Screen Resolution:     
Welcome to HRGRN
A Graph Search-Empowered Integrative Database of Arabidopsis Signaling Transduction, Metabolism and Gene Regulation Networks   
Location:  Home > Details for node AT5G57910
Type: Protein GRN ID: np36540 Name:
Annotation: unknown protein; BEST Arabidopsis thaliana protein match is: unknown protein (TAIR:AT4G30630.1); Has 30201 Blast hits to 17322 proteins in 780 species: Archae - 12; Bacteria - 1396; Metazoa - 17338; Fungi - 3422; Plants - 5037; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 2996 (source: NCBI BLink).
Gene Locus: AT5G57910
Gene Expression (Affy ATH1 probeset): 247835_at    
Graph Customization
   
Choose color for highlight:  
Display edge: validated and predicted
Display node/edge prompt:
Layout:
 as format     
Data Filter
 Protein modification
 Protein-protein interaction
        also include predicted relationship
 Compound-protein interaction
 TF-target gene regulation
 Small RNA-target regulation
        also include predicted relationship
 Carrier and transported molecule
 Catalytic chemical reaction
 Co-expressed gene pair
        with mutual information value >

  Ignore nodes having > relationships
 
Relationship type:  protein modification     catalytic chemical reaction     protein-protein interaction    
compound-protein interaction     TF-target gene regulation     small RNA-target regulation    
co-expressed gene pair     carrier and transported molecule     family/complex and member
Relationship evidence:  Solid line: validated          Dashed line: predicted
Relationship direction: Arrow: positive          T shape: negative          None arrow: unknown or n/a
Hormone association: Thicker line: hormone related relationship         : hormone related Node
Node type:  Transcription factor or transcriptional regulator       Compound       Kinase
 Small regulatory RNA (miRNA & ta-siRNA)       Other nodes
No. Path
2 AT5G57910  --  interacts with  --  LSU1
3 AT5G57910  --  interacts with  --  AT4G39050
4 AT5G57910  --  interacts with  --  AT4G32190
5 AT5G57910  --  interacts with  --  ATEXO70B2; EXO70B2
6 AT5G57910  --  interacts with  --  ATPEX5; EMB2790; PEX5
7 AT5G57910  --  interacts with  --  AT3G06530
8 AT5G57910  --  interacts with  --  AT4G29930
9 AT5G57910  --  interacts with  --  AT5G25070
10 AT5G57910  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  ATSPX4; SPX4
11 AT5G57910  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  RPS18C
12 AT5G57910  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  AT4G18630
13 AT5G57910  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  AT5G22890
14 AT5G57910  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  AT5G09770
15 AT5G57910  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  VAR3
16 AT5G57910  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  AT5G23130
17 AT5G57910  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  ASHR3; SDG4
18 AT5G57910  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  AT4G26310
19 AT5G57910  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  PSAD-1
20 AT5G57910  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  ATPTEN1; PTEN1
21 AT5G57910  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  AtCIB22; CIB22
22 AT5G57910  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  VPS9B
23 AT5G57910  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  AT5G66720
24 AT5G57910  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  PBF1
25 AT5G57910  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  ful
26 AT5G57910  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  FSD2
27 AT5G57910  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  AT5G65220
28 AT5G57910  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  HMA6; PAA1
29 AT5G57910  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  AT4G28200
30 AT5G57910  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  AT5G54580
31 AT5G57910  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  AT4G36970
32 AT5G57910  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  TOE2
33 AT5G57910  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  AT5G11090
34 AT5G57910  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  AT5G65683
35 AT5G57910  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  AT4G30490
36 AT5G57910  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  AT4G12450
37 AT5G57910  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  AT5G38420
38 AT5G57910  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  AT5G02870
39 AT5G57910  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  AT4G39820
40 AT5G57910  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  AtPP2-B5; PP2-B5
41 AT5G57910  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  LSH4
42 AT5G57910  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  AT1G01440
43 AT5G57910  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  NRPB6B; NRPE6B
44 AT5G57910  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  BLH8; PNF
45 AT5G57910  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  AT2G32840
46 AT5G57910  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  AT1G11430
47 AT5G57910  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  ATGRX2; CXIP2
48 AT5G57910  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  AT2G38300
49 AT5G57910  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  AT3G06790
50 AT5G57910  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  AT2G16930
51 AT5G57910  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  AT3G13160
52 AT5G57910  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  EDS1
53 AT5G57910  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  AT3G08740
54 AT5G57910  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  NF-YA4
55 AT5G57910  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  AT1G32580
56 AT5G57910  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  AT1G06270
57 AT5G57910  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  AT3G06590
58 AT5G57910  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  AT3G28900
59 AT5G57910  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  AT2G04390
60 AT5G57910  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  ATERF12
61 AT5G57910  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  AT1G77400
62 AT5G57910  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  AT2G17880
63 AT5G57910  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  SKL2
64 AT5G57910  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  AT2G24860
65 AT5G57910  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  AT2G35240
66 AT5G57910  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  GATA24; TIFY2B; ZML1; ZML1
67 AT5G57910  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  AT2G43370
68 AT5G57910  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  AT1G53800
69 AT5G57910  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  AT1G26740
70 AT5G57910  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  AT1G71970
71 AT5G57910  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  AT1G03250
72 AT5G57910  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  AT2G26800
73 AT5G57910  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  AT1G34030
74 AT5G57910  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  ZFP7
75 AT5G57910  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  ATCFM2; CFM2
76 AT5G57910  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  AT1G75400
77 AT5G57910  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  AT1G31050
78 AT5G57910  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  AT1G49850
79 AT5G57910  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  AT3G13310
80 AT5G57910  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  AT3G05625
81 AT5G57910  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  AtSS2; SS2
82 AT5G57910  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  JAZ9
83 AT5G57910  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  AT3G07480
84 AT5G57910  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  ENA
85 AT5G57910  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  JAZ1
86 AT5G57910  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  PAB3
87 AT5G57910  --  interacts with  --  AT4G39050  --  interacts with  --  KAN; KAN1
88 AT5G57910  --  interacts with  --  AT4G39050  --  interacts with  --  AT5G37550
89 AT5G57910  --  interacts with  --  AT4G39050  --  interacts with  --  VPS20.2
90 AT5G57910  --  interacts with  --  AT4G39050  --  interacts with  --  AT5G58950
91 AT5G57910  --  interacts with  --  AT4G39050  --  interacts with  --  ATPUB49; PUB49
92 AT5G57910  --  interacts with  --  AT4G39050  --  interacts with  --  AT5G63350
93 AT5G57910  --  interacts with  --  AT4G39050  --  interacts with  --  AT5G49210
94 AT5G57910  --  interacts with  --  AT4G39050  --  interacts with  --  AT1G55890
95 AT5G57910  --  interacts with  --  AT4G39050  --  interacts with  --  AT1G31870
96 AT5G57910  --  interacts with  --  AT4G39050  --  interacts with  --  TTL3; VIT
97 AT5G57910  --  interacts with  --  AT4G39050  --  interacts with  --  AT1G71020
98 AT5G57910  --  interacts with  --  AT4G39050  --  interacts with  --  CYCA2;3
99 AT5G57910  --  interacts with  --  AT4G39050  --  interacts with  --  CIPK9; PKS6; SnRK3.12
100 AT5G57910  --  interacts with  --  AT4G39050  --  interacts with  --  ATSIG6; SIG6; SIGF; SOLDAT8
101 AT5G57910  --  interacts with  --  AT4G39050  --  interacts with  --  AT1G48280
102 AT5G57910  --  interacts with  --  AT4G39050  --  interacts with  --  AT4G33920
103 AT5G57910  --  interacts with  --  AT4G39050  --  interacts with  --  AT2G39100
104 AT5G57910  --  interacts with  --  AT4G39050  --  interacts with  --  AT1G03140
105 AT5G57910  --  interacts with  --  AT4G39050  --  interacts with  --  AT3G60200
106 AT5G57910  --  interacts with  --  AT4G39050  --  interacts with  --  AT4G32590
107 AT5G57910  --  interacts with  --  AT4G39050  --  interacts with  --  PYM; UVI4
108 AT5G57910  --  interacts with  --  AT4G39050  --  interacts with  --  MOS1
109 AT5G57910  --  interacts with  --  AT4G39050  --  interacts with  --  AT2G17670
110 AT5G57910  --  interacts with  --  AT4G39050  --  interacts with  --  AT1G61590
111 AT5G57910  --  interacts with  --  AT4G39050  --  interacts with  --  ATHM4; ATM4; TRX-M4
112 AT5G57910  --  interacts with  --  AT4G39050  --  interacts with  --  DRIP2
113 AT5G57910  --  interacts with  --  AT4G39050  --  interacts with  --  AT3G13227
114 AT5G57910  --  interacts with  --  AT4G39050  --  interacts with  --  ATG8D
115 AT5G57910  --  interacts with  --  AT4G39050  --  interacts with  --  AT4G28230
116 AT5G57910  --  interacts with  --  AT4G39050  --  interacts with  --  AT3G24740
117 AT5G57910  --  interacts with  --  AT4G32190  --  interacts with  --  AT5G65495
118 AT5G57910  --  interacts with  --  AT4G32190  --  interacts with  --  TIFY8
119 AT5G57910  --  interacts with  --  AT4G32190  --  interacts with  --  AT5G52650
120 AT5G57910  --  interacts with  --  AT4G32190  --  interacts with  --  AT5G09450
121 AT5G57910  --  interacts with  --  AT4G32190  --  interacts with  --  AT5G59210
122 AT5G57910  --  interacts with  --  AT4G32190  --  interacts with  --  OBF5
123 AT5G57910  --  interacts with  --  AT4G32190  --  interacts with  --  PSL4
124 AT5G57910  --  interacts with  --  AT4G32190  --  interacts with  --  AtMYB51; BW51A; BW51B; HIG1; MYB51
125 AT5G57910  --  interacts with  --  AT4G32190  --  interacts with  --  AT1G68590
126 AT5G57910  --  interacts with  --  AT4G32190  --  interacts with  --  AT3G27420
127 AT5G57910  --  interacts with  --  AT4G32190  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD
128 AT5G57910  --  interacts with  --  AT4G32190  --  interacts with  --  ATMAP70-5; MAP70-5
129 AT5G57910  --  interacts with  --  AT4G32190  --  interacts with  --  ATHSP23.6-MITO; HSP23.6-MITO
130 AT5G57910  --  interacts with  --  AT4G32190  --  interacts with  --  ATMAP70-2; MAP70-2
131 AT5G57910  --  interacts with  --  AT4G32190  --  interacts with  --  AT4G17680
132 AT5G57910  --  interacts with  --  AT4G32190  --  interacts with  --  AT3G22440
133 AT5G57910  --  interacts with  --  AT4G32190  --  interacts with  --  BLH1; EDA29
134 AT5G57910  --  interacts with  --  AT4G32190  --  interacts with  --  AT1G01630
135 AT5G57910  --  interacts with  --  AT4G32190  --  interacts with  --  AT3G04860
136 AT5G57910  --  interacts with  --  AT4G32190  --  interacts with  --  AT1G07840
137 AT5G57910  --  interacts with  --  AT4G32190  --  interacts with  --  AT4G14900
138 AT5G57910  --  interacts with  --  AT4G32190  --  interacts with  --  AT1G19010
139 AT5G57910  --  interacts with  --  AT4G32190  --  interacts with  --  AT1G15385
140 AT5G57910  --  interacts with  --  AT4G32190  --  interacts with  --  ATCYTC-A; CYTC-1
141 AT5G57910  --  interacts with  --  AT4G32190  --  interacts with  --  ATDGK3; DGK3
142 AT5G57910  --  interacts with  --  AT4G32190  --  interacts with  --  TRFL5
143 AT5G57910  --  interacts with  --  AT4G32190  --  interacts with  --  AT1G25420
144 AT5G57910  --  interacts with  --  AT4G32190  --  interacts with  --  AT3G08780
145 AT5G57910  --  interacts with  --  ATEXO70B2; EXO70B2  --  interacts with  --  ATGPX5; GPX5; MEE42
146 AT5G57910  --  interacts with  --  ATEXO70B2; EXO70B2  --  interacts with  --  AT1G29640
147 AT5G57910  --  interacts with  --  ATEXO70B2; EXO70B2  --  interacts with  --  AT5G67130
148 AT5G57910  --  interacts with  --  ATEXO70B2; EXO70B2  --  interacts with  --  AT3G07680
149 AT5G57910  --  interacts with  --  ATEXO70B2; EXO70B2  --  interacts with  --  PUB22
150 AT5G57910  --  interacts with  --  ATEXO70B2; EXO70B2  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.914003) with  --  EVR; SOBIR1
151 AT5G57910  --  interacts with  --  ATEXO70B2; EXO70B2  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.9351) with  --  ATSNAP33; ATSNAP33B; SNAP33; SNP33
152 AT5G57910  --  interacts with  --  ATPEX5; EMB2790; PEX5  --  interacts with  --  ATPEX7; PEX7
153 AT5G57910  --  interacts with  --  ATPEX5; EMB2790; PEX5  --  interacts with  --  ATPEX14; PED2; PEX14
154 AT5G57910  --  interacts with  --  ATPEX5; EMB2790; PEX5  --  interacts with  --  AT5G65480
155 AT5G57910  --  interacts with  --  ATPEX5; EMB2790; PEX5  --  interacts with  --  AT5G57840
156 AT5G57910  --  interacts with  --  ATPEX5; EMB2790; PEX5  --  interacts with  --  ATLACS7; LACS7
157 AT5G57910  --  interacts with  --  ATPEX5; EMB2790; PEX5  --  interacts with  --  QWRF1; SCO3
158 AT5G57910  --  interacts with  --  ATPEX5; EMB2790; PEX5  --  interacts with  --  AT-SO; AtSO; SOX
159 AT5G57910  --  interacts with  --  ATPEX5; EMB2790; PEX5  --  interacts with  --  AT3G14420
160 AT5G57910  --  interacts with  --  ATPEX5; EMB2790; PEX5  --  interacts with  --  AT2G33520
161 AT5G57910  --  interacts with  --  ATPEX5; EMB2790; PEX5  --  interacts with  --  HAP1; MAGO; MEE63
162 AT5G57910  --  interacts with  --  ATPEX5; EMB2790; PEX5  --  interacts with  --  CAT1
163 AT5G57910  --  interacts with  --  AT3G06530  --  interacts with  --  AT3G24120
164 AT5G57910  --  interacts with  --  AT3G06530  --  interacts with  --  CSN6B
165 AT5G57910  --  interacts with  --  AT3G06530  --  interacts with  --  AT5G03500
166 AT5G57910  --  interacts with  --  AT3G06530  --  interacts with  --  AT4G27090
167 AT5G57910  --  interacts with  --  AT3G06530  --  interacts with  --  AT1G20770
168 AT5G57910  --  interacts with  --  AT3G06530  --  interacts with  --  EMB2819
169 AT5G57910  --  interacts with  --  AT3G06530  --  interacts with  --  AT2G32980
170 AT5G57910  --  interacts with  --  AT3G06530  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.912936) with  --  AT2G18220
171 AT5G57910  --  interacts with  --  AT3G06530  --  has similar expression pattern (mutual information value=1.10821) with  --  PPR596
172 AT5G57910  --  interacts with  --  AT3G06530  --  has similar expression pattern (mutual information value=1.02319) with  --  AtHsp90-6; AtHsp90.6; Hsp89.1
173 AT5G57910  --  interacts with  --  AT3G06530  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.92543) with  --  EMB2788
174 AT5G57910  --  interacts with  --  AT3G06530  --  has similar expression pattern (mutual information value=1.11364) with  --  ATHD2A; HD2A; HDA3; HDT1
175 AT5G57910  --  interacts with  --  AT3G06530  --  has similar expression pattern (mutual information value=1.05177) with  --  NRPA1
176 AT5G57910  --  interacts with  --  AT3G06530  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.957246) with  --  AT5G06550
177 AT5G57910  --  interacts with  --  AT3G06530  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.946596) with  --  AT5G14580
178 AT5G57910  --  interacts with  --  AT4G29930  --  interacts with  --  bHLH071
179 AT5G57910  --  interacts with  --  AT4G29930  --  interacts with  --  AT4G32960
180 AT5G57910  --  interacts with  --  AT4G29930  --  interacts with  --  ATWRKY75; WRKY75
181 AT5G57910  --  interacts with  --  AT4G29930  --  interacts with  --  AT5G10710
182 AT5G57910  --  interacts with  --  AT4G29930  --  interacts with  --  AT3G58380
183 AT5G57910  --  interacts with  --  AT4G29930  --  interacts with  --  AT3G13350
184 AT5G57910  --  interacts with  --  AT4G29930  --  interacts with  --  PSAD-2
185 AT5G57910  --  interacts with  --  AT4G29930  --  interacts with  --  CAO; CPSRP43
186 AT5G57910  --  interacts with  --  AT4G29930  --  interacts with  --  APL; WDY
187 AT5G57910  --  interacts with  --  AT4G29930  --  interacts with  --  AT4G37850
188 AT5G57910  --  interacts with  --  AT5G25070  --  interacts with  --  WPP2
   Funding by the National Science Foundation    Funding by the Oklahoma Center for the Advancement of Science & Technology    Additional funding by the Samuel Roberts Noble Foundation

Copyright © The Zhao Lab

Disclaimer | Contact