Screen Resolution:     
Welcome to HRGRN
A Graph Search-Empowered Integrative Database of Arabidopsis Signaling Transduction, Metabolism and Gene Regulation Networks   
Location:  Home > Details for node COP1
Type: Protein GRN ID: np06069 Name: COP1
Annotation: COP1, ATCOP1, DET340, FUS1, EMB168 | Transducin/WD40 repeat-like superfamily protein [TCDB:3.A.1.201] [EC:6.3.2.19]
Gene Locus: AT2G32950
Transcription factor /
transcriptional regulator:		 transcription factor family WD40-like
Pathways: Gibberellins;  Jasmonates 
Gene Expression (Affy ATH1 probeset): 267640_at    
Graph Customization
   
Choose color for highlight:  
Display edge: validated and predicted
Display node/edge prompt:
Layout:
 as format     
Data Filter
 Protein modification
 Protein-protein interaction
        also include predicted relationship
 Compound-protein interaction
 TF-target gene regulation
 Small RNA-target regulation
        also include predicted relationship
 Carrier and transported molecule
 Catalytic chemical reaction
 Co-expressed gene pair
        with mutual information value >

  Ignore nodes having > relationships
 
Relationship type:  protein modification     catalytic chemical reaction     protein-protein interaction    
compound-protein interaction     TF-target gene regulation     small RNA-target regulation    
co-expressed gene pair     carrier and transported molecule     family/complex and member
Relationship evidence:  Solid line: validated          Dashed line: predicted
Relationship direction: Arrow: positive          T shape: negative          None arrow: unknown or n/a
Hormone association: Thicker line: hormone related relationship         : hormone related Node
Node type:  Transcription factor or transcriptional regulator       Compound       Kinase
 Small regulatory RNA (miRNA & ta-siRNA)       Other nodes
No. Path
2 COP1  --  interacts with  --  BIN4; MID
3 COP1  --  interacts with  --  AT4G39070
4 COP1  --  interacts with  --  ATRANGAP2; ATSCAR1; SCAR1; WAVE1
5 COP1  --  interacts with  --  PHYE
6 COP1  --  interacts with  --  PHYD
7 COP1  --  interacts with  --  PHYC
8 COP1  --  interacts with  --  Phytochrome B (PhyB)
9 COP1  --  interacts with  --  ATCOL3; COL3
10 COP1  --  interacts with  --  HYH
11 COP1  --  interacts with  --  BBX24; STO
12 COP1  --  interacts with  --  AT-PHH1; ATCRY2; CRY2; FHA; PHH1
13 COP1  --  interacts with  --  GI
14 COP1  --  interacts with  --  ELF3; PYK20
15 COP1  --  interacts with  --  STH
16 COP1  --  interacts with  --  ATCRY1; BLU1; CRY1; HY4; OOP2
17 COP1  --  interacts with  --  CO; FG
18 COP1  --  interacts with  --  CIP1
19 COP1  --  interacts with  --  SPA1
20 COP1  --  interacts with  --  AtMYB18; MYB18
21 COP1  --  interacts with  --  CIP8
22 COP1  --  interacts with  --  HY5
23 COP1  --  interacts with  --  Phytochrome A (PhyA)
24 COP1  --  interacts with  --  FBI1; HFR1; REP1; RSF1
25 COP1  --  interacts with  --  AT1G61620
26 COP1  --  interacts with  --  ATMYB90; MYB90; PAP2
27 COP1  --  interacts with  --  UVR8
28 COP1  --  interacts with  --  HRT; RCY1; RPP8
29 COP1  --  interacts with  --  FIN219; JAR1
30 COP1  --  interacts with  --  DDB1B
31 COP1  --  interacts with  --  DDB1A
32 COP1  --  interacts with  --  CIP7
33 COP1  --  interacts with  --  CIP4
34 COP1  --  interacts with  --  CIN4; COP10; EMB144; FUS9
35 COP1  --  interacts with  --  ATTCP-1; TCP-1
36 COP1  --  is a member of  --  COP1/SPA1 COMPLEX
37 COP1  --  interacts with  --  BIN4; MID  --  interacts with  --  TFIIB
38 COP1  --  interacts with  --  BIN4; MID  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.863534) with  --  AT4G15890
39 COP1  --  interacts with  --  BIN4; MID  --  is the target gene of  --  ath-miR5648-3p
40 COP1  --  interacts with  --  BIN4; MID  --  is the target gene of  --  ath-miR426
41 COP1  --  interacts with  --  AT4G39070  --  interacts with  --  PFT1
42 COP1  --  interacts with  --  Phytochrome B (PhyB)  --  interacts with  --  PIN7
43 COP1  --  interacts with  --  Phytochrome B (PhyB)  --  interacts with  --  PIN3
44 COP1  --  interacts with  --  Phytochrome B (PhyB)  --  interacts with  --  ATPIN1
45 COP1  --  interacts with  --  Phytochrome B (PhyB)  --  interacts with  --  AtHB23; HB23
46 COP1  --  interacts with  --  Phytochrome B (PhyB)  --  interacts with  --  AT2G26190
47 COP1  --  interacts with  --  Phytochrome B (PhyB)  --  interacts with  --  AT1G74490
48 COP1  --  interacts with  --  Phytochrome B (PhyB)  --  interacts with  --  AtDBP1; DBP1
49 COP1  --  interacts with  --  Phytochrome B (PhyB)  --  interacts with  --  ADG1; APS1
50 COP1  --  interacts with  --  Phytochrome B (PhyB)  --  interacts with  --  PIL1
51 COP1  --  interacts with  --  Phytochrome B (PhyB)  --  interacts with  --  PIF6; PIL2
52 COP1  --  interacts with  --  Phytochrome B (PhyB)  --  interacts with  --  ATVOZ2; VOZ2
53 COP1  --  interacts with  --  Phytochrome B (PhyB)  --  interacts with  --  ATVOZ1; VOZ1
54 COP1  --  interacts with  --  Phytochrome B (PhyB)  --  interacts with  --  GLT1; PGLCT
55 COP1  --  interacts with  --  Phytochrome B (PhyB)  --  interacts with  --  ACBK1; ATCNGC10; CNGC10
56 COP1  --  interacts with  --  Phytochrome B (PhyB)  --  interacts with  --  ATERDJ2A
57 COP1  --  interacts with  --  Phytochrome B (PhyB)  --  interacts with  --  ABCG10
58 COP1  --  interacts with  --  Phytochrome B (PhyB)  --  interacts with  --  ATGDU2; GDU2
59 COP1  --  interacts with  --  Phytochrome B (PhyB)  --  interacts with  --  ATCPK1; CPK1
60 COP1  --  interacts with  --  Phytochrome B (PhyB)  --  interacts with  --  pil5
61 COP1  --  interacts with  --  Phytochrome B (PhyB)  --  interacts with  --  PIF4
62 COP1  --  interacts with  --  Phytochrome B (PhyB)  --  interacts with  --  ATNDPK2; NDPK IA; NDPK IA IA; NDPK1A; NDPK2
63 COP1  --  interacts with  --  Phytochrome B (PhyB)  --  interacts with  --  PKS1
64 COP1  --  interacts with  --  Phytochrome B (PhyB)  --  interacts with  --  ARR4
65 COP1  --  interacts with  --  Phytochrome B (PhyB)  --  interacts with  --  PIF3
66 COP1  --  interacts with  --  Phytochrome B (PhyB)  --  interacts with  --  PIF5; PIL6
67 COP1  --  interacts with  --  Phytochrome B (PhyB)  --  interacts with  --  AT1G72390
68 COP1  --  interacts with  --  Phytochrome B (PhyB)  --  interacts with  --  HMR; PTAC12
69 COP1  --  interacts with  --  Phytochrome B (PhyB)  --  interacts with  --  ATROPGEF11; PIRF1; ROPGEF11
70 COP1  --  interacts with  --  Phytochrome B (PhyB)  --  interacts with  --  IAA3
71 COP1  --  interacts with  --  Phytochrome B (PhyB)  --  interacts with  --  PAPP2C
72 COP1  --  interacts with  --  Phytochrome B (PhyB)  --  interacts with  --  PIF7
73 COP1  --  interacts with  --  Phytochrome B (PhyB)  --  interacts with  --  ADO1; FKL2; LKP1; ZTL
74 COP1  --  interacts with  --  Phytochrome B (PhyB)  --  is a member of  --  phy family, coding gene
75 COP1  --  interacts with  --  ATCOL3; COL3  --  interacts with  --  ADO2; LKP2
76 COP1  --  interacts with  --  ATCOL3; COL3  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.801543) with  --  LHCA3
77 COP1  --  interacts with  --  ATCOL3; COL3  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.85257) with  --  PSBR
78 COP1  --  interacts with  --  HYH  --  regulates the expression of   --  ATNRT1; B-1; CHL1; CHL1-1; NRT1; NRT1.1
79 COP1  --  interacts with  --  HYH  --  regulates the expression of   --  ATNR2; B29; CHL3; NIA2; NIA2-1; NR; NR2
80 COP1  --  interacts with  --  HYH  --  interacts with  --  GBF1
81 COP1  --  interacts with  --  BBX24; STO  --  interacts with  --  RGA1
82 COP1  --  interacts with  --  BBX24; STO  --  interacts with  --  ATP8; AtRCD1; CEO; CEO1; RCD1
83 COP1  --  interacts with  --  AT-PHH1; ATCRY2; CRY2; FHA; PHH1  --  interacts with  --  CIB5
84 COP1  --  interacts with  --  AT-PHH1; ATCRY2; CRY2; FHA; PHH1  --  interacts with  --  CIB1
85 COP1  --  interacts with  --  AT-PHH1; ATCRY2; CRY2; FHA; PHH1  --  interacts with  --  ckl4
86 COP1  --  interacts with  --  AT-PHH1; ATCRY2; CRY2; FHA; PHH1  --  interacts with  --  ckl3
87 COP1  --  interacts with  --  AT-PHH1; ATCRY2; CRY2; FHA; PHH1  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.829748) with  --  AT2G46550
88 COP1  --  interacts with  --  AT-PHH1; ATCRY2; CRY2; FHA; PHH1  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.835214) with  --  AtTLP9
89 COP1  --  interacts with  --  GI  --  interacts with  --  CBFS
90 COP1  --  interacts with  --  GI  --  interacts with  --  ATSOS3; CBL4; SOS3
91 COP1  --  interacts with  --  GI  --  interacts with  --  ATSOS2; CIPK24; SNRK3.11; SOS2
92 COP1  --  interacts with  --  GI  --  interacts with  --  SPY
93 COP1  --  interacts with  --  GI  --  interacts with  --  ADO3; FKF1
94 COP1  --  interacts with  --  GI  --  interacts with  --  SPL11
95 COP1  --  interacts with  --  GI  --  is a member of  --  FPA family, transcription factor gene
96 COP1  --  interacts with  --  ELF3; PYK20  --  interacts with  --  LUX; PCL1
97 COP1  --  interacts with  --  ELF3; PYK20  --  interacts with  --  ELF4
98 COP1  --  interacts with  --  ATCRY1; BLU1; CRY1; HY4; OOP2  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.827273) with  --  G6PD1
99 COP1  --  interacts with  --  CO; FG  --  regulates the expression of   --  FT?
100 COP1  --  interacts with  --  CO; FG  --  regulates the expression of   --  OBF4
101 COP1  --  interacts with  --  CO; FG  --  is regulated by  --  CDF1
102 COP1  --  interacts with  --  CO; FG  --  interacts with  --  ATHAP2B; HAP2B; NF-YA2; UNE8
103 COP1  --  interacts with  --  CO; FG  --  interacts with  --  NF-YC3
104 COP1  --  interacts with  --  CO; FG  --  interacts with  --  AT5G65683
105 COP1  --  interacts with  --  CO; FG  --  interacts with  --  AS1
106 COP1  --  interacts with  --  CO; FG  --  interacts with  --  NF-YB2
107 COP1  --  interacts with  --  CO; FG  --  interacts with  --  ATHAP3; ATNF-YB1; HAP3; HAP3A; NF-YB1
108 COP1  --  interacts with  --  CO; FG  --  interacts with  --  HAP5C; NF-YC9
109 COP1  --  interacts with  --  CO; FG  --  interacts with  --  ATHAP5B; HAP5B; NF-YC2
110 COP1  --  interacts with  --  CO; FG  --  interacts with  --  ATHAP5A; HAP5A; NF-YC1
111 COP1  --  interacts with  --  CO; FG  --  interacts with  --  ATSWI3B?
112 COP1  --  interacts with  --  CO; FG  --  interacts with  --  AT3G18380
113 COP1  --  interacts with  --  CO; FG  --  interacts with  --  OBE1
114 COP1  --  interacts with  --  CO; FG  --  interacts with  --  ABI3
115 COP1  --  interacts with  --  CO; FG  --  interacts with  --  SPA4
116 COP1  --  interacts with  --  CO; FG  --  interacts with  --  SPA3
117 COP1  --  interacts with  --  CO; FG  --  interacts with  --  SPA2
118 COP1  --  interacts with  --  CIP1  --  interacts with  --  TIR1
119 COP1  --  interacts with  --  CIP1  --  interacts with  --  COI1
120 COP1  --  interacts with  --  SPA1  --  regulates the expression of   --  FIP1
121 COP1  --  interacts with  --  SPA1  --  is regulated by  --  ATMYC2
122 COP1  --  interacts with  --  SPA1  --  interacts with  --  ATMYB75; MYB75; PAP1; SIAA1
123 COP1  --  interacts with  --  AtMYB18; MYB18  --  interacts with  --  FHL
124 COP1  --  interacts with  --  AtMYB18; MYB18  --  interacts with  --  FHY1; FRY1; PAT3
125 COP1  --  interacts with  --  AtMYB18; MYB18  --  is modified by  --  MPK16
126 COP1  --  interacts with  --  CIP8  --  interacts with  --  AT3G52155
127 COP1  --  interacts with  --  HY5  --  regulates the expression of   --  ATGA2OX2
128 COP1  --  interacts with  --  HY5  --  regulates the expression of   --  BBX22; DBB3; LZF1; STH3
129 COP1  --  interacts with  --  HY5  --  regulates the expression of   --  ANS; LDOX; TDS4; TT18
130 COP1  --  interacts with  --  HY5  --  regulates the expression of   --  DFR; M318; TT3
131 COP1  --  interacts with  --  HY5  --  regulates the expression of   --  CYP75B1; D501; TT7
132 COP1  --  interacts with  --  HY5  --  regulates the expression of   --  CHI
133 COP1  --  interacts with  --  HY5  --  regulates the expression of   --  ATCHS; CHS; TT4
134 COP1  --  interacts with  --  HY5  --  regulates the expression of   --  IAA14
135 COP1  --  interacts with  --  HY5  --  regulates the expression of   --  AXR2
136 COP1  --  interacts with  --  HY5  --  regulates the expression of   --  AtGA20ox1 family92, coding gene
137 COP1  --  interacts with  --  HY5  --  regulates the expression of   --  ATERF11
138 COP1  --  interacts with  --  HY5  --  regulates the expression of   --  F3'H; F3H; TT6
139 COP1  --  interacts with  --  HY5  --  regulates the expression of   --  ABI5
140 COP1  --  interacts with  --  HY5  --  regulates the expression of   --  AB140; CAB1; CAB140; LHCB1.3
141 COP1  --  interacts with  --  HY5  --  regulates the expression of   --  AB165; CAB2; LHCB1.1
142 COP1  --  interacts with  --  HY5  --  interacts with  --  AT3G56770
143 COP1  --  interacts with  --  HY5  --  interacts with  --  ATBZIP54; GBF2
144 COP1  --  interacts with  --  HY5  --  interacts with  --  AT5G21960
145 COP1  --  interacts with  --  HY5  --  interacts with  --  AtBBX21; BBX21; LHUS; STH2
146 COP1  --  interacts with  --  HY5  --  interacts with  --  FAR1
147 COP1  --  interacts with  --  HY5  --  interacts with  --  FHY3
148 COP1  --  interacts with  --  HY5  --  interacts with  --  ATPEX2; PEX2; TED3
149 COP1  --  interacts with  --  HY5  --  interacts with  --  CRF1
150 COP1  --  interacts with  --  HY5  --  interacts with  --  AT4G13040
151 COP1  --  interacts with  --  HY5  --  interacts with  --  MYC3
152 COP1  --  interacts with  --  HY5  --  interacts with  --  AT5G48560
153 COP1  --  interacts with  --  HY5  --  interacts with  --  AT3G23230
154 COP1  --  interacts with  --  HY5  --  interacts with  --  PYE
155 COP1  --  interacts with  --  HY5  --  interacts with  --  AT1G73870
156 COP1  --  interacts with  --  HY5  --  interacts with  --  BHLH101
157 COP1  --  interacts with  --  HY5  --  interacts with  --  AT5G57150
158 COP1  --  interacts with  --  HY5  --  interacts with  --  AT5G18450
159 COP1  --  interacts with  --  HY5  --  interacts with  --  BHLH039; ORG3
160 COP1  --  interacts with  --  HY5  --  interacts with  --  AtMYB79; MYB79
161 COP1  --  interacts with  --  HY5  --  interacts with  --  CES/CESTA
162 COP1  --  interacts with  --  HY5  --  interacts with  --  AT2G41130
163 COP1  --  interacts with  --  HY5  --  interacts with  --  RAP2.11
164 COP1  --  interacts with  --  HY5  --  interacts with  --  CHD3; CHR6; CKH2; GYM; PKL; SSL2
165 COP1  --  interacts with  --  Phytochrome A (PhyA)  --  interacts with  --  AT2G37680
166 COP1  --  interacts with  --  Phytochrome A (PhyA)  --  is regulated by  --  CAMTA3; SR1
167 COP1  --  interacts with  --  FBI1; HFR1; REP1; RSF1  --  regulates the expression of   --  PRE1
168 COP1  --  interacts with  --  FBI1; HFR1; REP1; RSF1  --  interacts with  --  CKB2
169 COP1  --  interacts with  --  FBI1; HFR1; REP1; RSF1  --  interacts with  --  CKB1
170 COP1  --  interacts with  --  FBI1; HFR1; REP1; RSF1  --  interacts with  --  KDR
171 COP1  --  interacts with  --  AT1G61620  --  interacts with  --  WAT1
172 COP1  --  interacts with  --  AT1G61620  --  has similar expression pattern (mutual information value=1.07346) with  --  EMB2776; LIS
173 COP1  --  interacts with  --  AT1G61620  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.821673) with  --  AT5G04910
174 COP1  --  interacts with  --  AT1G61620  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.818108) with  --  OBF5
175 COP1  --  interacts with  --  ATMYB90; MYB90; PAP2  --  interacts with  --  BHLH42; TT8
176 COP1  --  interacts with  --  ATMYB90; MYB90; PAP2  --  interacts with  --  ATMYC1; myc1
177 COP1  --  interacts with  --  ATMYB90; MYB90; PAP2  --  interacts with  --  ATMYC-2; EGL1; EGL3
178 COP1  --  interacts with  --  ATMYB90; MYB90; PAP2  --  interacts with  --  GL3; GL3; MYC6.2
179 COP1  --  interacts with  --  ATMYB90; MYB90; PAP2  --  interacts with  --  TCP3
180 COP1  --  interacts with  --  UVR8  --  interacts with  --  EFO2; RUP2
181 COP1  --  interacts with  --  UVR8  --  interacts with  --  EFO1; RUP1
182 COP1  --  interacts with  --  HRT; RCY1; RPP8  --  interacts with  --  AtCRT1a; CRT1; CRT1a
183 COP1  --  interacts with  --  FIN219; JAR1  --  interacts with  --  CKR1/EIN2
184 COP1  --  interacts with  --  DDB1B  --  interacts with  --  AT5G41560
185 COP1  --  interacts with  --  DDB1B  --  interacts with  --  FVE
186 COP1  --  interacts with  --  DDB1B  --  interacts with  --  ATCUL4; CUL4
187 COP1  --  interacts with  --  DDB1A  --  interacts with  --  AT5G12920
188 COP1  --  interacts with  --  DDB1A  --  interacts with  --  DCAF1
189 COP1  --  interacts with  --  DDB1A  --  interacts with  --  AT2G34260
190 COP1  --  interacts with  --  DDB1A  --  interacts with  --  AT4G15730
191 COP1  --  interacts with  --  DDB1A  --  interacts with  --  AT4G22250
192 COP1  --  interacts with  --  DDB1A  --  interacts with  --  DWA3
193 COP1  --  interacts with  --  DDB1A  --  interacts with  --  DWA2
194 COP1  --  interacts with  --  DDB1A  --  interacts with  --  PRL1
195 COP1  --  interacts with  --  DDB1A  --  interacts with  --  FY
196 COP1  --  interacts with  --  DDB1A  --  interacts with  --  AT3G45620
197 COP1  --  interacts with  --  DDB1A  --  interacts with  --  AT4G28450
198 COP1  --  interacts with  --  DDB1A  --  interacts with  --  AT1G65030
199 COP1  --  interacts with  --  DDB1A  --  interacts with  --  TIF3I1; TRIP-1
200 COP1  --  interacts with  --  DDB1A  --  interacts with  --  VIP3
201 COP1  --  interacts with  --  DDB1A  --  interacts with  --  RAE1
202 COP1  --  interacts with  --  DDB1A  --  interacts with  --  MSI3; NFC3
203 COP1  --  interacts with  --  DDB1A  --  interacts with  --  AtTHO6; DWA1; THO6
204 COP1  --  interacts with  --  DDB1A  --  interacts with  --  ATDET1; DET1; FUS2
205 COP1  --  interacts with  --  DDB1A  --  interacts with  --  AT2G19540
206 COP1  --  interacts with  --  DDB1A  --  interacts with  --  AT4G03020
207 COP1  --  interacts with  --  DDB1A  --  interacts with  --  AT3G20620
208 COP1  --  interacts with  --  DDB1A  --  interacts with  --  AT1G19750
209 COP1  --  interacts with  --  DDB1A  --  interacts with  --  ATCSA-1
210 COP1  --  interacts with  --  DDB1A  --  is a member of  --  CDD complex?
211 COP1  --  interacts with  --  CIN4; COP10; EMB144; FUS9  --  interacts with  --  COP9; CSN8; EMB143; FUS7
212 COP1  --  interacts with  --  CIN4; COP10; EMB144; FUS9  --  interacts with  --  ATS4; COP14; COP8; CSN4; EMB134; FUS4; FUS8
213 COP1  --  interacts with  --  CIN4; COP10; EMB144; FUS9  --  interacts with  --  COP13; CSN3; FUS11
214 COP1  --  interacts with  --  CIN4; COP10; EMB144; FUS9  --  interacts with  --  ATUBC4; UBC4
215 COP1  --  interacts with  --  CIN4; COP10; EMB144; FUS9  --  interacts with  --  UBC9
216 COP1  --  interacts with  --  ATTCP-1; TCP-1  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.883807) with  --  AT1G60770
217 COP1  --  interacts with  --  ATTCP-1; TCP-1  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.869727) with  --  ATPRMT10; PRMT10
218 COP1  --  interacts with  --  ATTCP-1; TCP-1  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.984855) with  --  AT1G73940
219 COP1  --  interacts with  --  ATTCP-1; TCP-1  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.887772) with  --  AT3G16780
220 COP1  --  interacts with  --  ATTCP-1; TCP-1  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.956966) with  --  TOM40
221 COP1  --  interacts with  --  ATTCP-1; TCP-1  --  has similar expression pattern (mutual information value=1.05156) with  --  AT3G12390
222 COP1  --  interacts with  --  ATTCP-1; TCP-1  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.895131) with  --  AT5G56500
223 COP1  --  interacts with  --  ATTCP-1; TCP-1  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.933345) with  --  PNM1
224 COP1  --  interacts with  --  ATTCP-1; TCP-1  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.971781) with  --  AT5G27330
   Funding by the National Science Foundation    Funding by the Oklahoma Center for the Advancement of Science & Technology    Additional funding by the Samuel Roberts Noble Foundation

Copyright © The Zhao Lab

Disclaimer | Contact