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A Graph Search-Empowered Integrative Database of Arabidopsis Signaling Transduction, Metabolism and Gene Regulation Networks   
Location:  Home > Details for node AT2G47560
Type: Protein GRN ID: np19745 Name:
Annotation: RING/U-box superfamily protein [TCDB:3.A.1.120] [TCDB:3.A.1.121] [TCDB:3.A.1.15]
Gene Locus: AT2G47560
Transcription factor /
transcriptional regulator:		 transcription factor family C2H2
Gene Expression (Affy ATH1 probeset): 245171_at    
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 as format     
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 Protein modification
 Protein-protein interaction
        also include predicted relationship
 Compound-protein interaction
 TF-target gene regulation
 Small RNA-target regulation
        also include predicted relationship
 Carrier and transported molecule
 Catalytic chemical reaction
 Co-expressed gene pair
        with mutual information value >

  Ignore nodes having > relationships
 
Relationship type:  protein modification     catalytic chemical reaction     protein-protein interaction    
compound-protein interaction     TF-target gene regulation     small RNA-target regulation    
co-expressed gene pair     carrier and transported molecule     family/complex and member
Relationship evidence:  Solid line: validated          Dashed line: predicted
Relationship direction: Arrow: positive          T shape: negative          None arrow: unknown or n/a
Hormone association: Thicker line: hormone related relationship         : hormone related Node
Node type:  Transcription factor or transcriptional regulator       Compound       Kinase
 Small regulatory RNA (miRNA & ta-siRNA)       Other nodes
No. Path
2 AT2G47560  --  transport  --  Nickel(2+)
3 AT2G47560  --  transport  --  Oleandomycin
4 AT2G47560  --  transport  --  Tylosin
5 AT2G47560  --  transport  --  Cu2+
6 AT2G47560  --  transport  --  Zinc cation
7 AT2G47560  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  NAD4L
8 AT2G47560  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  NAD1; NAD1C
9 AT2G47560  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  NAD5; NAD5.1; NAD5A
10 AT2G47560  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  NAD7
11 AT2G47560  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  NAD6
12 AT2G47560  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  COB
13 AT2G47560  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  HCF164
14 AT2G47560  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  sks15
15 AT2G47560  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  AT4G32600
16 AT2G47560  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  AT4G31290
17 AT2G47560  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  AT4G31210
18 AT2G47560  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  AT4G24920
19 AT2G47560  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  AtPPT1; PPT1
20 AT2G47560  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  CRK23
21 AT2G47560  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  CRK21
22 AT2G47560  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  CRK20
23 AT2G47560  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  CRK19
24 AT2G47560  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  APT3
25 AT2G47560  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  AT4G22550
26 AT2G47560  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  ALMT12; ATALMT12
27 AT2G47560  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  AT4G17790
28 AT2G47560  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  UGLYAH
29 AT2G47560  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  AT4G16450
30 AT2G47560  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  AT4G14730
31 AT2G47560  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  AT4G09810
32 AT2G47560  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  AT4G09760
33 AT2G47560  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  AT4G09640
34 AT2G47560  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  AT4G09580
35 AT2G47560  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  CPK4
36 AT2G47560  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  AT4G05380
37 AT2G47560  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  AT4G05350
38 AT2G47560  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  CRK25
39 AT2G47560  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  AT4G05160
40 AT2G47560  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  AT4G05150
41 AT2G47560  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  AT4G02690
42 AT2G47560  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  AT4G01440
43 AT2G47560  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  UBA2A
44 AT2G47560  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  TOM20-1
45 AT2G47560  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  AT3G09340
46 AT2G47560  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  AT3G09330
47 AT2G47560  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  AT3G09030
48 AT2G47560  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  AT2G46210
49 AT2G47560  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  AT2G42960
50 AT2G47560  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  ATSZF2; CZF1; SZF2; ZFAR1
51 AT2G47560  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  WLIM2a
52 AT2G47560  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  BP80-3;2; VSR3;2; VSR5
53 AT2G47560  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  LHB1B2; LHCB1.5
54 AT2G47560  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  ATXID; XID
55 AT2G47560  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  HSP70T-2
56 AT2G47560  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  AT2G22530
57 AT2G47560  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  UBA1A
58 AT2G47560  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  NDB4
59 AT2G47560  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  AT2G14520
60 AT2G47560  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  ATGSTZ1; GST18; GSTZ1
61 AT2G47560  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  ATTIM23-2; TIM23-2
62 AT2G47560  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  AT1G64450
63 AT2G47560  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  LCR66; PDF2.4
64 AT2G47560  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  sks14
65 AT2G47560  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  TSA1
66 AT2G47560  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  AT1G30600
67 AT2G47560  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  HERK2
68 AT2G47560  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  AAE14
69 AT2G47560  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  AT1G29740
70 AT2G47560  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  ATCB5-A; B5 #6; CB5-A
71 AT2G47560  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  LRR XI-23; RLK7
72 AT2G47560  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  ATGPAT4; GPAT4
73 AT2G47560  --  transport  --  Nickel(2+)  --  is transported by  --  ATFRO1; FRO1
74 AT2G47560  --  transport  --  Cu2+  --  is a member of  --  ETH+ receptors subfamily2 complex23
75 AT2G47560  --  transport  --  Cu2+  --  is a member of  --  ETH receptors subfamily2 complex21
76 AT2G47560  --  transport  --  Cu2+  --  is a member of  --  ETH +receptors subfamily1 complex22
77 AT2G47560  --  transport  --  Cu2+  --  is a member of  --  ETH receptors subfamily1 complex20
78 AT2G47560  --  transport  --  Cu2+  --  is product (in catalytic reaction) of  --  ATRAN1; RAN-1; RAN1
79 AT2G47560  --  transport  --  Cu2+  --  is transported by  --  AT4G36960
80 AT2G47560  --  transport  --  Cu2+  --  is transported by  --  AT4G27585
81 AT2G47560  --  transport  --  Cu2+  --  is transported by  --  AtSWEET14; SWEET14
82 AT2G47560  --  transport  --  Cu2+  --  is transported by  --  AMY1; ATAMY1
83 AT2G47560  --  transport  --  Cu2+  --  is transported by  --  CRK18
84 AT2G47560  --  transport  --  Cu2+  --  is transported by  --  CRK17; DUF26-21; EMB1290; RKC1
85 AT2G47560  --  transport  --  Cu2+  --  is transported by  --  AT4G09950
86 AT2G47560  --  transport  --  Cu2+  --  is transported by  --  AT3G28070
87 AT2G47560  --  transport  --  Cu2+  --  is transported by  --  AT3G28050
88 AT2G47560  --  transport  --  Cu2+  --  is transported by  --  AT3G27870
89 AT2G47560  --  transport  --  Cu2+  --  is transported by  --  AT3G27240
90 AT2G47560  --  transport  --  Cu2+  --  is transported by  --  CKI1
91 AT2G47560  --  transport  --  Cu2+  --  is transported by  --  PR-1-LIKE
92 AT2G47560  --  transport  --  Cu2+  --  is transported by  --  AT1G57620
93 AT2G47560  --  transport  --  Cu2+  --  is transported by  --  ATPUB44; PUB44; SAUL1
94 AT2G47560  --  transport  --  Zinc cation  --  is product (in catalytic reaction) of  --  ATHMA2; HMA2
95 AT2G47560  --  transport  --  Zinc cation  --  is product (in catalytic reaction) of  --  ATHMA4; HMA4
96 AT2G47560  --  transport  --  Zinc cation  --  is transported by  --  CP31B
97 AT2G47560  --  transport  --  Zinc cation  --  is transported by  --  ATCLC-C; CLC-C
98 AT2G47560  --  transport  --  Zinc cation  --  is transported by  --  AT5G47470
99 AT2G47560  --  transport  --  Zinc cation  --  is transported by  --  ATTIP2;3; DELTA-TIP3; TIP2;3
100 AT2G47560  --  transport  --  Zinc cation  --  is transported by  --  BOU
101 AT2G47560  --  transport  --  Zinc cation  --  is transported by  --  ABCB7; PGP7
102 AT2G47560  --  transport  --  Zinc cation  --  is transported by  --  ATKCO2; ATTPK2; KCO2
103 AT2G47560  --  transport  --  Zinc cation  --  is transported by  --  ATKCO3; KCO3
104 AT2G47560  --  transport  --  Zinc cation  --  is transported by  --  KAT1
105 AT2G47560  --  transport  --  Zinc cation  --  is transported by  --  APE2; TPT
106 AT2G47560  --  transport  --  Zinc cation  --  is transported by  --  ALDH6B2
107 AT2G47560  --  transport  --  Zinc cation  --  is transported by  --  AT2G07750
108 AT2G47560  --  transport  --  Zinc cation  --  is transported by  --  ATERDJ2A
109 AT2G47560  --  transport  --  Zinc cation  --  is transported by  --  ATPEX2; PEX2; TED3
110 AT2G47560  --  transport  --  Zinc cation  --  is transported by  --  TMK1
111 AT2G47560  --  transport  --  Zinc cation  --  is transported by  --  AT1G66120
112 AT2G47560  --  transport  --  Zinc cation  --  is transported by  --  AT1G66100
113 AT2G47560  --  transport  --  Zinc cation  --  is transported by  --  AT1G61340
114 AT2G47560  --  transport  --  Zinc cation  --  is transported by  --  DAL2; ZCF61
115 AT2G47560  --  transport  --  Zinc cation  --  is transported by  --  AT1G57600
116 AT2G47560  --  transport  --  Zinc cation  --  is transported by  --  AT1G56120
117 AT2G47560  --  transport  --  Zinc cation  --  is transported by  --  AT1G56050
118 AT2G47560  --  transport  --  Zinc cation  --  is transported by  --  AT1G54110
119 AT2G47560  --  transport  --  Zinc cation  --  is transported by  --  ALDH7B4
120 AT2G47560  --  transport  --  Zinc cation  --  is transported by  --  AT1G42680
121 AT2G47560  --  transport  --  Zinc cation  --  is transported by  --  AT1G34300
122 AT2G47560  --  transport  --  Zinc cation  --  is transported by  --  AT1G34110
123 AT2G47560  --  transport  --  Zinc cation  --  is transported by  --  AB140; CAB1; CAB140; LHCB1.3
124 AT2G47560  --  transport  --  Zinc cation  --  is transported by  --  AB165; CAB2; LHCB1.1
125 AT2G47560  --  transport  --  Zinc cation  --  is transported by  --  AB180; CAB3; LHCB1.2
126 AT2G47560  --  transport  --  Zinc cation  --  is transported by  --  AT1G29770
127 AT2G47560  --  transport  --  Zinc cation  --  is transported by  --  AT1G11300
128 AT2G47560  --  transport  --  Zinc cation  --  is transported by  --  AT1G11180
129 AT2G47560  --  transport  --  Zinc cation  --  is transported by  --  PSAD-2
130 AT2G47560  --  transport  --  Zinc cation  --  is transported by  --  AT1G03070
   Funding by the National Science Foundation    Funding by the Oklahoma Center for the Advancement of Science & Technology    Additional funding by the Samuel Roberts Noble Foundation

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