Screen Resolution:     
Welcome to HRGRN
A Graph Search-Empowered Integrative Database of Arabidopsis Signaling Transduction, Metabolism and Gene Regulation Networks   
Location:  Home > Details for node ATROPGEF11; PIRF1; ROPGEF11
Type: Protein GRN ID: np14819 Name: ATROPGEF11; PIRF1; ROPGEF11
Annotation: ATROPGEF11, ROPGEF11, PIRF1 | RHO guanyl-nucleotide exchange factor 11
Gene Locus: AT1G52240
Gene Expression (Affy ATH1 probeset): 259836_at    
Graph Customization
   
Choose color for highlight:  
Display edge: validated and predicted
Display node/edge prompt:
Layout:
 as format     
Data Filter
 Protein modification
 Protein-protein interaction
        also include predicted relationship
 Compound-protein interaction
 TF-target gene regulation
 Small RNA-target regulation
        also include predicted relationship
 Carrier and transported molecule
 Catalytic chemical reaction
 Co-expressed gene pair
        with mutual information value >

  Ignore nodes having > relationships
 
Relationship type:  protein modification     catalytic chemical reaction     protein-protein interaction    
compound-protein interaction     TF-target gene regulation     small RNA-target regulation    
co-expressed gene pair     carrier and transported molecule     family/complex and member
Relationship evidence:  Solid line: validated          Dashed line: predicted
Relationship direction: Arrow: positive          T shape: negative          None arrow: unknown or n/a
Hormone association: Thicker line: hormone related relationship         : hormone related Node
Node type:  Transcription factor or transcriptional regulator       Compound       Kinase
 Small regulatory RNA (miRNA & ta-siRNA)       Other nodes
No. Path
2 ATROPGEF11; PIRF1; ROPGEF11  --  interacts with  --  ARAC9; ATROP8; ROP8
3 ATROPGEF11; PIRF1; ROPGEF11  --  interacts with  --  ARAC3; ATROP6; RAC3; RHO1PS; ROP6
4 ATROPGEF11; PIRF1; ROPGEF11  --  interacts with  --  ARAC4; ATRAC4; ATROP2; ROP2
5 ATROPGEF11; PIRF1; ROPGEF11  --  interacts with  --  Phytochrome B (PhyB)
6 ATROPGEF11; PIRF1; ROPGEF11  --  interacts with  --  Phytochrome A (PhyA)
7 ATROPGEF11; PIRF1; ROPGEF11  --  interacts with  --  ARAC9; ATROP8; ROP8  --  interacts with  --  AT4G10080
8 ATROPGEF11; PIRF1; ROPGEF11  --  interacts with  --  ARAC9; ATROP8; ROP8  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.835841) with  --  AT2G25270
9 ATROPGEF11; PIRF1; ROPGEF11  --  interacts with  --  ARAC3; ATROP6; RAC3; RHO1PS; ROP6  --  interacts with  --  pin2/AGR
10 ATROPGEF11; PIRF1; ROPGEF11  --  interacts with  --  ARAC3; ATROP6; RAC3; RHO1PS; ROP6  --  interacts with  --  ATPIN1
11 ATROPGEF11; PIRF1; ROPGEF11  --  interacts with  --  ARAC3; ATROP6; RAC3; RHO1PS; ROP6  --  interacts with  --  clathrin family, coding gene
12 ATROPGEF11; PIRF1; ROPGEF11  --  interacts with  --  ARAC3; ATROP6; RAC3; RHO1PS; ROP6  --  interacts with  --  RIC1
13 ATROPGEF11; PIRF1; ROPGEF11  --  interacts with  --  ARAC3; ATROP6; RAC3; RHO1PS; ROP6  --  interacts with  --  SCN1
14 ATROPGEF11; PIRF1; ROPGEF11  --  interacts with  --  ARAC3; ATROP6; RAC3; RHO1PS; ROP6  --  interacts with  --  ABP; ABP1
15 ATROPGEF11; PIRF1; ROPGEF11  --  interacts with  --  ARAC3; ATROP6; RAC3; RHO1PS; ROP6  --  interacts with  --  ATFTA; FTA; PFT/PGGT-IALPHA; PLP
16 ATROPGEF11; PIRF1; ROPGEF11  --  interacts with  --  ARAC3; ATROP6; RAC3; RHO1PS; ROP6  --  interacts with  --  ATGGT-IB; GGB; PGGT-I
17 ATROPGEF11; PIRF1; ROPGEF11  --  interacts with  --  ARAC3; ATROP6; RAC3; RHO1PS; ROP6  --  interacts with  --  AT-GDI1; ATGDI1; GDI1
18 ATROPGEF11; PIRF1; ROPGEF11  --  interacts with  --  ARAC4; ATRAC4; ATROP2; ROP2  --  interacts with  --  RIC4
19 ATROPGEF11; PIRF1; ROPGEF11  --  interacts with  --  ARAC4; ATRAC4; ATROP2; ROP2  --  interacts with  --  RIP4
20 ATROPGEF11; PIRF1; ROPGEF11  --  interacts with  --  ARAC4; ATRAC4; ATROP2; ROP2  --  interacts with  --  FERONIA
21 ATROPGEF11; PIRF1; ROPGEF11  --  interacts with  --  ARAC4; ATRAC4; ATROP2; ROP2  --  interacts with  --  ATSRA1; KLK; PIR; PIR121; PIRP; SRA1
22 ATROPGEF11; PIRF1; ROPGEF11  --  interacts with  --  Phytochrome B (PhyB)  --  interacts with  --  PIN7
23 ATROPGEF11; PIRF1; ROPGEF11  --  interacts with  --  Phytochrome B (PhyB)  --  interacts with  --  PIN3
24 ATROPGEF11; PIRF1; ROPGEF11  --  interacts with  --  Phytochrome B (PhyB)  --  interacts with  --  AtHB23; HB23
25 ATROPGEF11; PIRF1; ROPGEF11  --  interacts with  --  Phytochrome B (PhyB)  --  interacts with  --  AT2G26190
26 ATROPGEF11; PIRF1; ROPGEF11  --  interacts with  --  Phytochrome B (PhyB)  --  interacts with  --  AT1G74490
27 ATROPGEF11; PIRF1; ROPGEF11  --  interacts with  --  Phytochrome B (PhyB)  --  interacts with  --  AtDBP1; DBP1
28 ATROPGEF11; PIRF1; ROPGEF11  --  interacts with  --  Phytochrome B (PhyB)  --  interacts with  --  ADG1; APS1
29 ATROPGEF11; PIRF1; ROPGEF11  --  interacts with  --  Phytochrome B (PhyB)  --  interacts with  --  PIL1
30 ATROPGEF11; PIRF1; ROPGEF11  --  interacts with  --  Phytochrome B (PhyB)  --  interacts with  --  SPA1
31 ATROPGEF11; PIRF1; ROPGEF11  --  interacts with  --  Phytochrome B (PhyB)  --  interacts with  --  PIF6; PIL2
32 ATROPGEF11; PIRF1; ROPGEF11  --  interacts with  --  Phytochrome B (PhyB)  --  interacts with  --  PHYE
33 ATROPGEF11; PIRF1; ROPGEF11  --  interacts with  --  Phytochrome B (PhyB)  --  interacts with  --  PHYD
34 ATROPGEF11; PIRF1; ROPGEF11  --  interacts with  --  Phytochrome B (PhyB)  --  interacts with  --  ATVOZ2; VOZ2
35 ATROPGEF11; PIRF1; ROPGEF11  --  interacts with  --  Phytochrome B (PhyB)  --  interacts with  --  ATVOZ1; VOZ1
36 ATROPGEF11; PIRF1; ROPGEF11  --  interacts with  --  Phytochrome B (PhyB)  --  interacts with  --  GLT1; PGLCT
37 ATROPGEF11; PIRF1; ROPGEF11  --  interacts with  --  Phytochrome B (PhyB)  --  interacts with  --  ACBK1; ATCNGC10; CNGC10
38 ATROPGEF11; PIRF1; ROPGEF11  --  interacts with  --  Phytochrome B (PhyB)  --  interacts with  --  ATERDJ2A
39 ATROPGEF11; PIRF1; ROPGEF11  --  interacts with  --  Phytochrome B (PhyB)  --  interacts with  --  ABCG10
40 ATROPGEF11; PIRF1; ROPGEF11  --  interacts with  --  Phytochrome B (PhyB)  --  interacts with  --  ATGDU2; GDU2
41 ATROPGEF11; PIRF1; ROPGEF11  --  interacts with  --  Phytochrome B (PhyB)  --  interacts with  --  ATCPK1; CPK1
42 ATROPGEF11; PIRF1; ROPGEF11  --  interacts with  --  Phytochrome B (PhyB)  --  interacts with  --  ATCRY1; BLU1; CRY1; HY4; OOP2
43 ATROPGEF11; PIRF1; ROPGEF11  --  interacts with  --  Phytochrome B (PhyB)  --  interacts with  --  pil5
44 ATROPGEF11; PIRF1; ROPGEF11  --  interacts with  --  Phytochrome B (PhyB)  --  interacts with  --  COP1
45 ATROPGEF11; PIRF1; ROPGEF11  --  interacts with  --  Phytochrome B (PhyB)  --  interacts with  --  PIF4
46 ATROPGEF11; PIRF1; ROPGEF11  --  interacts with  --  Phytochrome B (PhyB)  --  interacts with  --  ATNDPK2; NDPK IA; NDPK IA IA; NDPK1A; NDPK2
47 ATROPGEF11; PIRF1; ROPGEF11  --  interacts with  --  Phytochrome B (PhyB)  --  interacts with  --  PKS1
48 ATROPGEF11; PIRF1; ROPGEF11  --  interacts with  --  Phytochrome B (PhyB)  --  interacts with  --  AT-PHH1; ATCRY2; CRY2; FHA; PHH1
49 ATROPGEF11; PIRF1; ROPGEF11  --  interacts with  --  Phytochrome B (PhyB)  --  interacts with  --  ARR4
50 ATROPGEF11; PIRF1; ROPGEF11  --  interacts with  --  Phytochrome B (PhyB)  --  interacts with  --  PIF3
51 ATROPGEF11; PIRF1; ROPGEF11  --  interacts with  --  Phytochrome B (PhyB)  --  interacts with  --  PIF5; PIL6
52 ATROPGEF11; PIRF1; ROPGEF11  --  interacts with  --  Phytochrome B (PhyB)  --  interacts with  --  ELF3; PYK20
53 ATROPGEF11; PIRF1; ROPGEF11  --  interacts with  --  Phytochrome B (PhyB)  --  interacts with  --  AT1G72390
54 ATROPGEF11; PIRF1; ROPGEF11  --  interacts with  --  Phytochrome B (PhyB)  --  interacts with  --  HMR; PTAC12
55 ATROPGEF11; PIRF1; ROPGEF11  --  interacts with  --  Phytochrome B (PhyB)  --  interacts with  --  IAA3
56 ATROPGEF11; PIRF1; ROPGEF11  --  interacts with  --  Phytochrome B (PhyB)  --  interacts with  --  PAPP2C
57 ATROPGEF11; PIRF1; ROPGEF11  --  interacts with  --  Phytochrome B (PhyB)  --  interacts with  --  PIF7
58 ATROPGEF11; PIRF1; ROPGEF11  --  interacts with  --  Phytochrome B (PhyB)  --  interacts with  --  ADO1; FKL2; LKP1; ZTL
59 ATROPGEF11; PIRF1; ROPGEF11  --  interacts with  --  Phytochrome B (PhyB)  --  is a member of  --  phy family, coding gene
60 ATROPGEF11; PIRF1; ROPGEF11  --  interacts with  --  Phytochrome A (PhyA)  --  interacts with  --  FIN219; JAR1
61 ATROPGEF11; PIRF1; ROPGEF11  --  interacts with  --  Phytochrome A (PhyA)  --  interacts with  --  FHY1; FRY1; PAT3
62 ATROPGEF11; PIRF1; ROPGEF11  --  interacts with  --  Phytochrome A (PhyA)  --  interacts with  --  FHL
63 ATROPGEF11; PIRF1; ROPGEF11  --  interacts with  --  Phytochrome A (PhyA)  --  interacts with  --  AT2G37680
64 ATROPGEF11; PIRF1; ROPGEF11  --  interacts with  --  Phytochrome A (PhyA)  --  is regulated by  --  CAMTA3; SR1
   Funding by the National Science Foundation    Funding by the Oklahoma Center for the Advancement of Science & Technology    Additional funding by the Samuel Roberts Noble Foundation


Copyright © The Zhao Lab