Screen Resolution:     
Welcome to HRGRN
A Graph Search-Empowered Integrative Database of Arabidopsis Signaling Transduction, Metabolism and Gene Regulation Networks   
Location:  Home > Details for node LSH4
Type: Protein GRN ID: np27136 Name: LSH4
Annotation: LSH4 | Protein of unknown function (DUF640)
Gene Locus: AT3G23290
Gene Expression (Affy ATH1 probeset): 258288_at    256942_at    
Graph Customization
   
Choose color for highlight:  
Display edge: validated and predicted
Display node/edge prompt:
Layout:
 as format     
Data Filter
 Protein modification
 Protein-protein interaction
        also include predicted relationship
 Compound-protein interaction
 TF-target gene regulation
 Small RNA-target regulation
        also include predicted relationship
 Carrier and transported molecule
 Catalytic chemical reaction
 Co-expressed gene pair
        with mutual information value >

  Ignore nodes having > relationships
 
Relationship type:  protein modification     catalytic chemical reaction     protein-protein interaction    
compound-protein interaction     TF-target gene regulation     small RNA-target regulation    
co-expressed gene pair     carrier and transported molecule     family/complex and member
Relationship evidence:  Solid line: validated          Dashed line: predicted
Relationship direction: Arrow: positive          T shape: negative          None arrow: unknown or n/a
Hormone association: Thicker line: hormone related relationship         : hormone related Node
Node type:  Transcription factor or transcriptional regulator       Compound       Kinase
 Small regulatory RNA (miRNA & ta-siRNA)       Other nodes
No. Path
2 LSH4  --  interacts with  --  AT3G27960
3 LSH4  --  interacts with  --  LSU1
4 LSH4  --  interacts with  --  Fes1C
5 LSH4  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  KAN; KAN1
6 LSH4  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  AT3G52050
7 LSH4  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  AT5G37550
8 LSH4  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  DRB5
9 LSH4  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  VPS9B
10 LSH4  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  AT4G00980
11 LSH4  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  AT3G54826
12 LSH4  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  AT5G11090
13 LSH4  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  AT5G38420
14 LSH4  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  AT5G09770
15 LSH4  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  VAR3
16 LSH4  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  AT4G26910
17 LSH4  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  AT4G20300
18 LSH4  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  AT4G30490
19 LSH4  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  iqd2
20 LSH4  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  AT5G22310
21 LSH4  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  AT4G31875
22 LSH4  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  AT3G60200
23 LSH4  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  AT3G45210
24 LSH4  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  AT3G56290
25 LSH4  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  AT5G65220
26 LSH4  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  ATGPX6; GPX6; LSC803; PHGPX
27 LSH4  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  AT5G39790
28 LSH4  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  AT5G66720
29 LSH4  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  AT3G53560
30 LSH4  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  AT4G32470
31 LSH4  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  CDF1
32 LSH4  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  AT3G51180
33 LSH4  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  DIN10; RS6
34 LSH4  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  IQD23
35 LSH4  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  AtCIB22; CIB22
36 LSH4  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  AT1G19680
37 LSH4  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  AT1G55890
38 LSH4  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  AT3G15000
39 LSH4  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  NGA1
40 LSH4  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  AT3G05625
41 LSH4  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  MOM; MOM; MOM1
42 LSH4  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  ADCS; emb1997
43 LSH4  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  ATKRS-2; OVA5
44 LSH4  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  CLPB-M; CLPB4; HSP98.7
45 LSH4  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  CS26
46 LSH4  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  IDI2; IPIAT1; IPP2
47 LSH4  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  AT2G20270
48 LSH4  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  ATPC2
49 LSH4  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  ERCC1; UVR7
50 LSH4  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  GDC1; LTD
51 LSH4  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  PSB27
52 LSH4  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  AT2G47210
53 LSH4  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  PPR596
54 LSH4  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  ATCOQ3; COQ3; COQ3; EMB3002
55 LSH4  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  AT1G49840
56 LSH4  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  JAZ9
57 LSH4  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  AT3G07480
58 LSH4  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  CPFTSY; FRD4
59 LSH4  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  AT2G18465
60 LSH4  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  AT3G13160
61 LSH4  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  WRKY21
62 LSH4  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  AtSS2; SS2
63 LSH4  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  AT1G54770
64 LSH4  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  AT1G04930
65 LSH4  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  AT2G26800
66 LSH4  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  ATDGK3; DGK3
67 LSH4  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  BLH8; PNF
68 LSH4  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  AT1G77400
69 LSH4  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  AT1G29810
70 LSH4  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  ZFP7
71 LSH4  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  AT2G32840
72 LSH4  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  AT1G05860
73 LSH4  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  AT3G11590
74 LSH4  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  AT2G30540
75 LSH4  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  AT1G71970
76 LSH4  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  ATHM4; ATM4; TRX-M4
77 LSH4  --  interacts with  --  AT3G27960  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.800303) with  --  ATPERK1; PERK1
78 LSH4  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  ATSPX4; SPX4
79 LSH4  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  RPS18C
80 LSH4  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  AT4G18630
81 LSH4  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  AT5G57910
82 LSH4  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  AT5G22890
83 LSH4  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  AT5G23130
84 LSH4  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  ASHR3; SDG4
85 LSH4  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  AT4G26310
86 LSH4  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  PSAD-1
87 LSH4  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  ATPTEN1; PTEN1
88 LSH4  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  PBF1
89 LSH4  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  ful
90 LSH4  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  FSD2
91 LSH4  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  HMA6; PAA1
92 LSH4  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  AT4G28200
93 LSH4  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  AT5G54580
94 LSH4  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  AT4G36970
95 LSH4  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  TOE2
96 LSH4  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  AT5G65683
97 LSH4  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  AT4G12450
98 LSH4  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  AT5G02870
99 LSH4  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  AT4G39820
100 LSH4  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  AtPP2-B5; PP2-B5
101 LSH4  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  AT1G01440
102 LSH4  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  NRPB6B; NRPE6B
103 LSH4  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  AT1G11430
104 LSH4  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  ATGRX2; CXIP2
105 LSH4  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  AT2G38300
106 LSH4  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  AT3G06790
107 LSH4  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  AT2G16930
108 LSH4  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  EDS1
109 LSH4  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  AT3G08740
110 LSH4  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  NF-YA4
111 LSH4  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  AT1G32580
112 LSH4  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  AT1G06270
113 LSH4  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  AT3G06590
114 LSH4  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  AT3G28900
115 LSH4  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  AT2G04390
116 LSH4  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  ATERF12
117 LSH4  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  AT2G17880
118 LSH4  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  SKL2
119 LSH4  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  AT2G24860
120 LSH4  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  AT2G35240
121 LSH4  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  GATA24; TIFY2B; ZML1; ZML1
122 LSH4  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  AT2G43370
123 LSH4  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  AT1G53800
124 LSH4  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  AT1G26740
125 LSH4  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  AT1G03250
126 LSH4  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  AT1G34030
127 LSH4  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  ATCFM2; CFM2
128 LSH4  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  AT1G75400
129 LSH4  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  AT1G31050
130 LSH4  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  AT1G49850
131 LSH4  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  AT3G13310
132 LSH4  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  ENA
133 LSH4  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  JAZ1
134 LSH4  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  PAB3
135 LSH4  --  interacts with  --  Fes1C  --  interacts with  --  AT5G63200
136 LSH4  --  interacts with  --  Fes1C  --  interacts with  --  CYTC-2
137 LSH4  --  interacts with  --  Fes1C  --  interacts with  --  AT1G28135
138 LSH4  --  interacts with  --  Fes1C  --  interacts with  --  AT3G15160
139 LSH4  --  interacts with  --  Fes1C  --  interacts with  --  AT1G15385
   Funding by the National Science Foundation    Funding by the Oklahoma Center for the Advancement of Science & Technology    Additional funding by the Samuel Roberts Noble Foundation

Copyright © The Zhao Lab

Disclaimer | Contact