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Welcome to HRGRN
A Graph Search-Empowered Integrative Database of Arabidopsis Signaling Transduction, Metabolism and Gene Regulation Networks   
Location:  Home > Details for node ATGP4
Type: Protein GRN ID: np30926 Name: ATGP4
Annotation: ATGP4 | Ubiquitin family protein
Gene Locus: AT4G24990
Gene Expression (Affy ATH1 probeset): 254106_at    
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 Protein modification
 Protein-protein interaction
        also include predicted relationship
 Compound-protein interaction
 TF-target gene regulation
 Small RNA-target regulation
        also include predicted relationship
 Carrier and transported molecule
 Catalytic chemical reaction
 Co-expressed gene pair
        with mutual information value >

  Ignore nodes having > relationships
 
Relationship type:  protein modification     catalytic chemical reaction     protein-protein interaction    
compound-protein interaction     TF-target gene regulation     small RNA-target regulation    
co-expressed gene pair     carrier and transported molecule     family/complex and member
Relationship evidence:  Solid line: validated          Dashed line: predicted
Relationship direction: Arrow: positive          T shape: negative          None arrow: unknown or n/a
Hormone association: Thicker line: hormone related relationship         : hormone related Node
Node type:  Transcription factor or transcriptional regulator       Compound       Kinase
 Small regulatory RNA (miRNA & ta-siRNA)       Other nodes
No. Path
2 ATGP4  --  interacts with  --  ATUBC11; UBC11
3 ATGP4  --  interacts with  --  UBC30
4 ATGP4  --  interacts with  --  UBC28
5 ATGP4  --  interacts with  --  UBC10
6 ATGP4  --  interacts with  --  UBC9
7 ATGP4  --  interacts with  --  AT3G29270
8 ATGP4  --  interacts with  --  ATUBC11; UBC11  --  interacts with  --  AT5G42940
9 ATGP4  --  interacts with  --  ATUBC11; UBC11  --  interacts with  --  AT3G49810
10 ATGP4  --  interacts with  --  ATUBC11; UBC11  --  interacts with  --  RFI2
11 ATGP4  --  interacts with  --  ATUBC11; UBC11  --  interacts with  --  MUB4
12 ATGP4  --  interacts with  --  ATUBC11; UBC11  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.83571) with  --  ATECH2; ECH2
13 ATGP4  --  interacts with  --  ATUBC11; UBC11  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.852668) with  --  ERCC1; UVR7
14 ATGP4  --  interacts with  --  ATUBC11; UBC11  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.804203) with  --  AT3G20800
15 ATGP4  --  interacts with  --  ATUBC11; UBC11  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.813849) with  --  AAC3; ATAAC3
16 ATGP4  --  interacts with  --  ATUBC11; UBC11  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.872595) with  --  AT5G51510
17 ATGP4  --  interacts with  --  UBC28  --  interacts with  --  AT4G10080
18 ATGP4  --  interacts with  --  UBC28  --  interacts with  --  MUB6
19 ATGP4  --  interacts with  --  UBC28  --  interacts with  --  MUB5
20 ATGP4  --  interacts with  --  UBC28  --  interacts with  --  MUB2
21 ATGP4  --  interacts with  --  UBC28  --  transport  --  Biopterin
22 ATGP4  --  interacts with  --  UBC28  --  transport  --  Methotrexate
23 ATGP4  --  interacts with  --  UBC28  --  transport  --  Folate
24 ATGP4  --  interacts with  --  UBC28  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.944578) with  --  ATDI19; DI19
25 ATGP4  --  interacts with  --  UBC10  --  interacts with  --  AT1G49230
26 ATGP4  --  interacts with  --  UBC10  --  interacts with  --  MUB1
27 ATGP4  --  interacts with  --  UBC10  --  interacts with  --  ATCHIP; CHIP
28 ATGP4  --  interacts with  --  UBC9  --  interacts with  --  AT3G19950
29 ATGP4  --  interacts with  --  UBC9  --  interacts with  --  AT2G37150
30 ATGP4  --  interacts with  --  AT3G29270  --  interacts with  --  ATYLMG2; YLMG2
31 ATGP4  --  interacts with  --  AT3G29270  --  interacts with  --  AT5G03345
32 ATGP4  --  interacts with  --  AT3G29270  --  interacts with  --  AT1G16170
33 ATGP4  --  interacts with  --  AT3G29270  --  interacts with  --  TBL32
34 ATGP4  --  interacts with  --  AT3G29270  --  interacts with  --  AT3G62560
35 ATGP4  --  interacts with  --  AT3G29270  --  interacts with  --  AT1G14020
36 ATGP4  --  interacts with  --  AT3G29270  --  interacts with  --  AT4G26770
37 ATGP4  --  interacts with  --  AT3G29270  --  interacts with  --  ATFACE-2; ATFACE2; FACE2; RCE1
38 ATGP4  --  interacts with  --  AT3G29270  --  interacts with  --  ATMHX; ATMHX1; MHX; MHX1
39 ATGP4  --  interacts with  --  AT3G29270  --  interacts with  --  AtHSD7; HSD7
40 ATGP4  --  interacts with  --  AT3G29270  --  interacts with  --  AtHSD4; HSD4
41 ATGP4  --  interacts with  --  AT3G29270  --  interacts with  --  AT3G50920
42 ATGP4  --  interacts with  --  AT3G29270  --  interacts with  --  ATCSLC05; ATCSLC5; CSLC05; CSLC5
43 ATGP4  --  interacts with  --  AT3G29270  --  interacts with  --  AAP4
44 ATGP4  --  interacts with  --  AT3G29270  --  interacts with  --  ATRBL15; RBL15
45 ATGP4  --  interacts with  --  AT3G29270  --  interacts with  --  AT5G61340
46 ATGP4  --  interacts with  --  AT3G29270  --  interacts with  --  RUS6
47 ATGP4  --  interacts with  --  AT3G29270  --  interacts with  --  AT3G51510
48 ATGP4  --  interacts with  --  AT3G29270  --  interacts with  --  PRA1.A1
49 ATGP4  --  interacts with  --  AT3G29270  --  interacts with  --  OLE2; OLEO2
50 ATGP4  --  interacts with  --  AT3G29270  --  interacts with  --  BTI3; RTNLB4
51 ATGP4  --  interacts with  --  AT3G29270  --  interacts with  --  MEE55
52 ATGP4  --  interacts with  --  AT3G29270  --  interacts with  --  OLE1; OLEO1
53 ATGP4  --  interacts with  --  AT3G29270  --  interacts with  --  AT4G40042
54 ATGP4  --  interacts with  --  AT3G29270  --  interacts with  --  AT5G24130
55 ATGP4  --  interacts with  --  AT3G29270  --  interacts with  --  AT5G58782
56 ATGP4  --  interacts with  --  AT3G29270  --  interacts with  --  AT3G54120
57 ATGP4  --  interacts with  --  AT3G29270  --  interacts with  --  AT3G59500
58 ATGP4  --  interacts with  --  AT3G29270  --  interacts with  --  AT5G56020
59 ATGP4  --  interacts with  --  AT3G29270  --  interacts with  --  ABC4
60 ATGP4  --  interacts with  --  AT3G29270  --  interacts with  --  AT3G01570
61 ATGP4  --  interacts with  --  AT3G29270  --  interacts with  --  AT1G67860
62 ATGP4  --  interacts with  --  AT3G29270  --  interacts with  --  AT1G35430
63 ATGP4  --  interacts with  --  AT3G29270  --  interacts with  --  AT1G67360
64 ATGP4  --  interacts with  --  AT3G29270  --  interacts with  --  AT1G10040
65 ATGP4  --  interacts with  --  AT3G29270  --  interacts with  --  AT2G25890
66 ATGP4  --  interacts with  --  AT3G29270  --  interacts with  --  AT1G47740
67 ATGP4  --  interacts with  --  AT3G29270  --  interacts with  --  AT3G18570
68 ATGP4  --  interacts with  --  AT3G29270  --  interacts with  --  PRA1.F2; PRA7
69 ATGP4  --  interacts with  --  AT3G29270  --  interacts with  --  MMZ2; UEV1B
70 ATGP4  --  interacts with  --  AT3G29270  --  interacts with  --  AtCLO3; CLO-3; CLO3; RD20
71 ATGP4  --  interacts with  --  AT3G29270  --  interacts with  --  AT1G01230
72 ATGP4  --  interacts with  --  AT3G29270  --  interacts with  --  HIPP20
73 ATGP4  --  interacts with  --  AT3G29270  --  interacts with  --  PRA1.B2
74 ATGP4  --  interacts with  --  AT3G29270  --  interacts with  --  AT3G19460
75 ATGP4  --  interacts with  --  AT3G29270  --  interacts with  --  ARL
76 ATGP4  --  interacts with  --  AT3G29270  --  interacts with  --  AT3G09690
77 ATGP4  --  interacts with  --  AT3G29270  --  interacts with  --  PRA1.F4
   Funding by the National Science Foundation    Funding by the Oklahoma Center for the Advancement of Science & Technology    Additional funding by the Samuel Roberts Noble Foundation

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