Screen Resolution:     
Welcome to HRGRN
A Graph Search-Empowered Integrative Database of Arabidopsis Signaling Transduction, Metabolism and Gene Regulation Networks   
Location:  Home > Details for node AT1G17080
Type: Protein GRN ID: np10732 Name:
Annotation: Ribosomal protein L18ae family
Gene Locus: AT1G17080
Gene Expression (Affy ATH1 probeset): 262481_at    
Graph Customization
   
Choose color for highlight:  
Display edge: validated and predicted
Display node/edge prompt:
Layout:
 as format     
Data Filter
 Protein modification
 Protein-protein interaction
        also include predicted relationship
 Compound-protein interaction
 TF-target gene regulation
 Small RNA-target regulation
        also include predicted relationship
 Carrier and transported molecule
 Catalytic chemical reaction
 Co-expressed gene pair
        with mutual information value >

  Ignore nodes having > relationships
 
Relationship type:  protein modification     catalytic chemical reaction     protein-protein interaction    
compound-protein interaction     TF-target gene regulation     small RNA-target regulation    
co-expressed gene pair     carrier and transported molecule     family/complex and member
Relationship evidence:  Solid line: validated          Dashed line: predicted
Relationship direction: Arrow: positive          T shape: negative          None arrow: unknown or n/a
Hormone association: Thicker line: hormone related relationship         : hormone related Node
Node type:  Transcription factor or transcriptional regulator       Compound       Kinase
 Small regulatory RNA (miRNA & ta-siRNA)       Other nodes
No. Path
2 AT1G17080  --  interacts with  --  AT5G52750
3 AT1G17080  --  interacts with  --  AT4G26450
4 AT1G17080  --  interacts with  --  AT3G10260
5 AT1G17080  --  interacts with  --  AT3G16310
6 AT1G17080  --  interacts with  --  PIN4
7 AT1G17080  --  interacts with  --  AT5G52750  --  has similar expression pattern (mutual information value=1.11896) with  --  AT5G52760
8 AT1G17080  --  interacts with  --  AT5G52750  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.953233) with  --  XBAT34
9 AT1G17080  --  interacts with  --  AT4G26450  --  interacts with  --  AT5G18850
10 AT1G17080  --  interacts with  --  AT4G26450  --  interacts with  --  APE2; TPT
11 AT1G17080  --  interacts with  --  AT4G26450  --  interacts with  --  AT5G01430
12 AT1G17080  --  interacts with  --  AT4G26450  --  interacts with  --  ATB5-A; ATCB5-E; B5 #2; CB5-E
13 AT1G17080  --  interacts with  --  AT4G26450  --  interacts with  --  FIS1B
14 AT1G17080  --  interacts with  --  AT4G26450  --  interacts with  --  AT5G24130
15 AT1G17080  --  interacts with  --  AT4G26450  --  interacts with  --  AT5G60460
16 AT1G17080  --  interacts with  --  AT4G26450  --  interacts with  --  AT5G18150
17 AT1G17080  --  interacts with  --  AT4G26450  --  interacts with  --  ATVTI11; ATVTI1A; SGR4; VTI11; VTI1A; ZIG; ZIG1
18 AT1G17080  --  interacts with  --  AT4G26450  --  interacts with  --  IRX15-L
19 AT1G17080  --  interacts with  --  AT4G26450  --  interacts with  --  AT4G40042
20 AT1G17080  --  interacts with  --  AT4G26450  --  interacts with  --  AT4G35080
21 AT1G17080  --  interacts with  --  AT4G26450  --  interacts with  --  ATUTR3; UTR3
22 AT1G17080  --  interacts with  --  AT4G26450  --  interacts with  --  ATVAMP722; SAR1; VAMP722
23 AT1G17080  --  interacts with  --  AT4G26450  --  interacts with  --  AT1G55535
24 AT1G17080  --  interacts with  --  AT4G26450  --  interacts with  --  AT4G03410
25 AT1G17080  --  interacts with  --  AT4G26450  --  interacts with  --  AT1G16950
26 AT1G17080  --  interacts with  --  AT4G26450  --  interacts with  --  AT1G16790
27 AT1G17080  --  interacts with  --  AT4G26450  --  interacts with  --  ERG28
28 AT1G17080  --  interacts with  --  AT4G26450  --  interacts with  --  AT1G60010
29 AT1G17080  --  interacts with  --  AT4G26450  --  interacts with  --  ARL
30 AT1G17080  --  interacts with  --  AT4G26450  --  interacts with  --  ATSYP61; OSM1; SYP61
31 AT1G17080  --  interacts with  --  AT4G26450  --  interacts with  --  AT1G44800
32 AT1G17080  --  interacts with  --  AT4G26450  --  interacts with  --  AT2G32580
33 AT1G17080  --  interacts with  --  AT4G26450  --  interacts with  --  WAT1
34 AT1G17080  --  interacts with  --  AT4G26450  --  interacts with  --  AGP12; ATAGP12
35 AT1G17080  --  interacts with  --  AT4G26450  --  interacts with  --  AT3G51510
36 AT1G17080  --  interacts with  --  AT4G26450  --  interacts with  --  AT1G76670
37 AT1G17080  --  interacts with  --  AT4G26450  --  interacts with  --  TOM20-3
38 AT1G17080  --  interacts with  --  AT4G26450  --  interacts with  --  ATTSPO; TSPO
39 AT1G17080  --  interacts with  --  AT4G26450  --  interacts with  --  7RED; DWF5; LE; PA; ST7R
40 AT1G17080  --  interacts with  --  AT4G26450  --  interacts with  --  ATSPP; SPP
41 AT1G17080  --  interacts with  --  AT4G26450  --  interacts with  --  AT4G20300
42 AT1G17080  --  interacts with  --  AT4G26450  --  interacts with  --  AT2G17760
43 AT1G17080  --  interacts with  --  AT4G26450  --  interacts with  --  ATRBL6; RBL6
44 AT1G17080  --  interacts with  --  AT4G26450  --  interacts with  --  ATPUP4; PUP4
45 AT1G17080  --  interacts with  --  AT4G26450  --  interacts with  --  AT2G24290
46 AT1G17080  --  interacts with  --  AT4G26450  --  interacts with  --  PLA IIIB; PLP9
47 AT1G17080  --  interacts with  --  AT4G26450  --  interacts with  --  AT4G24310
48 AT1G17080  --  interacts with  --  AT4G26450  --  interacts with  --  AT2G17972
49 AT1G17080  --  interacts with  --  AT4G26450  --  interacts with  --  AT3G57280
50 AT1G17080  --  interacts with  --  AT4G26450  --  interacts with  --  PIP2;8; PIP3B
51 AT1G17080  --  interacts with  --  AT4G26450  --  interacts with  --  AT3G25190
52 AT1G17080  --  interacts with  --  AT4G26450  --  interacts with  --  AT3G43520
53 AT1G17080  --  interacts with  --  AT4G26450  --  interacts with  --  ROD1
54 AT1G17080  --  interacts with  --  AT4G26450  --  interacts with  --  ATBET11; ATBS14A; BET11; BS14A
55 AT1G17080  --  interacts with  --  AT4G26450  --  interacts with  --  CASP1
56 AT1G17080  --  interacts with  --  AT4G26450  --  interacts with  --  AT3G29034
57 AT1G17080  --  interacts with  --  AT4G26450  --  interacts with  --  AT3G02690
58 AT1G17080  --  interacts with  --  AT4G26450  --  interacts with  --  ATLPP2; ATPAP2; LPP2
59 AT1G17080  --  interacts with  --  AT4G26450  --  interacts with  --  AT3G22070
60 AT1G17080  --  interacts with  --  AT4G26450  --  interacts with  --  AT3G22570
61 AT1G17080  --  interacts with  --  AT4G26450  --  interacts with  --  AT1G77350
62 AT1G17080  --  interacts with  --  AT4G26450  --  interacts with  --  ATSYP51; SYP51
63 AT1G17080  --  interacts with  --  AT4G26450  --  interacts with  --  AT1G33800
64 AT1G17080  --  interacts with  --  AT4G26450  --  interacts with  --  AVA-P4
65 AT1G17080  --  interacts with  --  AT4G26450  --  interacts with  --  DELTA-TIP2; TIP2;2
66 AT1G17080  --  interacts with  --  AT4G26450  --  interacts with  --  AT1G05785
67 AT1G17080  --  interacts with  --  AT4G26450  --  interacts with  --  AT1G28250
68 AT1G17080  --  interacts with  --  AT3G10260  --  interacts with  --  AT5G43670
69 AT1G17080  --  interacts with  --  AT3G10260  --  interacts with  --  ATRBL15; RBL15
70 AT1G17080  --  interacts with  --  AT3G10260  --  interacts with  --  AT4G01150
71 AT1G17080  --  interacts with  --  AT3G10260  --  interacts with  --  AT5G61340
72 AT1G17080  --  interacts with  --  AT3G10260  --  interacts with  --  AT3G55600
73 AT1G17080  --  interacts with  --  AT3G10260  --  interacts with  --  ATRAB1A; ATRABD2B; RAB1A
74 AT1G17080  --  interacts with  --  AT3G10260  --  interacts with  --  AT5G07730
75 AT1G17080  --  interacts with  --  AT3G10260  --  interacts with  --  AT3G54120
76 AT1G17080  --  interacts with  --  AT3G10260  --  interacts with  --  PRA1.F4
77 AT1G17080  --  interacts with  --  AT3G10260  --  interacts with  --  PRA1.B5
78 AT1G17080  --  interacts with  --  AT3G10260  --  interacts with  --  AT3G59500
79 AT1G17080  --  interacts with  --  AT3G10260  --  interacts with  --  AT4G08230
80 AT1G17080  --  interacts with  --  AT3G10260  --  interacts with  --  ATLCB1; EMB2779; FBR11; LCB1
81 AT1G17080  --  interacts with  --  AT3G10260  --  interacts with  --  AT3G61300
82 AT1G17080  --  interacts with  --  AT3G10260  --  interacts with  --  ANAC001; NAC001
83 AT1G17080  --  interacts with  --  AT3G10260  --  interacts with  --  AT1G72170
84 AT1G17080  --  interacts with  --  AT3G10260  --  interacts with  --  AT3G09690
85 AT1G17080  --  interacts with  --  AT3G10260  --  interacts with  --  PRA1.B2
86 AT1G17080  --  interacts with  --  AT3G10260  --  interacts with  --  ATRNS1; RNS1
87 AT1G17080  --  interacts with  --  AT3G16310  --  interacts with  --  KMS1
88 AT1G17080  --  interacts with  --  AT3G16310  --  interacts with  --  AT3G21690
89 AT1G17080  --  interacts with  --  AT3G16310  --  interacts with  --  AT5G56020
90 AT1G17080  --  interacts with  --  AT3G16310  --  interacts with  --  AT5G12880
91 AT1G17080  --  interacts with  --  AT3G16310  --  interacts with  --  AT3G20510
92 AT1G17080  --  interacts with  --  AT3G16310  --  interacts with  --  AT5G43460
93 AT1G17080  --  interacts with  --  AT3G16310  --  interacts with  --  AT3G51390
94 AT1G17080  --  interacts with  --  AT3G16310  --  interacts with  --  AT4G16840
95 AT1G17080  --  interacts with  --  AT3G16310  --  interacts with  --  ERG9; SQS1
96 AT1G17080  --  interacts with  --  AT3G16310  --  interacts with  --  AT5G19750
97 AT1G17080  --  interacts with  --  AT3G16310  --  interacts with  --  AT3G51450
98 AT1G17080  --  interacts with  --  AT3G16310  --  interacts with  --  AT3G28050
99 AT1G17080  --  interacts with  --  AT3G16310  --  interacts with  --  FKBP15-1
100 AT1G17080  --  interacts with  --  AT3G16310  --  interacts with  --  BIGYIN; FIS1A
101 AT1G17080  --  interacts with  --  AT3G16310  --  interacts with  --  AT5G51010
102 AT1G17080  --  interacts with  --  AT3G16310  --  interacts with  --  AT4G09580
103 AT1G17080  --  interacts with  --  AT3G16310  --  interacts with  --  AT2G23910
104 AT1G17080  --  interacts with  --  AT3G16310  --  interacts with  --  ATRBL2; RBL2
105 AT1G17080  --  interacts with  --  AT3G16310  --  interacts with  --  AT1G75880
106 AT1G17080  --  interacts with  --  AT3G16310  --  interacts with  --  AT-SYR1; ATSYP121; ATSYR1; PEN1; SYP121; SYR1
107 AT1G17080  --  interacts with  --  AT3G16310  --  interacts with  --  AT1G52870
108 AT1G17080  --  interacts with  --  AT3G16310  --  interacts with  --  ATCSLC06; ATCSLC6; CSLC06; CSLC6
109 AT1G17080  --  interacts with  --  AT3G16310  --  interacts with  --  PORC
110 AT1G17080  --  interacts with  --  AT3G16310  --  interacts with  --  AT2G04690
111 AT1G17080  --  interacts with  --  AT3G16310  --  interacts with  --  AT1G11850
112 AT1G17080  --  interacts with  --  AT3G16310  --  interacts with  --  ALPHA-TIP; TIP3;1
113 AT1G17080  --  interacts with  --  AT3G16310  --  interacts with  --  AT1G33230
114 AT1G17080  --  interacts with  --  AT3G16310  --  interacts with  --  PIP2;3; PIP2C; RD28
115 AT1G17080  --  interacts with  --  AT3G16310  --  interacts with  --  PSBR
116 AT1G17080  --  interacts with  --  AT3G16310  --  interacts with  --  AT1G04340
117 AT1G17080  --  interacts with  --  AT3G16310  --  interacts with  --  AT2G32380
118 AT1G17080  --  interacts with  --  AT3G16310  --  interacts with  --  AT2G35170
119 AT1G17080  --  interacts with  --  AT3G16310  --  interacts with  --  AT2G14835
120 AT1G17080  --  interacts with  --  AT3G16310  --  interacts with  --  AT2G31490
121 AT1G17080  --  interacts with  --  AT3G16310  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.840169) with  --  ATUBA2; UBA 2
122 AT1G17080  --  interacts with  --  PIN4  --  interacts with  --  AT5G03345
123 AT1G17080  --  interacts with  --  PIN4  --  interacts with  --  AT1G16170
124 AT1G17080  --  interacts with  --  PIN4  --  interacts with  --  AT4; ATIPS2
125 AT1G17080  --  interacts with  --  PIN4  --  interacts with  --  AT1G14990
126 AT1G17080  --  interacts with  --  PIN4  --  interacts with  --  AT3G52070
127 AT1G17080  --  interacts with  --  PIN4  --  interacts with  --  AT4G40045
128 AT1G17080  --  interacts with  --  PIN4  --  interacts with  --  GAE5
129 AT1G17080  --  interacts with  --  PIN4  --  interacts with  --  ARAC8; ATRAC8; ATROP10; ROP10
130 AT1G17080  --  interacts with  --  PIN4  --  interacts with  --  AT1G25510
131 AT1G17080  --  interacts with  --  PIN4  --  interacts with  --  AT1G14020
132 AT1G17080  --  interacts with  --  PIN4  --  interacts with  --  AT2G38330
133 AT1G17080  --  interacts with  --  PIN4  --  interacts with  --  AT4G01410
134 AT1G17080  --  interacts with  --  PIN4  --  interacts with  --  AT1G56710
135 AT1G17080  --  interacts with  --  PIN4  --  interacts with  --  AT1G14670
136 AT1G17080  --  interacts with  --  PIN4  --  interacts with  --  ABCI12
137 AT1G17080  --  interacts with  --  PIN4  --  interacts with  --  AT5G07340
138 AT1G17080  --  interacts with  --  PIN4  --  interacts with  --  BOR5
139 AT1G17080  --  interacts with  --  PIN4  --  interacts with  --  AGP27; ATAGP27
140 AT1G17080  --  interacts with  --  PIN4  --  interacts with  --  AT5G55380
141 AT1G17080  --  interacts with  --  PIN4  --  interacts with  --  RPT2a
142 AT1G17080  --  interacts with  --  PIN4  --  interacts with  --  ELIP2
143 AT1G17080  --  interacts with  --  PIN4  --  interacts with  --  CDPK6
144 AT1G17080  --  interacts with  --  PIN4  --  interacts with  --  ATFACE-2; ATFACE2; FACE2; RCE1
145 AT1G17080  --  interacts with  --  PIN4  --  interacts with  --  ATCAX11; CAX11
146 AT1G17080  --  interacts with  --  PIN4  --  interacts with  --  PIP1;3; PIP1C; TMP-B
147 AT1G17080  --  interacts with  --  PIN4  --  interacts with  --  ATSK42; SK42
148 AT1G17080  --  interacts with  --  PIN4  --  interacts with  --  NPC3
149 AT1G17080  --  interacts with  --  PIN4  --  interacts with  --  ATL4; TL4
150 AT1G17080  --  interacts with  --  PIN4  --  interacts with  --  ATGUT1; GUT2; IRX10
151 AT1G17080  --  interacts with  --  PIN4  --  interacts with  --  ATUTR2; UTR2
152 AT1G17080  --  interacts with  --  PIN4  --  interacts with  --  At17.1
153 AT1G17080  --  interacts with  --  PIN4  --  interacts with  --  AtFYPP1; FYPP1
154 AT1G17080  --  interacts with  --  PIN4  --  interacts with  --  AT3G46890
155 AT1G17080  --  interacts with  --  PIN4  --  interacts with  --  AT2G41190
156 AT1G17080  --  interacts with  --  PIN4  --  interacts with  --  ATCLC-C; CLC-C
157 AT1G17080  --  interacts with  --  PIN4  --  interacts with  --  NIP7;1; NLM6; NLM8
158 AT1G17080  --  interacts with  --  PIN4  --  is a member of  --  ATPIN1 family27, coding gene
159 AT1G17080  --  interacts with  --  PIN4  --  is regulated by  --  zeatin complex17
160 AT1G17080  --  interacts with  --  PIN4  --  is modified by  --  D6PK
   Funding by the National Science Foundation    Funding by the Oklahoma Center for the Advancement of Science & Technology    Additional funding by the Samuel Roberts Noble Foundation

Copyright © The Zhao Lab

Disclaimer | Contact