Screen Resolution:     
Welcome to HRGRN
A Graph Search-Empowered Integrative Database of Arabidopsis Signaling Transduction, Metabolism and Gene Regulation Networks   
Location:  Home > Details for node VAR3
Type: Protein GRN ID: np37390 Name: VAR3
Annotation: VAR3 | zinc finger (Ran-binding) family protein
Gene Locus: AT5G17790
Gene Expression (Affy ATH1 probeset): 250050_at    
Graph Customization
   
Choose color for highlight:  
Display edge: validated and predicted
Display node/edge prompt:
Layout:
 as format     
Data Filter
 Protein modification
 Protein-protein interaction
        also include predicted relationship
 Compound-protein interaction
 TF-target gene regulation
 Small RNA-target regulation
        also include predicted relationship
 Carrier and transported molecule
 Catalytic chemical reaction
 Co-expressed gene pair
        with mutual information value >

  Ignore nodes having > relationships
 
Relationship type:  protein modification     catalytic chemical reaction     protein-protein interaction    
compound-protein interaction     TF-target gene regulation     small RNA-target regulation    
co-expressed gene pair     carrier and transported molecule     family/complex and member
Relationship evidence:  Solid line: validated          Dashed line: predicted
Relationship direction: Arrow: positive          T shape: negative          None arrow: unknown or n/a
Hormone association: Thicker line: hormone related relationship         : hormone related Node
Node type:  Transcription factor or transcriptional regulator       Compound       Kinase
 Small regulatory RNA (miRNA & ta-siRNA)       Other nodes
No. Path
2 VAR3  --  interacts with  --  LSU2
3 VAR3  --  interacts with  --  NCED4
4 VAR3  --  interacts with  --  ICR1; RIP1
5 VAR3  --  interacts with  --  CRR28
6 VAR3  --  interacts with  --  EMB3102; OTP82
7 VAR3  --  interacts with  --  AT3G27960
8 VAR3  --  interacts with  --  LSU1
9 VAR3  --  interacts with  --  ZFP7
10 VAR3  --  interacts with  --  AT1G51580
11 VAR3  --  interacts with  --  LSU2  --  interacts with  --  AT5G38420
12 VAR3  --  interacts with  --  LSU2  --  interacts with  --  AT5G65683
13 VAR3  --  interacts with  --  LSU2  --  interacts with  --  FSD2
14 VAR3  --  interacts with  --  LSU2  --  interacts with  --  KAN; KAN1
15 VAR3  --  interacts with  --  LSU2  --  interacts with  --  ATMGD3; MGD3; MGDC
16 VAR3  --  interacts with  --  LSU2  --  interacts with  --  AT1G29120
17 VAR3  --  interacts with  --  LSU2  --  interacts with  --  AT1G05860
18 VAR3  --  interacts with  --  LSU2  --  interacts with  --  AT2G32840
19 VAR3  --  interacts with  --  LSU2  --  interacts with  --  AT5G11090
20 VAR3  --  interacts with  --  LSU2  --  interacts with  --  AT5G18800
21 VAR3  --  interacts with  --  LSU2  --  interacts with  --  AT1G77400
22 VAR3  --  interacts with  --  LSU2  --  interacts with  --  AT1G54770
23 VAR3  --  interacts with  --  LSU2  --  interacts with  --  ATERF12
24 VAR3  --  interacts with  --  LSU2  --  interacts with  --  AT2G44970
25 VAR3  --  interacts with  --  LSU2  --  interacts with  --  RECA3
26 VAR3  --  interacts with  --  LSU2  --  interacts with  --  AT3G15160
27 VAR3  --  interacts with  --  LSU2  --  interacts with  --  AT1G04930
28 VAR3  --  interacts with  --  LSU2  --  interacts with  --  AT3G07310
29 VAR3  --  interacts with  --  LSU2  --  interacts with  --  AT3G60200
30 VAR3  --  interacts with  --  LSU2  --  interacts with  --  AT2G43370
31 VAR3  --  interacts with  --  LSU2  --  interacts with  --  PSAD-1
32 VAR3  --  interacts with  --  LSU2  --  interacts with  --  JAZ1
33 VAR3  --  interacts with  --  LSU2  --  interacts with  --  PBF1
34 VAR3  --  interacts with  --  LSU2  --  interacts with  --  AT2G39100
35 VAR3  --  interacts with  --  LSU2  --  interacts with  --  ATORC2; ORC2
36 VAR3  --  interacts with  --  LSU2  --  interacts with  --  PYM; UVI4
37 VAR3  --  interacts with  --  LSU2  --  interacts with  --  AT3G43980
38 VAR3  --  interacts with  --  LSU2  --  interacts with  --  AT4G36680
39 VAR3  --  interacts with  --  LSU2  --  interacts with  --  BLH8; PNF
40 VAR3  --  interacts with  --  LSU2  --  interacts with  --  AT1G49850
41 VAR3  --  interacts with  --  LSU2  --  interacts with  --  ATDGK3; DGK3
42 VAR3  --  interacts with  --  LSU2  --  interacts with  --  AT3G07440
43 VAR3  --  interacts with  --  LSU2  --  interacts with  --  AT3G11590
44 VAR3  --  interacts with  --  LSU2  --  interacts with  --  AT1G53800
45 VAR3  --  interacts with  --  LSU2  --  interacts with  --  AT2G38300
46 VAR3  --  interacts with  --  NCED4  --  interacts with  --  ATSERAT1;1; SAT-52; SAT5; SERAT1;1
47 VAR3  --  interacts with  --  NCED4  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.934672) with  --  PIFI
48 VAR3  --  interacts with  --  NCED4  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.854796) with  --  PGR5-LIKE A
49 VAR3  --  interacts with  --  NCED4  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.868264) with  --  ACD1-LIKE; PTC52; TIC55-IV
50 VAR3  --  interacts with  --  NCED4  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.846391) with  --  LHCA1
51 VAR3  --  interacts with  --  NCED4  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.889075) with  --  AT3G62550
52 VAR3  --  interacts with  --  NCED4  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.851474) with  --  ATFRO6; FRO6; FRO6
53 VAR3  --  interacts with  --  NCED4  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.851474) with  --  ATFRO7; FRO7
54 VAR3  --  interacts with  --  NCED4  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.853957) with  --  AT5G35170
55 VAR3  --  interacts with  --  NCED4  --  has product (in catalytic reaction)  --  C25-Epoxy-apo-aldehyde
56 VAR3  --  interacts with  --  NCED4  --  has product (in catalytic reaction)  --  12'-apo-Carotenal
57 VAR3  --  interacts with  --  NCED4  --  has product (in catalytic reaction)  --  xanthoxin
58 VAR3  --  interacts with  --  NCED4  --  is a member of  --  ATNCED3 family40, coding gene
59 VAR3  --  interacts with  --  ICR1; RIP1  --  interacts with  --  SEC3A
60 VAR3  --  interacts with  --  ICR1; RIP1  --  interacts with  --  ARAC11; ATRAC11; ATROP1; ROP1; ROP1AT
61 VAR3  --  interacts with  --  ICR1; RIP1  --  interacts with  --  AT4G24840
62 VAR3  --  interacts with  --  ICR1; RIP1  --  interacts with  --  AT3G11460
63 VAR3  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  AT3G52050
64 VAR3  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  AT5G37550
65 VAR3  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  DRB5
66 VAR3  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  VPS9B
67 VAR3  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  AT4G00980
68 VAR3  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  AT3G54826
69 VAR3  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  AT5G09770
70 VAR3  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  AT4G26910
71 VAR3  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  AT4G20300
72 VAR3  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  AT4G30490
73 VAR3  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  iqd2
74 VAR3  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  AT5G22310
75 VAR3  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  AT4G31875
76 VAR3  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  AT3G45210
77 VAR3  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  AT3G56290
78 VAR3  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  AT5G65220
79 VAR3  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  ATGPX6; GPX6; LSC803; PHGPX
80 VAR3  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  AT5G39790
81 VAR3  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  AT5G66720
82 VAR3  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  AT3G53560
83 VAR3  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  AT4G32470
84 VAR3  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  CDF1
85 VAR3  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  AT3G51180
86 VAR3  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  DIN10; RS6
87 VAR3  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  IQD23
88 VAR3  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  AtCIB22; CIB22
89 VAR3  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  AT1G19680
90 VAR3  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  AT1G55890
91 VAR3  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  AT3G15000
92 VAR3  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  LSH4
93 VAR3  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  NGA1
94 VAR3  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  AT3G05625
95 VAR3  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  MOM; MOM; MOM1
96 VAR3  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  ADCS; emb1997
97 VAR3  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  ATKRS-2; OVA5
98 VAR3  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  CLPB-M; CLPB4; HSP98.7
99 VAR3  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  CS26
100 VAR3  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  IDI2; IPIAT1; IPP2
101 VAR3  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  AT2G20270
102 VAR3  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  ATPC2
103 VAR3  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  ERCC1; UVR7
104 VAR3  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  GDC1; LTD
105 VAR3  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  PSB27
106 VAR3  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  AT2G47210
107 VAR3  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  PPR596
108 VAR3  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  ATCOQ3; COQ3; COQ3; EMB3002
109 VAR3  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  AT1G49840
110 VAR3  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  JAZ9
111 VAR3  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  AT3G07480
112 VAR3  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  CPFTSY; FRD4
113 VAR3  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  AT2G18465
114 VAR3  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  AT3G13160
115 VAR3  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  WRKY21
116 VAR3  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  AtSS2; SS2
117 VAR3  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  AT2G26800
118 VAR3  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  AT1G29810
119 VAR3  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  AT2G30540
120 VAR3  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  AT1G71970
121 VAR3  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  ATHM4; ATM4; TRX-M4
122 VAR3  --  interacts with  --  AT3G27960  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.800303) with  --  ATPERK1; PERK1
123 VAR3  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  ATSPX4; SPX4
124 VAR3  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  RPS18C
125 VAR3  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  AT4G18630
126 VAR3  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  AT5G57910
127 VAR3  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  AT5G22890
128 VAR3  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  AT5G23130
129 VAR3  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  ASHR3; SDG4
130 VAR3  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  AT4G26310
131 VAR3  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  ATPTEN1; PTEN1
132 VAR3  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  ful
133 VAR3  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  HMA6; PAA1
134 VAR3  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  AT4G28200
135 VAR3  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  AT5G54580
136 VAR3  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  AT4G36970
137 VAR3  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  TOE2
138 VAR3  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  AT4G12450
139 VAR3  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  AT5G02870
140 VAR3  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  AT4G39820
141 VAR3  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  AtPP2-B5; PP2-B5
142 VAR3  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  AT1G01440
143 VAR3  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  NRPB6B; NRPE6B
144 VAR3  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  AT1G11430
145 VAR3  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  ATGRX2; CXIP2
146 VAR3  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  AT3G06790
147 VAR3  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  AT2G16930
148 VAR3  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  EDS1
149 VAR3  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  AT3G08740
150 VAR3  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  NF-YA4
151 VAR3  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  AT1G32580
152 VAR3  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  AT1G06270
153 VAR3  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  AT3G06590
154 VAR3  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  AT3G28900
155 VAR3  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  AT2G04390
156 VAR3  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  AT2G17880
157 VAR3  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  SKL2
158 VAR3  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  AT2G24860
159 VAR3  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  AT2G35240
160 VAR3  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  GATA24; TIFY2B; ZML1; ZML1
161 VAR3  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  AT1G26740
162 VAR3  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  AT1G03250
163 VAR3  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  AT1G34030
164 VAR3  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  ATCFM2; CFM2
165 VAR3  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  AT1G75400
166 VAR3  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  AT1G31050
167 VAR3  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  AT3G13310
168 VAR3  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  ENA
169 VAR3  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  PAB3
170 VAR3  --  interacts with  --  ZFP7  --  interacts with  --  PTF1; TCP13; TFPD
171 VAR3  --  interacts with  --  ZFP7  --  interacts with  --  AT5G51910
172 VAR3  --  interacts with  --  ZFP7  --  interacts with  --  AtTCP11; TCP11
173 VAR3  --  interacts with  --  ZFP7  --  interacts with  --  MARD1
174 VAR3  --  interacts with  --  ZFP7  --  interacts with  --  RFI2
175 VAR3  --  interacts with  --  ZFP7  --  interacts with  --  AT5G22355
176 VAR3  --  interacts with  --  AT1G51580  --  interacts with  --  AT1G69170
177 VAR3  --  interacts with  --  AT1G51580  --  interacts with  --  AT3G13224
178 VAR3  --  interacts with  --  AT1G51580  --  interacts with  --  ECT1
179 VAR3  --  interacts with  --  AT1G51580  --  interacts with  --  BLH1; EDA29
180 VAR3  --  interacts with  --  AT1G51580  --  interacts with  --  EBF1
181 VAR3  --  interacts with  --  AT1G51580  --  interacts with  --  AtTCP15; TCP15
182 VAR3  --  interacts with  --  AT1G51580  --  interacts with  --  AT3G55290
   Funding by the National Science Foundation    Funding by the Oklahoma Center for the Advancement of Science & Technology    Additional funding by the Samuel Roberts Noble Foundation

Copyright © The Zhao Lab

Disclaimer | Contact