 WLIM2a  --  interacts with  --  BOI; RING  --  interacts with  --  AT5G66720
30 WLIM2a  --  interacts with  --  BOI; RING  --  interacts with  --  ATWRKY7; WRKY7
31 WLIM2a  --  interacts with  --  BOI; RING  --  interacts with  --  AT5G38640
32 WLIM2a  --  interacts with  --  BOI; RING  --  interacts with  --  ATWRKY11; WRKY11
33 WLIM2a  --  interacts with  --  BOI; RING  --  interacts with  --  AT4G36110
34 WLIM2a  --  interacts with  --  BOI; RING  --  interacts with  --  AtMYB108; BOS1; MYB108
35 WLIM2a  --  interacts with  --  BOI; RING  --  interacts with  --  AtMYB51; BW51A; BW51B; HIG1; MYB51
36 WLIM2a  --  interacts with  --  BOI; RING  --  interacts with  --  AT3G54826
37 WLIM2a  --  interacts with  --  BOI; RING  --  interacts with  --  AT2G38300
38 WLIM2a  --  interacts with  --  BOI; RING  --  interacts with  --  EMB2819
39 WLIM2a  --  interacts with  --  BOI; RING  --  interacts with  --  PSAD-2
40 WLIM2a  --  interacts with  --  BOI; RING  --  interacts with  --  PSRP4
41 WLIM2a  --  interacts with  --  BOI; RING  --  interacts with  --  NF-YA4
42 WLIM2a  --  interacts with  --  BOI; RING  --  interacts with  --  ATWRKY17; WRKY17
43 WLIM2a  --  interacts with  --  BOI; RING  --  interacts with  --  AT4G05400
44 WLIM2a  --  interacts with  --  BOI; RING  --  interacts with  --  AT2G43370
45 WLIM2a  --  interacts with  --  BOI; RING  --  interacts with  --  PSAD-1
46 WLIM2a  --  interacts with  --  BOI; RING  --  interacts with  --  HSP60-3A
47 WLIM2a  --  interacts with  --  BOI; RING  --  is the target gene of  --  ath-miR5650
48 WLIM2a  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  NAD4L
49 WLIM2a  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  NAD1; NAD1C
50 WLIM2a  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  NAD5; NAD5.1; NAD5A
51 WLIM2a  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  NAD7
52 WLIM2a  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  NAD6
53 WLIM2a  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  COB
54 WLIM2a  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  HCF164
55 WLIM2a  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  sks15
56 WLIM2a  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  AT4G32600
57 WLIM2a  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  AT4G31290
58 WLIM2a  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  AT4G31210
59 WLIM2a  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  AT4G24920
60 WLIM2a  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  AtPPT1; PPT1
61 WLIM2a  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  CRK23
62 WLIM2a  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  CRK21
63 WLIM2a  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  CRK20
64 WLIM2a  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  CRK19
65 WLIM2a  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  APT3
66 WLIM2a  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  AT4G22550
67 WLIM2a  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  ALMT12; ATALMT12
68 WLIM2a  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  AT4G17790
69 WLIM2a  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  UGLYAH
70 WLIM2a  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  AT4G16450
71 WLIM2a  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  AT4G14730
72 WLIM2a  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  AT4G09810
73 WLIM2a  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  AT4G09760
74 WLIM2a  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  AT4G09640
75 WLIM2a  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  AT4G09580
76 WLIM2a  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  CPK4
77 WLIM2a  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  AT4G05380
78 WLIM2a  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  AT4G05350
79 WLIM2a  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  CRK25
80 WLIM2a  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  AT4G05160
81 WLIM2a  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  AT4G05150
82 WLIM2a  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  AT4G02690
83 WLIM2a  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  AT4G01440
84 WLIM2a  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  UBA2A
85 WLIM2a  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  TOM20-1
86 WLIM2a  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  AT3G09340
87 WLIM2a  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  AT3G09330
88 WLIM2a  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  AT3G09030
89 WLIM2a  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  AT2G47560
90 WLIM2a  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  AT2G46210
91 WLIM2a  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  AT2G42960
92 WLIM2a  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  ATSZF2; CZF1; SZF2; ZFAR1
93 WLIM2a  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  BP80-3;2; VSR3;2; VSR5
94 WLIM2a  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  LHB1B2; LHCB1.5
95 WLIM2a  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  ATXID; XID
96 WLIM2a  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  HSP70T-2
97 WLIM2a  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  AT2G22530
98 WLIM2a  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  UBA1A
99 WLIM2a  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  NDB4
100 WLIM2a  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  AT2G14520
101 WLIM2a  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  ATGSTZ1; GST18; GSTZ1
102 WLIM2a  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  ATTIM23-2; TIM23-2
103 WLIM2a  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  AT1G64450
104 WLIM2a  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  LCR66; PDF2.4
105 WLIM2a  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  sks14
106 WLIM2a  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  TSA1
107 WLIM2a  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  AT1G30600
108 WLIM2a  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  HERK2
109 WLIM2a  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  AAE14
110 WLIM2a  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  AT1G29740
111 WLIM2a  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  ATCB5-A; B5 #6; CB5-A
112 WLIM2a  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  LRR XI-23; RLK7
113 WLIM2a  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  ATGPAT4; GPAT4
114 WLIM2a  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  ATFRO1; FRO1
115 WLIM2a  --  transport  --  Cu2+  --  is a member of  --  ETH+ receptors subfamily2 complex23
116 WLIM2a  --  transport  --  Cu2+  --  is a member of  --  ETH receptors subfamily2 complex21
117 WLIM2a  --  transport  --  Cu2+  --  is a member of  --  ETH +receptors subfamily1 complex22
118 WLIM2a  --  transport  --  Cu2+  --  is a member of  --  ETH receptors subfamily1 complex20
119 WLIM2a  --  transport  --  Cu2+  --  is product (in catalytic reaction) of  --  ATRAN1; RAN-1; RAN1
120 WLIM2a  --  transport  --  Cu2+  --  is transported by  --  AT4G36960
121 WLIM2a  --  transport  --  Cu2+  --  is transported by  --  AT4G27585
122 WLIM2a  --  transport  --  Cu2+  --  is transported by  --  AtSWEET14; SWEET14
123 WLIM2a  --  transport  --  Cu2+  --  is transported by  --  AMY1; ATAMY1
124 WLIM2a  --  transport  --  Cu2+  --  is transported by  --  CRK18
125 WLIM2a  --  transport  --  Cu2+  --  is transported by  --  CRK17; DUF26-21; EMB1290; RKC1
126 WLIM2a  --  transport  --  Cu2+  --  is transported by  --  AT4G09950
127 WLIM2a  --  transport  --  Cu2+  --  is transported by  --  AT3G28070
128 WLIM2a  --  transport  --  Cu2+  --  is transported by  --  AT3G28050
129 WLIM2a  --  transport  --  Cu2+  --  is transported by  --  AT3G27870
130 WLIM2a  --  transport  --  Cu2+  --  is transported by  --  AT3G27240
131 WLIM2a  --  transport  --  Cu2+  --  is transported by  --  CKI1
132 WLIM2a  --  transport  --  Cu2+  --  is transported by  --  PR-1-LIKE
133 WLIM2a  --  transport  --  Cu2+  --  is transported by  --  AT1G57620
134 WLIM2a  --  transport  --  Cu2+  --  is transported by  --  ATPUB44; PUB44; SAUL1
135 WLIM2a  --  transport  --  Zinc cation  --  is product (in catalytic reaction) of  --  ATHMA2; HMA2
136 WLIM2a  --  transport  --  Zinc cation  --  is product (in catalytic reaction) of  --  ATHMA4; HMA4
137 WLIM2a  --  transport  --  Zinc cation  --  is transported by  --  CP31B
138 WLIM2a  --  transport  --  Zinc cation  --  is transported by  --  ATCLC-C; CLC-C
139 WLIM2a  --  transport  --  Zinc cation  --  is transported by  --  AT5G47470
140 WLIM2a  --  transport  --  Zinc cation  --  is transported by  --  ATTIP2;3; DELTA-TIP3; TIP2;3
141 WLIM2a  --  transport  --  Zinc cation  --  is transported by  --  BOU
142 WLIM2a  --  transport  --  Zinc cation  --  is transported by  --  ABCB7; PGP7
143 WLIM2a  --  transport  --  Zinc cation  --  is transported by  --  ATKCO2; ATTPK2; KCO2
144 WLIM2a  --  transport  --  Zinc cation  --  is transported by  --  ATKCO3; KCO3
145 WLIM2a  --  transport  --  Zinc cation  --  is transported by  --  KAT1
146 WLIM2a  --  transport  --  Zinc cation  --  is transported by  --  APE2; TPT
147 WLIM2a  --  transport  --  Zinc cation  --  is transported by  --  ALDH6B2
148 WLIM2a  --  transport  --  Zinc cation  --  is transported by  --  AT2G07750
149 WLIM2a  --  transport  --  Zinc cation  --  is transported by  --  ATERDJ2A
150 WLIM2a  --  transport  --  Zinc cation  --  is transported by  --  ATPEX2; PEX2; TED3
151 WLIM2a  --  transport  --  Zinc cation  --  is transported by  --  TMK1
152 WLIM2a  --  transport  --  Zinc cation  --  is transported by  --  AT1G66120
153 WLIM2a  --  transport  --  Zinc cation  --  is transported by  --  AT1G66100
154 WLIM2a  --  transport  --  Zinc cation  --  is transported by  --  AT1G61340
155 WLIM2a  --  transport  --  Zinc cation  --  is transported by  --  DAL2; ZCF61
156 WLIM2a  --  transport  --  Zinc cation  --  is transported by  --  AT1G57600
157 WLIM2a  --  transport  --  Zinc cation  --  is transported by  --  AT1G56120
158 WLIM2a  --  transport  --  Zinc cation  --  is transported by  --  AT1G56050
159 WLIM2a  --  transport  --  Zinc cation  --  is transported by  --  AT1G54110
160 WLIM2a  --  transport  --  Zinc cation  --  is transported by  --  ALDH7B4
161 WLIM2a  --  transport  --  Zinc cation  --  is transported by  --  AT1G42680
162 WLIM2a  --  transport  --  Zinc cation  --  is transported by  --  AT1G34300
163 WLIM2a  --  transport  --  Zinc cation  --  is transported by  --  AT1G34110
164 WLIM2a  --  transport  --  Zinc cation  --  is transported by  --  AB140; CAB1; CAB140; LHCB1.3
165 WLIM2a  --  transport  --  Zinc cation  --  is transported by  --  AB165; CAB2; LHCB1.1
166 WLIM2a  --  transport  --  Zinc cation  --  is transported by  --  AB180; CAB3; LHCB1.2
167 WLIM2a  --  transport  --  Zinc cation  --  is transported by  --  AT1G29770
168 WLIM2a  --  transport  --  Zinc cation  --  is transported by  --  AT1G11300
169 WLIM2a  --  transport  --  Zinc cation  --  is transported by  --  AT1G11180
170 WLIM2a  --  transport  --  Zinc cation  --  is transported by  --  AT1G03070
   Funding by the National Science Foundation    Funding by the Oklahoma Center for the Advancement of Science & Technology    Additional funding by the Samuel Roberts Noble Foundation

Copyright © The Zhao Lab

Disclaimer | Contact