Screen Resolution:     
Welcome to HRGRN
A Graph Search-Empowered Integrative Database of Arabidopsis Signaling Transduction, Metabolism and Gene Regulation Networks   
Location:  Home > Details for node AT4G40042
Type: Protein GRN ID: np31677 Name:
Annotation: Microsomal signal peptidase 12 kDa subunit (SPC12)
Gene Locus: AT4G40042
Gene Expression (Affy ATH1 probeset):
Graph Customization
   
Choose color for highlight:  
Display edge: validated and predicted
Display node/edge prompt:
Layout:
 as format     
Data Filter
 Protein modification
 Protein-protein interaction
        also include predicted relationship
 Compound-protein interaction
 TF-target gene regulation
 Small RNA-target regulation
        also include predicted relationship
 Carrier and transported molecule
 Catalytic chemical reaction
 Co-expressed gene pair
        with mutual information value >

  Ignore nodes having > relationships
 
Relationship type:  protein modification     catalytic chemical reaction     protein-protein interaction    
compound-protein interaction     TF-target gene regulation     small RNA-target regulation    
co-expressed gene pair     carrier and transported molecule     family/complex and member
Relationship evidence:  Solid line: validated          Dashed line: predicted
Relationship direction: Arrow: positive          T shape: negative          None arrow: unknown or n/a
Hormone association: Thicker line: hormone related relationship         : hormone related Node
Node type:  Transcription factor or transcriptional regulator       Compound       Kinase
 Small regulatory RNA (miRNA & ta-siRNA)       Other nodes
No. Path
2 AT4G40042  --  interacts with  --  AT4G26450
3 AT4G40042  --  interacts with  --  AT3G29270
4 AT4G40042  --  interacts with  --  AT4G26450  --  interacts with  --  AT5G18850
5 AT4G40042  --  interacts with  --  AT4G26450  --  interacts with  --  APE2; TPT
6 AT4G40042  --  interacts with  --  AT4G26450  --  interacts with  --  AT5G01430
7 AT4G40042  --  interacts with  --  AT4G26450  --  interacts with  --  ATB5-A; ATCB5-E; B5 #2; CB5-E
8 AT4G40042  --  interacts with  --  AT4G26450  --  interacts with  --  FIS1B
9 AT4G40042  --  interacts with  --  AT4G26450  --  interacts with  --  AT5G24130
10 AT4G40042  --  interacts with  --  AT4G26450  --  interacts with  --  AT5G60460
11 AT4G40042  --  interacts with  --  AT4G26450  --  interacts with  --  AT5G18150
12 AT4G40042  --  interacts with  --  AT4G26450  --  interacts with  --  ATVTI11; ATVTI1A; SGR4; VTI11; VTI1A; ZIG; ZIG1
13 AT4G40042  --  interacts with  --  AT4G26450  --  interacts with  --  IRX15-L
14 AT4G40042  --  interacts with  --  AT4G26450  --  interacts with  --  AT4G35080
15 AT4G40042  --  interacts with  --  AT4G26450  --  interacts with  --  ATUTR3; UTR3
16 AT4G40042  --  interacts with  --  AT4G26450  --  interacts with  --  ATVAMP722; SAR1; VAMP722
17 AT4G40042  --  interacts with  --  AT4G26450  --  interacts with  --  AT1G55535
18 AT4G40042  --  interacts with  --  AT4G26450  --  interacts with  --  AT4G03410
19 AT4G40042  --  interacts with  --  AT4G26450  --  interacts with  --  AT1G16950
20 AT4G40042  --  interacts with  --  AT4G26450  --  interacts with  --  AT1G16790
21 AT4G40042  --  interacts with  --  AT4G26450  --  interacts with  --  ERG28
22 AT4G40042  --  interacts with  --  AT4G26450  --  interacts with  --  AT1G60010
23 AT4G40042  --  interacts with  --  AT4G26450  --  interacts with  --  ARL
24 AT4G40042  --  interacts with  --  AT4G26450  --  interacts with  --  ATSYP61; OSM1; SYP61
25 AT4G40042  --  interacts with  --  AT4G26450  --  interacts with  --  AT1G44800
26 AT4G40042  --  interacts with  --  AT4G26450  --  interacts with  --  AT2G32580
27 AT4G40042  --  interacts with  --  AT4G26450  --  interacts with  --  AT1G17080
28 AT4G40042  --  interacts with  --  AT4G26450  --  interacts with  --  WAT1
29 AT4G40042  --  interacts with  --  AT4G26450  --  interacts with  --  AGP12; ATAGP12
30 AT4G40042  --  interacts with  --  AT4G26450  --  interacts with  --  AT3G51510
31 AT4G40042  --  interacts with  --  AT4G26450  --  interacts with  --  AT1G76670
32 AT4G40042  --  interacts with  --  AT4G26450  --  interacts with  --  TOM20-3
33 AT4G40042  --  interacts with  --  AT4G26450  --  interacts with  --  ATTSPO; TSPO
34 AT4G40042  --  interacts with  --  AT4G26450  --  interacts with  --  7RED; DWF5; LE; PA; ST7R
35 AT4G40042  --  interacts with  --  AT4G26450  --  interacts with  --  ATSPP; SPP
36 AT4G40042  --  interacts with  --  AT4G26450  --  interacts with  --  AT4G20300
37 AT4G40042  --  interacts with  --  AT4G26450  --  interacts with  --  AT2G17760
38 AT4G40042  --  interacts with  --  AT4G26450  --  interacts with  --  ATRBL6; RBL6
39 AT4G40042  --  interacts with  --  AT4G26450  --  interacts with  --  ATPUP4; PUP4
40 AT4G40042  --  interacts with  --  AT4G26450  --  interacts with  --  AT2G24290
41 AT4G40042  --  interacts with  --  AT4G26450  --  interacts with  --  PLA IIIB; PLP9
42 AT4G40042  --  interacts with  --  AT4G26450  --  interacts with  --  AT4G24310
43 AT4G40042  --  interacts with  --  AT4G26450  --  interacts with  --  AT2G17972
44 AT4G40042  --  interacts with  --  AT4G26450  --  interacts with  --  AT3G57280
45 AT4G40042  --  interacts with  --  AT4G26450  --  interacts with  --  PIP2;8; PIP3B
46 AT4G40042  --  interacts with  --  AT4G26450  --  interacts with  --  AT3G25190
47 AT4G40042  --  interacts with  --  AT4G26450  --  interacts with  --  AT3G43520
48 AT4G40042  --  interacts with  --  AT4G26450  --  interacts with  --  ROD1
49 AT4G40042  --  interacts with  --  AT4G26450  --  interacts with  --  ATBET11; ATBS14A; BET11; BS14A
50 AT4G40042  --  interacts with  --  AT4G26450  --  interacts with  --  CASP1
51 AT4G40042  --  interacts with  --  AT4G26450  --  interacts with  --  AT3G29034
52 AT4G40042  --  interacts with  --  AT4G26450  --  interacts with  --  AT3G02690
53 AT4G40042  --  interacts with  --  AT4G26450  --  interacts with  --  ATLPP2; ATPAP2; LPP2
54 AT4G40042  --  interacts with  --  AT4G26450  --  interacts with  --  AT3G22070
55 AT4G40042  --  interacts with  --  AT4G26450  --  interacts with  --  AT3G22570
56 AT4G40042  --  interacts with  --  AT4G26450  --  interacts with  --  AT1G77350
57 AT4G40042  --  interacts with  --  AT4G26450  --  interacts with  --  ATSYP51; SYP51
58 AT4G40042  --  interacts with  --  AT4G26450  --  interacts with  --  AT1G33800
59 AT4G40042  --  interacts with  --  AT4G26450  --  interacts with  --  AVA-P4
60 AT4G40042  --  interacts with  --  AT4G26450  --  interacts with  --  DELTA-TIP2; TIP2;2
61 AT4G40042  --  interacts with  --  AT4G26450  --  interacts with  --  AT1G05785
62 AT4G40042  --  interacts with  --  AT4G26450  --  interacts with  --  AT1G28250
63 AT4G40042  --  interacts with  --  AT3G29270  --  interacts with  --  ATYLMG2; YLMG2
64 AT4G40042  --  interacts with  --  AT3G29270  --  interacts with  --  AT5G03345
65 AT4G40042  --  interacts with  --  AT3G29270  --  interacts with  --  AT1G16170
66 AT4G40042  --  interacts with  --  AT3G29270  --  interacts with  --  TBL32
67 AT4G40042  --  interacts with  --  AT3G29270  --  interacts with  --  AT3G62560
68 AT4G40042  --  interacts with  --  AT3G29270  --  interacts with  --  AT1G14020
69 AT4G40042  --  interacts with  --  AT3G29270  --  interacts with  --  AT4G26770
70 AT4G40042  --  interacts with  --  AT3G29270  --  interacts with  --  ATFACE-2; ATFACE2; FACE2; RCE1
71 AT4G40042  --  interacts with  --  AT3G29270  --  interacts with  --  ATMHX; ATMHX1; MHX; MHX1
72 AT4G40042  --  interacts with  --  AT3G29270  --  interacts with  --  AtHSD7; HSD7
73 AT4G40042  --  interacts with  --  AT3G29270  --  interacts with  --  AtHSD4; HSD4
74 AT4G40042  --  interacts with  --  AT3G29270  --  interacts with  --  AT3G50920
75 AT4G40042  --  interacts with  --  AT3G29270  --  interacts with  --  ATCSLC05; ATCSLC5; CSLC05; CSLC5
76 AT4G40042  --  interacts with  --  AT3G29270  --  interacts with  --  AAP4
77 AT4G40042  --  interacts with  --  AT3G29270  --  interacts with  --  ATRBL15; RBL15
78 AT4G40042  --  interacts with  --  AT3G29270  --  interacts with  --  AT5G61340
79 AT4G40042  --  interacts with  --  AT3G29270  --  interacts with  --  RUS6
80 AT4G40042  --  interacts with  --  AT3G29270  --  interacts with  --  PRA1.A1
81 AT4G40042  --  interacts with  --  AT3G29270  --  interacts with  --  OLE2; OLEO2
82 AT4G40042  --  interacts with  --  AT3G29270  --  interacts with  --  BTI3; RTNLB4
83 AT4G40042  --  interacts with  --  AT3G29270  --  interacts with  --  MEE55
84 AT4G40042  --  interacts with  --  AT3G29270  --  interacts with  --  OLE1; OLEO1
85 AT4G40042  --  interacts with  --  AT3G29270  --  interacts with  --  AT5G58782
86 AT4G40042  --  interacts with  --  AT3G29270  --  interacts with  --  ATGP4
87 AT4G40042  --  interacts with  --  AT3G29270  --  interacts with  --  AT3G54120
88 AT4G40042  --  interacts with  --  AT3G29270  --  interacts with  --  AT3G59500
89 AT4G40042  --  interacts with  --  AT3G29270  --  interacts with  --  AT5G56020
90 AT4G40042  --  interacts with  --  AT3G29270  --  interacts with  --  ABC4
91 AT4G40042  --  interacts with  --  AT3G29270  --  interacts with  --  AT3G01570
92 AT4G40042  --  interacts with  --  AT3G29270  --  interacts with  --  AT1G67860
93 AT4G40042  --  interacts with  --  AT3G29270  --  interacts with  --  AT1G35430
94 AT4G40042  --  interacts with  --  AT3G29270  --  interacts with  --  AT1G67360
95 AT4G40042  --  interacts with  --  AT3G29270  --  interacts with  --  AT1G10040
96 AT4G40042  --  interacts with  --  AT3G29270  --  interacts with  --  AT2G25890
97 AT4G40042  --  interacts with  --  AT3G29270  --  interacts with  --  AT1G47740
98 AT4G40042  --  interacts with  --  AT3G29270  --  interacts with  --  AT3G18570
99 AT4G40042  --  interacts with  --  AT3G29270  --  interacts with  --  PRA1.F2; PRA7
100 AT4G40042  --  interacts with  --  AT3G29270  --  interacts with  --  MMZ2; UEV1B
101 AT4G40042  --  interacts with  --  AT3G29270  --  interacts with  --  AtCLO3; CLO-3; CLO3; RD20
102 AT4G40042  --  interacts with  --  AT3G29270  --  interacts with  --  AT1G01230
103 AT4G40042  --  interacts with  --  AT3G29270  --  interacts with  --  HIPP20
104 AT4G40042  --  interacts with  --  AT3G29270  --  interacts with  --  PRA1.B2
105 AT4G40042  --  interacts with  --  AT3G29270  --  interacts with  --  AT3G19460
106 AT4G40042  --  interacts with  --  AT3G29270  --  interacts with  --  AT3G09690
107 AT4G40042  --  interacts with  --  AT3G29270  --  interacts with  --  PRA1.F4
   Funding by the National Science Foundation    Funding by the Oklahoma Center for the Advancement of Science & Technology    Additional funding by the Samuel Roberts Noble Foundation


Copyright © The Zhao Lab