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A Graph Search-Empowered Integrative Database of Arabidopsis Signaling Transduction, Metabolism and Gene Regulation Networks   
Location:  Home > Details for node PFT1
Type: Protein GRN ID: np14967 Name: PFT1
Annotation: PFT1 | phytochrome and flowering time regulatory protein (PFT1)
Gene Locus: AT1G25540
Gene Expression (Affy ATH1 probeset): 255725_at    
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 Protein modification
 Protein-protein interaction
        also include predicted relationship
 Compound-protein interaction
 TF-target gene regulation
 Small RNA-target regulation
        also include predicted relationship
 Carrier and transported molecule
 Catalytic chemical reaction
 Co-expressed gene pair
        with mutual information value >

  Ignore nodes having > relationships
 
Relationship type:  protein modification     catalytic chemical reaction     protein-protein interaction    
compound-protein interaction     TF-target gene regulation     small RNA-target regulation    
co-expressed gene pair     carrier and transported molecule     family/complex and member
Relationship evidence:  Solid line: validated          Dashed line: predicted
Relationship direction: Arrow: positive          T shape: negative          None arrow: unknown or n/a
Hormone association: Thicker line: hormone related relationship         : hormone related Node
Node type:  Transcription factor or transcriptional regulator       Compound       Kinase
 Small regulatory RNA (miRNA & ta-siRNA)       Other nodes
No. Path
2 PFT1  --  interacts with  --  ABI5
3 PFT1  --  interacts with  --  MYC3
4 PFT1  --  interacts with  --  DREB2; DREB2A
5 PFT1  --  interacts with  --  MYC4
6 PFT1  --  interacts with  --  AtbZIP; bZIP
7 PFT1  --  interacts with  --  ATERF15
8 PFT1  --  interacts with  --  AtMYB104; MYB104
9 PFT1  --  interacts with  --  ATWRKY10; MINI3; WRKY10
10 PFT1  --  interacts with  --  ORA59
11 PFT1  --  interacts with  --  ATMYC2
12 PFT1  --  interacts with  --  AT4G39070
13 PFT1  --  interacts with  --  PHL1
14 PFT1  --  interacts with  --  RRTF1
15 PFT1  --  interacts with  --  AT4G18450
16 PFT1  --  interacts with  --  ATERF1
17 PFT1  --  interacts with  --  AT3G23230
18 PFT1  --  interacts with  --  AT3G23220
19 PFT1  --  interacts with  --  RAP2.2
20 PFT1  --  interacts with  --  FLC
21 PFT1  --  interacts with  --  AT4G34040
22 PFT1  --  interacts with  --  AT2G15530
23 PFT1  --  interacts with  --  ABI5  --  regulates the expression of   --  ABI4
24 PFT1  --  interacts with  --  ABI5  --  regulates the expression of   --  ABF1 family47, transcription factor gene
25 PFT1  --  interacts with  --  ABI5  --  regulates the expression of   --  ATEM6; EM6; GEA6
26 PFT1  --  interacts with  --  ABI5  --  is regulated by  --  AtWRKY2
27 PFT1  --  interacts with  --  ABI5  --  is regulated by  --  sdir1
28 PFT1  --  interacts with  --  ABI5  --  is regulated by  --  AFP1
29 PFT1  --  interacts with  --  ABI5  --  is regulated by  --  ABI3
30 PFT1  --  interacts with  --  ABI5  --  is regulated by  --  SNRK2-3 family52, coding gene
31 PFT1  --  interacts with  --  ABI5  --  is regulated by  --  ARR6
32 PFT1  --  interacts with  --  ABI5  --  is regulated by  --  ARR5
33 PFT1  --  interacts with  --  ABI5  --  is regulated by  --  ARR4
34 PFT1  --  interacts with  --  ABI5  --  is regulated by  --  WRKY18
35 PFT1  --  interacts with  --  ABI5  --  is regulated by  --  W-BOX
36 PFT1  --  interacts with  --  ABI5  --  is regulated by  --  ATWRKY60; WRKY60
37 PFT1  --  interacts with  --  ABI5  --  is regulated by  --  HY5
38 PFT1  --  interacts with  --  ABI5  --  interacts with  --  AHG3/pp2ca
39 PFT1  --  interacts with  --  ABI5  --  interacts with  --  ATCDPK2/CPK11
40 PFT1  --  interacts with  --  ABI5  --  interacts with  --  ABF3
41 PFT1  --  interacts with  --  ABI5  --  interacts with  --  ABF1
42 PFT1  --  interacts with  --  ABI5  --  interacts with  --  AHG1
43 PFT1  --  interacts with  --  ABI5  --  interacts with  --  SNRK2-3
44 PFT1  --  interacts with  --  ABI5  --  interacts with  --  SNRK2-2
45 PFT1  --  interacts with  --  ABI5  --  interacts with  --  HAI1
46 PFT1  --  interacts with  --  ABI5  --  interacts with  --  COR27
47 PFT1  --  interacts with  --  ABI5  --  interacts with  --  CIR1; RVE2
48 PFT1  --  interacts with  --  ABI5  --  interacts with  --  AO
49 PFT1  --  interacts with  --  ABI5  --  interacts with  --  ATCAD5; CAD-5; CAD5
50 PFT1  --  interacts with  --  ABI5  --  interacts with  --  AT4G23050
51 PFT1  --  interacts with  --  ABI5  --  interacts with  --  AT4G16670
52 PFT1  --  interacts with  --  ABI5  --  interacts with  --  AT3G48510
53 PFT1  --  interacts with  --  ABI5  --  interacts with  --  AFP4; TMAC2
54 PFT1  --  interacts with  --  ABI5  --  interacts with  --  AFP2
55 PFT1  --  interacts with  --  ABI5  --  interacts with  --  AT1G10585
56 PFT1  --  interacts with  --  ABI5  --  interacts with  --  ATBZIP12; DPBF4; EEL
57 PFT1  --  interacts with  --  ABI5  --  interacts with  --  ACS10
58 PFT1  --  interacts with  --  ABI5  --  interacts with  --  DRB1
59 PFT1  --  interacts with  --  ABI5  --  interacts with  --  CCH/CHLH/GUN5
60 PFT1  --  interacts with  --  ABI5  --  interacts with  --  ATGSK1; ATSK2-3; ATSK22; BIL2; GSK1; SK22
61 PFT1  --  interacts with  --  ABI5  --  interacts with  --  ASKdZeta
62 PFT1  --  interacts with  --  ABI5  --  interacts with  --  FCA
63 PFT1  --  interacts with  --  ABI5  --  interacts with  --  AtMYB49; MYB49
64 PFT1  --  interacts with  --  ABI5  --  interacts with  --  SSP4
65 PFT1  --  interacts with  --  ABI5  --  interacts with  --  ANAC072; RD26
66 PFT1  --  interacts with  --  ABI5  --  interacts with  --  ABI1
67 PFT1  --  interacts with  --  ABI5  --  interacts with  --  AT4G25160
68 PFT1  --  interacts with  --  ABI5  --  interacts with  --  ATWNK2; WNK2; ZIK3
69 PFT1  --  interacts with  --  ABI5  --  interacts with  --  AtCLO3; CLO-3; CLO3; RD20
70 PFT1  --  interacts with  --  ABI5  --  interacts with  --  ATPP2-B11; PP2-B11
71 PFT1  --  interacts with  --  ABI5  --  interacts with  --  anac032; NAC032
72 PFT1  --  interacts with  --  ABI5  --  interacts with  --  AT1G76210
73 PFT1  --  interacts with  --  ABI5  --  interacts with  --  ATPP2-A5; PP2-A5
74 PFT1  --  interacts with  --  ABI5  --  interacts with  --  ANAC019; NAC019
75 PFT1  --  interacts with  --  ABI5  --  interacts with  --  RAP2.4
76 PFT1  --  interacts with  --  ABI5  --  interacts with  --  DCAF1
77 PFT1  --  interacts with  --  ABI5  --  interacts with  --  TAP46
78 PFT1  --  interacts with  --  ABI5  --  interacts with  --  AtFYPP1; FYPP1
79 PFT1  --  interacts with  --  ABI5  --  interacts with  --  ATSIZ1
80 PFT1  --  interacts with  --  ABI5  --  interacts with  --  KEG
81 PFT1  --  interacts with  --  ABI5  --  is modified by  --  AT5G21326
82 PFT1  --  interacts with  --  MYC3  --  interacts with  --  JAZ11
83 PFT1  --  interacts with  --  MYC3  --  interacts with  --  JAZ10
84 PFT1  --  interacts with  --  MYC3  --  interacts with  --  JAZ9
85 PFT1  --  interacts with  --  MYC3  --  interacts with  --  JAZ8
86 PFT1  --  interacts with  --  MYC3  --  interacts with  --  JAZ6
87 PFT1  --  interacts with  --  MYC3  --  interacts with  --  JAZ5
88 PFT1  --  interacts with  --  MYC3  --  interacts with  --  JAI3
89 PFT1  --  interacts with  --  MYC3  --  interacts with  --  JAZ2
90 PFT1  --  interacts with  --  MYC3  --  interacts with  --  JAZ1
91 PFT1  --  interacts with  --  MYC3  --  interacts with  --  EIL1
92 PFT1  --  interacts with  --  MYC3  --  interacts with  --  EIN3
93 PFT1  --  interacts with  --  MYC3  --  interacts with  --  ATMYB122; MYB122
94 PFT1  --  interacts with  --  MYC3  --  interacts with  --  ATMYB34; ATR1; MYB34
95 PFT1  --  interacts with  --  MYC3  --  interacts with  --  AtMYB28; HAG1; MYB28; PMG1
96 PFT1  --  interacts with  --  MYC3  --  interacts with  --  ATMYB29; MYB29; PMG2
97 PFT1  --  interacts with  --  MYC3  --  interacts with  --  AtMYB51; BW51A; BW51B; HIG1; MYB51
98 PFT1  --  interacts with  --  MYC3  --  interacts with  --  JAZ12
99 PFT1  --  interacts with  --  MYC3  --  interacts with  --  JAZ7
100 PFT1  --  interacts with  --  DREB2; DREB2A  --  interacts with  --  ATP8; AtRCD1; CEO; CEO1; RCD1
101 PFT1  --  interacts with  --  DREB2; DREB2A  --  interacts with  --  DRIP2
102 PFT1  --  interacts with  --  DREB2; DREB2A  --  interacts with  --  DRIP1
103 PFT1  --  interacts with  --  DREB2; DREB2A  --  interacts with  --  ABF2/AREB1
104 PFT1  --  interacts with  --  DREB2; DREB2A  --  interacts with  --  ABF4/AREB2
105 PFT1  --  interacts with  --  DREB2; DREB2A  --  interacts with  --  SRO1
106 PFT1  --  interacts with  --  DREB2; DREB2A  --  regulates the expression of   --  COR78; LTI140; LTI78; RD29A
107 PFT1  --  interacts with  --  MYC4  --  interacts with  --  JAZ4
108 PFT1  --  interacts with  --  ATERF15  --  is a member of  --  Family85, transcription factor gene
109 PFT1  --  interacts with  --  AtMYB104; MYB104  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.912069) with  --  AT5G25290
110 PFT1  --  interacts with  --  AtMYB104; MYB104  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.879928) with  --  AT1G44510
111 PFT1  --  interacts with  --  AtMYB104; MYB104  --  is the target gene of  --  ath-miR858b
112 PFT1  --  interacts with  --  AtMYB104; MYB104  --  is the target gene of  --  ath-miR858a
113 PFT1  --  interacts with  --  AtMYB104; MYB104  --  is the target gene of  --  ath-miR319c
114 PFT1  --  interacts with  --  AtMYB104; MYB104  --  is the target gene of  --  ath-miR159c
115 PFT1  --  interacts with  --  AtMYB104; MYB104  --  is the target gene of  --  ath-miR319b
116 PFT1  --  interacts with  --  AtMYB104; MYB104  --  is the target gene of  --  ath-miR319a
117 PFT1  --  interacts with  --  AtMYB104; MYB104  --  is the target gene of  --  ath-miR159b
118 PFT1  --  interacts with  --  AtMYB104; MYB104  --  is the target gene of  --  ath-miR159a
119 PFT1  --  interacts with  --  ORA59  --  regulates the expression of   --  PDF1.2;LCR77
120 PFT1  --  interacts with  --  ATMYC2  --  regulates the expression of   --  ATTPS11; ATTPSB; TPS11; TPS11
121 PFT1  --  interacts with  --  ATMYC2  --  regulates the expression of   --  ATTPS21; TPS21
122 PFT1  --  interacts with  --  ATMYC2  --  regulates the expression of   --  SPA1
123 PFT1  --  interacts with  --  ATMYC2  --  regulates the expression of   --  PR1 family109, coding gene
124 PFT1  --  interacts with  --  ATMYC2  --  regulates the expression of   --  ATRD22; RD22
125 PFT1  --  interacts with  --  ATMYC2  --  regulates the expression of   --  RBCS1A
126 PFT1  --  interacts with  --  ATMYC2  --  regulates the expression of   --  AB140; CAB1; CAB140; LHCB1.3
127 PFT1  --  interacts with  --  ATMYC2  --  is regulated by  --  RGA1
128 PFT1  --  interacts with  --  ATMYC2  --  interacts with  --  RGL3
129 PFT1  --  interacts with  --  ATMYC2  --  interacts with  --  RGL2
130 PFT1  --  interacts with  --  ATMYC2  --  interacts with  --  RGL
131 PFT1  --  interacts with  --  ATMYC2  --  interacts with  --  ATSWI3B?
132 PFT1  --  interacts with  --  ATMYC2  --  interacts with  --  TIC
133 PFT1  --  interacts with  --  ATMYC2  --  interacts with  --  ARD1; ATARD1
134 PFT1  --  interacts with  --  ATMYC2  --  interacts with  --  AHP5
135 PFT1  --  interacts with  --  ATMYC2  --  is a member of  --  AtMYC2 family108, transcription factor gene
136 PFT1  --  interacts with  --  AT4G39070  --  interacts with  --  COP1
137 PFT1  --  interacts with  --  PHL1  --  interacts with  --  ATSYP23; SYP23
138 PFT1  --  interacts with  --  ATERF1  --  regulates the expression of   --  ATHCHIB; B-CHI; CHI-B; HCHIB; PR-3; PR3
139 PFT1  --  interacts with  --  ATERF1  --  interacts with  --  ATBPM1; BPM1
140 PFT1  --  interacts with  --  ATERF1  --  is modified by  --  CDPK6
141 PFT1  --  interacts with  --  RAP2.2  --  interacts with  --  AT5G48240
142 PFT1  --  interacts with  --  RAP2.2  --  interacts with  --  ATCIPK14; ATSR1; CIPK14; PKS24; SnRK3.15; SR1
143 PFT1  --  interacts with  --  RAP2.2  --  interacts with  --  CIPK11; PKS5; SIP4; SNRK3.22
144 PFT1  --  interacts with  --  RAP2.2  --  interacts with  --  ATERF-8
145 PFT1  --  interacts with  --  RAP2.2  --  interacts with  --  SINAT2
146 PFT1  --  interacts with  --  FLC  --  interacts with  --  AGL22; SVP
147 PFT1  --  interacts with  --  FLC  --  interacts with  --  AGL16
148 PFT1  --  interacts with  --  FLC  --  regulates the expression of   --  SOC1
149 PFT1  --  interacts with  --  FLC  --  is regulated by  --  AT3G48430
150 PFT1  --  interacts with  --  FLC  --  is regulated by  --  CBFS
151 PFT1  --  interacts with  --  FLC  --  is regulated by  --  ATMYB67; ATY53; MYB67; MYB67
   Funding by the National Science Foundation    Funding by the Oklahoma Center for the Advancement of Science & Technology    Additional funding by the Samuel Roberts Noble Foundation

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