Screen Resolution:     
Welcome to HRGRN
A Graph Search-Empowered Integrative Database of Arabidopsis Signaling Transduction, Metabolism and Gene Regulation Networks   
Location:  Home > Details for node AT1G48280
Type: Protein GRN ID: np16477 Name:
Annotation: hydroxyproline-rich glycoprotein family protein
Gene Locus: AT1G48280
Gene Expression (Affy ATH1 probeset): 262250_at    
Graph Customization
   
Choose color for highlight:  
Display edge: validated and predicted
Display node/edge prompt:
Layout:
 as format     
Data Filter
 Protein modification
 Protein-protein interaction
        also include predicted relationship
 Compound-protein interaction
 TF-target gene regulation
 Small RNA-target regulation
        also include predicted relationship
 Carrier and transported molecule
 Catalytic chemical reaction
 Co-expressed gene pair
        with mutual information value >

  Ignore nodes having > relationships
 
Relationship type:  protein modification     catalytic chemical reaction     protein-protein interaction    
compound-protein interaction     TF-target gene regulation     small RNA-target regulation    
co-expressed gene pair     carrier and transported molecule     family/complex and member
Relationship evidence:  Solid line: validated          Dashed line: predicted
Relationship direction: Arrow: positive          T shape: negative          None arrow: unknown or n/a
Hormone association: Thicker line: hormone related relationship         : hormone related Node
Node type:  Transcription factor or transcriptional regulator       Compound       Kinase
 Small regulatory RNA (miRNA & ta-siRNA)       Other nodes
No. Path
2 AT1G48280  --  interacts with  --  AT4G39050
3 AT1G48280  --  interacts with  --  AT3G11590
4 AT1G48280  --  interacts with  --  ATHSP23.6-MITO; HSP23.6-MITO
5 AT1G48280  --  interacts with  --  AT4G39050  --  interacts with  --  KAN; KAN1
6 AT1G48280  --  interacts with  --  AT4G39050  --  interacts with  --  AT5G37550
7 AT1G48280  --  interacts with  --  AT4G39050  --  interacts with  --  VPS20.2
8 AT1G48280  --  interacts with  --  AT4G39050  --  interacts with  --  AT5G58950
9 AT1G48280  --  interacts with  --  AT4G39050  --  interacts with  --  AT5G57910
10 AT1G48280  --  interacts with  --  AT4G39050  --  interacts with  --  AT5G22890
11 AT1G48280  --  interacts with  --  AT4G39050  --  interacts with  --  AT5G11090
12 AT1G48280  --  interacts with  --  AT4G39050  --  interacts with  --  ATPUB49; PUB49
13 AT1G48280  --  interacts with  --  AT4G39050  --  interacts with  --  AT5G63350
14 AT1G48280  --  interacts with  --  AT4G39050  --  interacts with  --  AT5G49210
15 AT1G48280  --  interacts with  --  AT4G39050  --  interacts with  --  AT1G55890
16 AT1G48280  --  interacts with  --  AT4G39050  --  interacts with  --  AT1G31870
17 AT1G48280  --  interacts with  --  AT4G39050  --  interacts with  --  ATCFM2; CFM2
18 AT1G48280  --  interacts with  --  AT4G39050  --  interacts with  --  AT2G35240
19 AT1G48280  --  interacts with  --  AT4G39050  --  interacts with  --  TTL3; VIT
20 AT1G48280  --  interacts with  --  AT4G39050  --  interacts with  --  AT1G71020
21 AT1G48280  --  interacts with  --  AT4G39050  --  interacts with  --  AT2G43370
22 AT1G48280  --  interacts with  --  AT4G39050  --  interacts with  --  CYCA2;3
23 AT1G48280  --  interacts with  --  AT4G39050  --  interacts with  --  CIPK9; PKS6; SnRK3.12
24 AT1G48280  --  interacts with  --  AT4G39050  --  interacts with  --  ATSIG6; SIG6; SIGF; SOLDAT8
25 AT1G48280  --  interacts with  --  AT4G39050  --  interacts with  --  AT4G33920
26 AT1G48280  --  interacts with  --  AT4G39050  --  interacts with  --  AT2G39100
27 AT1G48280  --  interacts with  --  AT4G39050  --  interacts with  --  AT1G03140
28 AT1G48280  --  interacts with  --  AT4G39050  --  interacts with  --  AT3G60200
29 AT1G48280  --  interacts with  --  AT4G39050  --  interacts with  --  AT4G32590
30 AT1G48280  --  interacts with  --  AT4G39050  --  interacts with  --  PYM; UVI4
31 AT1G48280  --  interacts with  --  AT4G39050  --  interacts with  --  MOS1
32 AT1G48280  --  interacts with  --  AT4G39050  --  interacts with  --  AT2G32840
33 AT1G48280  --  interacts with  --  AT4G39050  --  interacts with  --  AT2G17670
34 AT1G48280  --  interacts with  --  AT4G39050  --  interacts with  --  AT1G61590
35 AT1G48280  --  interacts with  --  AT4G39050  --  interacts with  --  ATHM4; ATM4; TRX-M4
36 AT1G48280  --  interacts with  --  AT4G39050  --  interacts with  --  AT1G71970
37 AT1G48280  --  interacts with  --  AT4G39050  --  interacts with  --  DRIP2
38 AT1G48280  --  interacts with  --  AT4G39050  --  interacts with  --  AT3G13227
39 AT1G48280  --  interacts with  --  AT4G39050  --  interacts with  --  AT1G49850
40 AT1G48280  --  interacts with  --  AT4G39050  --  interacts with  --  ATG8D
41 AT1G48280  --  interacts with  --  AT4G39050  --  interacts with  --  AT4G28230
42 AT1G48280  --  interacts with  --  AT4G39050  --  interacts with  --  AT1G53800
43 AT1G48280  --  interacts with  --  AT4G39050  --  interacts with  --  AT3G24740
44 AT1G48280  --  interacts with  --  AT3G11590  --  interacts with  --  AT5G20030
45 AT1G48280  --  interacts with  --  AT3G11590  --  interacts with  --  AT3G50910
46 AT1G48280  --  interacts with  --  AT3G11590  --  interacts with  --  AT3G56680
47 AT1G48280  --  interacts with  --  AT3G11590  --  interacts with  --  AT3G17740
48 AT1G48280  --  interacts with  --  AT3G11590  --  interacts with  --  ATMAP70-5; MAP70-5
49 AT1G48280  --  interacts with  --  AT3G11590  --  interacts with  --  LSU2
50 AT1G48280  --  interacts with  --  AT3G11590  --  interacts with  --  AT4G15730
51 AT1G48280  --  interacts with  --  AT3G11590  --  interacts with  --  AT3G27960
52 AT1G48280  --  interacts with  --  AT3G11590  --  interacts with  --  HDG4
53 AT1G48280  --  interacts with  --  AT3G11590  --  interacts with  --  AME3
54 AT1G48280  --  interacts with  --  AT3G11590  --  interacts with  --  AT1G30860
55 AT1G48280  --  interacts with  --  AT3G11590  --  interacts with  --  ASIL1
56 AT1G48280  --  interacts with  --  AT3G11590  --  interacts with  --  ATSK41; SK41
57 AT1G48280  --  interacts with  --  AT3G11590  --  interacts with  --  AT2G19650
58 AT1G48280  --  interacts with  --  AT3G11590  --  interacts with  --  AT1G12650
59 AT1G48280  --  interacts with  --  AT3G11590  --  interacts with  --  AT3G06980
60 AT1G48280  --  interacts with  --  AT3G11590  --  interacts with  --  AT1G01630
61 AT1G48280  --  interacts with  --  AT3G11590  --  interacts with  --  AT1G80000
62 AT1G48280  --  interacts with  --  AT3G11590  --  interacts with  --  AtMYB70; MYB70
63 AT1G48280  --  interacts with  --  AT3G11590  --  interacts with  --  RCN1 ATB BETA BETA
64 AT1G48280  --  interacts with  --  AT3G11590  --  interacts with  --  AtPPR2; EMB2750; PPR2
65 AT1G48280  --  interacts with  --  AT3G11590  --  interacts with  --  AT2G32650
66 AT1G48280  --  interacts with  --  AT3G11590  --  interacts with  --  AT3G01690
67 AT1G48280  --  interacts with  --  AT3G11590  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.870626) with  --  AT3G16060
68 AT1G48280  --  interacts with  --  ATHSP23.6-MITO; HSP23.6-MITO  --  interacts with  --  ATCPK26; CPK26
69 AT1G48280  --  interacts with  --  ATHSP23.6-MITO; HSP23.6-MITO  --  interacts with  --  AT4G39820
70 AT1G48280  --  interacts with  --  ATHSP23.6-MITO; HSP23.6-MITO  --  interacts with  --  AT5G02050
71 AT1G48280  --  interacts with  --  ATHSP23.6-MITO; HSP23.6-MITO  --  interacts with  --  SIM
72 AT1G48280  --  interacts with  --  ATHSP23.6-MITO; HSP23.6-MITO  --  interacts with  --  AT5G51440
73 AT1G48280  --  interacts with  --  ATHSP23.6-MITO; HSP23.6-MITO  --  interacts with  --  AT5G05190
74 AT1G48280  --  interacts with  --  ATHSP23.6-MITO; HSP23.6-MITO  --  interacts with  --  VPS9B
75 AT1G48280  --  interacts with  --  ATHSP23.6-MITO; HSP23.6-MITO  --  interacts with  --  EDA40
76 AT1G48280  --  interacts with  --  ATHSP23.6-MITO; HSP23.6-MITO  --  interacts with  --  AT5G10710
77 AT1G48280  --  interacts with  --  ATHSP23.6-MITO; HSP23.6-MITO  --  interacts with  --  AT5G55220
78 AT1G48280  --  interacts with  --  ATHSP23.6-MITO; HSP23.6-MITO  --  interacts with  --  AT4G32190
79 AT1G48280  --  interacts with  --  ATHSP23.6-MITO; HSP23.6-MITO  --  interacts with  --  AT4G31875
80 AT1G48280  --  interacts with  --  ATHSP23.6-MITO; HSP23.6-MITO  --  interacts with  --  HSP18.2
81 AT1G48280  --  interacts with  --  ATHSP23.6-MITO; HSP23.6-MITO  --  interacts with  --  ATSAE1B; SAE1B
82 AT1G48280  --  interacts with  --  ATHSP23.6-MITO; HSP23.6-MITO  --  interacts with  --  AT-SAE1-2; SAE1B
83 AT1G48280  --  interacts with  --  ATHSP23.6-MITO; HSP23.6-MITO  --  interacts with  --  AT5G13260
84 AT1G48280  --  interacts with  --  ATHSP23.6-MITO; HSP23.6-MITO  --  interacts with  --  ATFKBP12; FKBP12
85 AT1G48280  --  interacts with  --  ATHSP23.6-MITO; HSP23.6-MITO  --  interacts with  --  ATCYP20-2; CYP20-2
86 AT1G48280  --  interacts with  --  ATHSP23.6-MITO; HSP23.6-MITO  --  interacts with  --  AT5G63200
87 AT1G48280  --  interacts with  --  ATHSP23.6-MITO; HSP23.6-MITO  --  interacts with  --  AtCIB22; CIB22
88 AT1G48280  --  interacts with  --  ATHSP23.6-MITO; HSP23.6-MITO  --  interacts with  --  ALF4
89 AT1G48280  --  interacts with  --  ATHSP23.6-MITO; HSP23.6-MITO  --  interacts with  --  NARA5
90 AT1G48280  --  interacts with  --  ATHSP23.6-MITO; HSP23.6-MITO  --  interacts with  --  AT5G39790
91 AT1G48280  --  interacts with  --  ATHSP23.6-MITO; HSP23.6-MITO  --  interacts with  --  GrxC5
92 AT1G48280  --  interacts with  --  ATHSP23.6-MITO; HSP23.6-MITO  --  interacts with  --  AT5G58575
93 AT1G48280  --  interacts with  --  ATHSP23.6-MITO; HSP23.6-MITO  --  interacts with  --  DEP
94 AT1G48280  --  interacts with  --  ATHSP23.6-MITO; HSP23.6-MITO  --  interacts with  --  AT2G12290
95 AT1G48280  --  interacts with  --  ATHSP23.6-MITO; HSP23.6-MITO  --  interacts with  --  AT3G56030
96 AT1G48280  --  interacts with  --  ATHSP23.6-MITO; HSP23.6-MITO  --  interacts with  --  IXR11; KNAT7
97 AT1G48280  --  interacts with  --  ATHSP23.6-MITO; HSP23.6-MITO  --  interacts with  --  AtFYPP1; FYPP1
98 AT1G48280  --  interacts with  --  ATHSP23.6-MITO; HSP23.6-MITO  --  interacts with  --  ATSKL1; SKL1
99 AT1G48280  --  interacts with  --  ATHSP23.6-MITO; HSP23.6-MITO  --  interacts with  --  AT2G38830
100 AT1G48280  --  interacts with  --  ATHSP23.6-MITO; HSP23.6-MITO  --  interacts with  --  ATORC4; ORC4
101 AT1G48280  --  interacts with  --  ATHSP23.6-MITO; HSP23.6-MITO  --  interacts with  --  AT1G13520
102 AT1G48280  --  interacts with  --  ATHSP23.6-MITO; HSP23.6-MITO  --  interacts with  --  AT1G30730
103 AT1G48280  --  interacts with  --  ATHSP23.6-MITO; HSP23.6-MITO  --  interacts with  --  AT1G52560
104 AT1G48280  --  interacts with  --  ATHSP23.6-MITO; HSP23.6-MITO  --  interacts with  --  AT2G32160
105 AT1G48280  --  interacts with  --  ATHSP23.6-MITO; HSP23.6-MITO  --  interacts with  --  AT3G54826
106 AT1G48280  --  interacts with  --  ATHSP23.6-MITO; HSP23.6-MITO  --  interacts with  --  PUB23
107 AT1G48280  --  interacts with  --  ATHSP23.6-MITO; HSP23.6-MITO  --  interacts with  --  AT1G72030
108 AT1G48280  --  interacts with  --  ATHSP23.6-MITO; HSP23.6-MITO  --  interacts with  --  HINT 2
109 AT1G48280  --  interacts with  --  ATHSP23.6-MITO; HSP23.6-MITO  --  interacts with  --  AT2G34340
110 AT1G48280  --  interacts with  --  ATHSP23.6-MITO; HSP23.6-MITO  --  interacts with  --  AT1G56150
111 AT1G48280  --  interacts with  --  ATHSP23.6-MITO; HSP23.6-MITO  --  interacts with  --  AT1G56680
112 AT1G48280  --  interacts with  --  ATHSP23.6-MITO; HSP23.6-MITO  --  interacts with  --  AT4G15270
113 AT1G48280  --  interacts with  --  ATHSP23.6-MITO; HSP23.6-MITO  --  interacts with  --  AT1G61340
114 AT1G48280  --  interacts with  --  ATHSP23.6-MITO; HSP23.6-MITO  --  interacts with  --  AT1G70590
115 AT1G48280  --  interacts with  --  ATHSP23.6-MITO; HSP23.6-MITO  --  interacts with  --  AT1G12620
116 AT1G48280  --  interacts with  --  ATHSP23.6-MITO; HSP23.6-MITO  --  interacts with  --  PSBQ; PSBQ-2; PSII-Q
117 AT1G48280  --  interacts with  --  ATHSP23.6-MITO; HSP23.6-MITO  --  interacts with  --  AT3G01820
118 AT1G48280  --  interacts with  --  ATHSP23.6-MITO; HSP23.6-MITO  --  interacts with  --  AT1G03250
119 AT1G48280  --  interacts with  --  ATHSP23.6-MITO; HSP23.6-MITO  --  interacts with  --  AT2G24550
120 AT1G48280  --  interacts with  --  ATHSP23.6-MITO; HSP23.6-MITO  --  interacts with  --  ATCAL4; TCH3
121 AT1G48280  --  interacts with  --  ATHSP23.6-MITO; HSP23.6-MITO  --  interacts with  --  AT4G08520
122 AT1G48280  --  interacts with  --  ATHSP23.6-MITO; HSP23.6-MITO  --  interacts with  --  EMB2819
123 AT1G48280  --  interacts with  --  ATHSP23.6-MITO; HSP23.6-MITO  --  interacts with  --  ARR14
124 AT1G48280  --  interacts with  --  ATHSP23.6-MITO; HSP23.6-MITO  --  interacts with  --  AT1G26460
125 AT1G48280  --  interacts with  --  ATHSP23.6-MITO; HSP23.6-MITO  --  interacts with  --  AT1G24996
126 AT1G48280  --  interacts with  --  ATHSP23.6-MITO; HSP23.6-MITO  --  interacts with  --  EMB2654
127 AT1G48280  --  interacts with  --  ATHSP23.6-MITO; HSP23.6-MITO  --  interacts with  --  HAP1; MAGO; MEE63
128 AT1G48280  --  interacts with  --  ATHSP23.6-MITO; HSP23.6-MITO  --  interacts with  --  AT1G06270
129 AT1G48280  --  interacts with  --  ATHSP23.6-MITO; HSP23.6-MITO  --  interacts with  --  AT1G50575
130 AT1G48280  --  interacts with  --  ATHSP23.6-MITO; HSP23.6-MITO  --  interacts with  --  AT3G56290
131 AT1G48280  --  interacts with  --  ATHSP23.6-MITO; HSP23.6-MITO  --  interacts with  --  IMPA-2
132 AT1G48280  --  interacts with  --  ATHSP23.6-MITO; HSP23.6-MITO  --  interacts with  --  AT1G19010
133 AT1G48280  --  interacts with  --  ATHSP23.6-MITO; HSP23.6-MITO  --  interacts with  --  SKL2
134 AT1G48280  --  interacts with  --  ATHSP23.6-MITO; HSP23.6-MITO  --  interacts with  --  NFD6
135 AT1G48280  --  interacts with  --  ATHSP23.6-MITO; HSP23.6-MITO  --  interacts with  --  AT2G25730
136 AT1G48280  --  interacts with  --  ATHSP23.6-MITO; HSP23.6-MITO  --  interacts with  --  AT1G22270
137 AT1G48280  --  interacts with  --  ATHSP23.6-MITO; HSP23.6-MITO  --  interacts with  --  AT3G56360
138 AT1G48280  --  interacts with  --  ATHSP23.6-MITO; HSP23.6-MITO  --  interacts with  --  AGL27; FLM; MAF1
139 AT1G48280  --  interacts with  --  ATHSP23.6-MITO; HSP23.6-MITO  --  interacts with  --  AT1G71865
140 AT1G48280  --  interacts with  --  ATHSP23.6-MITO; HSP23.6-MITO  --  interacts with  --  ABCA1; AtABCA1
141 AT1G48280  --  interacts with  --  ATHSP23.6-MITO; HSP23.6-MITO  --  interacts with  --  AT3G42630
142 AT1G48280  --  interacts with  --  ATHSP23.6-MITO; HSP23.6-MITO  --  interacts with  --  PQL1; PQL2
143 AT1G48280  --  interacts with  --  ATHSP23.6-MITO; HSP23.6-MITO  --  interacts with  --  AT1G63470
144 AT1G48280  --  interacts with  --  ATHSP23.6-MITO; HSP23.6-MITO  --  interacts with  --  CAO; CPSRP43
145 AT1G48280  --  interacts with  --  ATHSP23.6-MITO; HSP23.6-MITO  --  interacts with  --  ATEIF3G1; EIF3G1
146 AT1G48280  --  interacts with  --  ATHSP23.6-MITO; HSP23.6-MITO  --  interacts with  --  AT3G10970
   Funding by the National Science Foundation    Funding by the Oklahoma Center for the Advancement of Science & Technology    Additional funding by the Samuel Roberts Noble Foundation

Copyright © The Zhao Lab

Disclaimer | Contact