Screen Resolution:     
Welcome to HRGRN
A Graph Search-Empowered Integrative Database of Arabidopsis Signaling Transduction, Metabolism and Gene Regulation Networks   
Location:  Home > Details for node AT1G80000
Type: Protein GRN ID: np12000 Name:
Annotation: CASC3/Barentsz eIF4AIII binding [TCDB:9.A.2.1] [TCDB:9.A.23.1]
Gene Locus: AT1G80000
Gene Expression (Affy ATH1 probeset): 262063_at    
Graph Customization
   
Choose color for highlight:  
Display edge: validated and predicted
Display node/edge prompt:
Layout:
 as format     
Data Filter
 Protein modification
 Protein-protein interaction
        also include predicted relationship
 Compound-protein interaction
 TF-target gene regulation
 Small RNA-target regulation
        also include predicted relationship
 Carrier and transported molecule
 Catalytic chemical reaction
 Co-expressed gene pair
        with mutual information value >

  Ignore nodes having > relationships
 
Relationship type:  protein modification     catalytic chemical reaction     protein-protein interaction    
compound-protein interaction     TF-target gene regulation     small RNA-target regulation    
co-expressed gene pair     carrier and transported molecule     family/complex and member
Relationship evidence:  Solid line: validated          Dashed line: predicted
Relationship direction: Arrow: positive          T shape: negative          None arrow: unknown or n/a
Hormone association: Thicker line: hormone related relationship         : hormone related Node
Node type:  Transcription factor or transcriptional regulator       Compound       Kinase
 Small regulatory RNA (miRNA & ta-siRNA)       Other nodes
No. Path
2 AT1G80000  --  interacts with  --  AtLHP1; LHP1; TFL2
3 AT1G80000  --  interacts with  --  DRIP2
4 AT1G80000  --  interacts with  --  AT3G19120
5 AT1G80000  --  interacts with  --  AT2G03500
6 AT1G80000  --  interacts with  --  AT5G59210
7 AT1G80000  --  interacts with  --  AT4G20300
8 AT1G80000  --  interacts with  --  AT2G45850
9 AT1G80000  --  interacts with  --  AT5G51910
10 AT1G80000  --  interacts with  --  AT4G28230
11 AT1G80000  --  interacts with  --  AT3G11590
12 AT1G80000  --  interacts with  --  ATPAB2; PAB2; PABP2
13 AT1G80000  --  interacts with  --  FRS11
14 AT1G80000  --  transport  --  Mercury(2+)
15 AT1G80000  --  transport  --  Nicotinate
16 AT1G80000  --  transport  --  Nicotinamide
17 AT1G80000  --  interacts with  --  AtLHP1; LHP1; TFL2  --  interacts with  --  AT5G65360
18 AT1G80000  --  interacts with  --  AtLHP1; LHP1; TFL2  --  interacts with  --  LIF2
19 AT1G80000  --  interacts with  --  AtLHP1; LHP1; TFL2  --  interacts with  --  ATRING1; RING1
20 AT1G80000  --  interacts with  --  AtLHP1; LHP1; TFL2  --  interacts with  --  AT4G35110
21 AT1G80000  --  interacts with  --  AtLHP1; LHP1; TFL2  --  interacts with  --  IMPA-2
22 AT1G80000  --  interacts with  --  AtLHP1; LHP1; TFL2  --  interacts with  --  ARR14
23 AT1G80000  --  interacts with  --  AtLHP1; LHP1; TFL2  --  interacts with  --  AT3G23060
24 AT1G80000  --  interacts with  --  AtLHP1; LHP1; TFL2  --  interacts with  --  AT3G48550
25 AT1G80000  --  interacts with  --  AtLHP1; LHP1; TFL2  --  interacts with  --  IMPA-4
26 AT1G80000  --  interacts with  --  AtLHP1; LHP1; TFL2  --  interacts with  --  CMT3
27 AT1G80000  --  interacts with  --  AtLHP1; LHP1; TFL2  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.900188) with  --  AT5G17440
28 AT1G80000  --  interacts with  --  DRIP2  --  interacts with  --  AT3G09980
29 AT1G80000  --  interacts with  --  DRIP2  --  interacts with  --  AT5G58720
30 AT1G80000  --  interacts with  --  DRIP2  --  interacts with  --  IAA11
31 AT1G80000  --  interacts with  --  DRIP2  --  interacts with  --  AT2G46550
32 AT1G80000  --  interacts with  --  DRIP2  --  interacts with  --  PKP-ALPHA; PKP1
33 AT1G80000  --  interacts with  --  DRIP2  --  interacts with  --  ATROPGEF1; ROPGEF1
34 AT1G80000  --  interacts with  --  DRIP2  --  interacts with  --  AT4G39050
35 AT1G80000  --  interacts with  --  DRIP2  --  interacts with  --  AT4G13540
36 AT1G80000  --  interacts with  --  DRIP2  --  interacts with  --  AtMYB70; MYB70
37 AT1G80000  --  interacts with  --  DRIP2  --  interacts with  --  DREB2; DREB2A
38 AT1G80000  --  interacts with  --  AT3G19120  --  interacts with  --  AT3G54390
39 AT1G80000  --  interacts with  --  AT3G19120  --  interacts with  --  AtMYB41; MYB41
40 AT1G80000  --  interacts with  --  AT3G19120  --  interacts with  --  BP; BP1; KNAT1
41 AT1G80000  --  interacts with  --  AT3G19120  --  interacts with  --  ASIL1
42 AT1G80000  --  interacts with  --  AT3G19120  --  interacts with  --  AT3G07090
43 AT1G80000  --  interacts with  --  AT3G19120  --  interacts with  --  ASIL2
44 AT1G80000  --  interacts with  --  AT3G19120  --  interacts with  --  AT1G30860
45 AT1G80000  --  interacts with  --  AT3G19120  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.809351) with  --  AT2G34040
46 AT1G80000  --  interacts with  --  AT2G03500  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD
47 AT1G80000  --  interacts with  --  AT2G03500  --  interacts with  --  AT5G22355
48 AT1G80000  --  interacts with  --  AT5G59210  --  interacts with  --  ALF4
49 AT1G80000  --  interacts with  --  AT5G59210  --  interacts with  --  AT4G14900
50 AT1G80000  --  interacts with  --  AT5G59210  --  interacts with  --  ELF4-L2
51 AT1G80000  --  interacts with  --  AT5G59210  --  interacts with  --  AT4G32190
52 AT1G80000  --  interacts with  --  AT5G59210  --  interacts with  --  JAI3
53 AT1G80000  --  interacts with  --  AT5G59210  --  interacts with  --  AT3G06530
54 AT1G80000  --  interacts with  --  AT5G59210  --  interacts with  --  TIFY8
55 AT1G80000  --  interacts with  --  AT5G59210  --  interacts with  --  BEE2
56 AT1G80000  --  interacts with  --  AT5G59210  --  interacts with  --  AT1G60080
57 AT1G80000  --  interacts with  --  AT4G20300  --  interacts with  --  AT5G19960
58 AT1G80000  --  interacts with  --  AT4G20300  --  interacts with  --  AT4G26450
59 AT1G80000  --  interacts with  --  AT4G20300  --  interacts with  --  AT5G57210
60 AT1G80000  --  interacts with  --  AT4G20300  --  interacts with  --  ATEXO70E2; EXO70E2
61 AT1G80000  --  interacts with  --  AT4G20300  --  interacts with  --  AT3G27960
62 AT1G80000  --  interacts with  --  AT4G20300  --  interacts with  --  BOI; RING
63 AT1G80000  --  interacts with  --  AT4G20300  --  interacts with  --  AT4G14840
64 AT1G80000  --  interacts with  --  AT4G20300  --  interacts with  --  AT3G50910
65 AT1G80000  --  interacts with  --  AT4G20300  --  interacts with  --  AT1G06510
66 AT1G80000  --  interacts with  --  AT4G20300  --  interacts with  --  AT4G01090
67 AT1G80000  --  interacts with  --  AT2G45850  --  interacts with  --  AT4G17950
68 AT1G80000  --  interacts with  --  AT2G45850  --  interacts with  --  AT3G61310
69 AT1G80000  --  interacts with  --  AT2G45850  --  interacts with  --  AT5G62260
70 AT1G80000  --  interacts with  --  AT2G45850  --  interacts with  --  AHL1; ATAHL1
71 AT1G80000  --  interacts with  --  AT2G45850  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.883062) with  --  AtcFBP; FBP; FINS1
72 AT1G80000  --  interacts with  --  AT2G45850  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.801199) with  --  PLA IVD; PLP8
73 AT1G80000  --  interacts with  --  AT5G51910  --  interacts with  --  ATWRKY28; WRKY28
74 AT1G80000  --  interacts with  --  AT5G51910  --  interacts with  --  SARD1
75 AT1G80000  --  interacts with  --  AT5G51910  --  interacts with  --  TCP5
76 AT1G80000  --  interacts with  --  AT5G51910  --  interacts with  --  TCP2; TCP2
77 AT1G80000  --  interacts with  --  AT5G51910  --  interacts with  --  TCP3
78 AT1G80000  --  interacts with  --  AT5G51910  --  interacts with  --  MEE35; TCP4
79 AT1G80000  --  interacts with  --  AT5G51910  --  interacts with  --  ATTCP24; TCP24
80 AT1G80000  --  interacts with  --  AT5G51910  --  interacts with  --  TCP8
81 AT1G80000  --  interacts with  --  AT5G51910  --  interacts with  --  AtTCP11; TCP11
82 AT1G80000  --  interacts with  --  AT5G51910  --  interacts with  --  AT1G35560
83 AT1G80000  --  interacts with  --  AT5G51910  --  interacts with  --  AT-TCP20; ATTCP20; PCF1; TCP20
84 AT1G80000  --  interacts with  --  AT5G51910  --  interacts with  --  ATCDK8; CDKE;1; HEN3
85 AT1G80000  --  interacts with  --  AT5G51910  --  interacts with  --  CDF1
86 AT1G80000  --  interacts with  --  AT5G51910  --  interacts with  --  ANK6; PIA2
87 AT1G80000  --  interacts with  --  AT5G51910  --  interacts with  --  CHR3; SYD
88 AT1G80000  --  interacts with  --  AT5G51910  --  interacts with  --  TCP10
89 AT1G80000  --  interacts with  --  AT5G51910  --  interacts with  --  TCP17
90 AT1G80000  --  interacts with  --  AT5G51910  --  interacts with  --  AtTCP15; TCP15
91 AT1G80000  --  interacts with  --  AT5G51910  --  interacts with  --  AT2G37000
92 AT1G80000  --  interacts with  --  AT5G51910  --  interacts with  --  NRPB9A; NRPD9A; NRPE9A
93 AT1G80000  --  interacts with  --  AT5G51910  --  interacts with  --  ZFP7
94 AT1G80000  --  interacts with  --  AT5G51910  --  interacts with  --  AT2G34050
95 AT1G80000  --  interacts with  --  AT5G51910  --  interacts with  --  ACX1
96 AT1G80000  --  interacts with  --  AT5G51910  --  interacts with  --  ATU2AF65A
97 AT1G80000  --  interacts with  --  AT5G51910  --  interacts with  --  KDSB
98 AT1G80000  --  interacts with  --  AT5G51910  --  interacts with  --  AKIN11; ATKIN11; KIN11; SNRK1.2
99 AT1G80000  --  interacts with  --  AT5G51910  --  interacts with  --  AT2G30050
100 AT1G80000  --  interacts with  --  AT5G51910  --  interacts with  --  FZF
101 AT1G80000  --  interacts with  --  AT5G51910  --  interacts with  --  PYE
102 AT1G80000  --  interacts with  --  AT5G51910  --  interacts with  --  ATRTL2; RTL2
103 AT1G80000  --  interacts with  --  AT5G51910  --  interacts with  --  AT2G25730
104 AT1G80000  --  interacts with  --  AT5G51910  --  interacts with  --  FRL1
105 AT1G80000  --  interacts with  --  AT5G51910  --  interacts with  --  PIA1
106 AT1G80000  --  interacts with  --  AT5G51910  --  interacts with  --  HAT2
107 AT1G80000  --  interacts with  --  AT5G51910  --  interacts with  --  APRR2; PRR2
108 AT1G80000  --  interacts with  --  AT5G51910  --  interacts with  --  AT4G11175
109 AT1G80000  --  interacts with  --  AT4G28230  --  interacts with  --  TOPP6
110 AT1G80000  --  interacts with  --  AT4G28230  --  interacts with  --  CYCA2;3
111 AT1G80000  --  interacts with  --  AT4G28230  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.805736) with  --  AT4G23800
112 AT1G80000  --  interacts with  --  AT4G28230  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.86988) with  --  AT5G62550
113 AT1G80000  --  interacts with  --  AT3G11590  --  interacts with  --  AT5G20030
114 AT1G80000  --  interacts with  --  AT3G11590  --  interacts with  --  AT3G56680
115 AT1G80000  --  interacts with  --  AT3G11590  --  interacts with  --  AT3G17740
116 AT1G80000  --  interacts with  --  AT3G11590  --  interacts with  --  ATMAP70-5; MAP70-5
117 AT1G80000  --  interacts with  --  AT3G11590  --  interacts with  --  LSU2
118 AT1G80000  --  interacts with  --  AT3G11590  --  interacts with  --  AT4G15730
119 AT1G80000  --  interacts with  --  AT3G11590  --  interacts with  --  HDG4
120 AT1G80000  --  interacts with  --  AT3G11590  --  interacts with  --  AME3
121 AT1G80000  --  interacts with  --  AT3G11590  --  interacts with  --  AT5G58950
122 AT1G80000  --  interacts with  --  AT3G11590  --  interacts with  --  ATSK41; SK41
123 AT1G80000  --  interacts with  --  AT3G11590  --  interacts with  --  AT1G48280
124 AT1G80000  --  interacts with  --  AT3G11590  --  interacts with  --  AT2G19650
125 AT1G80000  --  interacts with  --  AT3G11590  --  interacts with  --  AT1G31870
126 AT1G80000  --  interacts with  --  AT3G11590  --  interacts with  --  AT1G12650
127 AT1G80000  --  interacts with  --  AT3G11590  --  interacts with  --  AT3G06980
128 AT1G80000  --  interacts with  --  AT3G11590  --  interacts with  --  AT1G49850
129 AT1G80000  --  interacts with  --  AT3G11590  --  interacts with  --  AT1G01630
130 AT1G80000  --  interacts with  --  AT3G11590  --  interacts with  --  RCN1 ATB BETA BETA
131 AT1G80000  --  interacts with  --  AT3G11590  --  interacts with  --  AtPPR2; EMB2750; PPR2
132 AT1G80000  --  interacts with  --  AT3G11590  --  interacts with  --  AT2G32650
133 AT1G80000  --  interacts with  --  AT3G11590  --  interacts with  --  AT3G01690
134 AT1G80000  --  interacts with  --  AT3G11590  --  interacts with  --  AT2G43370
135 AT1G80000  --  interacts with  --  AT3G11590  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.870626) with  --  AT3G16060
136 AT1G80000  --  interacts with  --  ATPAB2; PAB2; PABP2  --  interacts with  --  AT3G19090
137 AT1G80000  --  interacts with  --  ATPAB2; PAB2; PABP2  --  interacts with  --  AT2G43970
138 AT1G80000  --  interacts with  --  ATPAB2; PAB2; PABP2  --  interacts with  --  ATRBP37; CID12; RBP37
139 AT1G80000  --  interacts with  --  ATPAB2; PAB2; PABP2  --  interacts with  --  CID8
140 AT1G80000  --  interacts with  --  ATPAB2; PAB2; PABP2  --  interacts with  --  CID7
141 AT1G80000  --  interacts with  --  ATPAB2; PAB2; PABP2  --  interacts with  --  CID1; ERD15; LSR1
142 AT1G80000  --  interacts with  --  ATPAB2; PAB2; PABP2  --  interacts with  --  AT4G14270
143 AT1G80000  --  interacts with  --  FRS11  --  interacts with  --  AT4G00980
144 AT1G80000  --  interacts with  --  FRS11  --  interacts with  --  ADH2; ATGSNOR1; GSNOR; HOT5; PAR2
145 AT1G80000  --  interacts with  --  FRS11  --  interacts with  --  HLH1; PAR1
146 AT1G80000  --  transport  --  Mercury(2+)  --  is transported by  --  HCF164
147 AT1G80000  --  transport  --  Mercury(2+)  --  is transported by  --  sks15
148 AT1G80000  --  transport  --  Mercury(2+)  --  is transported by  --  AT4G32600
149 AT1G80000  --  transport  --  Mercury(2+)  --  is transported by  --  AT4G24920
150 AT1G80000  --  transport  --  Mercury(2+)  --  is transported by  --  CRK23
151 AT1G80000  --  transport  --  Mercury(2+)  --  is transported by  --  AT4G17790
152 AT1G80000  --  transport  --  Mercury(2+)  --  is transported by  --  UGLYAH
153 AT1G80000  --  transport  --  Mercury(2+)  --  is transported by  --  AT4G14730
154 AT1G80000  --  transport  --  Mercury(2+)  --  is transported by  --  AT4G09760
155 AT1G80000  --  transport  --  Mercury(2+)  --  is transported by  --  AT4G09640
156 AT1G80000  --  transport  --  Mercury(2+)  --  is transported by  --  AT4G09580
157 AT1G80000  --  transport  --  Mercury(2+)  --  is transported by  --  CPK4
158 AT1G80000  --  transport  --  Mercury(2+)  --  is transported by  --  AT4G05380
159 AT1G80000  --  transport  --  Mercury(2+)  --  is transported by  --  AT4G05350
160 AT1G80000  --  transport  --  Mercury(2+)  --  is transported by  --  CRK25
161 AT1G80000  --  transport  --  Mercury(2+)  --  is transported by  --  AT4G02690
162 AT1G80000  --  transport  --  Mercury(2+)  --  is transported by  --  AT1G61340
163 AT1G80000  --  transport  --  Mercury(2+)  --  is transported by  --  AT1G57620
164 AT1G80000  --  transport  --  Mercury(2+)  --  is transported by  --  ATPUB44; PUB44; SAUL1
165 AT1G80000  --  transport  --  Nicotinate  --  has product (in catalytic reaction)  --  Nicotinate D-ribonucleotide
166 AT1G80000  --  transport  --  Nicotinate  --  is transported by  --  AAA1; ATKTN1; BOT1; ERH3; FRA2; FRC2; FTR; KTN1; LUE1
167 AT1G80000  --  transport  --  Nicotinate  --  is transported by  --  AT1G80230
168 AT1G80000  --  transport  --  Nicotinamide  --  is product (in catalytic reaction) of  --  AT5G23600
169 AT1G80000  --  transport  --  Nicotinamide  --  is product (in catalytic reaction) of  --  emb1067; TRPT
170 AT1G80000  --  transport  --  Nicotinamide  --  is product (in catalytic reaction) of  --  SRT1
171 AT1G80000  --  transport  --  Nicotinamide  --  is product (in catalytic reaction) of  --  AT5G22470
172 AT1G80000  --  transport  --  Nicotinamide  --  is product (in catalytic reaction) of  --  ADP-D-ribosyl-acceptor
173 AT1G80000  --  transport  --  Nicotinamide  --  is product (in catalytic reaction) of  --  APP; ATPARP1; PARP1; PP
174 AT1G80000  --  transport  --  Nicotinamide  --  is product (in catalytic reaction) of  --  ATPARP2; PARP2
   Funding by the National Science Foundation    Funding by the Oklahoma Center for the Advancement of Science & Technology    Additional funding by the Samuel Roberts Noble Foundation

Copyright © The Zhao Lab

Disclaimer | Contact