Screen Resolution:     
Welcome to HRGRN
A Graph Search-Empowered Integrative Database of Arabidopsis Signaling Transduction, Metabolism and Gene Regulation Networks   
Location:  Home > Details for node AT3G27240
Type: Protein GRN ID: np29417 Name:
Annotation: Cytochrome C1 family [TCDB:1.A.56.1]
Gene Locus: AT3G27240
Gene Expression (Affy ATH1 probeset): 257148_at    
Graph Customization
   
Choose color for highlight:  
Display edge: validated and predicted
Display node/edge prompt:
Layout:
 as format     
Data Filter
 Protein modification
 Protein-protein interaction
        also include predicted relationship
 Compound-protein interaction
 TF-target gene regulation
 Small RNA-target regulation
        also include predicted relationship
 Carrier and transported molecule
 Catalytic chemical reaction
 Co-expressed gene pair
        with mutual information value >

  Ignore nodes having > relationships
 
Relationship type:  protein modification     catalytic chemical reaction     protein-protein interaction    
compound-protein interaction     TF-target gene regulation     small RNA-target regulation    
co-expressed gene pair     carrier and transported molecule     family/complex and member
Relationship evidence:  Solid line: validated          Dashed line: predicted
Relationship direction: Arrow: positive          T shape: negative          None arrow: unknown or n/a
Hormone association: Thicker line: hormone related relationship         : hormone related Node
Node type:  Transcription factor or transcriptional regulator       Compound       Kinase
 Small regulatory RNA (miRNA & ta-siRNA)       Other nodes
No. Path
2 AT3G27240  --  transport  --  Silver
3 AT3G27240  --  transport  --  Cu2+
4 AT3G27240  --  transport  --  Silver  --  is transported by  --  HCF164
5 AT3G27240  --  transport  --  Silver  --  is transported by  --  sks15
6 AT3G27240  --  transport  --  Silver  --  is transported by  --  AT4G36960
7 AT3G27240  --  transport  --  Silver  --  is transported by  --  AT4G32600
8 AT3G27240  --  transport  --  Silver  --  is transported by  --  AT4G27585
9 AT3G27240  --  transport  --  Silver  --  is transported by  --  AtSWEET14; SWEET14
10 AT3G27240  --  transport  --  Silver  --  is transported by  --  AMY1; ATAMY1
11 AT3G27240  --  transport  --  Silver  --  is transported by  --  AT4G24920
12 AT3G27240  --  transport  --  Silver  --  is transported by  --  CRK23
13 AT3G27240  --  transport  --  Silver  --  is transported by  --  CRK18
14 AT3G27240  --  transport  --  Silver  --  is transported by  --  CRK17; DUF26-21; EMB1290; RKC1
15 AT3G27240  --  transport  --  Silver  --  is transported by  --  AT4G17790
16 AT3G27240  --  transport  --  Silver  --  is transported by  --  UGLYAH
17 AT3G27240  --  transport  --  Silver  --  is transported by  --  AT4G14730
18 AT3G27240  --  transport  --  Silver  --  is transported by  --  AT4G09950
19 AT3G27240  --  transport  --  Silver  --  is transported by  --  AT4G09760
20 AT3G27240  --  transport  --  Silver  --  is transported by  --  AT4G09640
21 AT3G27240  --  transport  --  Silver  --  is transported by  --  AT4G09580
22 AT3G27240  --  transport  --  Silver  --  is transported by  --  CPK4
23 AT3G27240  --  transport  --  Silver  --  is transported by  --  AT4G05380
24 AT3G27240  --  transport  --  Silver  --  is transported by  --  AT4G05350
25 AT3G27240  --  transport  --  Silver  --  is transported by  --  CRK25
26 AT3G27240  --  transport  --  Silver  --  is transported by  --  AT4G02690
27 AT3G27240  --  transport  --  Silver  --  is transported by  --  AT3G28070
28 AT3G27240  --  transport  --  Silver  --  is transported by  --  AT3G28050
29 AT3G27240  --  transport  --  Silver  --  is transported by  --  AT3G27870
30 AT3G27240  --  transport  --  Cu2+  --  is a member of  --  ETH+ receptors subfamily2 complex23
31 AT3G27240  --  transport  --  Cu2+  --  is a member of  --  ETH receptors subfamily2 complex21
32 AT3G27240  --  transport  --  Cu2+  --  is a member of  --  ETH +receptors subfamily1 complex22
33 AT3G27240  --  transport  --  Cu2+  --  is a member of  --  ETH receptors subfamily1 complex20
34 AT3G27240  --  transport  --  Cu2+  --  is product (in catalytic reaction) of  --  ATRAN1; RAN-1; RAN1
35 AT3G27240  --  transport  --  Cu2+  --  is transported by  --  NAD4L
36 AT3G27240  --  transport  --  Cu2+  --  is transported by  --  NAD1; NAD1C
37 AT3G27240  --  transport  --  Cu2+  --  is transported by  --  NAD5; NAD5.1; NAD5A
38 AT3G27240  --  transport  --  Cu2+  --  is transported by  --  NAD7
39 AT3G27240  --  transport  --  Cu2+  --  is transported by  --  NAD6
40 AT3G27240  --  transport  --  Cu2+  --  is transported by  --  COB
41 AT3G27240  --  transport  --  Cu2+  --  is transported by  --  AT2G47560
42 AT3G27240  --  transport  --  Cu2+  --  is transported by  --  CKI1
43 AT3G27240  --  transport  --  Cu2+  --  is transported by  --  AT2G46210
44 AT3G27240  --  transport  --  Cu2+  --  is transported by  --  ATSZF2; CZF1; SZF2; ZFAR1
45 AT3G27240  --  transport  --  Cu2+  --  is transported by  --  WLIM2a
46 AT3G27240  --  transport  --  Cu2+  --  is transported by  --  ATXID; XID
47 AT3G27240  --  transport  --  Cu2+  --  is transported by  --  PR-1-LIKE
48 AT3G27240  --  transport  --  Cu2+  --  is transported by  --  ATGSTZ1; GST18; GSTZ1
49 AT3G27240  --  transport  --  Cu2+  --  is transported by  --  ATTIM23-2; TIM23-2
50 AT3G27240  --  transport  --  Cu2+  --  is transported by  --  AT1G64450
51 AT3G27240  --  transport  --  Cu2+  --  is transported by  --  LCR66; PDF2.4
52 AT3G27240  --  transport  --  Cu2+  --  is transported by  --  AT1G57620
53 AT3G27240  --  transport  --  Cu2+  --  is transported by  --  sks14
54 AT3G27240  --  transport  --  Cu2+  --  is transported by  --  TSA1
55 AT3G27240  --  transport  --  Cu2+  --  is transported by  --  AT1G30600
56 AT3G27240  --  transport  --  Cu2+  --  is transported by  --  HERK2
57 AT3G27240  --  transport  --  Cu2+  --  is transported by  --  AAE14
58 AT3G27240  --  transport  --  Cu2+  --  is transported by  --  AT1G29740
59 AT3G27240  --  transport  --  Cu2+  --  is transported by  --  ATCB5-A; B5 #6; CB5-A
60 AT3G27240  --  transport  --  Cu2+  --  is transported by  --  ATPUB44; PUB44; SAUL1
61 AT3G27240  --  transport  --  Cu2+  --  is transported by  --  LRR XI-23; RLK7
62 AT3G27240  --  transport  --  Cu2+  --  is transported by  --  ATGPAT4; GPAT4
63 AT3G27240  --  transport  --  Cu2+  --  is transported by  --  ATFRO1; FRO1
   Funding by the National Science Foundation    Funding by the Oklahoma Center for the Advancement of Science & Technology    Additional funding by the Samuel Roberts Noble Foundation


Copyright © The Zhao Lab