Screen Resolution:     
Welcome to HRGRN
A Graph Search-Empowered Integrative Database of Arabidopsis Signaling Transduction, Metabolism and Gene Regulation Networks   
Location:  Home > Details for node AT1G71970
Type: Protein GRN ID: np10624 Name:
Annotation: unknown protein; FUNCTIONS IN: molecular_function unknown; INVOLVED IN: biological_process unknown; LOCATED IN: chloroplast; EXPRESSED IN: 22 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; BEST Arabidopsis thaliana protein match is: unknown protein (TAIR:AT1G22680.1); Has 58 Blast hits to 58 proteins in 13 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 4; Fungi - 0; Plants - 49; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 5 (source: NCBI BLink).
Gene Locus: AT1G71970
Gene Expression (Affy ATH1 probeset): 260167_at    
Graph Customization
   
Choose color for highlight:  
Display edge: validated and predicted
Display node/edge prompt:
Layout:
 as format     
Data Filter
 Protein modification
 Protein-protein interaction
        also include predicted relationship
 Compound-protein interaction
 TF-target gene regulation
 Small RNA-target regulation
        also include predicted relationship
 Carrier and transported molecule
 Catalytic chemical reaction
 Co-expressed gene pair
        with mutual information value >

  Ignore nodes having > relationships
 
Relationship type:  protein modification     catalytic chemical reaction     protein-protein interaction    
compound-protein interaction     TF-target gene regulation     small RNA-target regulation    
co-expressed gene pair     carrier and transported molecule     family/complex and member
Relationship evidence:  Solid line: validated          Dashed line: predicted
Relationship direction: Arrow: positive          T shape: negative          None arrow: unknown or n/a
Hormone association: Thicker line: hormone related relationship         : hormone related Node
Node type:  Transcription factor or transcriptional regulator       Compound       Kinase
 Small regulatory RNA (miRNA & ta-siRNA)       Other nodes
No. Path
2 AT1G71970  --  interacts with  --  LSU1
3 AT1G71970  --  interacts with  --  AT4G39050
4 AT1G71970  --  interacts with  --  AT3G27960
5 AT1G71970  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.814627) with  --  AT1G52190
6 AT1G71970  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.880425) with  --  AT3G18050
7 AT1G71970  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.821502) with  --  P1R1
8 AT1G71970  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  ATSPX4; SPX4
9 AT1G71970  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  RPS18C
10 AT1G71970  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  AT4G18630
11 AT1G71970  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  AT5G57910
12 AT1G71970  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  AT5G22890
13 AT1G71970  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  AT5G09770
14 AT1G71970  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  VAR3
15 AT1G71970  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  AT5G23130
16 AT1G71970  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  ASHR3; SDG4
17 AT1G71970  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  AT4G26310
18 AT1G71970  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  PSAD-1
19 AT1G71970  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  ATPTEN1; PTEN1
20 AT1G71970  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  AtCIB22; CIB22
21 AT1G71970  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  VPS9B
22 AT1G71970  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  AT5G66720
23 AT1G71970  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  PBF1
24 AT1G71970  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  ful
25 AT1G71970  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  FSD2
26 AT1G71970  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  AT5G65220
27 AT1G71970  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  HMA6; PAA1
28 AT1G71970  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  AT4G28200
29 AT1G71970  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  AT5G54580
30 AT1G71970  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  AT4G36970
31 AT1G71970  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  TOE2
32 AT1G71970  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  AT5G11090
33 AT1G71970  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  AT5G65683
34 AT1G71970  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  AT4G30490
35 AT1G71970  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  AT4G12450
36 AT1G71970  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  AT5G38420
37 AT1G71970  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  AT5G02870
38 AT1G71970  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  AT4G39820
39 AT1G71970  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  AtPP2-B5; PP2-B5
40 AT1G71970  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  LSH4
41 AT1G71970  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  AT1G01440
42 AT1G71970  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  NRPB6B; NRPE6B
43 AT1G71970  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  BLH8; PNF
44 AT1G71970  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  AT2G32840
45 AT1G71970  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  AT1G11430
46 AT1G71970  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  ATGRX2; CXIP2
47 AT1G71970  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  AT2G38300
48 AT1G71970  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  AT3G06790
49 AT1G71970  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  AT2G16930
50 AT1G71970  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  AT3G13160
51 AT1G71970  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  EDS1
52 AT1G71970  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  AT3G08740
53 AT1G71970  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  NF-YA4
54 AT1G71970  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  AT1G32580
55 AT1G71970  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  AT1G06270
56 AT1G71970  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  AT3G06590
57 AT1G71970  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  AT3G28900
58 AT1G71970  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  AT2G04390
59 AT1G71970  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  ATERF12
60 AT1G71970  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  AT1G77400
61 AT1G71970  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  AT2G17880
62 AT1G71970  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  SKL2
63 AT1G71970  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  AT2G24860
64 AT1G71970  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  AT2G35240
65 AT1G71970  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  GATA24; TIFY2B; ZML1; ZML1
66 AT1G71970  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  AT2G43370
67 AT1G71970  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  AT1G53800
68 AT1G71970  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  AT1G26740
69 AT1G71970  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  AT1G03250
70 AT1G71970  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  AT2G26800
71 AT1G71970  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  AT1G34030
72 AT1G71970  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  ZFP7
73 AT1G71970  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  ATCFM2; CFM2
74 AT1G71970  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  AT1G75400
75 AT1G71970  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  AT1G31050
76 AT1G71970  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  AT1G49850
77 AT1G71970  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  AT3G13310
78 AT1G71970  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  AT3G05625
79 AT1G71970  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  AtSS2; SS2
80 AT1G71970  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  JAZ9
81 AT1G71970  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  AT3G07480
82 AT1G71970  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  ENA
83 AT1G71970  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  JAZ1
84 AT1G71970  --  interacts with  --  LSU1  --  interacts with  --  PAB3
85 AT1G71970  --  interacts with  --  AT4G39050  --  interacts with  --  KAN; KAN1
86 AT1G71970  --  interacts with  --  AT4G39050  --  interacts with  --  AT5G37550
87 AT1G71970  --  interacts with  --  AT4G39050  --  interacts with  --  VPS20.2
88 AT1G71970  --  interacts with  --  AT4G39050  --  interacts with  --  AT5G58950
89 AT1G71970  --  interacts with  --  AT4G39050  --  interacts with  --  ATPUB49; PUB49
90 AT1G71970  --  interacts with  --  AT4G39050  --  interacts with  --  AT5G63350
91 AT1G71970  --  interacts with  --  AT4G39050  --  interacts with  --  AT5G49210
92 AT1G71970  --  interacts with  --  AT4G39050  --  interacts with  --  AT1G55890
93 AT1G71970  --  interacts with  --  AT4G39050  --  interacts with  --  AT1G31870
94 AT1G71970  --  interacts with  --  AT4G39050  --  interacts with  --  TTL3; VIT
95 AT1G71970  --  interacts with  --  AT4G39050  --  interacts with  --  AT1G71020
96 AT1G71970  --  interacts with  --  AT4G39050  --  interacts with  --  CYCA2;3
97 AT1G71970  --  interacts with  --  AT4G39050  --  interacts with  --  CIPK9; PKS6; SnRK3.12
98 AT1G71970  --  interacts with  --  AT4G39050  --  interacts with  --  ATSIG6; SIG6; SIGF; SOLDAT8
99 AT1G71970  --  interacts with  --  AT4G39050  --  interacts with  --  AT1G48280
100 AT1G71970  --  interacts with  --  AT4G39050  --  interacts with  --  AT4G33920
101 AT1G71970  --  interacts with  --  AT4G39050  --  interacts with  --  AT2G39100
102 AT1G71970  --  interacts with  --  AT4G39050  --  interacts with  --  AT1G03140
103 AT1G71970  --  interacts with  --  AT4G39050  --  interacts with  --  AT3G60200
104 AT1G71970  --  interacts with  --  AT4G39050  --  interacts with  --  AT4G32590
105 AT1G71970  --  interacts with  --  AT4G39050  --  interacts with  --  PYM; UVI4
106 AT1G71970  --  interacts with  --  AT4G39050  --  interacts with  --  MOS1
107 AT1G71970  --  interacts with  --  AT4G39050  --  interacts with  --  AT2G17670
108 AT1G71970  --  interacts with  --  AT4G39050  --  interacts with  --  AT1G61590
109 AT1G71970  --  interacts with  --  AT4G39050  --  interacts with  --  ATHM4; ATM4; TRX-M4
110 AT1G71970  --  interacts with  --  AT4G39050  --  interacts with  --  DRIP2
111 AT1G71970  --  interacts with  --  AT4G39050  --  interacts with  --  AT3G13227
112 AT1G71970  --  interacts with  --  AT4G39050  --  interacts with  --  ATG8D
113 AT1G71970  --  interacts with  --  AT4G39050  --  interacts with  --  AT4G28230
114 AT1G71970  --  interacts with  --  AT4G39050  --  interacts with  --  AT3G24740
115 AT1G71970  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  AT3G52050
116 AT1G71970  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  DRB5
117 AT1G71970  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  AT4G00980
118 AT1G71970  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  AT3G54826
119 AT1G71970  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  AT4G26910
120 AT1G71970  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  AT4G20300
121 AT1G71970  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  iqd2
122 AT1G71970  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  AT5G22310
123 AT1G71970  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  AT4G31875
124 AT1G71970  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  AT3G45210
125 AT1G71970  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  AT3G56290
126 AT1G71970  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  ATGPX6; GPX6; LSC803; PHGPX
127 AT1G71970  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  AT5G39790
128 AT1G71970  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  AT3G53560
129 AT1G71970  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  AT4G32470
130 AT1G71970  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  CDF1
131 AT1G71970  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  AT3G51180
132 AT1G71970  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  DIN10; RS6
133 AT1G71970  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  IQD23
134 AT1G71970  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  AT1G19680
135 AT1G71970  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  AT3G15000
136 AT1G71970  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  NGA1
137 AT1G71970  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  MOM; MOM; MOM1
138 AT1G71970  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  ADCS; emb1997
139 AT1G71970  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  ATKRS-2; OVA5
140 AT1G71970  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  CLPB-M; CLPB4; HSP98.7
141 AT1G71970  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  CS26
142 AT1G71970  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  IDI2; IPIAT1; IPP2
143 AT1G71970  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  AT2G20270
144 AT1G71970  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  ATPC2
145 AT1G71970  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  ERCC1; UVR7
146 AT1G71970  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  GDC1; LTD
147 AT1G71970  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  PSB27
148 AT1G71970  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  AT2G47210
149 AT1G71970  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  PPR596
150 AT1G71970  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  ATCOQ3; COQ3; COQ3; EMB3002
151 AT1G71970  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  AT1G49840
152 AT1G71970  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  CPFTSY; FRD4
153 AT1G71970  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  AT2G18465
154 AT1G71970  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  WRKY21
155 AT1G71970  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  AT1G54770
156 AT1G71970  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  AT1G04930
157 AT1G71970  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  ATDGK3; DGK3
158 AT1G71970  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  AT1G29810
159 AT1G71970  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  AT1G05860
160 AT1G71970  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  AT3G11590
161 AT1G71970  --  interacts with  --  AT3G27960  --  interacts with  --  AT2G30540
162 AT1G71970  --  interacts with  --  AT3G27960  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.800303) with  --  ATPERK1; PERK1
163 AT1G71970  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.814627) with  --  AT1G52190  --  interacts with  --  WNK3
164 AT1G71970  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.814627) with  --  AT1G52190  --  interacts with  --  AT3G45700
165 AT1G71970  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.814627) with  --  AT1G52190  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.881012) with  --  AT2G18300
166 AT1G71970  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.814627) with  --  AT1G52190  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.879702) with  --  SAUR68
167 AT1G71970  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.814627) with  --  AT1G52190  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.968218) with  --  AtGPAT8; GPAT8
168 AT1G71970  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.814627) with  --  AT1G52190  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.871448) with  --  JK224; NPH1; PHOT1; RPT1
169 AT1G71970  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.880425) with  --  AT3G18050  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.833261) with  --  PSAE-2
170 AT1G71970  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.880425) with  --  AT3G18050  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.897162) with  --  PIF4
171 AT1G71970  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.880425) with  --  AT3G18050  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.821223) with  --  ATHVA22A; HVA22A
172 AT1G71970  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.880425) with  --  AT3G18050  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.812065) with  --  AT3G15570
173 AT1G71970  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.880425) with  --  AT3G18050  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.933556) with  --  AT4G23820
174 AT1G71970  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.880425) with  --  AT3G18050  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.820476) with  --  PORB
175 AT1G71970  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.880425) with  --  AT3G18050  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.908857) with  --  AT5G63180
176 AT1G71970  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.880425) with  --  AT3G18050  --  has similar expression pattern (mutual information value=0.850496) with  --  AT5G19940
   Funding by the National Science Foundation    Funding by the Oklahoma Center for the Advancement of Science & Technology    Additional funding by the Samuel Roberts Noble Foundation

Copyright © The Zhao Lab

Disclaimer | Contact