Screen Resolution:     
Welcome to HRGRN
A Graph Search-Empowered Integrative Database of Arabidopsis Signaling Transduction, Metabolism and Gene Regulation Networks   
Location:  Home > Details for node CDF1
Type: Protein GRN ID: np39013 Name: CDF1
Annotation: CDF1 | cycling DOF factor 1
Gene Locus: AT5G62430
Transcription factor /
transcriptional regulator:		 transcription factor family C2C2-Dof
Gene Expression (Affy ATH1 probeset): 247452_at    
Graph Customization
   
Choose color for highlight:  
Display edge: validated and predicted
Display node/edge prompt:
Layout:
 as format     
Data Filter
 Protein modification
 Protein-protein interaction
        also include predicted relationship
 Compound-protein interaction
 TF-target gene regulation
 Small RNA-target regulation
        also include predicted relationship
 Carrier and transported molecule
 Catalytic chemical reaction
 Co-expressed gene pair
        with mutual information value >

  Ignore nodes having > relationships
 
Relationship type:  protein modification     catalytic chemical reaction     protein-protein interaction    
compound-protein interaction     TF-target gene regulation     small RNA-target regulation    
co-expressed gene pair     carrier and transported molecule     family/complex and member
Relationship evidence:  Solid line: validated          Dashed line: predicted
Relationship direction: Arrow: positive          T shape: negative          None arrow: unknown or n/a
Hormone association: Thicker line: hormone related relationship         : hormone related Node
Node type:  Transcription factor or transcriptional regulator       Compound       Kinase
 Small regulatory RNA (miRNA & ta-siRNA)       Other nodes
No. Path
2 CDF1  --  interacts with  --  AT5G51910
3 CDF1  --  interacts with  --  AT3G27960
4 CDF1  --  interacts with  --  ADO3; FKF1
5 CDF1  --  interacts with  --  ADO2; LKP2
6 CDF1  --  regulates the expression of   --  CO; FG
7 CDF1  --  interacts with  --  AT5G51910  --  interacts with  --  ATWRKY28; WRKY28
8 CDF1  --  interacts with  --  AT5G51910  --  interacts with  --  SARD1
9 CDF1  --  interacts with  --  AT5G51910  --  interacts with  --  TCP5
10 CDF1  --  interacts with  --  AT5G51910  --  interacts with  --  TCP2; TCP2
11 CDF1  --  interacts with  --  AT5G51910  --  interacts with  --  TCP3
12 CDF1  --  interacts with  --  AT5G51910  --  interacts with  --  MEE35; TCP4
13 CDF1  --  interacts with  --  AT5G51910  --  interacts with  --  ATTCP24; TCP24
14 CDF1  --  interacts with  --  AT5G51910  --  interacts with  --  TCP8
15 CDF1  --  interacts with  --  AT5G51910  --  interacts with  --  AtTCP11; TCP11
16 CDF1  --  interacts with  --  AT5G51910  --  interacts with  --  AT1G35560
17 CDF1  --  interacts with  --  AT5G51910  --  interacts with  --  AT-TCP20; ATTCP20; PCF1; TCP20
18 CDF1  --  interacts with  --  AT5G51910  --  interacts with  --  ATCDK8; CDKE;1; HEN3
19 CDF1  --  interacts with  --  AT5G51910  --  interacts with  --  ANK6; PIA2
20 CDF1  --  interacts with  --  AT5G51910  --  interacts with  --  CHR3; SYD
21 CDF1  --  interacts with  --  AT5G51910  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD
22 CDF1  --  interacts with  --  AT5G51910  --  interacts with  --  TCP10
23 CDF1  --  interacts with  --  AT5G51910  --  interacts with  --  TCP17
24 CDF1  --  interacts with  --  AT5G51910  --  interacts with  --  AtTCP15; TCP15
25 CDF1  --  interacts with  --  AT5G51910  --  interacts with  --  AT2G37000
26 CDF1  --  interacts with  --  AT5G51910  --  interacts with  --  NRPB9A; NRPD9A; NRPE9A
27 CDF1  --  interacts with  --  AT5G51910  --  interacts with  --  ZFP7
28 CDF1  --  interacts with  --  AT5G51910  --  interacts with  --  AT2G34050
29 CDF1  --  interacts with  --  AT5G51910  --  interacts with  --  ACX1
30 CDF1  --  interacts with  --  AT5G51910  --  interacts with  --  ATU2AF65A
31 CDF1  --  interacts with  --  AT5G51910  --  interacts with  --  KDSB
32 CDF1  --  interacts with  --  AT5G51910  --  interacts with  --  AKIN11; ATKIN11; KIN11; SNRK1.2
33 CDF1  --  interacts with  --  AT5G51910  --  interacts with  --  AT2G03500
34 CDF1  --  interacts with  --  AT5G51910  --  interacts with  --  AT2G30050
35 CDF1  --  interacts with  --  AT5G51910  --  interacts with  --  FZF
36 CDF1  --  interacts with  --  AT5G51910  --  interacts with  --  PYE
37 CDF1  --  interacts with  --  AT5G51910  --  interacts with  --  ATRTL2; RTL2
38 CDF1  --  interacts with  --  AT5G51910  --  interacts with  --  AT2G25730
39 CDF1  --  interacts with  --  AT5G51910  --  interacts with  --  AT1G80000
40 CDF1  --  interacts with  --  AT5G51910  --  interacts with  --  FRL1
41 CDF1  --  interacts with  --  AT5G51910  --  interacts with  --  PIA1
42 CDF1  --  interacts with  --  AT5G51910  --  interacts with  --  IMPA-2
43 CDF1  --  interacts with  --  AT5G51910  --  interacts with  --  HAT2
44 CDF1  --  interacts with  --  AT5G51910  --  interacts with  --  APRR2; PRR2
45 CDF1  --  interacts with  --  AT5G51910  --  interacts with  --  AT4G11175
46 CDF1  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  KAN; KAN1
47 CDF1  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  AT3G52050
48 CDF1  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  AT5G37550
49 CDF1  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  DRB5
50 CDF1  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  VPS9B
51 CDF1  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  AT4G00980
52 CDF1  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  AT3G54826
53 CDF1  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  AT5G11090
54 CDF1  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  AT5G38420
55 CDF1  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  AT5G09770
56 CDF1  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  VAR3
57 CDF1  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  AT4G26910
58 CDF1  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  AT4G20300
59 CDF1  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  AT4G30490
60 CDF1  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  iqd2
61 CDF1  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  AT5G22310
62 CDF1  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  AT4G31875
63 CDF1  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  AT3G60200
64 CDF1  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  AT3G45210
65 CDF1  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  AT3G56290
66 CDF1  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  AT5G65220
67 CDF1  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  ATGPX6; GPX6; LSC803; PHGPX
68 CDF1  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  AT5G39790
69 CDF1  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  AT5G66720
70 CDF1  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  AT3G53560
71 CDF1  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  AT4G32470
72 CDF1  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  AT3G51180
73 CDF1  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  DIN10; RS6
74 CDF1  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  IQD23
75 CDF1  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  AtCIB22; CIB22
76 CDF1  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  AT1G19680
77 CDF1  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  AT1G55890
78 CDF1  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  AT3G15000
79 CDF1  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  LSH4
80 CDF1  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  NGA1
81 CDF1  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  AT3G05625
82 CDF1  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  MOM; MOM; MOM1
83 CDF1  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  ADCS; emb1997
84 CDF1  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  ATKRS-2; OVA5
85 CDF1  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  CLPB-M; CLPB4; HSP98.7
86 CDF1  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  CS26
87 CDF1  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  IDI2; IPIAT1; IPP2
88 CDF1  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  AT2G20270
89 CDF1  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  ATPC2
90 CDF1  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  ERCC1; UVR7
91 CDF1  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  GDC1; LTD
92 CDF1  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  PSB27
93 CDF1  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  AT2G47210
94 CDF1  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  PPR596
95 CDF1  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  ATCOQ3; COQ3; COQ3; EMB3002
96 CDF1  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  AT1G49840
97 CDF1  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  JAZ9
98 CDF1  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  AT3G07480
99 CDF1  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  CPFTSY; FRD4
100 CDF1  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  AT2G18465
101 CDF1  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  AT3G13160
102 CDF1  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  WRKY21
103 CDF1  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  AtSS2; SS2
104 CDF1  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  AT1G54770
105 CDF1  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  AT1G04930
106 CDF1  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  AT2G26800
107 CDF1  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  ATDGK3; DGK3
108 CDF1  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  BLH8; PNF
109 CDF1  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  AT1G77400
110 CDF1  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  AT1G29810
111 CDF1  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  AT2G32840
112 CDF1  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  AT1G05860
113 CDF1  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  AT3G11590
114 CDF1  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  AT2G30540
115 CDF1  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  AT1G71970
116 CDF1  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  ATHM4; ATM4; TRX-M4
117 CDF1  --  interacts with  --  AT3G27960  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.800303) with  --  ATPERK1; PERK1
118 CDF1  --  interacts with  --  ADO3; FKF1  --  interacts with  --  ADO1; FKL2; LKP1; ZTL
119 CDF1  --  interacts with  --  ADO3; FKF1  --  interacts with  --  APRR1; AtTOC1; PRR1; TOC1
120 CDF1  --  interacts with  --  ADO3; FKF1  --  interacts with  --  APRR5; PRR5
121 CDF1  --  interacts with  --  ADO3; FKF1  --  interacts with  --  CDF3
122 CDF1  --  interacts with  --  ADO3; FKF1  --  interacts with  --  CDF2
123 CDF1  --  interacts with  --  ADO3; FKF1  --  interacts with  --  ASK13; SK13
124 CDF1  --  interacts with  --  ADO3; FKF1  --  interacts with  --  ASK12; SK12
125 CDF1  --  interacts with  --  ADO3; FKF1  --  interacts with  --  ASK3; SK3
126 CDF1  --  interacts with  --  ADO3; FKF1  --  interacts with  --  ATDI19; DI19
127 CDF1  --  interacts with  --  ADO2; LKP2  --  interacts with  --  AT2G33500
128 CDF1  --  interacts with  --  ADO2; LKP2  --  interacts with  --  AT2G47890
129 CDF1  --  interacts with  --  ADO2; LKP2  --  interacts with  --  ATCOL5; COL5
130 CDF1  --  interacts with  --  ADO2; LKP2  --  interacts with  --  ATCOL4; COL4
131 CDF1  --  interacts with  --  ADO2; LKP2  --  interacts with  --  ATCOL3; COL3
132 CDF1  --  interacts with  --  ADO2; LKP2  --  interacts with  --  ATCOL2; COL2
133 CDF1  --  interacts with  --  ADO2; LKP2  --  interacts with  --  ATCOL1; COL1
134 CDF1  --  interacts with  --  ADO2; LKP2  --  interacts with  --  AT1G28050
135 CDF1  --  interacts with  --  ADO2; LKP2  --  interacts with  --  AT1G68520
136 CDF1  --  interacts with  --  ADO2; LKP2  --  interacts with  --  ASK20; SK20
137 CDF1  --  interacts with  --  ADO2; LKP2  --  interacts with  --  ASK14; SK14
138 CDF1  --  interacts with  --  ADO2; LKP2  --  interacts with  --  ASK5; SK5
139 CDF1  --  regulates the expression of   --  CO; FG  --  regulates the expression of   --  FT?
140 CDF1  --  regulates the expression of   --  CO; FG  --  regulates the expression of   --  OBF4
141 CDF1  --  regulates the expression of   --  CO; FG  --  interacts with  --  GI
142 CDF1  --  regulates the expression of   --  CO; FG  --  interacts with  --  ATHAP2B; HAP2B; NF-YA2; UNE8
143 CDF1  --  regulates the expression of   --  CO; FG  --  interacts with  --  NF-YC3
144 CDF1  --  regulates the expression of   --  CO; FG  --  interacts with  --  CBFS
145 CDF1  --  regulates the expression of   --  CO; FG  --  interacts with  --  AT5G65683
146 CDF1  --  regulates the expression of   --  CO; FG  --  interacts with  --  AS1
147 CDF1  --  regulates the expression of   --  CO; FG  --  interacts with  --  COP1
148 CDF1  --  regulates the expression of   --  CO; FG  --  interacts with  --  NF-YB2
149 CDF1  --  regulates the expression of   --  CO; FG  --  interacts with  --  ATHAP3; ATNF-YB1; HAP3; HAP3A; NF-YB1
150 CDF1  --  regulates the expression of   --  CO; FG  --  interacts with  --  HAP5C; NF-YC9
151 CDF1  --  regulates the expression of   --  CO; FG  --  interacts with  --  ATHAP5B; HAP5B; NF-YC2
152 CDF1  --  regulates the expression of   --  CO; FG  --  interacts with  --  ATHAP5A; HAP5A; NF-YC1
153 CDF1  --  regulates the expression of   --  CO; FG  --  interacts with  --  ATSWI3B?
154 CDF1  --  regulates the expression of   --  CO; FG  --  interacts with  --  AT1G72390
155 CDF1  --  regulates the expression of   --  CO; FG  --  interacts with  --  AT3G18380
156 CDF1  --  regulates the expression of   --  CO; FG  --  interacts with  --  OBE1
157 CDF1  --  regulates the expression of   --  CO; FG  --  interacts with  --  ABI3
158 CDF1  --  regulates the expression of   --  CO; FG  --  interacts with  --  SPA4
159 CDF1  --  regulates the expression of   --  CO; FG  --  interacts with  --  SPA3
160 CDF1  --  regulates the expression of   --  CO; FG  --  interacts with  --  SPA2
161 CDF1  --  regulates the expression of   --  CO; FG  --  interacts with  --  SPA1
   Funding by the National Science Foundation    Funding by the Oklahoma Center for the Advancement of Science & Technology    Additional funding by the Samuel Roberts Noble Foundation

Copyright © The Zhao Lab

Disclaimer | Contact